鸡西地区戊型肝炎流行病学研究

目的：探讨鸡西地区戊型肝炎流行病学特征。方法：对600份猪血清样本采用双抗原夹心法检测HEV—DNA,记录检测结果阳性率,给予统计学分析后得出结论。结果：600份猪血清中116份HEV—RNA检测结果为阳性（阳性率19．33％）,检测结果与年龄、品种相关性对比分析可知,年龄与检测结果阳性率呈正相关,而约克夏品种检测结果阳性率最高（100．00％）,对比结果具有统计学意义（P〈0．05）。结论：养殖者及防疫工作者应准确掌握本地区猪戊型肝炎病毒流行病学特征,对戊型肝炎高危猪群应采取适当药物干预措施并积极改善饲养环境,降低猪戊型肝炎发生率,提高人民饮食安全性。     

河南省猪场戊型肝炎病毒流行病学调查

为了解河南地区猪戊型肝炎感染情况,同时掌握该地区猪感染戊型肝炎病毒的基因型,对来自河南新乡、平顶山、南阳等地区不同商品猪场血清、肝脏、粪样品,采用ELISA技术检测猪血清中抗HEV特异性抗体水平,并使用套式RT-PCR检测肝脏和粪便中猪戊型肝炎病毒核酸。结果显示530份样品中HEV抗体阳性率0.6%,HEV RNA均为阴性,推测目前河南省猪戊型肝炎病毒感染率较低。     

湖南地区猪戊型肝炎流行病学调查研究

为了解湖南地区猪戊型肝炎感染情况,同时掌握该地区猪感染戊型肝炎病毒的基因型,以便进一步探讨猪戊型肝炎病毒在猪不同组织中的含量分布及组织损伤,采用ELISA技术检测猪血中抗-HEV特异性抗体水平,并用RT—nPCR检测猪粪便中HEVRNA和进行RNA核苷酸序列分析。结果表明,猪血中HEV抗体阳性率为84.3％;猪粪便样品中HEVRNA阳性率为28．9％。所得5株HEV的ORF2部分核苷酸序列与戊型肝炎病毒Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ型的同源性分别为80．7％～84．O％、78．7％。80．7％、77．3％～82．7％和86．7％～90．7％,其中与Chi-xinjiang株同源性为83.3％～84．0％,与Chi—ⅣT1亚型的同源性为87．7％～90．7％。湖南地区猪戊型肝炎感染率比较高,且戊型肝炎病毒的基因型属Ⅳ型。     

四川地区藏猪戊型肝炎病毒的检测和遗传演化分析

旨在调查四川地区藏猪戊型肝炎病毒（hepatitis E virus,HEV）的流行情况和遗传演化,作者用RT-PCR法对2018—2020年采集自四川省甘孜藏族自治州和阿坝藏族自治州的22个藏猪场332份藏猪粪便样本进行HEV检测,并对阳性样本进行基因分型。RT-PCR检测结果表明HEV核酸阳性率为20.48%（68/332,95% CI=16.3%~25.2%）,22个规模藏猪场中HEV猪场阳性率为77.27%（17/22,95% CI=54.6%~92.2%）,健康样本阳性率为2.86%（3/105,95% CI=0.6%~8.1%）,腹泻样本阳性率为28.63%（65/227,95% CI=22.8%~35.0%）,系统进化分析显示所有阳性株均为G4型。为了进一步研究该地区流行毒株的演化过程,以贝叶斯进化分析软件进行分歧时间估算,结果表明,藏猪流行毒株的分歧时间最早为1999年,最晚为2016年。并分别从每年的样本中挑选1份阳性样本得到全基因组序列,核酸序列相似性为89.5%~93.1%。通过对3条全基因组重组分析发现SWU/301/2019存在重组现象,SWU/301/2019重组区域位于ORF1的3 746—4 655 bp。本研究首次对四川地区藏猪源HEV进行调查,结果表明四川藏猪中存在一定程度的HEV感染,为四川地区对藏猪感染HEV的防治以及深入研究四川藏猪源HEV遗传变异及生物学特性提供了参考依据。     

陕西杨凌某蛋鸡场禽戊型肝炎病毒的检测

2014年-2015年陕西杨凌地区部分商品蛋鸡场产蛋量下降了10%~40%,剖检部分鸡只发现肝脏肿大出血。为确诊该疫情的病因,从发病的6个蛋鸡场采集了337份血清和268份粪便,利用间接ELISA和套式RT-PCR分别对血清中的禽戊型肝炎病毒(HEV)抗体和粪便中的禽HEV RNA进行了实验室检测。ELISA检测结果发现,168份血清为禽HEV抗体阳性,阳性率为49.85%;套式RT-PCR检测结果发现,63份粪便为禽HEV RNA基因片段阳性,阳性率为23.51%。基因片段的序列同源性分析发现,杨凌地区的禽HEV分离株与国内的同源性为93.0%~99.2%;进化树分析表明,其与国内其他地区的分离株在同一进化分支上,同属禽HEV基因3型。     

日本群马地区野猪和家猪戊型肝炎病毒感染的流行趋势

用血清学和遗传学方法检测日本群马地区野猪（Susscrofa leucomystax）和家猪感染戊型肝炎病毒（HEV）的流行趋势。野猪的抗HEV IgG抗体和HEV RNA的阳性率分别为4．5％（4／89）和1．1％（1／89），而家猪的分别为74.6％（126／169）和1．8％（3／169）。     

日本群马地区野猪和家猪戊型肝炎病毒感染的流行趋势

用血清学和遗传学方法检测日本群马地区野猪（Susscrofa leucomystax）和家猪感染戊型肝炎病毒（HEV）的流行趋势。野猪的抗HEV IgG抗体和HEV RNA的阳性率分别为4．5％（4／89）和1．1％（1／89）,而家猪的分别为74.6％（126／169）和1．8％（3／169）。     

四川省甘孜州藏猪戊型肝炎病毒分子流行病学调查

为了解甘孜州藏猪戊型肝炎病毒(HEV)的感染情况，分析其相似性和遗传进化关系。本试验用反转录套式聚合酶链反应(RT-nPCR)方法对采集于2018—2019年甘孜藏族自治州藏猪主要养殖区域4个县10个藏猪养殖场的229份藏猪粪便样本进行核酸检测，并对全部阳性样本进行ORF2基因部分片段扩增测序，遗传进化分析。结果显示：猪粪便HEV核酸阳性率为16.59%(38/229,95%CI=12.00%～22.10%),猪场HEV阳性率为70%(7/10,95%CI=34.8%～93.3%);38个ORF2基因片段彼此之间核苷酸序列相似性为76.1%～100.0%,推导的氨基酸序列相似性为79.6%～100.0%,系统进化树分析显示所有阳性毒株均为基因4型，且与人源HEV毒株亲缘关系近。结果表明甘孜州藏猪中存在一定程度的HEV感染，与人源HEV毒株遗传关系近，相关部门采取防控措施以降低HEV感染的公共卫生风险。     

云南省部分猪场猪戊型肝炎的流行情况调查

为了解云南省猪群戊型肝炎感染情况,从云南省8个猪场采集166份新鲜猪粪便样品,用套式RT-PCR技术对戊型肝炎病毒(HEV)核酸进行检测,结果 21份样品阳性,阳性率为12.7%,感染率较高。通过PCR产物片段的测序分析,去除重复序列后得到11株基因序列。同源性分析结果表明,这11株毒株序列与选定的Gen Bank中基因1型、2型、3型和4型参考序列的核苷酸序列同源性分别为85.6%~87.8%,85.6%~87.8%,85.6%~95.6%和92.8%~98.9%,说明这些株毒株属于基因4型,与中国其他地区分离的毒株同源性最高,证实HEV的流行具有地理分布的特征。     

云南省文山州地区猪戊型肝炎血清流行病学调查

为了解云南省文山州地区猪戊型肝炎病毒(HEV)的感染情况,从文山州8个县市部分规模养殖场和散养户采集健康猪血清样品2548份,采用ELISA方法对猪戊型肝炎病毒的感染情况进行调查.结果表明,共检测出阳性数470份,总阳性率为18.45％.其中规模养殖场的样品数1376份,阳性数为287份,阳性率为20.86％;散养户的...     

野猪肝脏戊型肝炎病毒的检测

在工业化国家,戊型肝炎病毒（HEV）的传播途径还是未知的,但许多研究结果表明,HEV可能是一种由猪引起的动物传染病。本试验旨在研究HEV在野猪中的患病率及野猪和家猪、人的HEV序列间的遗传关系。试验选取法国东南部的285头野猪,利用Real-time RT—PCR技术检测到有7头野猪（占2．5％）存在HEV RNA表达,其中5头野猪的HEV序列属于3f型,相互之间的核苷酸同源性为89％～100％,与从法国南部HEV患者身上提取的HEV同源性较近。因此,法国东南部野猪可能是人戊型肝炎的传染源。     

猪群HEV血清抗体调查及一株新的猪HEV ORF2部分基因序列分析

戊型肝炎病毒(Hepatitis E virus,HEV)主要引起人的戊型肝炎,新近研究发现猪在病毒传播中可能发挥重要作用.本研究对我国部分省区HEV感染血清学调查,在被检的1 138份血清中,有666份(57.5%)为HEV抗体阳性,猪群抗体阳性率随着月龄增长而升高.通过RT-PCR方法从一份猪粪中扩增并克隆了HEVORF2 N端主要抗原决定区339bp基因片段,序列分析显示,该段基因与我国人群HEV基因4型毒株核苷酸序列同源性为85.9%,但氨基酸序列完全一致.这一结果提示我国猪群存在广泛的HEV感染,并在一定程度上与人群HEV毒株密切相关.     

东北边境地区野猪及放养杂交野猪戊型肝炎流行病学调查

为了解东北边境地区野猪及放养杂交野猪群体猪戊型肝炎病毒(HEV)感染情况,于2015—2018年在吉林省、黑龙江省的中朝、中俄边境和内蒙古自治区境内加格达奇周边地区采集6月龄以上杂交野猪血清、粪便或肛拭子样品共520份,采集野猪血清和粪便样品共248份。ELISA检测、RT-nPCR检测、全基因组测序、同源性及进化分析结果显示,杂交野猪和野猪感染HEV的血清抗体总阳性率为34.1%(136/399);核酸总阳性率为1.56%(12/771),12份核酸阳性样品均来自杂交野猪,病毒基因组ORF2部分核苷酸序列同源性为85.4%～100.0%,属于基因4型,4a、4b亚型。对4a亚型的1份阳性样品(LJG-18)进行病毒全基因组扩增测序,其核苷酸序列与日本的人源毒株JKO-ChiSai98C同源性最高,为94.9%,与吉林省猪源毒株Ch-S-1同源性为90.2%。结果表明:东北边境地区放养杂交野猪群具有较高的HEV血清抗体阳性率,HEV流行毒株以4a亚型为主。本试验针对我国野猪及放养杂交野猪群体开展猪戊型肝炎流行病学调查,为该病的流行情况提供了新的科学数据,对我国养猪业健康发展和公共卫生安全具有重要意义。     

利用宏基因组学鉴定藏猪腹泻粪便病毒种群

为进一步了解藏猪腹泻粪便中病毒种群，从青藏高原地区16个藏猪场采集腹泻粪便样本146份，将样本混合成一个pool样，提取RNA反转录成cDNA，建库后利用TruSeq Illumina测序，对测序的序列进行整理分析及相关病毒的分子特征进行研究。数据分析结果表明：藏猪腹泻粪便样本病毒种群包括11个病毒科的19种病毒，主要以线性和环状的小DNA病毒为主，如猪粪相关环状病毒7型、猪腺病毒和猪博卡病毒（PBoV）等；与腹泻相关的病原有猪流行性腹泻病毒（PEDV）、猪圆环病毒2型（PCV-2）和牛病毒性腹泻病毒1型（BVDV-1）3种；与腹泻相关的新发病原有porcine bufavirus、rabovirus和pasivirus 3种。利用SOAP软件组装出猪细小病毒6型（PPV-6）、PCV-2、PBoV-2完整或接近全长的基因组和戊型肝炎病毒（HEV）完整的ORF2基因序列，系统发育结果显示PPV-6和PCV-2与参考毒株有较近的遗传进化关系，PBoV-2与参考毒株有较远的遗传进化关系，单独聚为一簇，可能是一个全新的基因型。为进一步调查PCV-2在藏猪腹泻粪便中的检出率，对采集146份样本进行检测，检出率为10.96%（16/146，95% CI：6.4%~17.2%），且与四川地区PCV-2流行株有较近的亲缘关系。本研究发现藏猪腹泻粪便中病毒种类复杂多样，且可能存在与其他动物和人交叉感染情况，具有重要的公共卫生学意义，也为藏猪腹泻病防控提供一定的理论依据。     

人与家畜戊型肝炎病毒感染的流行病学关联性调查

为探讨人群戊型肝炎病毒(HEV)感染与家畜HEV感染的流行病学关联性,揭示戊型肝炎发病的危险因素,以134例戊型肝炎患者为病例组进行1∶2配对病例对照研究,对收集与家畜相关的卫生行为资料采用多因素COX回归分析戊型肝炎发病的危险因素,同时采集研究现场的家养猪、鸡粪便、猪胆囊、猪肝、环境水样等进行HEV核酸检测,并对病例和猪肝阳性样本进行基因分析。多因素COX回归分析结果显示,猪类接触史(OR=7.21,95%CI:1.65~31.45)、生食瓜果蔬菜史(OR=2.95,95%CI:1.19~7.36)有统计学意义,研究现场的猪粪、猪胆囊、猪肝HEV核酸阳性检出率分别为10.2%、23.5%、30.8%,其余样本均为阴性。人和猪感染的HEV以基因4型为主,核苷酸同源性89.9%~99.3%。结果表明生猪接触史、生食瓜果蔬菜史是戊型肝炎的危险因素,猪胆囊、猪肝的HEV含量高,猪能通过猪粪排出HEV,本地区人源和猪源HEV同源性高,猪是本地人群HEV的重要宿主动物;应结合戊型肝炎的流行特点开展相关防控工作,加强戊型肝炎防控的健康教育和重点人群的保护。     

猪戊型肝炎病毒荧光定量PCR检测方法的建立及其分子流行病学

对已发表的戊型肝炎病毒(HEV)不同基因型毒株全序列进行分析,针对ORF3的保守区设计引物和探针优化建立了HEV荧光RT-PCR检测体系。分析表明该反应体系具有良好的扩增效率、特异性和稳定性,且检测灵敏度比普通RT-PCR方法高10～100倍。利用所建立的荧光定量PCR方法对采集自浙江及其周边上海、江苏等地区规模化猪场的样品以及HEV抗体阳性人血清样品进行了HEV核酸检测。其中,77份人血清样本仅有2份为HEV核酸阳性(2.6%)。而猪粪便样品阳性率则高达20.5%(56/273),且所调查的猪场均存在HEV感染。进一步的分子流行特征分析表明,浙江及周边地区的猪HEV毒株多为基因Ⅳ型,与其他地区的Ⅳ型HEV毒株同源性较高(83.4%～89.5%),但它们之间也存在较多的变异位点。猪源HEV毒株PJ-1则与多数Ⅲ型HEV毒株同源性较高(88%),进化分析也表明其为基因Ⅲ型。人血清样品中检测到的2份HEV毒株Human-1与Human-2与本地区Ⅳ型猪源毒株在分子进化关系上具有很高的亲源性,它们分布于同一分支内,而不构成独立分支。以上分析结果表明浙江及其周边地区猪HEV感染较为广泛,且以基因Ⅳ型毒株为主,但也存在...     

昆明地区猪戊型肝炎病毒感染的血清学调查

为了解昆明地区猪戊型肝炎病毒(HEV)感染的情况,从昆明地区12个规模化养猪场和部分散养户采集了270份猪血清,采用间接ELISA方法对血清样本进行抗HEV抗体检测。检测结果显示,235份规模化养猪场猪血清抗HEV抗体阳性率为59.15%,35份散养户猪群血清中抗HEV抗体阳性率为74.29%,其中3月龄以上的育肥猪HEV抗体阳性率较高,为75%。结果表明,昆明地区猪群普遍存在HEV感染,尤其是仔猪和生长育肥猪HEV的感染较为严重。     

江西部分地区猪粪便戊型肝炎病毒核酸检测及序列分析

采集江西省A猪场2～3月龄猪粪便40份,B猪场2～3月龄猪粪便40份,利用反转录套式聚合酶链方法(RT-nPCR),检测戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV)RNA,结果表明,A猪场7份样品为阳性,阳性率17.5%.B猪场10份样品为阳性,阳性率25.0%.总阳性率21.3%.对4份PCR扩增阳性产物进行纯化并测序,利用生物学软件进行序列分析和进化树绘制,4个分离株ORF2 348 bp同源性为92.1%～97.5%,为同一基因型,与HEV1、HEV2、HEV3同源性分别为70.7%～77.4%、72.5%~75.7%和71.6%～76.8%,与HEV4型的同源性79.2%～83.9%.4个分离株与HEV4型的代表株T1在同一分支上,属基因4型.与中国大陆6株猪源HEV比较,同源性为79.0%～87.3%,提示中国大陆猪源HEV的基因型比较一致,同属HEV 4型.