南江黄羊体重性状的微卫星标记研究

通过10个微卫星位点，对周岁体重差异较大的南江黄羊极端个体基因组DNA进行扩增检测，方差分析寻找与体重性状显著相关的微卫星标记。然后，利用该引物对随机群体进行检测，应用线性模型计算含有相应标记个体体重性状的标记效应和替代效应。结果发现，BM3413位点的186bp和190bp等位基因、MFA70位点的109bp等位基因、INRA063位点的178bp和184bp等位基因、MB066位点的110bp等位基因、MB3501位点的176bp等位基因，这些标记基因与南江黄羊周岁体重呈极显著正相关，相关系数在0.5180～0.7375之间。BM3413位点的182bp等位基因、MFA70位点的115bp等位基因、MB066位点的98bp等位基因，这些标记与南江黄羊周岁体重呈显著（极显著）的负相关，相关系数在-0.6539～-0.388之间。     

哲罗鱼生长速度相关性状的微卫星标记筛选

利用22个微卫星标记对随机交配的野生哲罗鱼F1176个个体的生长速度相关性状(体质量、全长、体高、体宽、头长、头宽和眼间距)进行分析,22个微卫星标记共检测到67个等位基因,各座位的等位基因2～6个,片段大小为109～452 bp,平均观测杂合度和期望杂合度分别为0.583 5和0.564 0,22个位点均有不同程度的偏离Hardy-Weiberg平衡。利用SPSS软件对7个性状正态分布检测发现,7个性状都显示出连续变异的特点,属典型的数量性状或者多基因遗传,符合正态分布;同时用GLM程序对22个微卫星标记与生长速度相关性状进行相关性分析,并将与性状显著相关的标记进行基因型之间的多重比较,结果显示,22个微卫星座位中,有11个标记与至少一种性状显著相关,其中与全长相关的标记最少为4个,与体高和体宽相关的标记最多的为7个;多重比较可知每个标记中同一性状均有部分基因型差异达到显著水平,不同标记所代表均值也有些差异。上述这些标记为进一步的分子标记辅助育种提供了基础。     

不同受体胚胎移植荷斯坦奶牛体尺体重指标生长比较及相关性分析

通过对酒泉地区不同受体胚胎移植荷斯坦奶牛生长指标的研究,探讨胚胎移植荷斯坦奶牛对酒泉地区生态条件的适应性。采用生长指标比较和相关性分析,对甘肃酒泉地区土杂、西杂和黑白花三种受体牛所产45头胚胎移植荷斯坦奶牛0日龄、6月龄、12月龄阶段的体尺体重指标进行了研究。结果发现：三种受体胚胎移植牛体尺体重随日龄的增加而增加,0—12月龄体重增长快速,体高、胸围增长较快,管围生长较慢。三阶段体尺体重彼此之间的相关系数均在0.90以上,各相关数之间有高度统计意义(P=0.000＜0.01)。体尺体重彼此呈显著正相关,线性程度非常好。胚胎移植荷斯坦奶牛对酒泉地区的生态气候条件具有较强的适应性。     

虾夷扇贝家系群体遗传结构及其微卫星标记与经济性状相关性的分析研究

为了有效利用微卫星技术分析虾夷扇贝的群体遗传结构并筛选与虾夷扇贝生长相关的标记。采用19个多态性微卫星分子标记对虾夷扇贝一个家系群体进行了遗传多样性分析。结果显示：19个微卫星位点共获得60个等位基因,每个位点的等位基因数(Na)为2~4个,等位基因片段大小为113~312 bp,平均等位基因数为3.26个,平均有效等位基因数(Ne)为3.0175个,观测杂合度(Ho)平均值为0.2952,期望杂合度(He)的平均值为0.6352,平均多态信息含量(PIC)值为0.5671。经卡方Hardy-Weinberg检验(P<0.01)显示多于半数的位点都发生了偏离。运用SPSS 16.0对微卫星标记与虾夷扇贝生长性状的相关性进行分析,结果表明：DQ679223与壳宽显著相关,EF056526与体重、壳长、壳高、壳宽显著相关,DQ221720与体重、壳高、壳宽显著相关,FJ262409与体重显著相关。研究结果表明：虾夷扇贝的群体遗传多样性水平较高,有较高的遗传改良潜力,可以利用筛选的与虾夷扇贝生长相关的标记进行辅助育种,提高育种效率。     

Strong evidence for a fire blight resistance gene of Malus robusta located on linkage group 3

Fire blight (FB), caused by the Gram-negative bacterium Erwinia amylovora is a dangerous disease on pome fruit, including apple. The FB-susceptible cultivar 'Idared' was crossed with the resistant wild species clone Malus  ×  robusta 5. A segregating population of 146 progeny has been tested by artificial shoot inoculation for susceptibility to FB. Progeny were infected from 0% to 100% of the shoot length. To identify chromosomal regions or loci responsible for resistance to FB of Malus  ×  robusta 5, a set of microsatellite markers (simple sequence repeat, SSRs) was chosen covering all linkage groups of apple. Up to eight different microsatellites were bulked to one mutliplex PCR using four different labels and a fifth label for a size standard. Fifty-nine microsatellite markers out of 72 SSRs were polymorphic. Fifty-four of 66 loci detected could be mapped and were useful for the detection of related resistant loci. Alleles of microsatellites Hi03d06, CH03g07 and CH03e03 originating from the resistant donor M. robusta were associated with resistance to Erwinia amylovora . Up to eighty percent of the phenotypic variation could be explained by the interval spanned by SSRs CH03g07 and CH03e03, indicating the presence of a major resistance gene. All three microsatellites are located on the distal part of linkage group 3, spanning 15 cM. The SSR marker CH03e03 can be regarded as diagnostic marker for FB resistance. Only seven progeny expressing allele b (184 bp) of CH03e03 showed blighted shoot lengths of more than 30% and only nine progeny lacking allele b showed blighted shoot lengths of <30%. By setting a threshold of 30% shoot necrosis for resistance to FB, the 146 individuals segregate into 71 susceptible and 75 resistant plants, and resistance to FB maps 9 cM away from marker CH03e03.     

昆明小鼠和ICR小鼠的遗传特征分析

为探究封闭群实验动物的遗传质量评价方法,利用脏器指数和微卫星检测对辽宁省两单位的昆明小鼠和ICR小鼠进行了遗传分析。选取小鼠不同染色体上10个多态信息丰富的微卫星位点,以PCR-PAGE技术进行多态性分析,常规方法测定脏器指数。结果表明：两单位KM小鼠和ICR小鼠的体重和部分脏器指数差异显著或极显著（P＞0.01或P＞0.05）,10个位点的等位基因数、基因型数、杂合度和多态性信息含量都较接近,A单位的KM小鼠的遗传多样性略高于B单位,B单位的ICR小鼠的遗传多样性略高于A单位,两品系在两单位间的遗传距离相近存在微弱的遗传分化。     

河田鸡体重、体尺及屠宰性状测定及其相关性分析

为了探讨河田鸡体重、体尺与屠宰性状的相关关系,为河田鸡的选育提供依据。本研究对120日龄河田鸡的体重、体尺和屠宰性状进行测定,并对各指标进行了相关性分析。结果表明：体重、体斜长、龙骨长、胸深、胸宽、胫长和胫围在公母之间存在极显著差异(P＜0.01);体重与体斜长、龙骨长、胸深、胸宽、胫长、胫围均有显著或极显著正相关(P＜0.01),其余各指标间亦有不同程度的相关;宰前体重、屠体重、半净膛重、全净膛重、腿肌重、腹脂重、皮脂重、腿肌率和腹脂率在公母之间存极显著差异(P＜0.01);宰前体重与屠体重、半净膛重、全净膛重、胸肌重、腿肌重、皮脂重、屠宰率、半净膛率、全净膛率呈显著(P＜0.05)或极显著正相关(P＜0.01),其余各指标间亦有不同程度的相关。     

‘扬州鹅’及其杂交配套组合体质量、体尺和羽绒产量测定及相关分析

为研究‘扬州鹅’及其杂交配套组合体重和体尺对羽绒产量的影响,为扬州鹅的选育提供依据,以70日龄罗扬鹅(L×Y)、卡扬鹅(K×Y)、浙扬鹅(Z×Y)和扬扬鹅(Y×Y)4个鹅群体为试验素材,测定其70日龄体质量、体尺及产绒性能并进行相关分析。结果表明:这种经济杂交方法不同程度的地提高了体重、体尺与产绒量。3个杂交配套组合的体重、半潜水长与胸宽均不同程度的大于对照组Y×Y组合,说明杂交可以在一定程度上提高体重与一些体尺性状;3个杂交组合的羽绒总重显著高于对照组Y×Y组合(P0.05),其中L×Y组合羽绒总重最大为144.71 g;L×Y组合与K×Y组合正羽重显著高于Z×Y组合与对照组Y×Y组合(P0.05);L×Y组合与Z×Y组合绒羽重显著高于K×Y组合与对照组Y×Y组合(P0.05)。通过体尺、体重与产绒性能关联分析,体重、半潜水长和胸深对产绒性能影响较大,相关性最高,体重和半潜水长与正羽重、绒羽重和羽绒总重均呈极显著正相关(P0.01)。由此可见,这种经济杂交方法可以提高了鹅的羽绒产量,而且体重和体尺与正羽重、绒羽重和羽绒总重呈不同程度的相关性。     

利用等位基因特异扩增快速检测水稻香味基因

水稻香味受隐性基因控制, 杂合材料不表现出香味, 因此在香稻选育中需要寻找一种快速、简便的香味基因检测方法。本试验通过等位基因特异扩增(ASA)方法对9个香稻和3个非香稻品种 (品系), 以及3个香稻/非香稻组合的F1的香味基因, 进行快速检测。结果显示, 纯合非香稻可获得长度为585和355 bp的两条带, 纯合香稻可获得长度为577和257 bp的两条带, 杂种F1可获得长度为355、257和580 bp左右的3条带。供试材料的分子检测结果与香味基因型完全相符, 所用方法快速有效, 可应用于香稻育种实践。     

甘蓝型油菜光敏色素互作因子4(BnaPIF4)基因克隆和功能分析

光敏色素互作因子4 (phytochrome interacting factor 4, PIF4)是光信号途径关键转录因子, PIF4与BZR互作介导光信号与油菜素内酯信号互作,参与植物光响应。本文在甘蓝型油菜湘油15号中克隆到2个PIF4基因,分别定位于A03号染色体和C03号染色体,命名为BnaPIF4_A03和BnaPIF4_C03,全长编码序列(coding sequence, CDS)、全长mRNA和全长基因分别为1242 bp和1245 bp、1701 bp和1731 bp、2527 bp和2665 bp,各自编码413和414个氨基酸。BnaPIF4_A03具有7个外显子和6个内含子, BnaPIF4_C03具有8个外显子和7个内含子,与测序品种中双11号相比, BnaPIF4_A03基因第1内含子存在单碱基插入突变,第4和第6内含子存在缺失突变,且具有更长的3'-UTR,两基因其他序列在湘油15号和中双11号之间无差别。BnaPIF4_A03和BnaPIF4_C03基因编码蛋白具有典型的植物bHLH结构域,亚细胞定位于细胞核,是典型的植物PIF4蛋白。多序列比对和进化分析表明, BnaPIF4蛋白与白菜、拟南芥、亚麻芥等PIF4蛋白高度同源。PIF4蛋白进化关系与物种进化关系一致,近缘物种中的PIF4蛋白在进化树中高度聚类,大量植物中可见PIF4蛋白重复且低等植物中分化程度明显低于高等植物中,表明PIF4蛋白是一个晚期进化事件且可能存在功能冗余。酵母杂交实验表明BnaPIF4与BnaBZR蛋白存在互作,但BnaPIF4不能与BnaBZR基因的启动子互作,表明BnaPIF4与BnaBZR在蛋白水平而非转录水平发生互作。湘油15号中BnaPIF4_A03和BnaPIF4_C03基因表达规律一致,BnaPIF4基因主要表达于油菜茎表皮、未成熟角果和叶中,在花和根中表达较低,且其表达随油菜生育进程逐渐降低。     

福建德化黑鸡体重和体尺性状的相关与聚类分析

摘要：本文应用相关分析和聚类分析对福建德化黑鸡的体重、体尺性状进行了研究。结果表明,公鸡的体重与体斜长、胸深、胸宽、胸角、龙骨长、胫长和胫围呈显著或极显著正相关,相关程度最大的是体斜长( r =0.796);而母鸡的体重与胸宽、胸角和胫围呈显著正相关,相关程度最大的是胸宽（r =0.454）。体尺性状对体重的影响及体尺性状间的相关关系随性别的不同而异。体型性状的聚类分析结果表明,公鸡可以聚成4类,母鸡则聚成3类。研究结果为保存、改良和开发利用这一地方鸡种资源提供参考信息。     

发掘大豆资源中灰斑病1号生理小种抗性优异等位变异

通过发掘大豆资源中抗灰斑病1号生理小种的优异等位变异和载体材料,为开展抗灰斑病品种分子设计育种提供理论基础。以205份大豆资源构建的自然群体为试验材料,对其进行灰斑病1号生理小种的抗性鉴定;利用117对SSR标记进行全基因组扫描,分析群体的遗传多样性和群体结构,应用GLM和MLM程序对标记与大豆灰斑病抗性开展关联分析。结果表明：205份大豆资源对灰斑病1号生理小种抗性遗传变异系数为20.90%;2个模型共检测到与灰斑病1号生理小种抗性关联的位点7个,表型变异解释率在7.58%~16.06%;发掘到增效等位变异36个,其中效应值较大的等位变异为Satt244-230（26.16）、Satt142-154（21.94）和Satt244-186（20.19）,携带上述3个等位变异的载体材料均为野生资源,3个典型材料分别为12C8646、12C8670和12C6175;育成品种中具有最大增效值的等位变异为Satt142-189（8.94）,有7个品种携带该等位片段,均为黑龙江品种,典型载体材料为东农43。 上述信息可用于分子标记辅助选择育种和抗源筛选。