14匹马经典MHC-Ⅰ类分子多态性分析

为分析马经典MHC-Ⅰ类分子的多态性,本研究从马外周血单个核细胞提取总RNA,并采用RT-PCR方法对14匹马经典MHC-Ⅰ类分子(包括编码肽结合区的大部分区域、α3区、穿膜区以及胞浆区)进行扩增和序列分析.结果显示,14匹实验马各自具有2个～4个MHC-Ⅰ等位基因,其在不同马匹之间的表达呈现明显的差异性,主要分布在2个分支.尽管如此,各马匹间均表达具有1个或1个以上相同或高度同源的对应经典MHC-Ⅰ类分子的mRNA.该研究结果为正在开展的针对马传染性贫血病毒减毒疫苗核心蛋白(p26)以及其他免疫原的CTL表位的筛选提供基础数据.     

马MHC-I基因研究进展及其多态性分析方法探讨

主要组织相容性复合体I (Major histocompatibility complex I,MHC-I)分子与细胞内源性抗原在内质网中结合形成MHC-I/抗原复合物并呈现于细胞膜上,被CD8+T细胞TCR识别,诱导细胞免疫.MHC-I分子也可作为NK细胞的抑制性受体的配体,抑制NK细胞介导的溶细胞作用,在天然免疫中发挥作用[1].基于MHC-I分子的上述重要作用,开展马MHC-I基因的相关研究将有助于对马属动物免疫机制的了解,有效促进马属动物的疫病研究和抗病育种等方面研究的开展.     

主要组织相容性复合体（MHC）基因研究进展

主要组织相容性复合体(major histocompatibility complex,MHC)广泛存在于脊椎动物中,由于其高度多态性,使其在遗传育种和抗病性方面成为人们关注的热点。作者通过对国内外研究者近几十年在MHC基因多态性及该基因与疾病之间的关系等方面的研究做一回顾性总结,并将其中的一些内容作为参考进行下一步的相关性试验。     

羊Leptin基因与GHR基因多态性的研究进展

瘦素基因是脂肪细胞分泌的多肽激素,是绵羊生长发育的重要候选基因。GHR基因的突变可能导致生长激素受体的结构和功能发生变化,从而影响信号转导和生长激素的生物学效应。本文就羊Leptin基因和GHR基因的相关研究情况进行了综述。     

马MxA基因多态性研究

从4个品种马外周血中提取RNA后,采用逆转录聚合酶链式反应,获得MxA cDNA,对其进行了测定。结果发现,马MxA cDNA全序列中有3个位点碱基发生有义突变,即977位点由G→A,1234位点由T→A和1790位点由G→C。据推测,该3个位点的碱基替换分别引起其编码的MxA蛋白质第298位点由精氨酸(Arg)改变成赖氨酸(Lys)、第377位点由缬氨酸(Val)改变成谷氨酸(Glu)和第562位点由色氨酸(Trp)改变成半胱氨酸(Cys),该3个突变点中只有1790位在不同个体间产生差异。     

羊主要组织相容性复合体基因多态性及其在抗病育种中的应用进展

羊的主要组织相容性复合体(MHC)基因由于具有高度多态性和疾病抗性,已成为世界范围内的研究热点。为详细了解羊MHC基因的多态性及其与某些疾病抗性的关系,本文对绵羊、山羊MHC基因的分类、多态性研究及其多态与疾病抗性的相关性进行了概括,并对其在育种中的应用前景进行了展望,以期为MHC基因作为分子标记在羊抗病育种中的利用提供理论依据和借鉴。     

硬骨鱼类MHCⅠ基因结构与抗病力关系探讨

在经历了数亿年的演变与进化后,硬骨鱼类形成了具有种属特征的抗感染以及稳定自身的特异性免疫应答系统;而在其特异性免疫应答系统中,由于MHCⅠ(major histocompatibility complex classⅠ)型分子的主要功能是与病毒等内源性蛋白多肽结合,并提呈至限制性CD8+T细胞,促进杀伤性CD8+T细胞的形成。在硬骨鱼类的免疫系统中发     

鸡主要组织相容性复合体及其相关基因的研究进展

主要组织相容性复合体(MHC)是由紧密连锁的高度多态的基因座所组成的染色体上的一个遗传区域,是一个与免疫应答和抗病性密切相关的多基因家族。其编码产物是免疫系统中极为复杂且具多态性的一类细胞表面转膜蛋白,称为MHC抗原,分布在各种细胞的表面。目前已证实,与人类及动物的多种疾病之间存在着强相关。     

猪SLA基因多态性研究进展

猪的MHC也叫猪的白细胞抗原(SLA),不仅在抗原递呈、机体器官移植、免疫应答与调控方面有重要的作用,而且还与其他的生物学功能如抗病力、生长、繁殖等有关。文章主要论述猪SLA基因多态性研究进展,包括猪SLA基因结构和生物学功能、SLA-Ⅰ基因多态性研究、SLA-Ⅱ基因多态性研究,希望为今后的研究提供理论依据和参考。     

马的ACE基因多态性的探索与研究

提取马血的总DNA,参照Genbank中人、羊、兔的ACE基因中的16,17外显子序列,设计1对保守引物p1,应用PCR技术扩增出目的基因,将其克隆到PMD19-T载体中进行测序,并用DNAStar软件进行序列分析。结果显示,扩增出的目的基因长度为345bp,与人的ACE基因16～17外显子(11576～12060bp)序列同源性达到82.3%,证明扩增出的基因包括了马的ACE基因16内含子序列。再参照此序列,设计特异性引物p2,对5种马的ACE基因进行PCR扩增,与人的ACE基因多态性的位点进行分析比较。结果证明,马在此位点上不存在多态性。该试验为马ACE耐力基因多态性的继续研究提供了基础资料,为赛马的选材提供了理论依据。     

牦牛MDHⅠ基因多态性及其与生长性状的关联分析

本研究旨在探讨牦牛细胞质苹果酸脱氢酶（cytoplasmic malate dehydrogenase,MDHⅠ）基因的遗传多态性及其与生长性状的关联性,以期为牦牛优良性状选育提供参考依据。选取5个牦牛类群（共178头）,采集耳组织样提取DNA并构建DNA池,对MDHⅠ基因所有外显子设计特异性引物进行扩增测序,用Mega 5.2筛查SNPs位点,直接测序法鉴定其基因型,利用PopGene 32进行χ²独立性检测、基因纯合度（Ho）、基因杂合度（He）、有效等位基因频率（Ne）和多态信息含量（PIC）分析,利用SPSS 24.0分析MDHⅠ基因与牦牛生长性状间的关联性。结果表明,申扎牦牛、类乌齐牦牛、斯布牦牛、帕里牦牛和麦洼牦牛均在外显子8区域发现1个突变位点（G23093C）,属同义突变,有3种基因型：GC、CC和GG,5个牦牛类群中,GC基因型为优势基因型（类乌齐牦牛中GG为优势基因型）,G为优势等位基因（斯布牦牛除外）,在斯布牦牛中,G和C基因频率相等。χ²适应性检验表明,申扎牦牛、类乌齐牦牛、斯布牦牛、帕里牦牛和麦洼牦牛均符合Hardy-Weinberg平衡（P>0.05）。MDHⅠ基因在申扎牦牛、帕里牦牛和斯布牦牛中属于高度多态（PIC>0.5）,在麦洼牦牛和类乌齐牦牛中属于中度多态（0.25 < PIC < 0.5）;纯合度最高的是申扎牦牛和类乌齐牦牛。关联性分析结果表明,MDHⅠ基因不同基因型对类乌齐牦牛、帕里牦牛和麦洼牦牛体重有显著性影响（P<0.05）;且种间分析发现,MDHⅠ基因不同基因型对牦牛体重有显著性影响（P<0.05）,说明该基因可作为人工选育的分子标记。     

马DRD4基因部分序列的克隆及StyⅠ酶切多态性分析

采用限制性内切核酸酶Sty Ⅰ对蒙古马和纯血马DRD4基因第一内含子及部分第一、第二外显子的1760bp扩增产物进行了PCR-RFLP多态性分析,共检测到6种基因型,由D、E、F3个复等位基因控制;通过酶切图谱分析发现,蒙古马和纯血马的DRD4基因第一内含子及部分第一、第二外显子的第357位和第1717位碱基表现出多态性;并对基因型频率和等位基因频率进行了统计分析,结果表明:DRD4基因的部分基因型频率和等位基因频率在2个群体之间差异显著(P<0.05)或极显著(P<0.01);x2适合性检验结果表明纯血马DRD4基因此位点未达到Hardy-Weinberg平衡状态(P<0.01),而蒙古马达到平衡(P>0.05)。     

奶牛α1-抗胰蛋白酶及其基因多态性研究进展

α1-抗胰蛋白酶是一种多功能糖蛋白.奶牛α1-抗胰蛋白酶编码基因多态性很高,并对奶牛经济性状具有重要意义.本文主要综述了α1-抗胰蛋白酶及其编码基因在奶牛上的研究进展.     

奶牛α1-1抗胰蛋白酶及其基因多态性研究进展

α-抗胰蛋白酶是一种多功能糖蛋白。奶牛α1-抗胰蛋白酶编码基因多态性很高．并对奶牛经济性状具有重要意义。本文主要综述了α1-抗胰蛋白酶及其编码基因在奶牛上的研究进展。     

BoLA-DQB基因上游调控区多态性研究

通过PCR扩增和克隆测序,对BoLA DQB 基因上游调控区的多态性进行研究。对BoLA DQB 基因ex on2的14种等位基因上游调控区序列进行同源性比较,结果表明:每个DQB·exon2 等位基因均与2 种DQB URR相连锁,在14种BoLA DQB·exon2等位基因上游共检测到15种DQB URR序列。这些序列中均存在与基因表达调控有关的W box 、X box、Y box、CCAAT box以及类TATA box调控元件,且遵循严格的空间顺序。其中W box 、X box 、Y box及类TATA box是多态的,CCAAT box是保守的,在这些调控元件之间也存在多态座位。这些多态座位的存在有可能对结构基因的表达水平产生影响。     

苏紫猪SLA-1基因多态性及其抗病潜能分析

【目的】探究苏紫猪白细胞抗原-1(swine leukocyte antigen-1,SLA-1)基因多态性,并对其抗病潜能进行分析,以期为苏紫猪分子育种提供理论基础。【方法】以苏紫猪血细胞cDNA为模板,用PCR法扩增苏紫猪SLA-1基因并测序,利用DNAStar和Mega 5.0软件分别进行相似性分析及系统进化树构建;利用NetMHCpan 4.1 server分析SLA-1与非洲猪瘟病毒(African swine fever virus, ASFV)抗原表位结合的能力及特征;运用生物学软件对其编码蛋白的理化性质、亲/疏水性、跨膜区、结构和功能等进行预测。【结果】试验成功扩增6条苏紫猪SLA-1等位基因序列,分别为SLA-1*sz01、SLA-1*sz02、SLA-1*sz03、SLA-1*sz04、SLA-1*sz05和SLA-1*sz06,其高变异位点主要位于肽结合沟(peptide-binding groove, PBG)α1区和α2区;相似性比对结果显示,6条苏紫猪SLA-1等位基因核苷酸、氨基酸序列相似性分别在92.9%～96.9%、87.0%～94.8%之间,与不同品...     

奶牛乳腺炎抗性候选基因多态性研究进展

奶牛的乳腺炎是一种极其复杂的疾病,是影响奶牛产业发展的一个重要因素。对奶牛乳腺炎抗性的研究有助于选育出有高抗性的奶牛群体,提高奶产品的数量和质量,并且可以减少抗生素的使用。近年来,随着生物信息学、分子育种技术和基因组学的发展,为奶牛的乳腺炎抗病育种提供的新的前景。本文主要介绍了牛锌指蛋白313基因、前脑锌指蛋白基因、T...     

马eCG/LHβ亚基基因多态性研究

马绒毛膜促性腺激素(equine chorionic gonadotropin,eCG)是由妊娠期母马胎儿尿膜—绒毛膜细胞分泌的一种由α、β两个亚基组成的异源二聚体糖蛋白,具有FSH、LH的双重活性。采用PCR-SSCP和测序方法对28匹蒙古马和25匹纯血马的eCG/LHβ亚基基因的多态性进行研究,结果发现,在蒙古马eCG/LHβ亚基基因5′调控区存在一突变位点:G-415A分为AA、BB、AB 3种基因型,AA、BB、AB基因型频率分别为0.89、0.07、0.04;纯血马此基因中未检测到多态性。     

水牛FASN基因外显子37多态性及其生物信息学分析

[目的]脂肪酸合成酶(Fatty acid synthase,FASN)是影响哺乳动物脂肪酸合成的关键酶,但有关水牛FASN基因的群体遗传组成特征还不清楚。[方法]本研究采用PCR产物直接测序法和PCR-SSCP方法对88头河流型和122头沼泽型水牛、54头牦牛和40头大额牛FASN基因外显子37进行群体变异检测,并结合已发表的牛科物种序列进行生物信息学分析。[结果]结果表明,仅在水牛中发现2个SNP位点,为c.6363CT和c.6372CT,均为同义替换。河流型和沼泽型水牛共享这2个SNP位点,但它们在两类水牛中的群体遗传组成不同。确定水牛特有的核苷酸位点3个,即c.6183A,c.6255T和c.6394A,其中c.6394A导致水牛FASN蛋白第2132位氨基酸与其它牛科物种不同,在水牛中为M而其它牛科物种中为V;山羊特有的位点2个,为c.6189A和c.6267T。普通牛、山羊和绵羊中具有异义替换SNP位点,分别为1个、3个和7个。普通牛的异义替换SNP位点c.6365GA对蛋白质功能影响不显著(subPSEC-3);山羊的这些异义替换SNP位点c.6296TC、c.6301CT和c.6341TC对其蛋白质功能影响均有显著影响(subPSEC-3);绵羊7个异义替换SNP位点中的2个,即c.6286AC和c.6406AG对FASN功能有显著影响(subPSEC-3)。[结论]这些核苷酸差异引起的氨基酸差异可能引起不同牛科物种间FASN功能的差异。