基于网络药理学探讨芒果叶干预肌肉减少症的活性成分和分子机制

采用网络药理学和分子对接方法预测芒果叶活性成分及干预肌肉减少症的分子机制。芒果叶活性成分靶点来自中药系统药理学数据库和分析平台（TCMSP）数据库，肌肉减少症靶点来自GeneCards、DisGeNET数据库。蛋白相互作用（PPI）网络由Cytoscape生成，通过拓扑分析确定核心靶点。将核心靶点导入DAVID平台，用于GO和KEGG分析，应用Mcule在线平台进行分子对接。最终筛选出25个主要成分，确定7个核心靶点。关键通路涉及乙型肝炎、白细胞介素17等信号通路。分子对接结果表明芒果叶活性成分中槲皮素与丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1、基质金属蛋白酶9、肿瘤抑制基因P53及小窝蛋白-1均具有较好结合能力。应用网络药理学和分子对接方法分析预测可知芒果叶具有通过调节细胞凋亡和抗炎来抑制肌减少的潜力，为进一步药理试验和药物开发明确方向。     

基于反向分子对接的虫草素和三磷酸虫草素的生物活性

分别采用idTarget、Pharm Mapper在线反向分子对接软件预测虫草素和三磷酸虫草素的靶标蛋白(药效团匹配蛋白),用Ledock分子对接软件模拟虫草素、三磷酸虫草素与靶标蛋白的结合构象,用Lig Plus软件分析结合构象活性口袋内残基与配体的相互作用。反向分子对接结果表明:三磷酸虫草素与靶标蛋白的自由结合能比虫草素与靶标蛋白的自由结合能低。分子对接结果表明:与虫草素相比,三磷酸虫草素与靶标蛋白活性口袋内的氨基酸残基可形成更多的氢键,且三磷酸虫草素和靶标蛋白有较好的几何匹配,其自由结合能也较低,其结合构象更稳定。根据正向、反向分子对接结果,认为三磷酸虫草素是虫草素进入人体内发挥生物活性的主要物质。     

基于网络药理学探讨艾草抗鸡马立克病毒的活性成分与作用机制

运用网络药理学方法探讨艾草抗鸡马立克病毒（Marek’s disease virus,MDV）的活性成分、作用靶点及可能的作用机制。利用TCMSP数据库检索艾草化学成分和作用靶点,查阅文献收集MDV相关宿主基因靶点,建立靶点数据库;利用STRING数据库结合Cytoscape 3.8.0软件构建靶点蛋白相互作用网络及活性成分-关键靶点网络,筛选核心靶点和主要活性成分;利用DAVID数据库对关键靶点进行GO功能分析和KEGG通路富集分析;最后利用分子对接技术验证主要活性成分与关键靶点的结合能力。结果显示,从艾草中筛选出8种活性成分,共有108个基因靶点与MDV宿主基因存在相互作用,艾草抗MDV作用的主要靶点有JUN、CCND1、CDK1、IL-6等;GO功能分析涉及细胞活性、炎症反应等过程,KEGG富集分析涉及C型凝集素受体信号通路、MAPK信号通路、细胞衰老、p53信号通路、细胞凋亡、Toll样受体信号通路等;异泽兰黄素与靶点蛋白CCND1的对接能力最强。结果表明,艾草主要活性成分异泽兰黄素可能是通过作用于CCND1,干预细胞周期影响细胞活性,进而发挥抗MDV效应。     

甘草提取物的功效及其作用机制研究陈健敏(莆田学院药学与医学技术学院,药物分析与检验医学福建省高校重点实验室,福建莆田351100)

甘草提取物具有抗氧化和酪氨酸酶活性抑制作用,但目前尚未探清其功效的作用机制。以甘草提取物中的主要成分槲皮素、光甘草定、异甘草素、刺芒柄花素、甘草酸和甘草次酸为研究对象,采用ABTS自由基清除法、DPPH自由基清除法以及FRAP(铁离子还原能力)法测定这些成分的抗氧化能力;采用酪氨酸酶抑制试验测试酶抑制活性,并用Autodock软件研究这些成分与酪氨酸酶的相互作用。结果表明,甘草提取物中起抗氧化作用的主要是槲皮素、光甘草定和异甘草素,且抗氧化作用与酚羟基的数量成正相关;甘草提取物中起酪氨酸酶活性抑制作用的主要是光甘草定和槲皮素,光甘草定的抑制作用最强,分子对接研究表明其可能是通过影响酶活性中心的构象而产生抑制作用。研究结果为进一步有效地开发甘草资源提供了理论基础和数据支持。     

酸性条件下甘草苷及异甘草素提取工艺的优化

[目的]优化甘草苷及异甘草素的提取工艺。[方法]以2种甘草总黄酮提取物为原料,在酸性条件下用超声波提取甘草苷及异甘草素;采用正交设计优化2种成分的提取工艺;利用HPLC法检测其含量。[结果]原料Ⅱ是提取甘草苷及异甘草素的较优材料,甘草苷的最佳提取条件：酸浓度为0.5 mol/L,超声提取时间为1.5 h,提取温度为70℃,料液比为1∶20;异甘草素的最佳提取条件：酸浓度为2.0 mol/L,超声提取时间为1.5 h,提取温度为70℃,料液比为1∶10。[结论]该工艺简单、易行,重复性好,适合甘草苷及异甘草素的工业化提取。     

基于生物信息学及分子动力学探讨牛膝影响铁死亡治疗骨质疏松机制

通过生物信息学分析、分子对接及分子动力学来研究牛膝通过影响铁死亡治疗骨质疏松（Osteoporosis, OP）的潜在作用机制。在GEO数据库获取GSE56116、GSE2208和GSE7158共3个数据集，采用R软件进行差异分析得出OP潜在的发病基因。利用中药系统药理学技术平台（TCMSP）检索牛膝的成分和作用靶点，再通过FerrDb数据库获取铁死亡相关靶点与分析3个数据集所得的差异基因取交集得到关键治疗靶点。通过蛋白质印迹试验验证关键治疗靶点在对照组与OP患者血液中的差异表达情况，再对关键治疗靶点与牛膝的活性成分黄芩素进行分子对接及分子动力学模拟。本研究共筛选出关键靶基因1个（花生四烯酸-12-脂加氧酶，ALOX12）。蛋白质印迹试验结果显示ALOX12在OP中表达显著升高（P <0.05）。分子对接及分子动力学结果显示黄芩素能够与ALOX12紧密对接，通过氢键及疏水键形成稳定结构而发挥作用。牛膝可能通过作用于ALOX12影响铁死亡从而起到治疗OP作用。     

复方中药制剂对小鼠腹泻的治疗作用研究

为研究复方中药制剂对小鼠腹泻的治疗作用,采用番泻叶、蓖麻油和硫酸镁建立小鼠腹泻模型,观察药物组小鼠的一般状态及行为学改变,测定腹泻次数,并以炭末推进率为指标,计算单位长度肠推进率及胃残留率,评价复方中药制剂的抗腹泻作用。结果表明:复方制剂均可极显著降低番泻叶、蓖麻油和硫酸镁所致小鼠腹泻模型的腹泻次数(P 0.01),极显著降低番泻叶所致小鼠肠推进率(P 0.01),极显著增加小鼠胃残留率(P 0.01)。研究表明,研制的复方中药制剂可有效缓解番泻叶、蓖麻油和硫酸镁所致小鼠的腹泻。     

基于网络药理学探讨活血健骨方治疗骨质疏松的潜在作用机制

目的 基于网络药理学探讨活血健骨方治疗骨质疏松(OP)活性成分、作用靶点及分子机制.方法 通过文献查找活血健骨方有效成分,并借助有关数据库筛选活血健骨方与OP共同靶点,构建"药材-成分-靶点"网络,进行GO分析和KEGG通路富集分析,并用LEDOCK对关键成分与核心靶点进行分子对接.结果 获得活血健骨方有效成分61个,...     

基于UPLC-Q-TOF-MS与网络药理学的锦灯笼配方颗粒抗炎、抗肿瘤有效成分的研究

为探究锦灯笼配方颗粒抗炎、抗肿瘤有效成分及其作用机制,采用UPLC-Q-TOF-MS技术对锦灯笼配方颗粒进行成分分析;筛选锦灯笼配方颗粒抗炎、抗肿瘤作用对应的靶点,构建核心蛋白互作(PPI)网络和活性成分-靶点网络;对关键靶点进行GO和KEGG通路富集分析,采用AutoDock软件进行分子对接验证。结果表明：共鉴定出有机酸类、黄酮类、香豆素类和甾体类等化合物共36个。PPI分析发现TNF、AKT1、IL1β等为锦灯笼配方颗粒抗炎作用核心靶点,AKT1、EGFR、TNF等为抗肿瘤作用核心靶点,GO富集分析发现锦灯笼配方颗粒抗炎、抗肿瘤作用与急性病毒性心肌炎、癌症等信号通路相关。5个核心成分木犀草素、槲皮素、酸浆苦素G、阿魏酸、秦皮乙素与8个核心靶点具有较低的结合能。综上,基于超高效液相色谱-四极杆飞行时间串联质谱技术、网络药理学、分子对接技术初步阐述锦灯笼配方颗粒抗炎、抗肿瘤有效成分及作用机制,为锦灯笼配方颗粒药效物质基础研究奠定了试验基础,为其质量控制与临床应用提供了参考依据。     

基于网络药理学和分子对接的“当归-川芎”药对作用机制研究

研究"当归-川芎"药对的网络药理学机制,并用分子对接进行验证.通过检索数据库和文献,筛选出当归和川芎的活性成分及靶点,构建"成分-靶点"网络,得到关键靶点,分析其与FDA批准药物靶点的共同靶点,建立"共同靶点-疾病"网络.将关键靶点进行基因功能和KEGG通路分析,药对活性成分与关键靶点进行分子对接,共筛选出"当归-川芎"药对活性成分14个,对应257个靶点,分析"成分-靶点"网络得到54个关键靶点,与FDA批准药物靶点的共同靶点有34个,涉及113种疾病.关键靶点主要参与155个生物学过程、 29个细胞组分和66个分子功能,还参与了Pathways in cancer, Estrogen signaling pathway, Proteoglycans in cancer等58条信号通路.分子对接结果表明:6个活性成分与7个靶点对接成功.揭示了"当归-川芎"药对的主要活性成分、靶点、潜在治疗的疾病及作用机制,为其临床应用提供了参考.