用微卫星标记分析福建地方山羊品种及波尔山羊的遗传多样性

用OARAE101、OARFCB11、MCM218、MCM38、BMS2508、BM143、INRA063及MAF65等8个微卫星座位,对福清山羊、戴云山羊及波尔山羊11个群体350份样本进行遗传多样性检测.结果表明:(1)11群体共检测到69个等位基因,平均每个座位为8.60个,其中23个等位基因为11个群体所共有,4个等位基因为福建地方山羊所特有;(2)福清山羊、戴云山羊和波尔山羊总的有效等位基因数分别为5.33、4.58和4.80;(3)福清山羊的平均杂合度为0.7889,戴云山羊为0.7745,波尔山羊为0.7930;(4)福清山羊与戴云山羊Nei氏标准遗传距离为0.2415-0.3485,与波尔山羊为0.4552-0.5767,戴云山羊与波尔山羊为0.5845-0.7026.本结果表明福建地方山羊的遗传多样性丰富,具有较高的选择潜力.     

9个山羊品种微卫星DNA遗传多样性分析

为了研究湘东黑山羊、川东白山羊、云岭山羊、板角山羊、黄淮山羊、圭山山羊、贵州白山羊、安徽白山羊和波尔山羊9个山羊品种的遗传多样性,利用微卫星标记技术检测了4个微卫星座位（OarAE101、OarHH55、BM1329、BM143）的多态性。结果表明,9个山羊品种的4个微卫星座位中共检测到53个等位基因,9个山羊品种的期望杂合度（He）和观察杂合度（Ho）均在0.850以上,属于高杂合群体;9个山羊品种4个微卫星座位的PIC均值在0.820以上,属于高度多态微卫星DNA座位,可提供大量的遗传信息,具有遗传多样性评价优势,其中 PIC值最高的是圭山山羊（PIC=0.857）;主成分分析与UPGMA 聚类分析结果显示贵州白山羊、云岭山羊与圭山山羊亲缘关系较近,川东白山羊与板角山羊亲缘关系较近,湘东黑山羊、黄淮山羊与安徽白山羊亲缘关系较近,引入的波尔山羊自成一类,它与其他山羊亲缘关系较远。综上,9个山羊品种均具有较高的遗传多样性,其中圭山山羊的遗传多样性最丰富,贵州白山羊遗传多样性最低;各品种之间的亲缘关系符合不同品种的地理位置与育成史。     

7个绵羊微卫星DNA标记在绵(山)羊群体中的多态性检测

选择分别位于绵羊2,4,6,9,17和19号染色体上的7个微卫星标记OarFCB11,OarFCB128,MAF70,OarAE101,MAF33,OarFCB48和OarFCB304,对湖羊、同羊及长江三角洲白山羊的典型群随机样本相应位点进行了PCR检测。结果表明,每个微卫星座位发现7个以上等位基因,且均存在多态;湖羊、同羊、长江三角洲白山羊群体杂合度(H)分别为0.9092,0.9177和0.8867,相应的群体基因平均多态信息含量(PIC)分别为0.9024,0.9116和0.8774,有效等位基因数(Ne)分别为11.7723,12.4538和11.6104,均以同羊为最高;以产生有效条带为标志,随机样本的PCR扩增效率存在明显的群体间和座位间差异,以长江三角洲白山羊和OarFCB128座位为最高;以7个座位微卫星等位基因频率推算群体间标准遗传距离,山羊与绵羊群体间遗传距离远大于绵羊群体之间,湖羊、同羊间亲缘距离系数R为0.1998。研究结果提示:选择的7个微卫星DNA座位均为多态座位;以7个微卫星标记为测度,湖羊、同羊及长江三角洲白山羊具有丰富的遗传多态性;7个微卫星标记可进一步用于绵山羊近缘种间遗传分析研究。     

陇东绒山羊微卫星多态性及其与部分经济性状相关性的研究

为了在陇东绒山羊群体实施标记辅助选择,根据山羊遗传连锁图谱和相关文献资料,选用9个微卫星座位,8%非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳PCR扩增产物,对我国特有遗传资源50只陇东绒山羊基因组DNA的遗传多样性进行了检测,通过标记多态性与生产性状的最小二乘线性模型,进行了分子标记与经济性状的相关分析.结果表明:9个微卫星座位在陇东绒山羊群体中共检测到90个等位基因,平均每个座位的等位基因数为10个.其中微卫星座位LSCV24等位基因数最多,为14个,等位基因数最少的是DB6,只有6个;在所标记群体内平均多态信息含量为0.84±0.03,平均遗传杂合度为0.86±0.03.在9个基因座上发现与某些经济性状密切相关的标记效应(P＜0.05),同时在这些位点上找到各经济性状优势基因型以及对相应性状具有正效应或负效应的等位基因.     

乌珠穆沁羊遗传多样性与系统地位的研究

利用7个微卫星标记对乌珠穆沁羊、小尾寒羊、滩羊、湖羊、同羊、长江三角洲白山羊6个绵(山)羊群体进行了遗传多样性检测,结果显示:6个绵(山)羊群体共检测到224个等位基因,每个座位在每个群体都检测到7个以上等位基因;7个微卫星座位在6个群体中呈高度多态性,总群体杂合度为0.9499;6个群体PIC平均值在0.8452~0.9294之间。根据标准遗传距离和DA遗传距离用UPGMA方法分别对6个群体进行亲缘关系聚类,乌珠穆沁羊和小尾寒羊聚为一类,然后与滩羊聚为一类,湖羊和同羊较近聚为一类,五个绵羊品种最后与山羊相聚。研究结果提示:乌珠穆沁羊就血统而言归属与"蒙古羊"集团,这基本符合品种的育成过程,乌珠穆沁羊和小尾寒羊、滩羊、湖羊、同羊共同归属于"蒙古羊"集团。     

黄河中下游流域固有山羊亲缘系统的研究

以黄河中、下游流域９个,东北、西藏、长江流域７个地方山羊群休控制血液酶和其它蛋白质变异的１８个基因座位４３个等位基因的频率为基础,搜集国内外２２个群体的相同资料,构建、合成了描述群体间遗传相似性的模糊等价关系矩阵,对３８个群体进行亲缘关系聚类。研究表明：黄河中游流域是中亚以东南家山羊的驯养、传播中心之一。相对于这一广大区域的其它山羊群体而言,蒙古高原西训、青藏高原和黄河中游流域的固有山羊群体有相同     

江苏地方山羊不同地域群体间的遗传分化

在采用多座位电泳法检测江苏地方山羊群体结构基因座遗传变异的基础上,分析群体间的遗传分化水平并探讨了影响群体遗传分化的主要因素。结果显示,4个山羊群体间的遗传分化系数在0.0067~0.0368之间,平均仅为0.0177,说明群体间的遗传分化水平很低,遗传变异绝大部分存在于群体内;不同地域山羊群体的分布符合地理隔离模式,而且群体间的基因流十分通畅;亲缘关系的模糊聚类结果与已知的品种史也是吻合的。据此可认为,大而通畅的基因流是江苏4个地方山羊群体间遗传分化水平很低的主要原因,而生境异质性则是引起群体发生轻微遗传分化的原因。     

黄河中下游流域固有山羊亲缘系统的研究

 以黄河中、下游流域 9个 ,东北、西藏、长江流域 7个地方山羊群体控制血液酶和其它蛋白质变异的 1 8个基因座位 43个等位基因的频率为基础 ,搜集国内外 2 2个群体的相同资料 ,构建、合成了描述群体间遗传相似性的模糊等价关系矩阵 ,对 38个群体进行亲缘关系聚类。研究表明 :黄河中游流域是中亚以东南家山羊的驯养、传播中心之一。相对于这一广大区域的其它山羊群体而言 ,蒙古高原西部、青藏高原和黄河中游流域的固有山羊群体有相同的起源。黄河下游流域和中游流域的群体之间亲缘关系相对疏远。中亚以东南固有山羊群体可划分为“东亚”、“南亚”两大亲缘系统 ,东南亚各群体分别归属于这两大亲缘系统。     

云南屏边大围山微型鸡遗传多样性*

 云南屏边大围山微型鸡是我国具有独特遗传特性的、属于亚热带热带型早熟地方家禽品种。研究采用了33个家鸡特异性的微卫星标记对该鸡种自然群体中30个个体进行了多态性电泳检测,目的在于阐明其群体遗传变异和遗传结构状况。研究结果显示：33个微卫星座位共检测到65个等位基因,每个座位的等位基因数在1～3个之间,这些等位基因的频率大小在0.0333～1.000之间,平均每个座位的等位基因数为1.9697个,有效等位基因数在100～263个之间, 平均有效等位基因数为1.6846。群体平均杂合度（H）和群体平均多态信息含量（PIC）为0.1737和0.3279。结果表明,大围山微型鸡群体平均杂合度和群体平均多态信息含量较低,纯合度较高,未受到其它外来血液的混杂,是一个封闭的原始群体,具有较高的遗传一致性     

巴什拜羊微卫星标记多态性及其与生长指标关联性分析

【目的】以巴什拜羊为研究材料,通过分析微卫星DNA座位的基因型,并与生长性状进行相关分析,以寻找影响巴什拜羊生长性状的微卫星标记,为分子标记辅助选择提供依据。【方法】从GenBank数据库查询绵羊、山羊的微卫星座位,根据微卫星选择标准选择符合要求的10个微卫星标记,对巴什拜羊189个个体基因组DNA进行检测,采用最小二乘方法分析微卫星座位与生长指标的关联效应。【结果】10个微卫星标记共检测到110个等位基因,平均每个座位等位基因数为11个,平均多态信息含量为0.7914,平均杂合度为0.8149;10个微卫星座位中有8个微卫星座位与巴什拜羊体重、体尺等5项生长指标有显著和极显著的关联性,特别是基因座BM415与体重、体尺指标均呈极显著相关(P0.01),多重比较结果显示8个微卫星座位都存在优势基因型。【结论】发现了巴什拜羊群体生长指标具有显著效应,多态性较高的微卫星基因座,为开展巴什拜羊生长指标的分子标记辅助育种提供了有价值的遗传标记。     

长江三角洲白山羊保种群体的SSR遗传多样性分析

长江三角洲白山羊是皮、肉、毛兼优的地方山羊品种。通过微卫星标记（SSR）对长江三角洲白山羊保种群体进行遗传多样性分析,可为种质资源保护和品种改良提供数据支持。选取30个SSR标记,采用PCR扩增和毛细管电泳技术检测海门山羊、崇明白山羊和崇明地区杂交白山羊的遗传多样性。对各群体不同位点和各位点不同基因型进行分析。海门山羊、崇明白山羊和崇明地区杂交山羊群体中等位基因总数分别为205、191和147个,平均有效等位基因数（Ne）为4.012、3.812、3.092,平均期望杂合度（He）为0.683、0.668、0.617,平均观测杂合度（Ho）为0.726、0.691、0.633,平均多态信息含量（PIC）为0.647、0.630、0.567。三个群体的平均近交系数（Fis）为0.011 0,平均遗传分化系数（Fst）为0.050 7,平均基因流（Nm）为4.680 6。杂交山羊和崇明白山羊的遗传距离较近,和海门山羊遗传距离较远。系统进化树聚类分析表明,崇明白山羊与崇明杂交山羊聚为一类。两个纯种长江三角洲白山羊群体和杂交群体均表现出较高的杂合度、多态性和遗传变异;两个保种群体为中度遗传分化,近亲繁殖率低,存在基因交流,可用于种质资源的保存和利用。     

伏牛山区山羊遗传多样性和遗传资源评估

线粒体DNA遗传变异丰富,是研究群体遗传多样性重要手段.文章以伏牛山区伏牛白山羊、尧山白山羊和槐山羊3个地方山羊品种为研究对象,分析线粒体DNA D-loop区全序列遗传多态性,评估伏牛山区山羊遗传资源现状.遗传多态性研究结果表明,槐山羊(Hd=0.975,Pi=0.01092)与尧山白山羊(Hd=0.895,Pi=0...     

9个山羊群体乳上皮黏蛋白MUC1遗传多态性及群体聚类分析

采用SDS-PAGE法分析山羊乳MUC1遗传多态性。结果显示,9个山羊群体中,乳MUC1在SDS-PAGE上均呈现出丰富的遗传多态性,表现为1条或2条迁移率不同的区带,317个个体共检测到7个不同分子量的MUC1区带,分别代表A,B,C,D,E,F和G7个等位基因;共检测到17种基因型。山羊乳MUC1在群体内存在较大的基因杂合度,且基因频率和基因型频率在群体间存在一定的差异。根据乳MUC1基因频率可将9个山羊群体划分为两大类,该聚类结果与这些羊群体的外貌特征、已知的羊品种形成史以及所处的地缘位置基本一致。     

云南保种乳用圭山羊遗传多样性蛋白电泳研究

 采用水平式淀粉胶蛋白电泳技术,对路南保种乳用圭山羊33个个体的46个遗传座位的血液蛋白及同工酶的多态性进行了研究.结果发现AKP,LAP,CES-I,ESD,ME和Pa6个座位具多态性,多态座位的基因AKP⁰,LAP^A,CES-I¹,ME^B,ESD¹和Pa^A的基因频率较高;多态座位百分比P=0.1304,平均杂合度H=0.0501.在Tf座位,出现两种表型AA,AB,但多态性贫乏;LDH谱带中发现一种不同的类型.结果表明,该品种山羊与已检测的其它山羊比较,蛋白多态水平较高,遗传背景较丰富.     

中国绒山羊群体形态及生态特征的多元统计分析

应用主成分分析法,对我国6个绒山羊群体的22项数量指标进行了多元统计分析;并用构造的主成分值进行了系统聚类,结果在一定程度上揭示了这些绒山羊群体间的遗传分化。对22项数量指标的R型系统聚类结果显示,海拔和年降水量是影响绒山羊分布的重要指标。因此,在绒山羊品种分类中生态因子亦是一个相对重要的方面。     

江苏山羊品种细胞色素b基因(Cyt b)变异特点及其系统地位分析

测定了江苏山羊品种的细胞色素b基因全序列1 140 bp,并引用10个山羊品种(群体)细胞色素b基因全序列进行比较,分析碱基组成和变异情况以及核苷酸序列差异.以绵羊为外群,分别采用邻近法、最大简约法和最大似然法构建分子系统树,得到的拓扑结构一致,初步提示了江苏山羊品种的系统进化关系:长江三角洲白山羊和黄淮山羊的亲缘关系较近,可能来自同一个母系;它们与日本山羊可能在较早的世代具有共同的祖先.本研究结果也支持将东亚、南亚和东南亚固有山羊群体划分为"东亚"和"南亚"两大亲缘系统的观点.     

东亚4个黑山羊群体mtDNA D-环遗传多样性及其起源

为了研究地方山羊品种的起源与分化,了解其遗传背景,为山羊资源的合理利用提供基础资料,利用PCR产物直接测序法对3个中国黑山羊群体和1个韩国黑山羊群体共39个个体的mtDNAD-环部分序列进行了测定和分析。测定的序列经排列比对后选取441bp分析,发现了55个多态位点,单一多态位点11个,简约信息位点44个,确定了29种单倍型,单倍型多样度为0.984。构建系统发育树将29种单倍型分成了明显的3个分支,角猾羊聚入A分支。同时利用群体间的单倍型的错配分布和遗传距离分析了各群体的亲缘关系。结果表明:4个黑山羊群体遗传多样性丰富,至少拥有3个不同的母系起源,角猾羊是家山羊的一个母系祖先。     

黄淮山羊与长江三角洲白山羊遗传多样性研究

采用中心产区典型群随机抽样方法和多种电泳技术检测53只黄淮山羊、30只长江三角洲白山羊编码血液蛋白17个结构基因座上的变异,分析其遗传多样性。结果表明:黄淮山羊、长江三角洲白山羊结构基因座平均杂合度分别为0.0826和0.0899;平均多态信息含量分别为0.0699和0.0899;平均有效等位基因数分别为1.0000和1.1533。黄淮山羊与长江三角洲白山羊群体对于“东亚集团”的基因贴近度分别为0.8445、0.8981,对于“南亚集团”的基因贴近度分别为0.7440、0.8201,说明黄淮山羊群体与长江三角洲白山羊群体应属于“东亚山羊集团”。该研究结果符合山羊播迁的路线并与其地理分布相吻合。