猪肿瘤坏死因子α基因5'侧翼区域多态性分析

利用直接测序法研究猪肿瘤坏死因子α(Tumor necrosis factor,TNF-α)基因5'侧翼区域多态性,并作多态位点与仔猪腹泻和生长性状关联分析。发现在TNF-α基因5'侧翼区域存在6个SNPs位点,建立针对SNP:-1048T/C和SNP:-1016A/G的Hha ⅠPCR-RFLP和Taq Ⅰ PCR-RFLP分型技术。Hha ⅠPCR-RFLP研究发现,在民猪群体中存在TC和CC两种基因型,在长白猪群体中存在TT、TC和CC三种基因型。Taq Ⅰ PCR-RFLP研究发现,在民猪和长白猪群体中仅存在AG和GG两种基因型。性状关联分析结果表明,TC比CC基因型民猪具有较高的35日龄断奶重(P0.05)和日增重(P0.05);TT基因型长白猪腹泻指数高于TC基因型个体(P=0.06)和CC个体(P=0.06);TT基因型长白猪出生重显著高于TC和CC基因型长白猪(P0.05)。结果表明,猪TNF-α基因对仔猪腹泻和生长性状有一定影响,但HhaⅠ位点能否作为新遗传标记有待进一步研究。     

PPARγ2基因外显子1多态性对猪胴体性状的影响

利用PCR-SSCP技术,对约克夏、杜洛克、长白猪、金华猪、碧湖猪和嵊县花猪共6个品种258头猪的PPARγ2基因外显子1进行多态性分析,并采用SPSS程序中GLM模型分析该位点与胴体性状的相关性。研究结果发现编码区175 bp处存在A175G单核苷酸多态。国内外猪种的基因型频率间存在较大差异,在国外种猪中,AA基因型频率较高,国内猪种中AG基因型频率较高。相关性分析结果表明,在长白猪群中,PPARγ2基因与肩部背膘厚、腰荐结合部背膘厚均存在极显著相关性(P<0.01),与6/7th肋背膘厚和眼肌面积均存在显著相关性(P<0.05)。在金华猪群内,PPARγ2基因与肩部背膘厚显著相关(P<0.05)。因此推测PPARγ2基因可能是影响猪胴体性状的潜在分子育种标记。     

猪PPARGC1A基因的遗传变异检测及与胴体性状的关联分析

采用PCR-SSCP方法检测PPARGC1A基因第9外显子A1747C位点在通城猪及其杂交群体中的遗传变异,并分析其对胴体性状的影响.猪PPARGC1A基因第9外显子A1747C位点在通城猪(n=24)、瑞典长白猪(n=26)、英国大白猪(n=23)、长大通(n=43)、大长通(n=40)存在多态分布,在长白猪中只有AA基因型.基因型频率分析表明国外品种中CC基因型频率低于国内地方品种;性状关联分析结果表明:CC基因型个体的胸腰椎背膘厚、肩部背膘厚和三点平均背膘厚显著高于AA基因型个体,等位基因C是胸腰椎背膘厚和三点平均背膘厚的增效等位基因.     

猪TGFβ1和TGFβRⅠ基因多态性与产活仔数的关联分析

为探讨猪转化生长因子β1(TGFβ1)及其受体(TGFβRⅠ)基因多态性与大白猪和长白猪产活仔数的相关性。采用PCR-SSCP方法检测了TGFβ1第6内含子和TGFβRⅠ第7内含子中与猪繁殖力相关的2个突变位点在大白猪和长白猪(共计232头)中的单核苷酸多态性,同时分析多态位点基因型与大白猪和长白猪产活仔数的关联性。结果发现:TGFβ1基因第7外显子上游的第9位碱基存在C→T突变,在大白猪和长白猪中均检出CC和TT 2种基因型,且不同基因型对2猪种产活仔数的影响差异不显著(P0.05);TGFβRⅠ基因第7内含子第808位碱基存在A→G突变,在大白猪中检出AA、AG、GG 3种基因型,长白猪中未检出GG基因型,大白猪中GG型母猪产活仔数极显著高于AA型(P0.01),长白猪中,AA型和AG型产活仔数的影响差异不显著(P0.05)。研究结果表明,TGFβ1基因的突变位点对大白猪和长白猪的产活仔数没有显著影响,TGFβRⅠ基因多态位点与母猪产活仔数显著相关,可作为猪分子遗传育种的候选基因,加快猪育种进程。     

LIF基因与长白母猪繁殖性状的关联分析

猪繁殖性状遗传力低,表型选择基本无效。因此,近年来研究遗传标记与猪繁殖性状的相互关系成为人们探索的热点。研究表明,血病抑制因子(LIF)具有促进附植前胚胎发育的功能,是胚胎正常附植必须的生长因子。检测了长白猪LIF基因外显子3中C>T突变的基因型,分析了该基因与长白猪繁殖性状的相关关系。结果表明,AA和AB基因型母猪的产仔数接近,均显著或极显著高于BB基因型。     

IGF2基因多态性检测与生长性状相关性分析

采集395头核心群的种猪耳样,采用PCR-SNaPshot方法检测长白猪和大白猪胰岛素样生长因子2(IGF2)基因内含子3的位点多态性,并分析各基因型与生长性状的相关性.结果表明,长白和大白猪中均存在3种基因型,大白猪3种基因型分布为:AA＞GA＞GG,长白猪3种基因型分布为:GA ＞AA＞GG.大白和长白猪的A等位基...     

猪繁殖性状候选基因多态性与产仔数的关联分析

利用本课题组已报道的猪繁殖性状候选基因的8个SSCP-SNPs标记,对995头长白猪和大白猪群体的遗传多样性进行分析,统计了各群体内SNP的多态信息含量(PIC)、有效等位基因数(E)和遗传杂合度(h)。通过比较各SNP位点基因型关联的总产仔数(TNB)和产活仔数(NBA),找到了各猪群中的优势和劣势基因型。结果表明:8个SNP位点在2个猪群中的多态信息含量有3个为中度多态,5个为高度多态。IL-8基因C424G位点的AA基因型为2个猪群的最优势基因型,VEGF基因C1489T位点的AB型和IL-8基因Intron1 977A位点的AB型分别为长白猪和大白猪的最劣势基因型,3个多态位点的基因型都可在猪的分子育种中进行标记辅助选择。     

秦川牛 OLR1基因多态性与肉质性状的关联分析

采用PCR-RFLP的方法对230头秦川肉牛基因组的氧化型低密度脂蛋白受体1(OLR1)基因进行研究,并对其基因型与部分肉质性状进行关联分析。结果发现,OLR1基因存在g.10497C>A突变,该突变位点能够被PstI限制性酶识别。群体中共存在3种基因型,分别命名为AA、AC和CC,基因型频率分别为0.287、0.217和0.496。等位基因A和C的基因频率分别为0.396和0.604。χ2检验表明,该基因座处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05)。关联分析结果表明,CC基因型的眼肌面积显著高于AA基因型(P<0.05);同样,CC基因型与高眼肌深度相关(P<0.05)。而AC基因型与AA和CC基因型之间没有显著差异(P>0.05);在背膘厚和肌间脂肪含量这2个性状上,3种基因型之间差异不显著(P>0.05)。     

NCOA-1基因型对长白猪繁殖性能的影响

利用PCR-RFLP技术,检测101头长白猪NCOA-1基因多态性,并分析其与繁殖性状的关系。结果表明,NCOA-1基因AA、AB、BB基因型频率分别为0.500、0.335、0.165;NCOA-1基因中BB型在窝产仔数和窝产仔活数、初生窝重和断奶窝重与AA型、AB型有显著性差异(P0.05)。     

FSH-β和PRLR基因多态性对长白猪繁殖性能的影响

[目的]调查麟和FSH-β基因与长白猪繁殖性状的关系。[方法]采用PCR—RFLP技术分析了长白猪FSH-β基因和PRLR基因的多态性及其与繁殖性状的相关性。[结果]FSH-β基因3个基因型从、AB、BB在长白猪中的频率分别为0．035、0．075、0．890;PRLR基因3个基因型AA、AB、BB在长白猪中的频率分别为0．154、0．585、0．251。FSH-β基因对长白母猪的各项繁殖性状影响不显著;PRLR基因对长白母猪的总产仔数、产活仔数、初生窝重和断奶窝重影响显著,并呈现出AB〉AA〉BB的趋势。[结论]该研究为PRLR和FSH-β2个基因的应用提供基础数据。     

猪ADAMTS-1基因对繁殖性状的遗传效应分析(英文)

The nucleotide sequences in exon 7 of a disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs-1(ADAMTS-1)gene in Landrace pig were obtained with cloning and sequencing by using PCR-RFLP technique in this experiment.Sequence alignment results showed that the C/G substitution in exon 7 induced amino acid change(Arg → Pro).AA,BB and AB genotypes were found in Landrace pig by PvuⅡ-RFLP.Correlation analysis between genotypes and reproductive traits indicated that ADAMTS-1 was significantly correlated with litter size(LS)and number born alive(NBA).     

猪ADAMTS-1基因对繁殖性状的遗传效应分析(英文)

The nucleotide sequences in exon 7 of a disintegrin and metalloproteinase with thrombospondin motifs-1(ADAMTS-1)gene in Landrace pig were obtained with cloning and sequencing by using PCR-RFLP technique in this experiment.Sequence alignment results showed that the C/G substitution in exon 7 induced amino acid change(Arg → Pro).AA,BB and AB genotypes were found in Landrace pig by PvuⅡ-RFLP.Correlation analysis between genotypes and reproductive traits indicated that ADAMTS-1 was significantly correlated with litter size(LS)and number born alive(NBA).     

Polymorphism Analysis on Partial Sequence of Pig Obese Gene of Different Breeds by PCR-SSCP

Obese gene (ob gene) was identified in mouse adi- pose tissues in 1954, and it has an autosomal reces- sive genetic pattern[1]. Mouse ob gene is located on chromosome 6, whose mutation will lead to seriously genetic fatness. Human ob gene is mapped on q31…     

山东地方猪种与引进猪种EDG4基因多态性分析

为了探讨内皮分化基因4(endothelial differentiation gene 4,EDG4)的生物学功能,利用PCR-RFLP技术研究EDG4基因外显子2在7个猪群中的多态性分布规律.结果表明,仅在鲁莱猪和大约克猪群体中检测到TT、TC和CC 3种基因型,在莱芜猪、里岔猪、沂蒙猪和杜洛克猪群体中检测到TC和CC 2种基因型,在长白猪只检测到CC1种基因型;在7个猪群体中C均为优势等位基因,CC为优势基因型.x2检验结果表明,基因型分布在里岔猪、莱芜猪、沂蒙猪、鲁莱猪、长白猪和杜洛克群均达到了哈代-温伯格平衡(P＞0.05);不同基因型在群体间的分布差异极显著.群体遗传特性结果表明,有效等位基因数在1.000～1.5127之间.7个猪种的多态信息含量(PIC)介于0.0000～0.2815之间,其中鲁莱猪PIC大于0.25,为中度多态;其余品种PIC值低于0.25,为低度多态.     

猪品种间HSL基因外显子IPCR—RFLP的研究

激素敏感脂肪酶（Hormone-sensitve lipase,HSL)是负责分解脂肪组织中甘油三酯释放游离脂肪酸关键酶。本研究利用PCR－RFLP(polymerase chain reaction-resiction fragment length polymorphism)方法，分析了猪HSL基因外显子I区多态性，发现不同品种猪间存在多态性。瘦肉型大白猪和长白猪全部表现为GG基因型；杜洛克猪表现为AG和GG两种基因型，其等位基因A和G的频率是15％和85％；脂肪型通城猪和清平猪表现为AA和AG两种基因型，其等侠基因A、G的频率分别是91．67％、8．33％和89．83％、10．17％。     

猪EGR2基因外显子2变异位点分析

早期生长反应因子2(EGR2,Krox20)能够参与脂肪代谢并具有可以结合靶基因启动子富含GC序列的3个锌指的转录极早期转录调控因子。EGR2能够调控CCAAT增强子结合蛋白Beta(C/EBPβ)、类Krupple因子5(KLF5)、过氧化物酶体增殖物激活受体Gamma(PPARγ)的表达来参与对脂肪代谢的影响。对EGR2基因外显子2进行克隆测序,获得1247bp序列,并利用PCR-SSCP方法对其进行分子扫描,寻找多态位点,分析不同基因型在不同猪种间的分布规律。χ2独立性检验表明,野猪、民猪、大白猪、杜洛克、长白猪间不同基因型的分布存在着极其显著的差异(P<0.01)。     

Study on the Polymorphisms of Porcine Myostatin Gene in Promoter Region by PCR-RFLPS

In order to further study functions of the porcine myostatin gene, we analyzed the polymorphisms of porcine myostatin gene in promoter region among different breeds including Yorkshire, Landrace, Duroc, Junmu, Min pig and Sanjiang white pig by PCR-RFLPs. The allele T dominated in the imported lean-type pig breeds such as Yorkshire, Landrace and Duroc. No allele A was detected in Junmu and Sanjiang white pig, and the frequencies of three genotypes were about equal in Min pig. The result using X^2 analysis showed that the distribution of three genotypes was related to pig breeds.     

猪H-FABP基因内含子1的一个遗传多态性及其遗传效应分析

[目的]为H-FABP基因运用于猪育种过程中的标记辅助选择提供基础资料。[方法]应用PCR-SSCP方法分析H-FABP基因在山西白猪、马身猪、大白猪、长白猪和杜洛克猪5个猪种的多态性,并研究基因型与肌内脂肪含量的相关性。[结果]在猪H-FABP基因内含子1扩增的片段上发现了一个多态性,检测到2个等位基因（A、B）、3种基因型（AA、AB、BB）,并对纯合子进行测序,发现SSCP的变异是由碱基C→T的替换造成的。基因型在不同猪种分布的多重比较表明,马身猪与山西白猪、长白猪、大白猪、杜洛克猪间基因型分布差异极显著（P〈0.01）,其他纯种猪群间基因型分布差异不显著（P〉0.05）。固定效应模型分析表明,肌内脂肪含量基因型间差异极显著（P〈0.01）。最小二乘分析表明,BB基因型个体与AA基因型个体比较肌内脂肪含量差异显著（P〈0.05）。[结论]H-FABP基因对猪肉品质存在一定的影响。