3个不同地理群体真鲷遗传变异的RAPD分析

随机扩增多态DNA(random amplified polymorphic DNA,RAPD)是建立在PCR技术基础上的检测DNA序列多态性和建立分子遗传标记的技术,Williams等[1]首次运用随机引物扩增寻找多态DNA片段作为分子遗传标记.Welsh等[2]也发现以寡核苷酸作为引物对基因组DNA进行扩增,产物的图谱表现出高度的变异性.因其具有操作简单、能够快速高效地提供许多个体或基因型许多位点的DNA序列多态性数据等优点,在生物的遗传多样性、群体遗传学、分类学及农牧业的遗传育种等研究中得到了广泛的应用.     

长石爬鮡3个地理群体遗传多样性的RAPD分析

采用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对李仙江流域景东、国庆和大寨长石爬鮡(Euchiloglanis longus)种群的遗传多样性进行了分析.从100条RAPD随机引物中筛选出20条引物,对长石爬鮡3个地理种群进行了分析;共检测到58个有效位点,其中多态位点36个,多态位点达62.07％,Nei基因多样性指数为0.2378,Shannon信息指数为0.3501.3个群体未检测到各自特有的扩增带.AMOVA分析结果显示,大多数(73.06％)的遗传变异由群体内不同个体间的遗传差异造成,26.94％的遗传变异来自于群体间.种群间的遗传分化系数(Gst)为0.2104,基因流Nm为1.8762.根据个体间遗传距离进行的PCoA分析显示,3个群体基本分开.     

应用RAPD技术分析雅砻江5种裂腹鱼类的亲缘关系

利用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对雅砻江流域的2属5种(亚种)裂腹鱼类的亲缘关系进行了初步分析.采用筛选确定的20个扩增效果好的引物进行扩增,检测出214个位点.遗传距离和用UPG-MA法聚类得到的聚类图反映的5种裂腹鱼类的亲缘关系,与形态学分类方法所得结果基本一致.说明RAPD技术可有效用于这几种裂腹鱼类亲缘关系的研究.     

RAPD技术及其在虾、蟹类研究中的应用

RAPD技术即随机扩增多态DNA (RandomAmplifiedPolymorphicDNA)技术 ,是由美国科学家Williams等〔1〕和Welsh等〔2〕两个研究小组在聚合酶链式反应 (PolyineraseChainReaction ,PCR)技术的基础上发展起来的 ,它是一种用于检测基因组DNA多态性和基因组遗传标记的方法。目前已被广泛应用于系统发育研究、动植物种类鉴定、基因图谱构建、种群的遗传分析、人类基因组研究等领域〔3〕。我国的虾、蟹增养殖已有相当长的历史 ,但虾类的增养殖 ,其品种选育还刚刚起步 ,“野捕家养”的种苗供给系统和近亲交配加剧了虾类的种质退化和优良性状…     

斑鳢Channa.maculata(♀)×乌鳢C.argus(♂)杂交子代及其亲本的遗传关系分析与鉴定

应用RAPD技术研究闽香鳢及其亲本之间在遗传结构、种群多样性上的相互关系,由此为探讨种质鉴定提供依据.在所用的90个随机引物中,有35个引物在闽香鳢及其亲本之间呈现多态.通过RAPD分析,获取了闽香鳢及其亲本的RAPD指纹图带.结果表明闽香鳢与斑鳢或乌鳢的遗传距离要比其父母本之间的遗传距离近,即闽香鳢为父母本杂交所产生的后代.闽香鳢种群的多态性比例47.9％与杂合度H=0.122,可作为闽香鳢遗传育种的指标来检测后代的群体遗传多样性.通过多态性比较,获得2条具有群体差异性的DNA片断,大小分别为910 bp和1 011 bp,经过测序后合成特异性引物,此引物可特异性区分上述3种鱼.     

长江口刀鲚遗传多样性的随机扩增多态DNA(RAPD)分析

用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对长江口刀鲚(Coilia ectenes)30个个体的遗传多样性进行了检测,从40个随机引物中筛选出17个对每个刀鲚的DNA进行扩增,结果表明,17个引物共检测到148条清晰且重复性好的条带,分子量在200～2000bp之间,其中多态位点为86个,占58．11％;群体的Shannon多样性指数为0．1905,Nei基因多样性指数为0．2280;个体间最大遗传距离为0.212,最小遗传距离为0．092。通过与其他鱼类的遗传多样性的研究结果比较可初步判断,刀鲚群体的遗传多样性比较丰富。     

广东沿海3个斜带石斑鱼养殖群体的RAPD和线粒体Cyt b基因序列变异分析

斜带石斑鱼（Epinephelus coioides）为中国南方重要的海水增养殖经济鱼类,但过度捕捞和人工养殖的快速扩张导致了其自然资源衰退和遗传多样性降低。文章采用随机扩增多态DNA（RAPD）和线粒体细胞色素b（Cyt b）基因序列分析方法,对惠州、深圳和湛江3个斜带石斑鱼养殖群体进行了遗传多样性状况和遗传差异的研究。结果表明：1）相比较于线粒体Cyt b基因序列分析,RAPD技术在研究斜带石斑鱼种内遗传变异方面具有更高的灵敏性和多态性;2）相比较于其他已经报道的石斑鱼类,斜带石斑鱼的遗传多样性较低,RAPD检测到的多态位点百分率（P）为40.57%,究其原因,可能是受过度捕捞和人工养殖的影响;3）RAPD检测到的群体间遗传相似度（Ⅰ）高达0.967 1～0.980 8,而Cyt b的核苷酸多样性仅为0.003 8;斜带石斑鱼养殖群体间的遗传差异显然很小,具有相似的遗传背景。文章还探讨了斜带石斑鱼线粒体Cyt b基因的特点,并针对目前斜带石斑鱼的养殖现状提出了相应保护遗传多样性的对策与建议。     

RAPD技术在水产动物种质资源研究中的应用

对水产动物的种质资源进行鉴定和评价 ,其方法主要是从形态学、经济性状、同工酶、线粒体DNA和核 DNA等几方面分析。对 DNA的研究以前主要测量 DNA的含量和分子量的大小 ,现在已深入到 DNA序列的测定和功能基因的标记等层次。 RAPD技术目前已被广泛应用。　　一、RAPD技术的原理　　随机扩增多态性 DNA(Random AmplifiedPolymorphic DNA,简称 RAPD)技术由 Williams等 (1 990 )首先运用 ,它是建立在聚合酶链反应 (Polyinerase Chain Reaction,PCR )技术基础上的一种检测基因组 DNA多态性、基因组遗传标记的方法。其原理是…     

用同工酶和RAPD技术分析黑斑口虾蛄的遗传多样性

采用同工酶技术和RAPD技术对宁波黑斑口虾蛄的遗传多样性进行了分析,采用聚丙烯酰胺凝胶电泳方法(PAGE)对LDH、MDH、MEP、EST、ADH、GDH、GLDH、AMY、POD、SDH等10种同工酶进行了群体生化遗传分析,共检测了29个基因座,其中11个基因座表现为多态,其多态位点比例为37.93%,平均杂合度为0.1470;采用RAPD技术对其遗传多样性进行检测,用24个随机引物共检测出129个位点,其中多态位点为102个,占79.06%,个体间遗传相似系数为0.3106,遗传变异度为0.6894,表明黑斑口虾蛄的遗传多样性状况良好。     

银鲳4个地理种群遗传多样性的初步研究

采用随机扩增多态DNA(RAPD)技术对取自海南(HN)、浙江(ZJ)、江苏(JS)、河北(HB)等近海海域的4个地理群体银鲳进行遗传多样性分析。从20个随机引物中筛选出10个,利用POPGEN Version 1.31软件对多态位点比例和遗传距离进行统计分析。共检测出总位点数56个,其中多态位点有39个,多态位点比例为69.64%。4个海域银鲳群体的Shannon多样性指数分别为0.123 2~0.158 7,Ne i基因多样性指数分别为0.077 6~0.100 4。JS群体与HN群体的遗传距离最远,为0.321 6;JS群体与HB群体的遗传距离最近,为0.231 6。结果表明,RAPD技术具有较高的灵敏性和多态性,是分析评估银鲳遗传多样性较为适宜的分子标记之一;JS群体保持着最高的遗传多样性,而HN群体多态性比例最低、ZJ群体Shannon多样性指数最低,应采取一些有效的保护措施,以避免HN群体遗传多样性的进一步丧失。