梭鱼养殖群体与自然群体的遗传结构研究

[目的]掌握渤海地区梭鱼种群的种质资源状况。[方法]应用随机扩增多态DNA(RAPD)技术,对梭鱼养殖群体与自然群体的遗传多样性进行了分析。[结果]从45个随机引物中选出20个扩增效果稳定的引物进行群体分析。其中,梭鱼自然群体共检出了204个扩增位点,多态位点136个,多态位点比例为66.7%;养殖群体中共检出了217个扩增位点,多态位点130个,多态位点比例为59.9%。[结论]目前梭鱼群体的遗传多样性较为丰富,人工养殖还未对其造成明显的影响。     

野生银杏资源群体遗传多样性的RAPD分析

用随机扩增多态DNA（RAPD）技术对浙江西天目山、贵州务川、湖北大洪山区、重庆金佛山区和福建武夷山区等5个群体150个银杏Ginkgo biloba个体进行了遗传多样性分析。12个寡核苷酸引物共检测到194个位点,多态位点130个,多态位点百分率66．67％。用PopGen 32软件对数据进行了分析,结果显示：Nei’s基因多样性指数（h）的群体水平是0．4317,Shannon信息指数（I）的群体水平是0．6211,基因分化系数（Gst）是0．2882。Shannon信息指数（I）分析揭示的银杏群体遗传分化水平[（Isp-Ipop）／Isp]=0．1903,AMOVA分析结果得出银杏群体间的分化占36．7％。RAPD数据显示．5个银杏群体遗传多样性较高,其中浙江西天目山、贵州务川和湖北大洪山区有可能是野生银杏冰川期避难所。图4表5参22     

西江野生鲮与养殖群体的遗传分析

利用部分鲤科鱼类中具多态位点的74对微卫星引物对鲮基因组DNA进行筛选扩增,其中11对引物可稳定扩增且有较高的多态性,占总引物数的14.86%,并利用筛选的引物对西江段3个野生鲮群体(深色群体、浅色群体、西江群体)和1个养殖群体进行遗传多样性分析.结果显示:11个引物扩增得到等位基因数为4～23个,大小为100～374 bp,平均多态信息含量为0.749 8,不同群体的观测杂合度为0.510 5～0.627 3,期望杂合度为0.712 0～0.765 6,深色群体、浅色群体、西江群体和养殖群体的Nei氏基因多样度分别为0.745 1±0.388 4,0.763 2±0.396 8,0.708 1±0.371 2,0.739 2±0.385 2,野生群体与养殖群体相比,杂合度和遗传多样性水平基本一致.运用Genetix 软件计算得到4个群体间的基因分化系数为0.026 8～0.070 3.AMOVA分析表明群体间的变异占总变异的6.96%,群体内个体间的变异占93.04%,固定系数为0.069 64,群体间具有一定程度的分化,但分化主要表现在野生群体和养殖群体之间,而野生群体之间的分化不明显.     

泥鳅与大鳞副泥鳅群体RAPD分析

用从１００种随机引物中筛选出的４种引物对自然群体中的泥鳅,大鳞副泥鳅进行了ＲＡＰＤ分析,结果表明：４种引物（Ｓ２９,Ｓ９６,Ｓ９７,Ｓ９９）分析得到泥鳅种教员人遗传的纯度分别为０．５４４９,０．４９４６,０５９２６,０．６４２０,大鳞副泥鳅遗传纯度分别为０．４４９,０．４３０４,０．５１５９,０．５２４;两者间遗传距离依闪为０．５３８５,０．５７１４,０．５０２４,０．５２６６;泥鳅特征带１．０ｋ     

槟榔江水牛群体遗传结构的RAPD分析

 为探讨RAPD标记在水牛遗传多样性方面检测的应用价值，以及了解槟榔江水牛的群体遗传结构状况，研究采用随机扩增多态性DNA标记技术对槟榔江水牛20个个体进行了遗传变异分析，从70个随机引物中筛选出15个多态性丰富的引物对其所有个体的总基因组DNA进行了PCR扩增，结果15条引物共产生105种扩增片段，多态片段95条，平均每条引物的扩增带数为7，各引物多态性片段范围在2～12之间，多态频率在40%～100%之间，多态座位平均为90.48%。表明槟榔江水牛的遗传多样性较丰富。     

克氏原螯虾4个地理群体遗传差异的RAPD分析

[目的]对克氏原螯虾4个地理群体的遗传多样性状况进行调查,为克氏原螯虾遗传育种、资源保护和利用提供一定的理论依据。[方法]应用RAPD技术对怀远县（HY）、盱眙县（XY）、潜江市（QJ）、升金湖（SJH）4个地理群体的克氏原螯虾各30个个体进行了遗传多样性分析。[结果]在优化的反应条件下,所挑选的上海生工200个随机引物中,共有20个引物扩增出清晰稳定的片段。遗传距离显示克氏原螯虾群体间有一定遗传分化,其中怀远群体和潜江群体之间的遗传距离最大（0.3333）,潜江群体和升金湖群体之间的遗传距离最小（0.2203）。怀远群体内的遗传相似系数最高（0.9187）,盱眙最低（0.8900）。[结论]淮河水系的怀远群体和盱眙群体聚为一支,长江水系的潜江群体和升金湖群体聚为一支。     

卵形鲳鲹养殖群体与野生群体遗传多样性的AFLP分析

利用AFLP技术对北部湾卵形鲳鲹野生群体和养殖群体进行遗传多样性分析和比较,可为卵形鲳鲹种质优化提供基础依据.研究采用10对引物组合在2个群体中共扩增出513个位点,其中多态位点数为133个,占总位点数的25.93％,两个群体平均多态位点比率为23.59％和18.32％,遗传多样性相对贫乏.养殖群体中低频位点明显减少而隐性纯合基因位点显著增加表明养殖群体丢失了低频基因.群体遗传结构分析表明,两群体间的遗传距离比较小,群体遗传结构相似.     

青蟹野生与养殖群体遗传多样性的微卫星分析

利用微卫星分子标记对青蟹东海三门湾野生群体和浙江三门养殖群体的遗传多样性进行分析。6个微卫星位点在2个青蟹群体中共检测到66个等位基因,多态信息含量为0.746 ～ 0.895,均表现为高度多态性,可有效应用于青蟹遗传多样性的研究。青蟹野生群体与养殖群体的等位基因数分别为4 ～ 18,6 ～ 14,平均杂合度分别为0.577,0.561,平均多态信息含量分别为0.779,0.828;群体间遗传分化指数FST值为0.0317,遗传相似性指数为0.7930,遗传距离为0.2319。结果表明,青蟹野生与养殖群体的遗传多样性均较丰富,群体间存在一定的遗传分化。     

黄山松群体遗传多样性分析

利用RAPD分子标记分析了黄山松 1 0个家系的遗传多样性。从 2 0 6个随机引物 (组 )中筛选出 1 7个引物 ,获得 38个多态位点。Shannon多样性指数平均为 4 5 2 5 1 ,Shannon多样性值范围在 0 0 1 0 2～ 0 0 5 0 4。家系 (余姚×文石 )遗传多样性水平最高 ,其Shannon多样性指数为7 965 8。根据这 38个多态位点计算遗传距离 ,进行聚类分析。在遗传距离 0 42处可将 1 0个家系聚类分成 3组。图 2表 3参 1 3     

基因组位点对引物的竞争效应

采用RAPD标记研究黄瓜属 (CucumisL .)正反杂交及不同倍性杂种的差异 ,发现在筛选的 76条引物中 ,有 2 1条(占 2 7 6 % )发生亲本条带的缺失。从缺失的位点数来看 ,亲本酸黄瓜 (C .hystrixChakr.2n =2 4 )在杂种中缺失的比例为 5 1%～ 6 9% ,亲本栽培黄瓜 (C .sativusL . 2n =14 )为 5 7%～ 9 8%。所有杂种扩增出的条带数要远小于理论值 ,这可能是由于两种基因组间位点对引物的竞争所致。正反杂交对扩增也有较大影响 ,其中 11条引物 (占 14 5 % )在正反杂种间存在较大差异 ,部分引物条带呈“父性”扩增的规律 ,但这部分条带仍是核基因组上的位点。通过对总基因组DNA和叶绿体DNA扩增结果的深入研究 ,表明核基因组DNA和叶绿体DNA之间亦存在位点对引物的竞争效应。     

随机扩增多态DNA(RAPD)技术及其在农业上的应用(综述)

随机扩增多态DNA技术是近年发展起来的一种DNA多态性检测技术。它以一系列不同的随机排列碱基顺序的寡核苷酸单链(通常是十聚体)为引物,对所研究的基因组DNA进行单引物扩增。扩增DNA片段的多态性反映了基因组相应区域的DNA多态性。RAPD技术可以在对物种没有任何分子生物学研究的情况下,对其进行DNA多态性分析,同RFLP及DNA指纹图谱法等其他DNA多态性检测技术相比,RAPD具有检测效率高、样品用量少、灵敏度高和检测容易的优点。RAPD技术已广泛的应用于农作物和畜禽品种及品系的遗传纯度的测定、品种和品系的鉴定、品种和品系遗传关系的确定、基因的定位和分离以及构建基因图谱等方面的研究。     

WHBE兔遗传特异性的RAPD分析

应用随机扩增多态DNA技术(RAPD)对WHBE兔、日本大耳白兔和新西兰兔进行了遗传分析.用10个随机引物对其基因组DNA进行PCR扩增.根据电泳结果选用其中8个引物扩增的条带进行遗传分析,共检测到107条扩增片段,其中多态性片段32条,占29.91%,反映了家兔品系间的遗传变异.多态性统计分析表明,WHBE免和日本大耳白兔的遗传相似度最高,为0.7948.其中4个引物既可扩增出3个品系共同的DNA条带,也可扩增出不同品系的特征条带,表明WHBE兔与日本大耳白兔和新西兰兔之间有遗传的相似性,也存在遗传差异.这些结果表明应用RAPD技术可以很好地检测家兔不同品系间以及同一品系不同个体间的亲缘关系.     

甘草素在翘嘴鳜细菌性败血症疫苗中的佐剂效果

从甘草中提取的甘草素（Ｇｌｙ）添加在翘嘴鳜细菌性败血症２种疫苗中的佐剂,即福尔马林知嗜水气单胞菌（ＦＫＣ）菌体脂多糖（ＬＰＳ）中,经添加Ｇｌｙ的疫苗接种后,受免翘嘴鳜头肾中白细胞的吞噬活性和经活菌改毒后的免疫保护率显高于本活加Ｇｌｙ疫苗的免疫组（ｔ测验,Ｐ〈０．０５）,表明了Ｇｌｙ具有佐剂效果,但是受兔鱼的凝集抗体效价和补体活性在全部受兔鱼中则没有明显差别（ｔ检测,Ｐ〉０．０５）。     

福建若干荔枝古树资源的RAPD分析

利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,从104个十聚体随机引物筛选出13个引物对福建荔枝著名的古树以及相关品种等12份材料的基因组DNA进行扩增,共得到78条扩增谱带,其中2条为共同带,多态性程度达97.44%,平均每条引物扩增的谱带数目为6条.采用遗传标记计算遗传资源相似性系数,进行聚类分析,并构建树状分析图.结果表明:现在栽培的陈紫品种与宋家香的亲缘很近,可能来源于宋家香;而元红与西禅寺“宋荔”亲缘关系较远.应用RAPD技术为荔枝古树遗传资源的鉴定和分类提供了新的途径.     

棕包梨的RAPD分析

通过建立梨RAPD反应的优化体系对棕包梨和其他梨品种进行聚类分析,探讨了它们之间的亲缘关系.结果表明:西洋梨(Pyrus communis L.)与东方梨[(砂梨(P.pyrifdia Burn)和白梨(P.bretschneideri Rehd)]品种之间亲缘关系较远;而砂梨与白梨品种之间亲缘关系较近;棕包梨与砂梨、日本梨品种之间的亲缘关系较远;而棕包梨与蜜雪梨间的亲缘关系很近,而蜜雪梨为我国台湾横山梨和日本水晶梨的杂交品种.表明我国台湾的横山梨和福建的棕包梨可能是同一品种类型.     

利用RAPD技术对蜜桃种质资源的分析

利用RAPD技术，采用从200个10碱基随机引物筛选的22个引物对14个蜜桃品种的基因组DNA进行扩增，通过扩增180个位点的谱带的聚类，分析供试蜜桃的系统发育，将供试的蜜桃品种分为3组；并运用特殊谱带，建立了蜜桃的分子检索表，提出了特殊保存的蜜桃种质有秋蜜，太原水蜜，深州红蜜和温州水蜜。     

翘嘴鳜和翘嘴红鲌血细胞DNA含量测定

以翘嘴鳜(Siniperca chuatsi)和翘嘴红鲌(Erythroculter ilishaeformis)的血细胞为材料,以鸡血细胞为DNA标准(2.5 pg/2C),利用流式细胞仪(Beckman Coulter Quanta SC)分别采用内标法和外标法测定其细胞核DNA含量。结果表明,翘嘴鳜和翘嘴红鲌的血细胞DNA含量分别为鸡血细胞的0.69倍和0.87倍,换算成绝对含量分别为1.74 pg/2C和2.18 pg/2C。     

外源DNA导入技术及其RAPD分析的研究进展

根据近年来植物外源DNA导入技术在我国农业分子育种上所取得的研究成果，对植物外源DNA导入技术所使用的方法、应用研究的领域和所取得的进展进行了详细的分析，并结合现代分子生物学技术在农业分子育种上的应用从分子水平上对外源DNA导入技术的可行性进行了讨论。     

汉江上游鲫鱼RAPD遗传多样性研究

采用RAPD技术从26个随机引物中筛选出8个引物对汉江上游汉中段野生鲫鱼群体的遗传多样性进行研究,结果共检测出512个位点,其中多态位点347个,其多态位点比例(P)为67.77%;利用POPGEN软件获得汉江上游汉中段野生鲫鱼群体11个个体间的遗传距离,个体间遗传距离(D)在0.008 6~0.535 0,个体间遗传相似系数(S)在0.585 6~0.991 5,Shannon遗传多样性指数(H0)为0.652 5。试验表明,汉江上游汉中段野生鲫鱼群体仍保持着较丰富的遗传多样性,应加以保护。