基于DNA宏条形码的莼菜大田土壤真菌多样性研究

高通量测序与DNA条形码结合产生的DNA宏条形码技术(DNA-Metabarcoding),能快速鉴定混合样本中的物种,现已成为检测群类物种多样性和丰富度的常用方法.本试验采用这一方法分析了莼菜大田不同种植年限土壤真菌多样性,结果表明:10年生土壤中含有最多的真菌种类,多样性及丰富度最高;在属水平上表现为蛙粪霉属、裂梗霉属、酵母属等占优势;群类组成分析显示,种植年限的变化对土壤真菌群落组成有一定的影响;聚类分析中10年与15年生莼菜土壤物种多样性相似度较高.     

DNA条形码技术及其在海洋贝类分类中研究进展

海洋贝类种类繁多,传统的形态学鉴定方法很多时候已无法准确区分各物种。新兴的DNA条形码技术能够利用物种的DNA序列在较短时间内完成对物种的有效鉴定,弥补传统方法的不足。目前,基于线粒体细胞色素c氧化酶Ⅰ基因的DNA条形码在动物物种鉴定方面已获得较为广泛的认可,同时研究人员们也在积极开发适用于植物、真菌等物种的DNA条形码序列。本文综述了DNA条形码技术在常见海洋贝类分类中的研究进展,分析了DNA条形码技术的可行性、优势与局限,并对其发展前景进行了展望,以期为日后DNA条形码技术更广泛的运用提供理论依据。     

基于细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ序列的DNA微条形码技术鉴别11种生鲜肉制品掺假的研究

建立并优化了基于细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome C oxidase subunitⅠ, COⅠ)序列的DNA微条形码(DNA mini-barcoding)技术,以检测生鲜肉制品中11种常见肉类的掺假情况。样品经真空冷冻干燥处理、提取DNA后,采用通用引物进行聚合酶链式反应(polymerase chain reaction, PCR)扩增,目标条带扩增产物经切胶、回收、纯化后,进行克隆测序,并将测序结果提交到GenBank数据库(http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi)中进行Blast比对,筛选出适合猪肉、牛肉、羊肉、鸡肉、鸭肉、鸽子肉、马肉、驴肉、鹅肉、兔肉、鼠肉等11种肉类扩增的通用引物COⅠ-A,并对PCR扩增条件进行优化,建立18个掺假模型,以对低经济价值肉类的最低掺入比例进行考察验证。结果表明:11种肉类的PCR扩增效率均为100%。在这18个掺假模型中,牛肉和羊肉中掺入6种低经济价值肉类(猪肉、鸡肉、鸭肉、马肉、驴肉、鼠肉)的最低检出比例均为5%,而在鹅肉、鸽子肉和兔肉中其最低检出比例为10%。本方法前处理简单,灵敏度高,重现性好,可作为高经济价值生鲜肉制品中掺假低经济价值肉类的有效检测方法。     

畜禽禁养政策下我国肉类供给反应——基于产品异质性的实证分析

利用2000—2017年猪肉、禽肉、牛肉和羊肉主产省份产量、价格等面板数据和Nerlove模型,估计并对比了各种肉类的短期和长期供给弹性;研究了畜禽禁养政策对不同肉类供给的影响及差异。结果表明:1)猪肉、禽肉、牛肉和羊肉短期内供给均缺乏弹性,长期内供给均富有弹性;2)4种肉类中,禽肉短期供给弹性最大,其次为猪肉,牛肉短期供给弹性最小;3)猪肉、禽肉、牛肉和羊肉并不互为供给替代品,即某一种肉类产品产量直接受其他肉类价格变化影响不显著;4)猪肉、禽肉和牛肉供给均受畜禽禁养政策影响显著,其中禽肉供给受畜禽禁养政策影响最大,猪肉次之,牛肉最小,而羊肉产量受畜禽禁养政策影响不显著。在研究结论的基础上,提出政策建议:长期内制定扶持政策促进畜牧业生产,短期内加强畜禽生产监测;当肉类价格发生变化时,针对不同肉类采取不同稳定供给措施;完善畜禽禁养政策,实现保环境与保供给双赢。     

世界和主要肉类生产国的生产结构分析

2000～2009年,全球的禽肉产量增长最快。10年增长34.9%,年均递增3.4%,增速高于肉类的总体增长速度（年均递增2.2%）和作为第1肉类品种——猪肉（年均递增1.9%）的增长速度。与上个10年相比,猪肉、禽肉等肉类产量增速放缓,而牛肉和羊肉增速提高。中国和德国肉类生产结构中以猪肉为主,而美国和日本以禽肉为主,澳大利亚以牛肉为主,巴西以禽肉和牛肉为主（禽肉生产量从2002年超过牛肉成为巴西第1大肉类生产品种）。与德国相比,中国肉类结构中猪肉和牛肉比重均低于德国,而禽肉和羊肉比重高于德国。与世界肉类生产结构相比,中国禽肉和牛肉比重均低于世界平均水平,羊肉略高于世界平均水平,而猪肉比重高于世界平均水平26.3个百分点。     

植物DNA条形码鉴定研究进展

DNA条形码技术是近几年迅速发展的一种基于分子水平的物种鉴定技术,基本原理是根据不同物种间特定基因片段的序列差异,利用生物信息学技术对物种进行快速分类和鉴定,在植物的物种鉴定中已有较广泛的应用。本文从植物DNA条形码鉴定的步骤、DNA条形码在植物鉴定中的研究进展方面进行综述,并提出DNA条形码技术在植物中应用的一些展望。     

DNA条形码在水生动物物种鉴定中的应用

水生动物是一类主要生活于水中的动物类群,其具有种类多样、分布广泛、复杂难辨等特点,但是对于水产动物的物种鉴定长期以来一直困扰着相关方面的专家和学者.随着DNA条形码技术的提出,其已被成功地应用于水生动物的物种鉴定.整理总结了国内外使用DNA条形码在水生动物物种鉴定中的应用.     

牛肉及其中式加工品中猪肉成分的定性、定量检测方法研究

【目的】建立牛肉及中式加工品中猪肉成分的定性、定量检测方法,保障牛肉产品的纯正性。【方法】提取猪肉及不同加工猪肉制品中的猪基因组DNA,通过DNA质量检测,PCR扩增,灵敏度试验,分析加工方式对猪DNA质量、灵敏度和检测限的影响;制备生牛肉和经干、蒸、煮、炖、煎、炸、烤制处理的牛肉制品中掺入不同比例(10%、5%、1%、0.1%)猪肉的二元混合肉,进行普通PCR和荧光定量PCR定性定量检测,探索DNA在掺假鉴别中的应用。【结果】不同加工方式下猪DNA质量检测结果显示,不同加工方式显著影响DNA纯度(P0.05),生猪肉及7种猪肉制品中DNA纯度(A260nm/A280nm)范围为1.893—1.977,高于理论值1.8;DNA含量范围为110—277μg·g-1,经加工处理的猪肉制品的DNA含量显著高于生猪肉处理组(P0.05);琼脂糖电泳结果发现,放置6个月后生猪肉和7种肉制品的DNA严重降解,但生猪肉依然能获得一些不清晰的长片段DNA,而7种肉制品的猪DNA全部降解为小片段DNA,说明长时间放置和热处理明显影响了猪DNA的完整性;猪肉制品中DNA的降解虽然严重,经普通PCR扩增线粒体基因,所有样品的PCR产物均呈现为清晰且单一的条带,可见从加工肉制品中提取的DNA可以开展灵敏度试验和掺假检测试验;灵敏度试验结果显示普通PCR是高度敏感的,经10倍梯度稀释,8个试验组样品中提取的猪DNA最低检测限均为0.005 ng;荧光定量PCR扩增猪DNA所得Ct值形成的标准曲线也具有良好的线性关系,其标准曲线斜率处在-3.1—-3.7,决定系数R2值均大于0.99,PCR扩增效率处在89%—100%,且定量PCR最低能够检测出0.005 ng的猪DNA。掺假样品定性定量PCR检测结果显示,除炸制混合肉(为1%)外,混合生肉及其他6种混合肉制品的定性检测试验最低检测限均为0.1%,说明普通PCR可检测微量的猪肉成分;混合肉的定量试验中根据不同掺假比例所建立的8个试验组标准曲线的决定系数R20.99,斜率为-3.1—-3.6,各曲线均具有良好的线性关系,可以实现牛肉中猪肉成分的定量检测;对比生肉与肉制品的定量结果,混合生肉与混合肉制品的标准曲线的截距之间存在约0.01—0.6个循环数的差异。【结论】不同加工处理能够显著影响肉中DNA的含量、纯度和完整性,但不影响肉制品中DNA的检测限和灵敏度,普通PCR和定量PCR均可以检测到极微含量的掺假肉成分。可见,基于PCR技术的检测方法灵敏度高、速度快、特异性强,定量检测标准曲线有较高的线性相关性和扩增效率,可为肉类行业质量控制和检验计划以及验证标签声明提供可靠的依据,可应用于一些商业样品,以保证肉制品的纯正性。     

猪肉价格变动对其他畜禽肉类价格的影响

探讨猪肉价格变动对鸡肉、羊肉和牛肉价格的影响,结果发现,猪肉价格变动会影响其他3种肉类价格的变化,鸡肉和羊肉反之也一样,但牛肉价格变化不会对猪肉价格产生影响;猪肉价格对其他肉类价格的连续正向冲击会使其他肉类价格呈阶梯式上涨趋势;猪肉价格变化对鸡肉、羊肉和牛肉价格冲击持续时间分别在10个月、24个月和14个月左右,对3者价格变动的贡献度分别在18.20%、6.40%和4.15%左右;受猪肉价格变动影响,畜禽肉类价格之间会呈现"肉-肉价格螺旋"上涨趋势。     

常见肉类食品加工技术探讨

就常见肉类加工技术进行概述,包括猪肉、牛肉、羊肉、鸡肉、鱼肉等肉类的加工,以为食品加工企业或个人提供参考。     

菌物DNA条形码技术的研究进展

DNA条形码技术是通过对一个DNA片段的分析比对,进而对物种进行鉴定的方法。研究的基因片段可以是1个或多个,进而完成物种识别和鉴定或者发现新物种。该项技术的优势在于整个鉴定过程不受研究对象不同发育阶段的影响。由于菌物具有独特而复杂的生活史,因此对菌物的鉴定工作相对较困难。世界上许多科学家都尝试过寻找适合于大多数菌物的标准DNA条码,但还没有找到能满足条件的基因片段。笔者对DNA条形码技术的发展历史、目的基因片段的筛选和研究进展等方面进行了综述,并讨论了DNA条形码技术存在的问题和今后研究的方向。     

DNA条形码技术在病原真菌分类鉴定中的应用

病原真菌是一种具有致病性的真菌,对植物有极大的危害。DNA条形码技术是通过对足够变异、短、能够作为标准目的基因的DNA序列进行分析,并进一步对未知物种进行快速、高效地分类和鉴定或者发现新物种的一项新技术。在介绍DNA条形码技术概况的基础上,对DNA条形码技术在病原真菌分类鉴定中的应用前景进行展望,以推进我国病原真菌DNA条形码在相关研究和应用领域的发展。     

DNA条形码技术在生物分类学中的应用前景

DNA条形码(DNA barcoding)技术作为近年来发展起来的一门物种鉴定的新兴技术,已引起越来越多的关注。这一技术的主要目的是鉴定已知物种和发现的新物种。DNA条形码提供了可信息化的分类学标准和更加敏感的分子差别模式,相对于传统生物鉴定的优势在于可以揭示隐存种,鉴定缺少形态数据或形态不易区分的种类,为物种鉴定提供简单有效的工具。综述了DNA条形码技术的产生、发展和基本原理以及在生物分类学中的应用及存在的问题。     

我国猪肉及其主要替代品价格波动的关联性

选取2009年1月至2018年12月的猪肉、牛肉、羊肉和活鸡的集贸市场月度价格数据,运用格兰杰因果关系检验、VAR模型和脉冲响应等方法,分析我国猪肉及其主要替代品价格波动的关联性.结果表明:(1)研究期间我国牛肉价格与羊肉价格的上涨幅度较大,猪肉价格波动最为剧烈,而鸡肉价格的波动曲线则更为平缓.(2)从传导机制上看,猪肉市场价格更易受牛肉市场价格波动的影响,牛肉价格和羊肉价格互为彼此价格波动的重要影响因素,而鸡肉价格与猪肉价格之间的关联性相对较弱.(3)牛肉价格对其他3种肉类价格的溢出效应最为明显,随后依次为猪肉、羊肉和鸡肉价格.建议加强保供稳价宏观调控、建立肉类价格预警机制、保障肉类市场供给稳定.     

DNA条形码技术在真菌上的研究与应用

DNA条形码技术通过标准化的小片段DNA序列对物种进行快速鉴定分析,在动植物和微生物分类鉴定中得到广泛应用,而在真菌鉴定研究中相对滞后.综述了DNA条形码的起源、发展及其在真菌研究中的应用,并探讨分析了DNA条形码技术存在的问题以及未来的发展.     

DNA条形码技术在海马物种鉴定中的应用分析

海马具有重要的药用和观赏价值，但因其可供鉴定的形态特征较少，应用形态学对海马进行种水平的鉴定时经常会遇到很多困难。DNA条形码技术为海马物种鉴定提供了重要的鉴定方法。通过检索生命条形码数据库（BOLD）和GenBank数据库中海马的DNA条形码信息，应用MEGA软件计算海马种间遗传距离，分析DNA条形码在海马物种鉴定中的应用效果。结果表明，COI基因条码可以有效鉴别大部分种以上阶元的海马，但对亲缘关系较近的海马难以获得准确的鉴定结果。还有一些海马尚无相关的基因信息，也无法通过基因条形码进行鉴别。因此，应用DNA条形码鉴定海马物种尚有一定的局限性。     

基于区域和知识差异的大城市居民肉类消费分析——以北京市为例

基于2016年北京市多辖区内实地调研,运用计量模型对城镇居民肉类消费区域及知识差异等影响因素进行实证分析。结果表明,北京市城镇居民肉类消费区域差异显著,东城区人均肉类消费量最高,海淀区最低;城镇居民肉类及猪肉、牛肉消费总量具有区域差异;户主的年龄、收入水平、教育水平、家庭常住人口数和家中学生人口数分别对不同辖区的肉类消费有显著影响。     

牛肉、鸡肉和猪肉价格波动的关联性分析——基于2006—2021年全国数据的VAR模型分析

基于2006—2021年全国相关数据,以鸡肉价格和猪肉价格为自变量、牛肉价格为因变量,应用Eviews 8.0软件,建立向量自回归（VAR）模型,对牛肉、鸡肉、猪肉之间的价格关联性变化进行量化分析。结果显示：猪肉与牛肉价格存在长期协整关系,猪肉价格对牛肉价格波动有长期显著正向影响;鸡肉价格对猪肉价格波动有长期正影响;牛肉价格对鸡肉价格波动影响大于对猪肉价格,牛肉价格对鸡肉价格的贡献度基本稳定在44%,明显大于牛肉价格对猪肉价格最高贡献度21%。为此,应深化牲畜行业供给侧改革,加强良种培育,引导饲料转型升级,转变发展理念;建立畜禽肉类市场价格监测机制,加强畜禽肉类产品生产和市场动态跟踪监测,加强政府和企业对畜禽疫病突发性事件的监测和防控;加强宏观调控和政策支持产业发展,加强政府宏观调控,鼓励产业发展,为企业和养殖户做好服务。     

2013年前3季度国际畜产品市场分析及展望

2013年前3季度国际畜产品市场不同肉类产品差别较大,禽肉、猪肉和牛肉产品价格小幅上涨,羊肉价格下降。不同国家畜产品价格走势也不同,美国猪肉、禽肉和羊肉价格先涨后跌,牛肉价格先跌后涨;欧盟猪肉价格先跌后涨,禽肉价格总体处于涨势,牛羊肉价格先涨后跌;日本牛肉和猪肉价格总体上涨,巴西活牛和鸡肉价格先跌后涨。受主要肉类消费市场猪肉产量增加影响,主要猪肉出口市场出口量下降。受产量预增影响,预计玉米价格将维持弱势,饲料成本下降,2013年第4季度猪肉和禽肉价格缺乏上涨支撑。     

美国家畜营销业的主要法案

美国的家畜营销业直接或间接地受到许多法案的影响,包括联邦法案和各州的法案。而且,随着人们价值观的不断变化和技术、经济条件的改变,各项法案的内容也随之发生变化。本文试图对美国联邦一级影响家畜营销业的主要法案作一简介。一、影响家畜营销业的主要联邦法案肉类检验法（ＭｅａｔＩｎｓｐｅｃｔｉｏｎＡｃｔ）１９世纪末,美国的牛肉和猪肉出口受到了抵制,主要原因是病牛导致的牛肉品质下降和猪肉引发了旋毛虫病。越来越多的国家严格限制从美国进口牛肉和猪肉。因此肉类生产者和包装商提出了对肉类进行检验的要求。１８９０年,国会通过…