动物双歧杆菌基因组的研究进展

动物双歧杆菌是一种常用的益生双歧杆菌菌株,常以益生菌的形式添加到乳制品和其他食品中。该研究就动物双歧杆菌基因组的最新研究进展、重要功能基因和比较基因组进行了综述,以期进一步推广应用该菌株。     

生长猪胃肠道乳酸菌、双歧杆菌和大肠杆菌的数量和分布规律

本研究采用严格的厌氧微生物培养方法，对5头生长猪进行了测定。结果表明，在生长猪的胃肠道内容物中和粘膜上均有相当数量的乳酸菌、双歧杆菌和大肠杆菌分布，但乳酸菌的数量显著高于其他2种菌（P＜0．01）。3类菌在内容物中的分布为：乳酸菌在猪后肠内容物中的数量分布显著高于胃和小肠（P＜0．01）；双歧杆菌在盲肠内容物中数量最高（P＜0．01）；而盲肠和结构内容物中大肠杆菌的数量分布大于其他部位（P＜0．01）。粘膜的分布为：乳酸菌在结肠，双歧杆菌和大肠杆菌在盲肠粘膜上的数量分布显著高于其他各区段（P＜0．05）。猪胃肠道各区段中，除直肠内容物中双歧杆菌的数量显著高于大肠杆菌外（P＜0．01），其他各区段中2种菌的数量统计差异不显著（P＞0．05）；结肠和直肠粘膜上双歧杆菌的数量显著高于大肠杆菌（P＜0．05）。     

嗜酸乳杆菌和婴儿双歧杆菌对肠道致病菌的抑制性

通过实验菌株发酵液对三种肠道致病菌生长抑制的研究 ,得出嗜酸乳杆菌 PB1、A878和婴儿双歧杆菌 PBa对致病菌的抑制性较强 ,形成明显的抑菌圈。 PB1、A878、PBa的抑菌机理主要是有机酸 ,其他抗菌类物质作用不明显     

双歧杆菌对脾虚小鼠肠道菌群的影响

使昆明小白鼠致脾虚,用双歧杆菌纯制剂治疗后,检测结肠内容物和粪便的肠杆菌、肠球菌、双歧杆菌和乳酸杆菌数量的变化,并结肠进行组织学检查。结果显示:小鼠脾虚后肠杆菌、肠球菌数量明显增多(P<0.05),双歧杆菌、乳酸杆菌数量大量减少(P<0.01);用双歧杆菌纯制剂治疗6d～12d后,肠杆菌、肠球菌数量减少(P<0.05),双歧杆菌、乳酸杆菌大量增多(P<0.01);治疗组结肠组织学观察显示,肠壁肌层厚度增加,杯状细胞数量增多,肠黏膜微绒毛排列紊乱显著改善。     

动物双歧杆菌AD011表面脂蛋白的全基因组预测和功能分析

[目的]运用生物信息学方法预测动物双歧杆菌AD011定位于细胞膜的表面脂蛋白,为后续研究该菌与宿主相互作用的分子机制提供基础资料。[方法]用Signal P 4.0和Lipo P软件对动物双歧杆菌AD011全基因组编码蛋白中表面脂蛋白和信号肽进行预测,同时采用COG功能数据库对预测的脂蛋白进行功能注释和聚类分析。[结果]对动物双歧杆菌AD011基因组1 518个蛋白的表面脂蛋白预测,结果表明,19个蛋白具有脂蛋白信号肽。功能分析显示,该菌株19个脂蛋白中有3个蛋白没有功能注释,16个蛋白有功能注释,其中10个蛋白参与氨基酸代谢与转运、3个蛋白参与碳水化合物代谢与转运,3个蛋白参与无机盐离子代谢与转运。[结论]动物双歧杆菌AD011表面脂蛋白参与的功能主要与营养物质的转运和代谢有关。     

双歧杆菌BB12菌株Sec分泌途径及底物蛋白分析

[目的]采用生物信息学方法分析双歧杆菌BB12菌株的Sec途径分泌系统及预测底物蛋白。[方法]以双歧杆菌BB12菌株基因组注释的蛋白氨基酸序列为研究对象,在NCBI中以Fasta形式下载,采用一系列生物信息学软件分析该基因组中Sec分泌途径及底物蛋白行使的功能,同时采用COG功能数据库对这些蛋白进行功能注释和聚类分析。[结果]通过分析发现双歧杆菌BB12菌株Sec分泌途径相关的蛋白基因共有9个,其中5个是Sec分泌途径构建蛋白基因,2个信号肽酶识别基因,1个脂蛋白信号肽识别基因和1个信号肽识别蛋白编码基因。Sec底物蛋白分析发现该菌共含1 583个蛋白,经过Sec分泌途径到细胞外的蛋白有57个,35个具有COG功能,占61%,其中被Spase Ⅰ型信号肽酶识别的有37个,被SpaseⅡ型信号肽酶识别的有20个。[结论]COG功能注释显示一些蛋白没有功能,有功能的蛋白主要与氨基酸运输和代谢、碳水化合物的运输和代谢、功能细胞壁/膜和无机离子运输和代谢功能有关。     

双歧杆菌在仔猪肠道的粘附特性研究

用扫描电镜观察了１０株猪源双歧杆菌对仔猪不同肠段的粘附情况。结果表明：不同双歧杆菌菌株对肠道的粘附情况差异较大,其中有４株双歧杆菌粘附性较好,有粘附特性的以杆菌粘附能力与所作用肠段有关;异物可增增双歧杆菌的粘附;观察到１株未见报道的形态变异菌,杆状菌体上有多突起。     

双歧杆菌在仔猪肠道的粘附特性研究

用扫描电镜观察了 1 0株猪源双歧杆菌对仔猪小肠不同肠段的粘附情况。结果表明 :不同双歧杆菌菌株对肠道的粘附情况差异较大 ,其中有 4株双歧杆菌粘附性较好 ;有粘附特性的双歧杆菌粘附能力与所作用肠段有关 ;异物可增强双歧杆菌的粘附 ;观察到 1株未见报道的形态变异菌 ,杆状菌体上有多突起     

动物双歧杆菌AD011暴露外表面蛋白的种类和功能分析

[目的]分析动物双歧杆菌AD011暴露外表面蛋白的种类和功能,有助于了解该菌株的各项生理功能以及为探讨该菌与宿主相互作用的分子机制奠定基础。[方法]以动物双歧杆菌AD011基因组序列为研究对象,采用Inmembrane方法和COG功能数据库对预测的外表面蛋白进行功能注释和聚类分析。[结果]AD011菌体暴露外表面蛋白数目为193个,包括11个细胞壁蛋白、20个脂蛋白、暴露外表面的膜蛋白140个、22个细胞外蛋白。AD011外表面蛋白的功能分析结果显示,193个外表面蛋白中,含有较大比例的蛋白没有功能注释(78个),115个蛋白具有COG功能注释。在有功能注释的蛋白中,所占比例较大的是氨基酸转运与代谢(16个),无机离子转运与代谢(14个),细胞壁、细胞膜生物合成(13个),碳水化合物转运与代谢(10个),防御机制(10个)等有关蛋白。[结论]AD011菌体外表面蛋白与营养物质的吸收和转运,细胞壁、细胞膜生物合成,防御机制有关。     

双歧杆菌的保健功能及其产品研发

就双歧杆菌的分布、生物学特性、功效及双歧杆菌制品的开发应用前景进行了综述。     

双歧杆菌对正常小白鼠免疫调节及肠道菌群的影响

应用动物实验方法,研究婴儿双歧杆菌和长双歧杆菌对正常小白鼠免疫功能的调节作用以及对肠道菌群的影响。结果发现,两株菌对正常小白鼠体重、脾/体重和肾/体重比无显著性影响;对肝/体重比有增加趋势;能显著增加血液中IgA,IgG,C3,C4,IL-2,IL-6和IL-8的含量(P<0.05),婴儿双歧杆菌效果优于长双歧杆菌;婴儿双歧杆菌可极显著增加IgM的含量(P<0.01)。两株菌均可显著增加双歧杆菌(P<0.05)和乳杆菌的数量,显著降低肠杆菌的数量(P<0.05)。实验结果表明,两株菌对正常BALB/C小白鼠的免疫功能具有一定的正相调节作用,并具有良好调节肠道菌群能力,婴儿双歧杆菌效果优于长双歧杆菌。     

动物双歧杆菌AD011细胞壁蛋白的预测和功能分析

[目的]运用生物信息学方法预测动物双歧杆菌AD011锚定于细胞壁的蛋白并进行功能分析,为后续研究该菌与宿主相互作用的分子机制提供基础资料。[方法]用Phobius和SignalP 4.0软件对动物双歧杆菌AD011全基因组编码蛋白中细胞壁蛋白进行预测,同时采用COG(Cluster of Orthologous Groups of proteins)功能数据库对预测的细胞壁蛋白进行功能注释和聚类分析。[结果]动物双歧杆菌AD011基因组1 518个编码蛋白中,11个蛋白含有细胞壁的锚定基序,6个蛋白含有LP×TG基序,1个蛋白含有Lys M基序,1个蛋白含有PG结合区域,2个蛋白含有SLH结构域,1个蛋白含有NLPC_P60结构域。细胞壁蛋白功能分析结果显示,11个细胞壁蛋白中,9个蛋白没有功能注释,2个蛋白(NLP/P60 protein和1,4-beta-N-acetylmuramidase)参与细胞壁和细胞膜的生物合成。[结论]动物双歧杆菌AD011大多数细胞壁蛋白功能未知,还需在以后的研究中进行进一步的功能注释。     

不同磷肥分配方式的施用效果及其后效研究

在黄棕壤上等量磷肥以不同分配方式进行田间试验研究结果表明,磷肥分季施用总利用率最高,达50.09%,固定率最低,为46.12%,平均增产率16.4%,优于其它各处理,是磷肥较好的施肥方式.磷肥施入土壤后,发生化学固定,其后效可达3年以上.     

不同磷肥分配方式的施用效果及其后效研究

在黄棕壤上等量磷肥以不同分配方式进行田间试验研究结果表明,磷肥分季施用总利用率最高,达50.09%,固定率最低,为46.12%,平均增产率16.4%,优于其它各处理,是磷肥较好的施肥方式.磷肥施入土壤后,发生化学固定,其后效可达3年以上.     

金露梅株丛的植物量及其空间分布的研究

研究了东祁连山金露梅株丛的植物量形成规律,空间分布特点及其与立地类型的关系。结果表明,地上植物量８月底最高,６月生长最快,１０月凋落速度最快。年凋落量是年增量的７２％左右。株丛植物量Y与株丛分枝数Ｘ１、丛高Ｘ２、株丛投影面积Ｘ３成正相关关系,可用多元线性回归方程Ｙ干质量＝－３２５.３４６十１０．４２１Ｘ2＋０.１１０Ｘ３（ｒ＝０.８５７,Ｐ＜０.０１）或Ｙ鲜质量＝２１０.６３７＋７.２１８Ｘ1＋１.４００Ｘ２＋０．０８７Ｘ３（ｒ＝０．８７２．Ｐ＜０．０１）来估测,估测精度分别为９１．２％和９５.８％。地上植物量的８０％分布于０～３０ｃｍ高度内,地下植物量的８５％集中分布于０～２０ｃｍ的土层中。株丛地下植物量３７８．９ｇ／ｍ２·ＤＭ是地上植物量３２６.６ｇ／ｍ２ＤＭ的１．２倍,地下部分所占空间是地上的３５～１０.２倍。不同立地条件下金露梅株丛的分枝数不同,单枝质量差异很大。     

扶贫资金投入与减贫:来自新疆农村地区数据的分析

新疆的贫困问题不仅是一项经济社会课题,更是一项事关西北边疆安全与稳定的政治课题。该问题的有效解决很大程度上取决于新疆农村地区扶贫资金的使用效率。基于新疆农村居民家庭人均纯收入分组数据,采用SVAR模型及脉冲响应函数,测算了1988-2012年新疆农村地区的FGT贫困指数,分析扶贫资金投入对新疆农村地区的减贫作用。结果表明,新疆农村地区贫困程度波动明显,2012年新疆农村贫困广度为13.9%、贫困深度为6.7%、贫困强度为7.4%;贫困人口"被脱贫"现象仍然存在,贫困标准有待进一步提高;新疆农村Gini系数已达0.49,收入分配状况不容乐观;扶贫资金的投入对降低新疆农村地区贫困广度和贫困深度作用较为明显,而对贫困强度的改善作用比较微弱。今后扶贫工作中,更加注重精准扶贫和最贫困人口状况是提高扶贫资金减贫效果的关键所在。     

蔬菜中铅的含量及分布规律研究

利用原子吸收分光光度法测定了蔬菜不同部位铅的含量,结果发现:(1)不同种类的蔬菜可食部分铅的含量差异较大,次序为:叶菜类(7.94-15.30 μg/g DW)＞茎菜类(5.39-9.17 μg/g DW)＞果菜类(3.68-5.36 μg/g DW);(2)同株蔬菜通常以茎的含铅量最高,果实的含铅量最低,根叶含铅量则因蔬菜种类不同而有所不同.