转录组学在果蔬采后衰老生物学中的研究进展

采后衰老是制约果蔬贮藏保鲜的重要因素。利用转录组学技术,可以从转录组水平上揭示果蔬成熟衰老的分子机理。本文综述了主要的转录组学平台的技术特点、方法以及转录组学在果蔬采后研究中的应用现状,重点介绍了转录组学在番茄、桃、西蓝花和越橘等果蔬采后衰老生物学研究中的进展,分析了目前应用中存在的问题,并展望了转录组学在果蔬采后生物学研究中的发展前景。     

转录组学在植物响应干旱胁迫中的研究进展

干旱胁迫是植物生长周期中极易遭受的非生物胁迫之一,了解植物如何响应干旱逆境及其调控途径,成为了一个热点问题。随着转录组技术的广泛应用,人们可以从基因层面了解在干旱胁迫下,植物体内的信号转导及其相关的网络调控机制。本文主要查阅近年来RNA-Sep技术在植物干旱胁迫方面的研究进展,介绍了植物受到干旱胁迫后,从膜上信号感受器,到细胞内信号转导,以及主要的植物激素代谢调控途径等方面的调控机制,展望了未来转录组学在植物响应干旱胁迫中的发展方向。     

基于宏转录组研究蔬菜秸秆发酵体系细菌群落

分析蔬菜秸秆快速好氧发酵过程中活性细菌群落丰度、组成、多样性的演变规律,为进一步挖掘微生物资源,调节发酵工艺提供理论参考依据。依托罐式有机物料快速腐解设备,选取发酵过程中4个不同发酵时期（升温期、高温期、降温期和腐熟期）的有机物料为研究对象,提取微生物总RNA、反转录cDNA,以16S rRNA基因为分子标靶,借助qPCR技术和Illumina Miseq高通量测序平台,研究不同发酵时期细菌群落丰度、组成、多样性的变化及群落组成与物料理化因子偶联分析,揭示群落与理化因子之间的相关性。不同发酵时期物料的pH发生了显著的变化,升温期物料pH为6.26,而到了高温期乃至腐熟期pH均在8.0以上;发芽指数随着发酵进程推移达到94%以上。高温期的细菌数量显著高于其他3个时期。各个时期的活性细菌α多样性指数,除Simpson指数外,其余差异不显著。不同时期的优势菌门均是厚壁菌门（Firmicutes）、变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）,但相对丰度变化较大;不同时期菌群属组成和相对丰度之间存在显著差异,升温期存在其他时期检测不到的菌属。通过CCA分析可知pH是影响微生物群落结构的主要因子。     

宏基因组学在红树林土壤微生物研究中的应用

红树林的土壤微生物群落蕴藏丰富的自然资源,但传统研究方法复杂、低效,而且只能获得极不完全的小部分信息,近年来兴起的宏基因组学克服了这些缺点。介绍了宏基因学的主要研究方法,在此基础上总结了宏基因组学在红树林土壤微生物多样性、空间分布特征、土壤理化性质与微生物群落结构之间的关系、土壤微生物代谢产物4个方面的具体应用,最后对该领域未来的研究方向提出了展望。     

代谢组学在植物研究中的应用

对代谢组学的概念、分析技术及原理进行了介绍,重点对核磁共振技术、色谱-质谱联用技术进行了阐述,并对其在植物生理、植物鉴定与转基因植物鉴别、植物代谢途径、功能基因组及基因工程中的应用进行了阐述,最后对其发展前景进行了分析.     

仿刺参行为生态学及相关转录组学研究进展与展望

行为生态学是研究由于生态压力而产生的动物行为的进化基础的学科,通过研究这些行为发生的原因及规律能更好地帮助我们理解自然和保护动物。转录组学是一种研究特定细胞、组织或器官在特定生长发育阶段或某种生理状况下所有转录本的科学,与相对稳定的基因组不同,随着生长发育阶段、生理状态和外界环境改变转录组会发生相应变化。所以,能通过转录组分析研究生物生长发育、应激生理、抗病免疫等作用机制。仿刺参行为学研究对于改善仿刺参生产管理模式、完善仿刺参增养殖方式与提高仿刺参采捕效率、采捕设施设计和调查研究具有重要意义,而仿刺参转录组学更像是一把钥匙,能够更好地帮我们打开行为学研究的大门,帮助我们更好地理解仿刺参行为出现的原因和调控机理,使我们能够更加高效地利用仿刺参行为进行生产养殖。本文主要综述了目前仿刺参运动、摄食、集群、应激、繁殖、争胜、夏眠等不同行为的研究现状,并对与仿刺参行为相关的转录组学研究进行概述,为未来仿刺参的行为生态学及转录组学研究提供借鉴及参考。     

下一代测序技术在畜禽转录组研究中的应用

下一代测序技术凭借其高通量的特点成为现代生命科学研究的重要工具之一。转录组学是功能基因组学研究的重要内容,畜禽转录组学的研究是国内外生命科学研究的热点内容。文章综述了下一代测序技术的原理及特点,转录组学的研究概要,重点介绍了下一代测序技术在畜禽转录组研究中的应用进展,最后对下一代测序技术在生命科学研究中存在的问题和今后的发展方向进行了展望。     

微生物宏基因组学及其在瘤胃微生物研究中的应用

宏基因组学可以在非实验室纯培养的条件下直接获取环境微生物DNA,并对其基因组进行分析,将其克隆到合适的载体上,筛选所需要功能基因。就微生物宏基因组学及其在瘤胃微生物研究中的应用作一综述。     

宏组学在哺乳动物消化道微生物研究中的应用

为了能够了解微生物在宿主体内扮演的角色,有必要探明它们的遗传信息、基因表达、功能变化,及其对微生物种群和宿主带来的影响。近几年高通量测序技术的革命性发展,质谱、核磁共振技术的进步,使人们对复杂微生物系统的深入研究成为了可能,这有助于进一步揭示消化道微生物对宿主生理代谢的影响。本文综述了最新的宏组学技术在哺乳动物消化道微生物研究上的应用,主要包括近些年来16S rRNA测序、宏基因组、宏转录组、宏蛋白组、宏代谢组在人类、模型动物和反刍动物上的研究方法和最新成果,并简单概述了这些技术的优势及其现阶段所存在的不足。     

代谢组学在水稻研究中的应用进展

代谢组学是系统生物学重要的分支,通过对小分子代谢物的研究来揭示生命体的生理状态,进而探索生命活动的规律。对代谢组学进行了简单概述,介绍了代谢组学常用的分析平台,综述了代谢组学在水稻响应非生物和生物胁迫、基因功能、辅助育种及转基因安全研究中的应用现状,并就存在的挑战和机遇进行了分析,以期为代谢组学应用于水稻研究提供参考。     

土壤微生物生态学研究进展

介绍了土壤微生物生态学研究的主要内容及其进展情况,旨在为相关研究提供依据。     

森林枯落层及土壤层微生物生态研究

本文着重从研究范围、内容、方法及结果等方面综述了森林枯落层及土壤层微生物生态研究的现状，同时对存在的问题进行了简析，展望了该方面研究的发展方向。     

生物信息学在微生物生态学中的应用

高通量测序技术的快速发展极大地推动了微生物多样性的研究,各种生物信息学软件的开发用于分析由此产生的大量基因信息。综述了生物信息学在微生物生态学中的应用以及相关软件和数据库在α、β-多样性研究中的应用。     

生物有机肥的发展与展望

通过对目前生物有机肥的研究,提出了未来生物有机肥的发展方向。生物有机肥可以在土壤微生态方面改善土壤质量,提高土壤生物群落数量以及起到生防的作用。     

分子生态学技术应用于新疆环境微生物研究进展

对应用于环境微生物研究的分子生态学技术进行综述,并综述了近些年来新疆环境微生物研究的进展,最后,对新疆极端环境微生物研究前景进行了展望。     

生态规划的生态学原理研究

总结了生态规划的概念,分析了生态规划的内涵,并从生态学的概念入手,分析了生态规划的生态学基本原理。     

冗余分析在微生物生态学研究中的应用

冗余分析(Redundancy analysis,RDA)是多元回归模型的延伸,其用排序的方法对环境变量与物种间关系进行间接梯度分析,这一方法在经典生态学研究中已取得大量研究成果.本文阐述了冗余分析的概念,并在CANOCO软件RDA分析操作步骤的基础上,综述了近年冗余分析在微生物群落多样性、碳源代谢、核心微生物组、微生...     

植物生态学原理在景观设计中的应用

植物在景观设计中有这十分重要的作用,在景观设计中应该利用植物生态学的原理指导没计。设计者应该尊重植物群落的自然特点,考虑植物他感作用的影响等,同时充分考虑生态环境因子对植物的影响,以达到植物景观的艺术性、生态性和科学性的统一。     

微生物技术在烟草种植中的应用探究

由于我国科学技术的快速发展,在生物技术领域的研究也取得了很大的进步,微生物技术也 逐渐被广泛应用在农业生产之中。由于微生物可以在土壤中分解一些有害的物质,有效改变土壤环 境,从而促进农作物的生产量以及提供农作物的综合质量,所以也开始在烟草种植中逐步实施。对 此,本文对微生物技术在烟草种植中的应用进行探究,希望能为利用微生物技术进行烟草种植提供参 考作用。     

韭菜根系浸提液对香蕉枯萎病和土壤微生物生态的影响

通过抑菌试验(采用菌丝生长速率法和孢子萌发法)和盆栽试验,研究了韭菜根系浸提液对香蕉枯萎病的抑菌效应和防治效果,以及对土壤微生物生态的影响.抑菌试验结果表明,韭菜根系浸提液对香蕉枯萎病菌菌丝生长和孢子萌发均具有明显的抑制作用,并表现出浓度效应,即随着韭菜根系浸提液质量浓度的增加,菌丝生长减缓,孢子萌发率降低,对病原菌菌丝生长和孢子萌发的抑制作用增强.通过对病原菌菌丝和孢子形态的显微观察,韭菜根系浸提液能使病原菌菌丝和孢子发生畸变.香蕉苗期接种试验防病效果显著,随着韭菜根系浸提液质量浓度的增加,防病效果增强,当达到最大测试质量浓度160 mg·mL-1时,防病效果达到53.66%.韭菜根系浸提液影响盆栽土壤中香蕉枯萎病菌和主要微生物类群数量:韭菜根系浸提液能显著减少土壤中香蕉枯萎病菌、真菌和放线菌数量,提高细菌的数量.移栽香蕉后第40天的Biolog分析结果表明:韭菜根系浸提液能够提高土壤微生物对碳源的利用能力和土壤微生物群落的多样性、丰富度和均匀度,说明韭菜根系浸提液能改善土壤微生物群落结构,增强土壤微生物生态系统的稳定性和抑病性,从而减少香蕉枯萎病病害的发生.