蔷薇科SSR引物在云南栘［木衣］中的通用性分析

【目的】探究蔷薇科植物的SSR引物在云南栘［木衣］中的通用性,以便快速获得在云南栘［木衣］可以通用的SSR标记。【方法】以云南省瑞丽市、梁河县、陇川县和芒市4个天然居群的云南栘［木衣］为试验材料,利用100对李、梨、苹果、枇杷和Malacomeles denticulata等蔷薇科植物的SSR引物对云南栘［木衣］进行PCR扩增,从中筛选出具有多态性的SSR引物,并对云南栘［木衣］进行遗传多样性分析和聚类分析。【结果】在100对蔷薇科植物的SSR引物中有52对SSR引物在云南栘［木衣］中扩增出了目标产物条带,其中有42对SSR引物扩增出多态性条带,多态性引物所占比例为80.77%。4个云南栘［木衣］天然居群的多态位点比例、Shannon’s指数、Nei’s遗传多样性、观测等位基因数和有效等位基因数的均值分别为32.65%,0.191 7,0.131 1,1.326 5和1.232 4,其中瑞丽居群的以上多样性指数依次为40%,0.224 3,0.150 9,1.400 0和1.257 7,明显高于其他居群,表明其具有较高的遗传多样性,可能具有较为丰富的遗传变异。聚类分析结果表明,4个居群的云南栘［木衣］可分为2大类群,其中瑞丽、陇川和芒市居群聚为一类,梁河居群单独聚为一类,分类结果与地理区域分布情况一致。【结论】蔷薇科植物的SSR引物在云南栘［木衣］中具有较好的通用性,这些SSR为后续云南栘［木衣］及其近缘种进行种质资源鉴定和遗传多样性分析等研究提供了可用的标记。     

番茄叶片总RNA提取方法的比较

番茄叶片富含酚类、多糖、蛋白质等次生代谢物质,用普通方法提取番茄叶片总RNA时很难将其去除,试验比较研究了RNA plant Reagent、UNIQ-10柱总RNA抽提试剂盒和改进Trizol三种方法的提取效果。结果表明,改进的Trizol法能从番茄叶片中提取纯度较高的RNA,凝胶电泳显示条带清晰完整,分光光度计检测A260/A280比值为1.88。用该方法提取的番茄叶片总RNA可以用于逆转录、RT-PCR、Northern blot等分子生物学研究。     

烟草叶片总RNA提取方法的比较

[目的]研究提取烟草叶片总RNA的最佳方法。[方法]利用CTAB法、酚-SDS法和Trizol法等从烟草叶片中提取总RNA。[结果]通过紫外分光光度法和凝胶电泳检测,结果表明,CTAB法、Trizol法、RNAiso法均能得到质量较高的RNA。RNAiso法提取RNA操作步骤简单,所提取的RNA纯度好、质量高且无污染,可以进行下一步的分子生物学研究。[结论]RNAiso法最适用于烟草叶片总RNA的提取。     

茴香叶片总RNA提取方法的比较

为促进茴香的分子生物学研究,以宁夏海原的茴香叶片为试验材料,分别采用CTAB法、CTAB改良法、CTAB水饱和酚法、Tris-硼酸法、异硫酸氰胍法、异硫酸氰胍改良法、Trizol法和Trizol改良法共8种方法提取茴香叶片RNA,比较其提取效果.结果表明:CTAB改良法提取的RNA质量最好,浓度为1481.9μg·μL...     

盐肤木叶片总RNA提取方法的比较研究

比较了Trizol法、异硫氰酸胍法、CTAB法、SDS法以及改良CTAB法和改良SDS法等方法提取盐肤木叶片总RNA,琼脂糖电泳和紫外检测结果表明:改良SDS法提取的盐肤木总RNA没有降解,28S和18SrRNA条带清晰,D260nm/D280nm和D260nm/D230nm分别为2.05和2.12,虽然其产量只有59.87μg/g,但是综合判断改良SDS法是适宜盐肤木总RNA提取的一种有效方法.     

云南栘(木衣)总DNA提取方法比较及SSR反应体系优化

【目的】从云南栘叶片中提取高质量的总DNA,并建立稳定的SSR-PCR反应体系。【方法】以云南栘幼嫩叶片为材料,采用尿素法、改良尿素法、SDS法、CTAB法、MAGEN试剂盒法和磁珠试剂盒法提取总DNA,从中筛选提取云南栘总DNA的最佳方法;利用L₁₆(4⁵)的正交设计试验优化影响云南栘SSRPCR扩增体系的影响因子,建立云南栘SSR-PCR反应体系。【结果】改良尿素法为云南栘总DNA的最佳提取方法,提取的总DNA质量浓度、总量和A₂₆₀/A₂₈₀分别为382.64 ng/μL、38.26μg和1.87,且琼脂糖凝胶电泳的条带清晰明亮,说明DNA完整性好、质量浓度高。优化后的SSR-PCR扩增反应体系为：模板DNA30 ng,Taq DNA聚合酶0.5 U,引物1.25μmol/L,Mg²⁺2.0 mmol/L,dNTPs 2.5 mmol/L,10×PCR buffer 2.5μL,补水至25μL。【结论】改良尿素法能够从云南栘中提取高质量的总DNA,所建立的SSR-PCR反...     

山药叶片总RNA提取方法的比较

[目的]提取高质量的山药叶片总RNA。[方法]以山药叶片为材料,采用异硫氰酸胍法、改良CTAB法提取山药叶片总RNA并进行比较分析,利用琼脂糖凝胶电泳分析所提RNA的完整性,并用紫外分光光度计分析RNA的纯度。[结果]改良CTAB法提取的总RNA的28S、18SrRNA条带清晰、整齐,测得A260/A280为1.72.0。[结论]改良的CTAB法适合山药叶片总RNA提取。     

不同方法提取狗脊蕨叶片总RNA的比较分析

[目的]为构建狗脊蕨叶cDNA文库,保存珍贵基因资源,克隆和研究与有效成分合成相关的基因等提供技术参考。[方法]以狗脊蕨叶片为材料,采用CTAB法、一步法、酚-SDS法和RNA试剂盒提取分离法提取总RNA,通过比较分析确定最优方法。[结果]这4种方法都能提取出182、8 S的RNA,但CTAB法和试剂盒提取分离法的总RNA质量较高,CTAB法还提取出清晰的5S RNA。一步法和SDS法带型模糊,有降解现象。CTAB法提取的狗脊蕨叶片总RNA质量较好,28S1、8S和5S条带清晰,且无明显降解。CTAB提取法OD260/OD280的值在1.93~2.06,试验中其OD260/OD280值为2.012,接近2.0,纯度较高。一步法和SDS法OD260/OD280>2.0,试剂盒法OD260/OD280<2.0。[结论]CTAB法适合提取的狗脊蕨叶片总RNA,质量较好,可用于cDNA合成、文库构建等后续分子生物学试验。     

番茄叶片及果实总RNA提取方法的比较

以番茄品种Moneymaker(MM)为材料,比较了试剂盒法、Trizol法和Trizol改良法3种方法对番茄叶片及果实不同时期总RNA的提取效果,分别采用核酸蛋白检测仪及琼脂糖凝胶电泳,测定了提取样本总RNA的浓度、纯度及完整性.结果表明,就番茄叶片而言,3种方法提取的总RNA纯度均较好;其中Trizol改良法是提取...     

几种玉米叶片总RNA提取方法的比较研究

本研究以玉米(B73)叶片为实验材料,比较了Trizol法、CTAB法和改进的SDS酚法提取后RNA的质量。琼脂糖凝胶电泳结果表明,CTAB法和Trizol法提取物中含有大量多糖,RNA质量不足以进行后续的研究工作,而通过加入适量的乙醇等实验步骤改进的SDS酚法,提取的RNA纯度高,电泳效果好。通过特异引物扩增试验发现,利用改进的SDS酚法能扩增出预期的目的基因片段,可很好的应用于基因克隆等后续分子生物学实验。     

玫瑰花柱总RNA提取方法的比较研究

为获得一种玫瑰(Rosa rugosa)花柱总RNA提取的理想方法,为后续相关基因工程研究奠定基础。以玫瑰花柱为材料,用核酸蛋白仪和凝胶电泳法比较了改良CTAB 法、Trizol 法以及EASY spin Plus 植物RNA提取试剂盒法提取的玫瑰花柱总RNA的纯度、浓度及完整性,利用RT-PCR反应检测了其反转录产物用于基因扩增的有效性。结果表明：改良CTAB法提取的总RNA纯度、浓度较高,但存在严重降解现象;Trizol 法提取的总RNA纯度和浓度极低;EASY spin Plus 植物RNA提取试剂盒法提取的总RNA纯度和浓度较高,条带清晰,且28S 条带亮度是18S 条带亮度的2 倍,将其反转录获得的cDNA用于RT-PCR,能够扩增出清晰的特异性条带。综上所述：EASY spin Plus 植物RNA提取试剂盒法从玫瑰花柱中提取的RNA质量最好,完全能够满足后续的玫瑰分子生物学研究要求。     

玉米花粉总RNA提取方法的比较和分析

以玉米花粉为材料,借鉴其他植物RNA的提取方法,比较了利用Trizol法、酸性酚—异硫氰酸胍法和CTAB改进法提取玉米花粉RNA的效果,利用普通琼脂糖凝胶代替甲醛变性胶电泳分析3种不同方法所提取的RNA的完整性,并用紫外分光光度计分析RNA的纯度。结果表明,CTAB改进法为其中最好的方法。     

美洲南瓜种皮RNA提取方法的比较

为探索提取高质量RNA的方法,采用改良CTAB法、SDS法、异硫酸氰胍法和Trizol法从美洲南瓜种皮中提取总RNA.结果表明:改良CTAB法提取的RNA中28 S rRNA和18 S rRNA 2条带清晰,且28 S rRNA在亮度约为18 S rRNA的2倍,两条带之间无弥散现象;OD260/OD280值为1.996 5,OD260/OD230为2.235 7,RNA产率为161 μg/g.异硫酸氰胍法提取的总RNA纯度较高,但产量较低;SDS法和Trizol法提取的总RNA产量较低,且纯度不高.改良的CTAB法从种皮中提取的RNA质量好、产率高、完整性强,是从富含次生代谢物质的种皮中提取高质量总RNA的有效方法.     

杜仲树皮总RNA提取方法的比较

[目的]从杜仲树皮中获得高质量的总RNA。为开展杜仲后续mRNA分离、杜仲抗真菌蛋白基因克隆、及杜仲树皮cDNA文库构建等研究奠定基础。[方法]以杜仲树皮为材料,分别采用改良CTAB-LiCl法、RNApure Plant Kit法和RNAiso Plus法进行总RNA提取,用琼脂糖甲醛变性凝胶电泳检测总RNA的完整性,用紫外分光光度计检测总RNA的纯度和得率。[结果]改良CTAB-LiCl法和RNA-pure PlantKit法提取的杜仲树皮总RNA纯度和完整性较高,A260/A280值均在1.800~2.000,28和18 SrRNA条带清晰,RNA得率较高;而RNAiso Plus法提取的杜仲树皮总RNA的纯度和完整性较低,A260/A280值为1.652,28S和18S rRNA条带存在降解和弥散现象,RNA得率低。[结论]改良CTAB-LiCl法和RNApure Plant Kit法抽提获得的杜仲树皮总RNA质量较高,能满足后续RT-PCR和RACE等试验的要求,这为成功克隆杜仲相关基因奠定了基础。关键词杜仲树皮;RNA提取;方法;比较     

三七根部总 RNA 不同提取方法的比较

为探明三七根部总 RNA 的最佳提取方法,获取高质量 RNA,选取三七根部为材料,比较 Tr-izol 试剂法、CTAB 法、改良 Trizol 法和试剂盒法提取三七根部总 RNA 的质量。结果表明：4种方法提取三七根部 RNA 效果不同,其中以改良 Trizol 法提取 RNA 的质量最高,其 RNA 的 OD260／OD280为2．00, OD260／OD230为1．90,28S∶18S 为1．9,RIN 值为7．4,质量浓度为386μg／μL。而另外3种方法易出现样品降解、盐离子残留。结论：改良 Trizol 法适用于三七根部总 RNA 的提取。     

野葛块根总RNA的不同提取方法比较研究

以块根膨大与块根不膨大突变型的野葛块根为材料,比较Trizol、CTAB、SDS及改良SDS法提取野葛块根总RNA的效果,通过RNA产量、纯度及电泳图谱分析等,初步确立了一种有效提取野葛块根总RNA的改良SDS法。该方法提取的RNA OD260/OD280值介于1.7～1.9,电泳图谱清晰完整,产量高,成本低,完全适用于RT-PCR、cDNA-AFLP及Northern杂交等分子生物学后续试验。     

脏器RNA提取方法的改进

以猪脏器为材料,应用TRIpure Reagent总RNA提取试剂盒提取脏器总RNA,发现直接按照试剂盒说明书操作提取的RNA效果不理想。通过反复试验,改进了提取过程中的部分操作步骤。结果表明:改进后与改进前相比,提取RNA的纯度和得率在0.01水平上有差异;改进后提取的RNA经RT-PCR扩增猪"βactin基因,电泳结果显示,扩增条带清晰、特异,说明提取的RNA完全满足后续分子生物学试验的要求。     

外源硝态氮对水培鸢尾叶片抗氧化酶活性的影响

以鸢尾为试验材料,采用营养液水培控制溶氧浓度的方法,研究了短期低氧胁迫下外源硝态氮对鸢尾体内的几个逆境指标的影响。NO^-₃浓度共设4个水平:0、7.5、15.0 mmol·L^-1和22.5 mmol·L^-1,以1/2×Hoagland营养液正常低氧处理（NO^-₃浓度7.5 mmol·L^-1）为对照。结果表明:各处理SOD、POD、CAT酶活性均呈现先升高后降低的趋势。与对照相比,营养液加氮处理的SOD、POD、CAT酶活性升高,膜质过氧化程度减轻;氮浓度越大,酶活性升高幅度越大,而营养液缺氮处理的酶活性降低,膜质过氧化程度加重;营养液缺氮处理鸢尾体内的H₂O₂和MDA含量升高,而营养液加氮处理可降低O^·-₂的产生及MDA含量,且NO^-₃离子浓度高时效果更好,说明适当提高营养液中的氮素水平可以缓解低氧胁迫对鸢尾的伤害。     

阔叶薰衣草叶片总RNA两种提取法的比较

分别采用TRIzol法和改良的CTAB法提取阔叶薰衣草叶片的RNA,并用紫外光谱和琼脂糖凝胶电泳对其提取效果进行鉴定。实验结果表明：TRIzol法提取的总RNA浓度高,但杂质较多且有部分降解、稳定性差;改良的CTAB法提取得到的总RNA的纯度较高,OD260/OD280值为1.909,效果稳定,有良好的可重复性。因此,...