中国率先破译家蚕基因 有望突破产业瓶颈成为家蚕强国

我国科学家15日宣布:经过40 0多名科研人员5个月的艰苦努力,我国已率先完成家蚕基因组“框架图”绘制工作。这是我国科学家继完成人类基因组1%测序工作,水稻基因组“框架图”和“精密图”之后,向人类贡献的第三大基因组研究成果。中国家蚕基因组计划项目主持人、中国工程院院士向仲怀说:“我国率先向世界公布第一个家蚕基因组‘框架图’,标志着我国在家蚕基因组研究方面已居世界领先地位,也是建立2 1世纪‘丝绸之路’的起点和里程碑。”根据计算机组装和数据分析结果表明,基因组测序完成了6倍的覆盖深度,所获序列覆盖了家蚕基因组的95 .5 4%…     

2007年家蚕基因芯片论文发表

<正>1)2007年1月,研究所在北京向科技部、教育部专题汇报家蚕功能基因组研究进展。2)2007年4月,重庆市政府对家蚕基因组研究项目作重要批示。3)2007年4月,中日家蚕基因组精细图会议在重庆召开,家蚕基因组精细图谱主体工作完成。     

基因组研究为何选中家蚕为"代表生物"?

家蚕基因组"框架图"是我国科学家继完成人类基因组1%测序工作、水稻基因组"框架图"和"精细图"之后,向人类贡献的第三大基因组研究成果.     

家蚕基础科学研究浅论

家蚕是重要的经济昆虫和新兴模式生物,它与人类有着密切的联系,它的生存和繁殖完全依赖于人类。家蚕作为蚕业的基础,对蚕丝绸行业的农民和工人来说意味着经济来源甚至生存基础。从19世纪开始,家蚕成为微生物学、生理学和遗传学科学研究的目标,使得人类对生物学的理解发生了巨大变化。2003年家蚕基因组计划启动实施,之后随着家蚕全基因组框架图、精细图和遗传变异图先后完成,家蚕功能基因组研究及相关技术取得了长足发展。这里我们将概述家蚕基础科学研究领域包括遗传学、基因组学和功能基因组学的研究现状,从而推动家蚕作为昆虫研究模式的发展,促进鳞翅目昆虫等生物基因组研究的拓展。     

从测序到编辑：家蚕基因组研究再获突破

家蚕是一种重要的经济昆虫、文化载体和模式生物，其不但在蚕丝产业的发展和丝绸之路的文化传播中做出了卓越的贡献，在蚕丝纤维新材料、生物反应器和模式生物中也逐渐凸显出广阔的应用前景。为了对家蚕进行更深入的研究和利用，西南大学夏庆友教授领衔的家蚕基因组研究团队率先开展了家蚕基因组研究，并于2004年和2009年先后在《science》杂志上公布家蚕基因组图谱和家蚕遗传变异图谱。在该研究的推动下，团队在功能基因组研究、家蚕转基因和家蚕生物反应器方面取得了显著的进展，家蚕的研究也受到越来越广泛的关注。但是，家蚕要成为全世界公认的生物反应器和模式生物，依然有很长的路要走，其中最重要的一步就是定点敲除和敲入等基因组编辑技术的建立。     

家蚕基因组研究取得重要成果西南大学举行新闻发布会并隆重表彰

2009年8月28日,西南大学家蚕基因组研究取得重大突破和又一项标志性成果,家蚕基因组研究创新团队主持完成的“40个基因组的重测序揭示了蚕的驯化事件及驯化相关基因”研究成果在国际著名学术杂志《SCIENCE》上发表,学校隆重召开新闻发布会,并向家蚕基因组团队进行表彰。     

西南农业大学蚕桑学重点实验室家蚕基因组计划背景

1995年9月,向仲怀院士和中国科技大学李振刚教授提出家蚕基因组计划设想,并着手基因组生物材料系统的构建.同年日本开始实施家蚕基因组研究.     

中国家蚕基因组与21世纪丝绸之路

由于西南农业大学和中国科学院北京基因组研究所暨华大基因研究中心的科学家的出色工作 ,中国家蚕基因组工作框架图于 2 0 0 3年 10月胜利完成。这是蚕业科学发展史上里程碑式的重大成果。家蚕全基因组有效长度为 4 5 0Mb ,这次绘制的框架图覆盖了家蚕全基因组的 95 .5 4 % ,达到了高质量工作框架图的要求。随着家蚕基因组框架图的完成 ,蚕业科学将进入以分子设计和生物信息为基础的新的发展阶段。紧密合作 ,共同奋斗 ,为 2 1世纪丝绸之路更加绚丽辉煌作出新的贡献 ,将是我国蚕业科技工作者的历史任务     

日本家蚕基因组研究代表团到渝会谈

20 0 3年12月16日由日本分子生物学会理事长、日本基因组计划高级顾问、总协调人吉川先生为团长的日本家蚕基因组研究小组一行4人到渝与西南农业大学向仲怀院士等专家就家蚕基因组研究的国际合作事宜进行了会谈。在商讨过程中吉川先生首先表明了这次他们专程到重庆来的目的,对于由多种原因未能与中国实行合作表示遗憾和道歉,希望中日双方将现有数据整合起来共同发表第一篇文章。向仲怀院士就中日家蚕基因组合作研究的过程作了回顾,表明我们始终坚持国际合作的原则,愿意就家蚕基因组的研究进行国际合作,但由于日方的原因造成中日双方未能合作…     

从50年来在《Science》发表的蚕丝学文献看中国家蚕基因组研究

检索、概括了50年来在《Science》杂志刊登的10篇蚕丝学文献的基本情况和内容,介绍了家蚕基因组框架图在家蚕全基因组序列分析、比较基因组学和丝腺、激素及发育相关基因等功能基因研究方面取得的重要进展,显示了中国家蚕基因组研究对世界蚕业科学的重大贡献。     

我国家蚕基因组的最新研究——对家蚕基因组精细图和40个蚕类基因组遗传变异图的解读

2008年12月,西南大学家蚕基因组研究团队宣布了世界上第1张家蚕基因组精细图谱的诞生。家蚕基因组精细图和2003年发布的家蚕基因组框架图相比,具有基因覆盖度高、基因组组装更加完整、基因鉴定更加准确等特点。2009年,该研究团队在家蚕基因组精细图的基础上,选取具有代表性的29个家蚕突变品系和11个不同地理来源的中国野桑蚕品系进行了全基因组重测序与序列比较分析,共获得了29个家蚕突变品系和11个中国野桑蚕地理品系的全基因组序列,绘制完成了世界上第1张基因组水平上的蚕类单碱基遗传变异图谱,同时还发现了驯化对家蚕生物学性状影响的基因组印记,从全基因组水平上揭示了家蚕的起源进化。2009年8月,《Science》杂志发表了西南大学的研究论文"40个蚕类基因组的重测序揭示了家蚕的驯化事件及驯化相关基因",标志着家蚕基因组计划进入一个新的历史阶段。     

祝贺我国家蚕基因组研究获“日本蚕丝学会特别奖”

报道了中、日两国家蚕基因组研究团队分别获得“日本蚕丝学会特别奖”的情况,介绍了两国家蚕基因组研究的成果及其意义。     

家蚕基因组中的分子标记遗传图谱

遗传标记既是基因组研究的重要内容，又是构建遗传图谱、研究生物多样性、育种、基因定位与克隆等的基因。目前，已有多项分子标记技术用于家蚕基因组的研究，并构建了多种分子标记遗传图谱，包括限制性酶切片段长度多态性（简称RFLP）、DNA随机扩增多态性（简称RAPD）、扩增片段长度多态性（简称AFLP）、简单重复序列PCR（简称SSR－PCR）等。本文就分子标记技术构建的家蚕基因组分子标记遗传图谱进行了讨论。     

家蚕cDNA文库构建及大规模EST测序

EST(expressedsequencetag,表达序列标签 )测序分析技术广泛应用于基因功能和表达模式的分析研究。以家蚕品种“大造”为材料 ,采用非均一化的Oligo dT引物定向克隆技术构建了 13个组织的cDNA文库 ,进行了cDNA克隆 5′端测序 ,共获得 84 791万条EST序列 ,初步拼接得到 2 76 93个非重复序列 ,其中包括 10 4 33个Contigs,172 6 0个Singletons。家蚕大规模EST测序将为家蚕功能基因组研究和全基因组测序计划的实施奠定基础     

转座子显示技术及其在家蚕遗传进化研究中的应用展望

转座子显示技术是研究基因组中转座子遗传进化的有力工具。家蚕基因组测序结果发现,基因组中含有大量的转座子。本文综述了转座子显示技术和家蚕基因组中转座子特点,展望转座子显示技术在家蚕遗传进化研究中的应用。     

家蚕抗菌肽基因研究进展

抗菌肽是昆虫先天性免疫系统中十分重要的效应因子,近年来一直是昆虫免疫学研究的热点。家蚕作为鳞翅目昆虫的代表,其抗菌肽研究取得了长足进展。根据已经研究获得的抗菌肽基因序列在家蚕基因组中进行同源搜寻,共获得了40个家蚕抗菌肽基因。这些基因编码的多肽在大小、氨基酸组成和性质上差异很大,但基于结构性质可以分成3类:(1)具有α-螺旋结构并且缺乏半胱氨酸(cysteine,Cys)的线性抗菌肽;(2)富含脯氨酸或甘氨酸的组成性抗菌肽;(3)富含半胱氨酸的环形抗菌肽。以这3类结构作为主线,综述了家蚕抗菌肽近年来的研究进展。     

家蚕胚胎发育相关基因的分析(英文)

在家蚕基因组中检索分析了与果蝇86个胚胎发育相关基因同源的基因。分析结果表明,在果蝇的这86个基因中,有62(72%)个基因在家蚕基因组中存在直向同源关系,其中58(67%)个基因并且在家蚕、果蝇、冈比亚按蚊3种昆虫的基因组间呈现1∶1∶1直向同源关系。通过比较分析发现,体节极性决定基因在3种昆虫基因组间最为保守。同果蝇和冈比亚按蚊相比,家蚕中决定背-腹部形成的基因分化最大。进一步利用芯片数据对其中的12个母性基因在家蚕5龄第3天幼虫生殖腺中的表达情况进行分析:有2个基因(orb和nanos)在卵巢中特异表达;4个基因(spire、Ras85D、gd和arrest)在精巢中特异表达;另外的6个基因(exuperantia、vasa、pumilio、mago nashi、nudel和dorsal)在精巢和卵巢中均有表达,但是其中的2个基因(pumilio和nudel)在雌、雄间的表达量存在显著差异。研究结果为家蚕发育调控机制的进一步研究提供了重要线索和数据信息。     

基因组时代荧光原位杂交技术在家蚕研究中的应用

随着家蚕DNA分子标记和物理图谱的发展,基因组序列的释放,以及EST数据库和BAC文库的构建,FISH技术在家蚕的遗传学、基因组学研究,尤其是物理图谱研究中取得重要进展。本文综述了FISH及相关技术原理及近年在家蚕和部分鳞翅目昆虫研究中的应用,并对其在家蚕及鳞翅目昆虫的研究前景作了展望。     

家蚕转座子表达载体pSVHK1.4的构建

研究利用PCR方法扩增黑腹果蝇 (D .melanogaster)hsp70启动子 ,然后插入到质粒pcDNA3上水母绿色荧光蛋白基因gfp的上游 ,与之顺向拼接构建成含hsp70和gfp的重组质粒pCGH。将家蚕K1 4转座子序列从pUK1 .4亚克隆到真核表达载体pSVL中PvuⅡ位点 ,获得中间载体pSK1 .4。最后将hsp70启动子和gfp报告基因的融合片段从pCGH中亚克隆到质粒pSK1 .4中K1 .4片段上的BglⅡ位点处 ,从而完成对转座子表达载体pSVHK1 .4的构建。