蝎蝽次目线粒体基因组22个tRNA基因的比较研究(半翅目:异翅亚目)

[目的]本研究旨在对蝎蝽次目11科线粒体基因组中22个tRNA基因的序列特征、遗传距离、同源基因相同核苷酸百分比和二级结构进行比较研究,同时基于22个tRNA序列构建蝎蝽次目的系统发育树。[方法]通过GenBank获得蝎蝽次目所有12个代表种的tRNA序列,在MEGA 6.0中计算tRNA基因序列特征和遗传距离,同源基因相同核苷酸百分比在BioEdit 7.1中进行,tRNA二级结构在RNA structure 5.8中构建。在RAxML 8.2.8和Mrbayes 3.2.5中构建系统发育树。[结果]结果显示蝎蝽次目11科核苷酸碱基组成(A+T)%平均含量为76.41%,碱基A和T的含量均高于G和C,其中多数种呈现A高于T,所有种呈现G高于C。蝎蝽次目11科间的遗传距离在0.13～0.26之间。核苷酸保守性较高的tRNA-L2、tRNA-T和tRNA-M基因均位于线粒体基因组的J链,核苷酸保守性较低的tRNA-V和tRNA-F基因均位于线粒体基因组的N链。蝎蝽次目11科内tRNA二级结构中氨基酸接受茎表现为较高的保守性,而环中除了反密码子环相对保守外,其余环都有不同程度的碱基变异。系统发育结果显示固蝽总科、仰泳蝽总科和划蝽总科均为单系,其中固蝽总科和仰泳蝽总科为姐妹群关系,其余总科的单系性没有得到很好的解析,可能与tRNA基因序列能够提供的有效系统发育信号较少有关。[结论]本研究补充了tRNA在蝎蝽次目研究中的不足,揭示了tRNA基因及其二级结构在比较线粒体基因组学研究中的重要性。     

小片蝽线粒体基因组及蝽科系统发育分析

为了从线粒体基因组水平探讨小片蝽Sciocoris lateralis在蝽科的分类地位,丰富蝽科线粒体基因组基本数据,为蝽科系统发育进化研究提供一定的理论依据,通过高通量测序,首次测定并分析了小片蝽完整线粒体基因组（Genbank登录号：OP531920）,提取蝽科物种的13个蛋白编码串联序列（PCGs）,使用最大似然法、贝叶斯法构建系统发育树。结果显示,小片蝽昆虫的线粒体全基因组长度为15 445 bp,包括13个蛋白编码基因（Protein-codinggenes,PCGs）、2个rRNA基因（ribosomeRNAs,rRNAs）、22个tRNA基因（transferRNAs,tRNAs）和1个控制区（Control region）。小片蝽线粒体基因组结构排序与其他蝽科物种一致,均无基因重排现象。小片蝽线粒体全序列AT含量为74.26%,GC含量为25.74%。13个蛋白编码基因中,cox1、nad1和nad6的起始密码子为TTG,其余10个蛋白编码基因的起始密码子是ATT、ATA、ATG。在所测得的tRNA基因中,trnS1和trnV缺失DHU臂,其他20个tRNA均能折叠形成...     

斯氏珀蝽和青革土蝽的线粒体基因组及系统发育分析

【目的】分析斯氏珀蝽和青革土蝽的线粒体基因组特征及蝽总科的系统发育关系,为更好地理解蝽总科下科级和种级水平的亲缘关系提供依据。【方法】通过测序分析了斯氏珀蝽和青革土蝽的线粒体全基因组数据,并基于此,以已经公布线粒体基因组数据的蝽总科的113个物种和本研究的2种昆虫为内群,2种红蝽总科昆虫为外群,分别利用最大似然法和贝叶斯法构建系统发育树。【结果】斯氏珀蝽和青革土蝽的线粒体基因组均包含37个基因(13个蛋白质编码基因、2个核糖体RNA基因和22个转运RNA基因)和1个非编码控制区;两种昆虫的线粒体基因组全长分别为15 346、14 632 bp(GenBank序列号：OP919327和OP930890)。两种方法构建的系统发育树一致支持蝽科、龟蝽科、盾蝽科、兜蝽科、荔蝽科、土蝽科、同蝽科、异蝽科和Megarididae均为单系群;斯氏珀蝽与珀蝽为姐妹群,青革土蝽与Macroscytus subaeneus为姐妹群。【结论】斯氏珀蝽与珀蝽亲缘关系最近,青革土蝽与Macroscytus subaeneus亲缘关系最近。     

猎蝽科昆虫线粒体基因组的比较研究

线粒体基因组是系统发育常用的分子标记,本研究旨在对猎蝽科昆虫的线粒体基因组进行比较研究,着重分析基因重排、碱基组成、密码子使用偏好性等特征,并构建基于13个蛋白编码基因的系统发育关系。在GenBank数据库下载猎蝽科11亚科30属代表物种的线粒体基因组序列,通过Geneious 8.0.4抽提各编码基因的序列。利用MEGA 7.0统计碱基组成、氨基酸和核苷酸序列信息位点、起始密码子、终止密码子、相对密码子使用频率（RSCU）等序列基本信息。另外,利用DnaSP 6.0计算蛋白编码基因的非同义替换率（K_a）和同义替换率（K_s）,并通过K_a/K_s值比较基因的核苷酸进化速率。通过jModelTest选择进化模型,在MrBayes 3.2.2软件中构建基于贝叶斯法（BI）的系统发育树。结果表明：猎蝽科线粒体基因组均呈共线性结构,没有发现大面积的基因重排现象,只有部分序列中rrnS和trnT基因编码方向与原始序列编码方向相反,trnR和cytb基因出现多拷贝的现象。猎蝽科线粒体最常使用ATN起始密码子和TAA...     

褐兜蝽线粒体全基因组序列及系统发育分析

褐兜蝽(Coridius brunneus)是一种常见农林害虫,主要为害洋丝瓜和南瓜等葫芦科植物,常与药用昆虫九香虫混合发生.通过高通量测序技术,组装、拼接获得褐兜蝽线粒体基因组全序列,对其进行分析并基于13个蛋白质编码基因(PCGs)构建系统发育树.结果表明：褐兜蝽线粒体基因组的序列全长为15 792 bp(GenBank登录号：MW899158),包含13个PCGs、22个tRNAs、2个rRNAs和1个D-loop区,核苷酸组成及基因排布序列与异翅亚目昆虫一致;线粒体全序列A+T含量为75.16%,G+C含量为24.84%;预测了22个tRNAs的二级结构,除trnV缺失DHU臂外,其余均为典型的三叶草结构;系统发育分析表明兜蝽科与荔蝽科互为姐妹群关系,且兜蝽科下5个物种的系统发育关系为[(褐兜蝽C.brunneus+九香虫C.chinensis)+(短角瓜蝽Megymenum brevicorne+细角瓜蝽M.gracilicorne)]+小皱蝽Cyclopelta parva.可见,褐兜蝽与九香虫亲缘关系最近,与传统形态分类结果一致.     

山西省蝽总科(半翅目)昆虫调查

调查记录了山西省境内半翅目Hemiptera,蝽总科Pentatomoidea昆虫6科53属93种,其中有山西省内新记录12种。     

对虾科物种线粒体基因组特征和系统发育分析

综合分析对虾科(Penaeidae)21个物种线粒体基因组的全序列,发现其线粒体基因组的长度为15 893～16 071 bp, A+T含量为64.59%～70.61%。K_a/K_s分析表明,对虾科物种线粒体13个蛋白质编码基因(protein-coding genes, PCGs)中,atp8基因的K_a/K_s最高,表明在对虾科中atp8基因受到了较弱的选择压力;在差异位点的分析中,发现nd5和rrnL基因的差异位点比例较高,是理想的分子标记,可用于分析对虾不同群体之间的遗传多样性;在密码子的使用中,被编码的氨基酸均体现相似的偏好性。同时,采用ML(Maximum likelihood)和BI(Bayesian inference)方法构建系统发育树,结果显示,这两种方法构建的系统发育树拓扑结构完全一致,且同属物种也都归为一类或者单独归为一支。本研究为快速鉴定对虾科生物提供了可靠的分子标记,为分析对虾科物种遗传多样性提供理论依据。     

基于线粒体16S rDNA序列的蝽总科系统发育研究(异翅亚目:蝽次目)

以线粒体16S rDNA基因作为分子标记,对蝽总科8个科23种昆虫进行了系统发育的分析,并采用最大简约法、最大似然法和邻接法构建了分子系统树。结果表明:利用16S rDNA分子研究蝽总科的系统发育关系是适合的,能够重建蝽总科的单系性;土蝽科的位置不稳定,在蝽总科各科进化过程中处于中间位置;龟蝽科与蝽科在MP树和ML树中都形成姊妹群关系,在NJ树中2个科的亲缘关系也比较近;异蝽科是最早分支出来的,表明异蝽科是所研究类群中最为原始的类群。本研究从分子水平上支持了将荔蝽亚科、盾蝽亚科和兜蝽亚科从蝽科中分立出来提升为科的观点。     

梭长蝽外部形态及其系统学意义的研究(半翅目:长蝽科)

记术了半翅目长蝽科梭长蝽Pachygrontha antannata(Uhler）成虫期的外部形态，提供特征图15幅，通过形态特征研究，获得对梭长蝽亚科（Pachygronthinae）形态学的进一步认识，为长蝽科的系统发育研究提供比较形态学的新资料，并对有关特征进行了系统学意义讨论。     

江苏省网蝽科昆虫(半翅目:网蝽总科)

通过文献资料整理和对2000-2012年江苏省采集网蝽科昆虫标本的鉴定,整理出江苏省13种网蝽科昆虫名录,记录了其中文名称、学名、异名、别名和寄主,及江苏省、全国和世界的分布情况.其中,长头网蝽(Cantacader lethierryi Scott,1874)、华无孔网蝽(Dictyla rasilis Drake et Maa,1955)、华南冠网蝽(Stephanitis laudata Drake et Poor,1953)和角菱背网蝽(Eteoneus angulatus Drake et Maa,1953)是江苏新记录种,并对这4个新记录种作了简述.     

江苏省长蝽科昆虫(半翅目:长蝽总科)

通过文献资料的整理和对2001—2011年在江苏省采集的长蝽科昆虫标本的鉴定,整理出江苏省的长蝽科27种的昆虫名录;其中,以江苏为模式产地或所查最早文献仅江苏分布的有:中国束长蝽Malcus sinicusStys,1967、纤脊长蝽Tropidothorax fimbriztus(Dallas,1852)2种;发现豆突眼长蝽Chauliops fallax(Scott,1874)、白边刺胫长蝽Horridipameira lateralis(Scott,1874)、台裂腹长蝽Nerthus taivanicus(Bergroth,1914)和黄纹梭长蝽Pachygrontha flavorlineataZhengetHsiao,1979为江苏新纪录种。记录了江苏27种长蝽的中文名称、学名、别名、寄主、江苏省及全国和世界的分布。简述了江苏4新记录种。     

中国小花蝽核型研究(半翅目:花蝽科)

采用姬姆萨染色空气干燥压片法，对花蝽科小花蝽属中国小花蝽的核型作了研究。结果表明：该种单倍染色体组成为n=11A X(Y)。根据性染色体行为和系统发育角度，在花蝽科内中国小花蝽可能是进化者。图1参8     

蝽科Strachia属群的系统发育分析(半翅目)

作者对Strachiini 族中Strachia 属群的6个属级单元的代表种做了形态学研究,选取了外部形态特征以及雌、雄外生殖器以及雌性受精囊等方面的20项形态特征,运用PAUP程序进行支序分析,得出该属群的属级关系支序图.同时对Strachia 属群的系统发育及一些雌、雄外生殖器特征的演化趋势作了讨论.     

锯谷盗线粒体基因组及扁甲总科系统发育分析

【目的】探究锯谷盗Oryzaephilus surinamensis的线粒体基因组结构特征及扁甲总科的系统发育关系。【方法】利用下一代测序方法获得了锯谷盗线粒体基因组的全序列,并基于扁甲总科65个物种(内群)和2个象甲总科物种(外群)的13个蛋白质编码基因、通过最大似然法和邻接法构建扁甲总科的系统发育树。【结果】锯谷盗的线粒体基因组包含37个基因(13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因和2个rRNA基因)和一段控制区。整个线粒体基因组全长为15 711 bp(GenBank登录号：OM215199)。锯谷盗线粒体基因组的3个蛋白质编码基因(cox1,nad2和nad1)的起始密码子是ATC或GTG,其余10个蛋白质编码基因都是以ATT或ATG开头;cox1,cox2,nad2,cox3和nad3以不完整的终止密码子T结尾,其余蛋白质编码基因以完整的终止密码子TAA或TAG结尾。除trnS1因缺少DHU臂而形成一个简单的环,无法形成稳定的三叶草结构外,其余tRNA基因均能形成典型的三叶草结构。此外,trnS1的反密码子不是常见的GCU,而是UCU。rrnL基因的全长为1 281 bp,...     

江苏省缘蝽总科昆虫(半翅目:蝽次目)

通过文献资料的整理和对馆藏2003—2011年采集于江苏省的缘蝽总科昆虫标本的鉴定,整理出38种缘蝽总科昆虫名录;其中,异稻缘蝽Leptocorisa varicornis(Fabricius,1803)、宽棘缘蝽Cletus schmidtiKiritshenko,1916、禾棘缘蝽Cletus graminisHsiaoetZheng,1964三种为江苏新纪录种。还记录了江苏省38种缘蝽的中文名,学名,异名,别名以及江苏省和全国、全球的分布情况。简述了3个新纪录种。     

江苏省猎蝽科4个新记录种(半翅目:猎蝽总科)

简述了江苏省猎蝽科4个新记录种,即细足猎蝽亚科普猎蝽属的四纹普猎蝽、刺胸猎蝽属的窄刺胸猎蝽、梭猎蝽属的敏梭猎蝽和光猎蝽亚科斯猎蝽属的褐斯猎蝽的形态特征,提供了它们国内及国外的分布.     

蝽总科科间支序分析及系统发育(半翅目:异翅亚目)

根据对蝽总科科级阶元所做的特征分析,选取了共28项新征.运用 PAUP 程序对蝽总科的主要科级阶元进行了支序分析,得出蝽总科中主要科的科间关系支序图.与已有的同类工作做了比较和讨论。同时对这些科的演化关系以及一些形态特征在系统发育中的意义也作了简要讨论.     

内蒙古盲蝽科一新种(半翅目,盲蝽科)记述

记述了内蒙古盲蝽科昆虫一新种:鄂尔多斯柽盲蝽(Tuponia ordosica sp.nov.),新种外形特征与蒙古条斑翅盲蝽(Tuponiamongolica Drapolyuk,1980)相似,不同点是:新种的右阳基侧突比较窄;阳茎端有两端刺,较长端刺基部1/3处着生一半圆形具微小突起的膜叶,在交界处呈锯齿状。在外形上,新种楔片端部浅橘红色,革片中下部至爪片下部有一条灰色的带,被浓密的黑色平伏毛,特征明显,后者楔片草黄色端部颜色略淡,没有显著特征。模式标本采自内蒙古自治区鄂尔多斯市,存放于内蒙古师范大学生命科学与技术学院昆虫标本室。     

中国小花蝽核型研究 (半翅目:花蝽科)

采用姬姆萨染色空气干燥压片法, 对花蝽科小花蝽属中国小花蝽的核型作了研究。结果表明:该种单倍染色体组成为n =11A +X (Y)。根据性染色体行为和系统发育角度, 在花蝽科内中国小花蝽可能是进化者。图1 参8