取代芳烃对大型蚤急性毒性的定量构效关系研究

[目的]建立具有良好相关性和稳定性的取代芳烃对大型蚤定量结构-活性关系（QSAR）模型。[方法]采用Gaussian03程序包中密度泛函理论（DFT）B3LYP方法计算取代芳烃的部分结构参数和毒性参数。[结果]-lgEC50的回归方程为-lgEC50=4.496＋1.5×10-2MM＋9.958×EHOMO＋0.677×ΔQR;方程中各自变量的变异膨胀因子（VIF）分别为：1.508、1.364和1.157。取代芳烃对大型蚤急性毒性的主要影响因子为分子量MM、分子最高占有轨道能EHOMO和苯环上净电荷增量ΔQR,且这3个结构参数与-lgEC50正相关,其标准系数分别为0.986、0.289和0.175。分子量越大,分子总能量（能量为负值）越低,化合物越稳定,毒性越大;分子量越大,lgP越大,化合物的脂溶性越大,毒性越大。[结论]该试验建立的模型具有良好的稳定性和很强的预测能力。     

分子连接性指数mXz与脂环烃和脂肪烃沸点的定量关系

提出了计算分子中成键原子点价δzi的新方法,并以δzi为基础建构了新的分子连接性指数mXz,研究了mXz(m=0,1)与脂环烃和脂肪烃沸点的定量关系。结果表明,mXz指数与脂环烃和脂肪烃的沸点具有优良的性质相关性,并且mXz指数的性质相关性明显优于Kier指数。以0Xz,1Xz和碳原子数N为自变量的三元回归方程可以预测脂环烃和脂肪烃的沸点。对于碳原子数N为4～30的化合物,预测值与实验值符合较好。     

超分子与纯分子连接性指数的研究与应用

根据有关原理与方法,计算了色谱分离过程中溶质分子的分子连接性指数及其与固定相形成超分子的超分子连接性指数。并用这些指数对硫醇类化合物在聚乙二醇固定相上分离的定量结构-保留关系(QSRR)进行了研究,所得回归方程相关系数高达0．99。该方法不仅保留了分子连接性指数的优点,还能够反映溶质分子与固定相相互作用模型对色谱保留值的影响,因此超分子连接性指数比分子连接性指数能更全面地反映影响色谱保留值的因素,使用范围更广泛,具有良好应用前景。     

超分子与纯分子连接性指数的研究与应用

根据有关原理与方法,计算了色谱分离过程中溶质分子的分子连接性指数及其与固定相形成超分子的超分子连接性指数.并用这些指数对硫醇类化合物在聚乙二醇固定相上分离的定量结构-保留关系(QSRR)进行了研究,所得回归方程相关系数高达0.99.该方法不仅保留了分子连接性指数的优点,还能够反映溶质分子与固定相相互作用模型对色谱保留值的影响,因此超分子连接性指数比分子连接性指数能更全面地反映影响色谱保留值的因素,使用范围更广泛,具有良好应用前景.     

基于分子电性距离矢量的CDK4抑制剂Fascaplysin定量构效关系研究

海洋生物的多样性、活性物质结构的新颖性以及海洋环境的独特性使得海洋生物成为天然抗肿瘤活性物质的重要来源之一。以分子电性距离矢量（MEDV-13）为结构描述子,应用基于预测的变量筛选（VMSP）方法,对44种海洋Fascaplysin类CDK4抑制剂的活性作用数据进行模拟分析,获得一个6变量的定量结构—活性关系（QSAR）模型,而且对样本内部使用LOO（Leave-One-Out）验证方法、外部通过测试集对模型进行了验证。模型相关系数r=0.923 9,LOO交互检验相关系数q=0.878 9,显示模型具有良好的估计能力和对外部样本的预测能力。随后,计算了模型最优子集各变量对生物活性的碎片贡献率,结果显示,影响抑制剂活性的主要分子结构单元为=C-(或-C-)、>C-、>N-、-O以及二联苯中苯环的位置,苯环在对位时对活性有利。     

单烯烃的沸点与分子价连接性指数（mX*）的关系

提出了一个计算不饱和烃分子中碳原子价点价 δ*i 的新方法 ,以 δ*i 为核心建构了分子价连接性指数 m X* (m=0 ,1) ,并研究了单烯烃的沸点与 m X*的相关性。结果表明 ,m X*不仅对单烯烃具有优良的结构选择性 ,而且与单烯烃的沸点具有高度相关性。     

应用结构信息价连接性指数预测多氯联苯(PCBS)的气相色谱保留指数(RRT)

根据隐氢分子图中顶点i原子的价层轨道在参与成键时的杂化形式,新定义了顶点i原子的价点价δiY,以价连接矩阵为基础构建了1个新的结构信息价连接性指数mQtY。新的结构信息价连接性指数mQtY能很好地反映化合物的结构特征,并且比Kier等人提出的价连接性指数mχtv的结构选择区分性能好。多氯联苯(PCBS)是一类重要的环境污染物。利用多元线性回归技术建立了209个PCBS化合物的mQtY与这些物质的气相色谱保留指数(RRT)的定量结构/保留相关关系(QSRR)模型,其相关性良好。新模型物理意义明确,计算简便,预测能力比较强。     

基于分子电性距离矢量的CDK4抑制剂Fascaplysin定量构效关系研究

海洋生物的多样性、活性物质结构的新颖性以及海洋环境的独特性使得海洋生物成为天然抗肿瘤活性物质的重要来源之一。以分子电性距离矢量(MEDV-13)为结构描述子,应用基于预测的变量筛选(VMSP)方法,对44种海洋Fascaplysin类CDK4抑制剂的活性作用数据进行模拟分析,获得一个6变量的定量结构—活性关系(QSAR)模型,而且对样本内部使用LOO(Leave-One-Out)验证方法、外部通过测试集对模型进行了验证。模型相关系数r=0.923 9,LOO交互检验相关系数q=0.878 9,显示模型具有良好的估计能力和对外部样本的预测能力。随后,计算了模型最优子集各变量对生物活性的碎片贡献率,结果显示,影响抑制剂活性的主要分子结构单元为=C-(或-C-)、>C-、>N-、-O-以及二联苯中苯环的位置,苯环在对位时对活性有利。研究亮点:发展小分子CDK4抑制剂是当前癌症治疗的新研究领域。首次使用QSAR方法对44种海洋Fascaplysin类化合物的生物活性与其分子结构之间的定量关系进行研究,且对模型进行了内部验证和外部验证,计算了基团对活性的贡献大小。     

有机磷农药氯过氧化物酶反应活性的定量构效研究

氯过氧化物酶（CPO）是应用最广的一种过氧化物酶,能催化一系列底物的氧化。采用量子化学从头算方法在HF／6—31G（d）水平下计算了7种含S=P键的有机磷农药的多个量子化学参数,运用偏最小二乘法建立CPO对有机磷农药反应活性的定量结构-活性关系（QSAR）模型。结果表明,CPO对有机磷农药的反应活性与所考查的量子化学参数之间存在非线性关系。以对数关系建模得到了相关系数为0．910的模型,该模型具有较高的拟合精度和较强的预测能力。模型辅助分析表明。农药分子的S=P键中S原子电荷的大小对氧化活性的影响最大,P原子电荷大小的影响次之,分子偶极矩对氧化活性也有一定影响：农药分子中S原子带负电荷越多,P原子所带正电荷越多,分子极性越小,该农药就越容易被CPO催化氧化。最后运用所得模型预测了2种有机磷农药的CPO反应活性。     

定量构效关系研究方法及其在环境科学中的应用

定量构效关系是一种非常有效的有机污染物环境活性预测手段,其核心是建立有机物结构与活性之间的函数关系.文章系统介绍了定量构效关系的发展历程及其研究方法,并以有机农药、多环芳烃、多氯联苯和苯取代物等典型环境有机污染物为例,对定量构效关系在环境科学中的应用进行了综述,最后对定量构效关系的发展趋势进行了展望.     

卤代苯沸点与分子结构的定量关系

用结构信息连接性指数mL研究了卤代苯的沸点与分子结构之间的定量关系。提出了计算有机物分子中成键原子点价izδ*的新方法。基于izδ*和分子图的邻接矩阵,建构了一个新的结构信息连接性指数mL(m=0,1,2),并研究了mL指数与卤代苯沸点的相关性。结果表明,mL指数与卤代苯的沸点具有良好的性质相关性,其相关性明显优于mXv指数(Kier指数)。以mL(m=0,1,2),lgmL(m=0,1,2)和相对分子质量MW为自变量的六元和七元回归方程的相关系数分别为0.999 1和0.999 6,其对卤代苯沸点的预测结果非常令人满意。     

一种基于表达序列标签（EST）的新型目标分子标记技术——保守区域扩增多态性（CoRAP）

CoRAP分子标记技术是一种基于表达序列标签的目标分子标记新技术,具有操作简单、重复性高和特异性强等优点。该分子标记的原理是：根据表达序列标签来设计1个固定引物,根据大多数内含子内部的一段保守序列设计另1个随机引物,在退火温度为52℃的常规3步法PCR程序下,扩增产生偏向表达序列标签附近区域的显性或共显性标记。该分子标记可以作为SRAP、TRAP标记有效补充的目标分子标记新技术,在生物多样性分析、遗传图谱构建、重要性状基因标记、QTL定位及分子标记辅助育种等方面均有较大的应用潜力。     

分子蒸馏技术拆分细辛油及GC-MS分析

水蒸气蒸馏法得到细辛油,利用分子蒸馏技术对细辛油进行拆分,得到不同馏分物,并进行气相色谱-质谱(GC-MS)分析。分子蒸馏条件分为二级,一级蒸发温度为30℃,真空度5.0 mbar;二级蒸发温度为60℃,真空度5.0 mbar,二级进样温度均为30℃,冷凝水温度为10℃,刮膜转速150~160 r·min-1。结果表明,经过二级分离后,得到2部分轻组分(distillate fraction,DF)和1部分重组分(residue fraction,RF);一级轻组分(DF1)、二级轻组分(DF2)和二级重组分(RF2)所占质量比分别为68.30%、13.27%和15.95%。对原油和各级馏分物分别进行GC-MS分析,共检测出35个化合物,主要成分为右旋萜二烯、α-蒎烯、β-蒎烯、4-萜烯醇、桉叶油醇、萜品油烯和L-香芹醇等;3部分馏分物DF1、DF2和RF2及原油中组分数量分别为6、16、28和14种;且各部分中成分相对含量差别显著。以上结果表明分子蒸馏技术能有效对原油成分进行拆分,为挥发油充分利用提供新的理论基础。     

新型甘蓝型油菜CMS选育及分子鉴定

以榨菜细胞质雄性不育系(CMS)为不育胞质来源,甘蓝型油菜自交系为父本,通过连续回交定向选育方法进行榨菜胞质甘蓝型油菜CMS的转育,获得了原始不育系‘93-12A’,并通过父本载体的转换对其进行改良,获得了一份综合性状较优良的不育系‘嘉油58A’;根据已报道的油菜CMS相关基因orf224、orf138和叶用芥菜CMS相关基因orf220设计特异引物,对榨菜胞质甘蓝型油菜CMS及其保持系的基因组DNA进行PCR扩增,结果显示,仅orf220的特异引物能在原始不育系‘93-12A’和改良不育系‘嘉油58A’中扩增出特异条带,扩增产物序列与orf220具有100%的同源性,从而从分子水平验证‘93-12A’和‘嘉油58A’的不育胞质来源于榨菜。     

QTLs for Sugar Content of Stalk in Sweet Sorghum （Sorghum bicolor L.Moench）

High sugar content of sorghum stalk is an important factor in the sorghum silage production. To identify the genomic regions controlling sugar content and to develop molecular markers linked to sugar content in sweet sorghum, we used an F2：3 segregating population consisting of 207 individuals derived from a cross between a high sugar content inbred line, Early Folger, and a normal inbred line, N32B, for genetic linkage mapping and quantitative trait locus （QTL） analysis. We constructed a genetic linkage map spanning 983.5 cM based on a total of 327 markers comprising 31 restriction fragment length polymorphism （RFLP） markers, 254 amplified fragment length polymorphism （AFLP） markers, and 42 simple sequence repeat （SSR） markers. In the 20 linkage groups detected, 98.2% of markers aligned to the 10 linkage groups of sorghum. Variations in sugar content at different growth stages and among internodes suggested that the sugar content of middle internodes is stable and suitable for measuring at early dough stage. The broad sense heritability （hB0 of sugar content was 0.64 and 0.62 estimated from the data of F3 families and each parent in 2003 and 2004. We identified one and two QTLs accounting for 22.2 to 25.0% of phenotypic variance using simple interval mapping method in 2003 and 2004, respectively. These two QTLs showed a negative additive effect, and over-dominance effect. A QTL on LG-D was detected in both two years. Above results will be help us to understand the genetic mechanism of sugar content in sorghum and the QTL detected in this study might be useful in the improvement of sugar content by marker-assisted selection.     

MA(1)时序的三足标尾指数估计量

给出了有限移动平均时间序列尾指数的一类三足标的Pickands型估计量,证明了其弱相合性和渐近正态性,并在均方误差最小的情况下,给出了参数k1的优选.     

MA(1)时序的三足标尾指数估计量

给出了有限移动平均时间序列尾指数的一类三足标的Pickands型估计量,证明了其弱相合性和渐近正态性,并在均方误差最小的情况下,给出了参数k1的优选．