牡丹AFLP荧光反应体系的建立和优化

以牡丹的叶片为材料,通过对扩增长度多态性(AFLP)反应体系中几个关键参数进行优化,建立了牡丹的AFLP荧光反应体系,首次在牡丹DNA提取、酶切连接、预扩增、选择性扩增等试验过程取的成功,得到了清晰的部分牡丹品种的指纹图谱.为牡丹品种指纹图谱的绘制、亲缘关系的研究等奠定基础.     

柑橘苗期SSR鉴定分析体系的优化及初步应用

以柑橘幼苗微量叶片（3～5mg）为材料,改进柑橘基因组DNA提取方法,并对3种PAGE凝胶浓度和3种银染色方法进行了筛选和优化,建立了一种经济,高效的柑橘苗期SSR分析体系。试验结果表明：该微量叶片提取方法需材少,用时短,所提取基因组DNA质量好、纯度高,完全适用于SSR—PCR扩增反应。     

茄子微卫星标记(SSR)反应体系的优化研究

以茄子品种"哈农杂茄4号"DNA为试材,利用单因素试验方法,研究了茄子SSR技术中PCR体系的主要成分对SSR扩增结果的影响,并比较了聚丙烯酰胺凝胶和琼脂糖电泳检测扩增产物多态性的差异。结果表明:反应体系中,模板DNA的适宜浓度为20~40ng,适宜的引物浓度为0.3μmol/L,dNTP的适宜浓度为200μmol/L,Mg2+的最适浓度范围为2.0~2.5mmol/L,Taq聚合酶在20μL反应体系中宜加入1U。茄子SSR的最佳反应程序为94℃预变性5min;94℃变性1min,52~56℃复性1min,72℃延伸2min,35个循环;最后72℃延伸8min。PCR产物检测时6%的聚丙烯酰胺凝胶的分辨率显著高于1.8%的琼脂糖电泳。     

岩虱子RAPD反应体系的研究

利用RAPD（随机扩增多态DNA）技术对濒危植物岩虱子进行了RAPD反应体系的研究.以岩虱子叶片为材料,采用改良的CTAB法提取其基因组DNA,进行RAPD反应条件的优化试验.通过单因子试验分别研究了模板DNA用量、Mg^2＋浓度、dNTPS浓度、Taq酶的用量和引物浓度对RAPD反应的影响,建立了适于岩虱子RAPD分析的有效的稳定的反应体系,即在25μL总反应体系中,模板DNA的最适用量为10 ng、Mg^2＋的适宜浓度为2.0 mmol/L、dNTPs的适宜浓度2.2 mmol/L、Taq酶的用量以1 U、随机引物的浓度以2.5 μmol/L为佳.     

虎奶菇菌丝体和菌核基因组甲基化分析

以虎奶菇[Pleurotus tuber-regium (Fr.) Singer]菌丝体和菌核为材料,利用MSAP技术分析其甲基化水平,并对甲基化差异片段进行回收测序,探究虎奶菇生长与DNA全基因组甲基化的关系.结果 表明,菌丝体和菌核的DNA甲基化率分别为7.94％和9.54％,其中半甲基化率分别为4.50％和4.0...     

野蔷薇的DNA提取和RAPD反应体系的建立

以野蔷薇(Rosa multiflora)的冬末初春芽和夏初叶片为材料,研究了DNA的提取方法,并对影响随机扩增多态DNA(RAPD)的反应因素进行了优化.建立了适合野蔷薇RAPD的反应体系和反应程序,在20μL反应体系中,25ng模板DNA,2.0mmol/LMgCl2,0.2mmol/LdNTPs,1UTaqDNA聚合酶,0.1μmol/L引物.扩增程序为:94℃预变性4min,然后94℃变性45s,37℃退火1min,72℃延伸1min,37个循环,最后72℃延伸5min,4℃保存.     

板栗基因组AFLP银染反应体系的建立

为了建立准确、高效、实用的板栗品种鉴别体系和方法,采用改进的CTAB—DNA提取方法,从板栗的嫩叶和老叶中提取获得总DNA。所得DNA样品的D260nm/D280nm值为1.7～1.9,琼脂糖凝胶上主带清晰、较少降解、样品纯度高、蛋白去除干净且获得率高。该体系使用操作简便、快捷、高效,适合于板栗DNA提取,所提取的DNA样品不含PCR反应抑制剂及其他酶反应抑制剂,可被限制性内切酶MseI和EcoRI完全酶切,适合AFLP-PCR反应应用,得到清晰的指纹式样,适宜用作板栗品种鉴别的有效方法。     

李属植物DNA提取及RAPD反应体系的优化

以1号李,6号李和公主红为试材,对李属植物DNA提取方法进行改良并进行RAPD反应体系的优化.结果表明:改良CTAB(3%)法提取的DNA产量高,可满足RAPD扩增的需要.25 μL反应体系中,DNA聚合酶、Mg2 、引物、模板DNA和dNTPs 5种主要成分的适宜浓度或用量分别是:1.0 U、2.0mmol/L、10 pmol/L、20 ng和1.0mmol/L.     

菠萝DNA的提取及AFLP反应体系的建立

为了应用AFLP分子标记对菠萝种资源进行种质鉴定、分类及亲缘关系等方面的研究,最重要的是要获得高质量的DNA,菠萝叶片革质化程度较高,且纤维、多糖、多酚等次生代谢物质含量较多,严重干扰DNA的抽提或影响其后的AFLP双酶切及其扩增反应,本研究以菠萝叶片为材料,利用改良CTAB法得到了39个高质量的菠萝分类群的DNA基因组,并进行了AFLP分析,得到了条带清晰、多态性好的菠萝品种指纹图谱,这为菠萝基因库的建立、优良品种选育以及亲缘关系的系列研究提供理论依据。     

硅胶干燥胡杨叶片DNA提取与RAPD反应体系的建立

以塔里木河流域胡杨(Populus euphratica)硅胶干燥叶片为材料,采用改进CTAB法提取胡杨基因组DNA,得到满足RAPD(Random amplif ied polymorphic DNA),随机扩增多态性DNA分析的胡杨基因组DNA。通过单因素优化试验,得到胡杨RAPD分析的最佳反应体系为:40 ng模板DNA,0.8 U rTaqDNA聚合酶,2.5 mmol/L Mg2+,0.3 mmol/L dNTPs,0.5μmol/L随机引物,1×buffer缓冲液,ddH2O补足至10μL。扩增反应程序为:94℃预变性5 min,94℃变性30 s,38℃复性30 s,72℃延伸120 s,35个循环,最后72℃延伸7 min。     

番木瓜DNA提取与SRAP反应体系优化

对番木瓜基因组DNA的提取及SRAP反应体系的模板、引物、dNTP、Taq聚合酶等条件进行了优化。结果表明,在20μL反应体系中,最优反应体系为模板DNA 40 ng,引物浓度0.4μmol/L,Taq聚合酶0.4 U/20μL,dNTPs 0.2 mmol/L。番木瓜的SRAP-PCR程序为94℃预变性4分钟;94℃变性1分钟,35℃复性1分钟,72℃延伸1.5分钟,5个循环;94℃变性1分钟,52℃复性1分钟,72℃延伸1.5分钟,35个循环;最后72℃延伸10分钟,4℃保存。     

满天星基因组DNA提取及RAPD扩增条件优化

以满天星试管苗叶片为材料,进行满天星基因组DNA提取及RAPD扩增条件优化。结果表明,采用CTAB法提取的DNA质量较高,适宜于RAPD分析;RAPD扩增最佳反应体系为25μL：14．17μL ddH2O,150μmol／LdNTP,1．5μmol／L MgCL2,2．5μL Buffer,0．3μmol／L引物,10ngDNA模板,1U TaqDNA聚合酶。扩增反应程序为：94℃预变性5min,94℃变性1min,36℃退火1min,72℃延伸1．5min;45个循环;最后72℃延伸7min。     

西印度瓜幼胚超微量DNA提取及甜瓜远缘杂交早期SSR鉴定

因存在巨大的生殖障碍,甜瓜远缘杂交十分困难,因而进行甜瓜远缘杂交生殖学研究对于克服甜瓜远缘杂交障碍具有重要意义.采用Chelex-100法对西印度瓜自交授粉后3d的幼胚进行了单胚DNA提取,结果Chelex-100法对质量低至0.3 mg的单个幼胚可有效提取DNA,SSR扩增分析表明该方法可满足SSR分析要求;对西印度瓜和甜瓜杂交后的幼胚进行了Chelex-100法DNA提取及SSR分析,结果在幼胚DNA中稳定地扩增出父本SSR特征带,表明西印度瓜和甜瓜在授粉后不久已成功地完成了杂交.研究为甜瓜远缘杂交障碍的克服提供了理论依据.     

桃基因组DNA提取方法及部位的比较研究

通过对桃基因组DNA几种提取方法所得的DNA质量分析,表明分步离心法是最为理想的提取方法,能满足RAPD及其他分子生物学研究的需要。用此方法提取桃不同部位基因组DNA,结果分析表明,从嫩叶和幼嫩果实提取DNA产率较高。     

IBA与ABT不同浓度组合对喜树扦插生根效应的影响

以珍珠岩∶草炭=1∶1为基质,采用不同浓度组合的IBA和ABT配比,研究了各处理对2 a生喜树嫩枝扦插生根效应的影响。结果表明:与清水对照相比,不同浓度IBA和ABT组合均可显著提高插穗生根质量;处理后的插穗愈伤组织及新生根产生时间显著提前;新生根长度、插穗成活率及新生叶数量显著提高;干鲜重比值显著增加。在各处理中,以ABT 1 000 mg/L+IBA 1 000 mg/L浸泡20 s效果最好,第10天就可形成愈伤组织,比对照提前2 d;且愈伤生长速度最快,第10天直径可达0.43 cm;其生根时间也最早,第21天即可生根,比对照提前7.75 d;成活率平均可达81.67%,比对照提高了23.34%;同时,成活后的干鲜重比值比对照增加12.16%(P0.05)。同时试验还发现,喜树扦插中基质必须疏松透气、排水良好,而且要严格控制湿度,否则湿度过大仅产生愈伤组织,时间过长,愈伤褐化,引起插穗腐烂。     

天竺葵基因组DNA五种提取方法的比较

以天竺葵为试材,比较分析了CTAB法、简单法、高盐低pH值法、CTAB-SDS法、SDS法对天竺葵叶基因组DNA提取的效果。结果表明：5种方法提取的天竺葵总DNA在纯度上有很大的差别。所得到的DNA提取纯度依次为简单法、CTAB-SDS法、CTAB法、高盐低pH法、SDS法。酶切结果为简单法、CTAB法效果最好,其次SDS法,高盐低pH法、CTAB-SDS法不能被EcoRI酶完全消化。经综合的比较分析,认为简单法是最佳的提取方法。因其步骤简单、快捷,得到的基因组DNA降解少、杂质含量少,能获得高质量的DNA模板,可以用于分子生物学试验研究。     

冬瓜DNA提取方法的研究

采用CTAB、CTAB-Free、PVP、SDS 4种方法提取冬瓜DNA。结果表明：PVP法和CTAB-Free法提取的冬瓜DNA质量高,完全能满足分子生物学研究的需要。     

基于SSR标记的食荚菜豆指纹图谱构建

以14个食荚菜豆品种为试材,采用SSR分子标记技术,对其进行遗传多样性研究,并建立了特异性指纹图谱,以期为今后食荚菜豆的品种鉴定建立新的参考依据,同时也为菜豆种质资源的分类和筛选提供分子生物学的参考方法。结果表明:74对SSR引物中有18对引物在供试样品中表现出多态性,筛选出其中5对具有良好多态性SSR引物(BM200、PVBR269、PVBR6、BM141、BM154)用于构建指纹图谱,并对14个食荚菜豆品种进行聚类分析。在相似系数为0.64时,14个食荚菜豆品种被分为2个类群,聚类结果显示"黑珍珠"和"黄金钩"的相似度最高,相似系数为0.98。最终构建菜豆指纹图谱,对深入挖掘菜豆种质资源,减少亲本选配的盲目性,提高育种工作效率,并对品种鉴定和知识产权保护均具有重要的应用意义。