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采用PCR产物直接测序法寻找家兔F11R基因变异位点,利用PCR-SSCP分型技术对新西兰兔共257个(患病组:n=129,健康对照组:n=128)个体进行基因分型及case-control关联分析。结果发现家兔F11R基因内含子2上存在一个SNP位点(c.178+177 C>T),c.178+177 C和c.178+177 T在case组和control组中平均基因频率为分别为0.5175和0.4825,三种基因型CC、CT和TT的频率分别为0.2724、0.4903和0.2373。该位点在case和control的整个群体中表现出中度多态(0.25T位点与家兔非特异性消化道紊乱不相关(P>0.05)。 相似文献
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为研究黑皮质素受体1(MC1R)基因对吐鲁番黑山羊毛色的影响,试验采用PCR扩增和测序技术,对吐鲁番黑羊MC1R基因编码区核苷酸序列及其与毛色的相关性进行了研究。结果表明:MC1R基因编码区核苷酸序列954 bp,编码317个氨基酸,编码区存在2个错义突变(c.218 T〉A,p.73 Met〉Lys;c.361 G〉A,p.121 Asp〉Asn)和3个同义突变(c.429 C〉T,p.143 Tyr〉Tyr;c.600 T〉G,p.200 Leu〉Leu;c.735 C〉T,p.245 Ile〉Ile)。SNPs分析表明,单倍型AATGT数量占62%。初步认为MC1R基因可以作为吐鲁番黑羊黑色被毛调控的候选基因。 相似文献
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旨在研究马MC1R基因多态位点与马毛色的关联性,为马的毛色育种提供重要的理论参考依据。本研究采集了10种不同毛色共132匹马的颈静脉血,提取基因组并应用PCR技术克隆MC1R基因编码序列,通过限制性长度多态性(RFLP)分析和测序分析,对马MC1R基因多态性与毛色进行关联分析,并预测了SNPs对其编码蛋白结构的影响。构建和分析了MC1R基因的系统发育树。结果发现,马MC1R基因存在3个多态位点,其中c.G102A为同义突变,c.C248T和c.G250A为错义突变。c.C248T造成MC1R蛋白的第83个氨基酸由极性亲水丝氨酸变为非极性疏水苯丙氨酸,预测突变后该位点氨基酸与第三跨膜区的第127个氨基酸(丝氨酸)之间的氢键消失而改变了MC1R的蛋白构象,该突变导致MC1R基因出现EE、Ee和ee 3种基因型。错义突变c.G250A导致其翻译的氨基酸由天冬氨酸变为天冬酰胺,该位点突变后与邻近氨基酸及跨膜域作用力复杂,推测比只出现c.C248T突变对MC1R蛋白功能的影响要小,该位点突变导致出现基因型ee~a。综合NCBI中的马MC1R基因型数据(共571匹)与其毛色性状进行相关性分析发现,在骝毛马和黑毛马群体中存在EE和Ee两种基因型,青毛马群体中存在EE、Ee、ee和ee~a基因型,栗毛中存在ee和ee~a两种基因型。黑毛和骝毛马的基因型分布差异极显著(P0.01),呈现Hardy-Weinberg不平衡,等位基因E为优势等位基因;在栗色马中未检测到E等位基因,e为优势等位基因。MC1R基因系统发育树分析显示,EE基因型个体与家马、普氏野马相似性最高。本研究结果显示,马MC1R多态位点产生的不同基因型与马的骝毛、黑毛、栗毛及以这3种毛色为基础毛色的花马毛色存在相关性,骝毛马与黑毛马中不存在基因型ee,栗毛马中则不存在等位基因E。为应用基因型对马的毛色进行定向选择育种奠定了基础。 相似文献
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本研究合成非洲猪瘟的K205R基因,将K205R基因克隆至pET-30c(+)质粒,构建重组原核表达质粒pET30C-K205R。该重组质粒的阅读框架正确,表达的融合蛋白的N端和C端均带6×组氨酸。pET30C-K205R-BL21菌株经培养和诱导表达后,可生产K205R可溶性蛋白,K205R可溶性蛋白可用Ni柱纯化。纯化表达K205R蛋白的ELISA试验证明,表达的K205R蛋白与猪阳性非洲猪瘟血清具有较好的特异性反应。 相似文献
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流形学习算法是一种非常有效的非线性数据降维方法被广泛应用于数据挖掘,模式识别,机器学习等邻域.基于Hessian特征映射的局部线性嵌入算法(HLLE)是一种经典的流形学习算法,在很多方面都有很好的应用.但是HLLE算法对邻域的选择太过敏感,如何提高邻域选择的稳定性成了算法研究的核心内容,本文提出一种基于均值距离的选择邻域的方法,大大的提高了算法的对邻域选择的稳定性,在人工流形上取得了很好的实验效果. 相似文献
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TAS1R2基因是味觉受体I型家族的第2个成员。本试验采集新西兰兔共417个样本,采用PCR产物直接测序法检测了家兔TAS1R2基因上的单核苷酸多态性(SNPs),分析不同基因型与日龄重的遗传效应。研究结果如下:家兔TAS1R2基因exon 6的c.1581 G>A突变基因型AA极显著影响40日龄、56日龄和84日龄家兔的体重以及35~84日龄的平均日增重(P<0.01),可考虑将TAS1R2基因作为家兔生产性状的候选基因,以期为家兔生长性状标记辅助选择提供理论依据。 相似文献
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IgG Fc受体(FcγRs)的一个主要效应机制是可结合IgG免疫复合物发生反应。目前已鉴定出的FcγRs有4类:高亲和力的FcγRⅠ(CD64),中等亲和力的FcγRⅠ、FcγRⅡ(CD32),以及低亲和力的FcγRⅢ(CD16)。人FcγRⅡ主要有FcγRⅡa、FcγRⅡb、FcγRⅡc 3个亚型;小鼠有1个亚型FcγRⅡb;牛有2个亚型FcγRⅡb、FcγRⅡc。人、小鼠、牛中FcγRⅡb又包括2个亚型:FcγRⅡb1(b1)和FcγRⅡb2(b2),但有关猪FcγRⅡb亚型的研究鲜有报道。本研究对猪FcγRⅡb亚型(FcγRⅡb1)进行了分子克隆、测序及鉴定,并运用RT-PCR从猪外周血白细胞RNA中扩增出猪FcγRⅡb1cDNA序列。结果发现,猪FcγRⅡb1cDNA序列包含一个951bp的开放阅读框(ORF),可编码316个氨基酸跨膜糖蛋白,包括两个免疫球蛋白(Ig)样胞外结构域,一个跨膜区域,一个带有免疫受体酪氨酸抑制基序(ITIM)的胞质尾区。猪FcγRⅡb1cDNA序列与DQ026064同源性为98.3%,其在胞质尾区有一19个氨基酸的插入框。荧光免疫试验结果发现,猪FcγRⅡb1cDNA序... 相似文献
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《中国家禽》2021,(11)
为研究影响太行鸡不同羽色性状的重要候选基因MC1R的表达及生物信息学特性,试验以太行鸡麻、白两种羽色为研究对象,采用PCR克隆、实时荧光定量PCR技术和生物信息学分析进行探讨。测序结果显示:太行鸡MC1R基因CDS序列为945 bp,编码蛋白为314个氨基酸;蛋白理化性质分析发现,MC1R蛋白存在7个跨膜区,为跨膜受体;CDS区序列比对发现,太行鸡MC1R基因存在c.637CT的突变,突变造成编码氨基酸mRNA二级结构和编码蛋白空间结构发生改变;实时荧光定量PCR检测发现,太行鸡麻羽品系毛囊中MC1R的表达量极显著高于白羽品系(P0.01)。研究结果表明:MC1R基因的c.637CT突变显著影响太行鸡的羽色,可以作为太行鸡羽色选育的候选分子标记。 相似文献
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《中国禽业导刊》2000,(12)
国 务 院 召 开 的 全 国 粮 食 生 产 和 流 通 工 作 会 议 近 日 在 北 京 举 行 。 会 议 的 主 要 任 务 是 , 全 面 分 析 当 前 粮 食 生 产 和 流 通 面 临 的 新 形 势 , 研 究 部 署 进 一 步 落 实 和 完 善 食 流 通 体 制 改 革 , 推 进 农 业 和 粮 食 生 产 结 构 调 整 的 各 项 工 作 。 中 共 中 央 政 治 局 常 委 、 国 务 院 总 理 朱 钅 容 基 在 闭 幕 会 上 发 表 讲 话 。 他 强 调 , 各 地 区 、 各 部 门 都 要 把 思 想 认 识 和 行 动 进 一 步 统 一 到 中 央 关 于 粮 食 流 通 体 制 改 革 的 政 … 相似文献