基于线粒体DNA标记的阿根廷滑柔鱼2个产卵群体遗传变异分析

通过线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ(COI)和细胞色素b(Cytb)基因2个分子标记对阿根廷滑柔鱼(Illex argentinus)冬生群体与秋生群体的遗传变异进行了研究,并检验了冬生群体在时间上的遗传差异。结果显示,基于COI基因序列分析得到的单倍型数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数及平均核苷酸差异数分别为11、0.535±0.066、0.002 24±0.001 59和1.243。基于Cytb基因序列分析得到的单倍型数、单倍型多样性指数、核苷酸多样性指数及平均核苷酸差异数分别为7、0.528±0.058、0.002 65±0.001 89和1.222。2个分子标记均揭示:阿根廷滑柔鱼2个产卵群体具有较高的单倍型多样性指数和较低的核苷酸多样性指数。单倍型邻接树、分子方差分析(AMOVA)及两两群体间的遗传分化系数F st均表明,阿根廷滑柔鱼2个产卵群体间的遗传差异不显著,不存在显著的群体遗传结构。此外,冬生群体在时间上的遗传差异也不显著,。可见,阿根廷滑柔鱼产卵群体间具有频繁的基因流。推测与该物种为大型洄游性种类,生命周期短,以及海洋环流有关。     

西南大西洋阿根廷滑柔鱼遗传多样性的微卫星分析

西南大西洋阿根廷滑柔鱼(Illex argentinus)是重要的经济大洋性头足类,其种群结构较为复杂。本研究采用8个微卫星标记,对西南大西洋阿根廷滑柔鱼群体的遗传多样性进行了检测。8个基因座位上,共检测出172个等位基因,每个基因座位检测到10～30个等位基因不等。8个位点的平均观测等位基因数为21.500 0,平均有效等位基因数为12.074 1。各位点的观测杂合度(Ho)变化范围为0.300 0～0.775 0,期望杂合度(He)为0.484 2～0.977 0,平均观测杂合度为0.504 6,平均期望杂合度为0.873 4。8个微卫星位点的多态信息含量(PIC)平均值为0.853 6。以卡方检验估计Hardy-Weinberg平衡,发现8个基因座位均不符合Hardy-Weinberg平衡。Fst分析显示该群体无明显的遗传分化。研究结果揭示:西南大西洋阿根廷滑柔鱼种群显示了高水平的微卫星多态性,该海域阿根廷滑柔鱼群体的遗传多态性水平在经历了近十年的密集捕捞压力后没有明显的变化,同时证明微卫星分子标记是研究该物种自然种群的有利工具。     

西南大西洋阿根廷滑柔鱼夏季产卵种群繁殖生物学的初步研究

根据我国鱿钓船于2012年12月—2013年3月渔汛期间,在西南大西洋公海海域作业时随机采集的阿根廷滑柔鱼夏季产卵种群样本(雌性148尾,雄性99尾),初步研究了其种群繁殖生物学。结果表明,渔汛期间阿根廷滑柔鱼夏季产卵种群雌性胴长172~252 mm,雄性胴长164~248 mm。随着月份推移,雌性占比逐月递减,从12月份的84.21%递减至次年3月份的27.03%;雄性个体占比则逐月递增,从12月份的15.79%递增至次年3月份的72.97%。雌性样本超过30%的个体性腺发育成熟并且部分处于繁殖期,雄性个体超过60%的个体性腺发育成熟并且部分处于繁殖期。雌雄个体的胴长和体质量均在性腺功能发育成熟时达到最大值,但是雌性胴长大于雄性,体质量却小于雄性。性腺指数、缠卵腺指数和精荚复合体指数随着个体生长逐渐增长。雌性个体性腺指数为0.001 2~0.31,平均值0.074;缠卵腺指数为0.003 1~0.55,平均值0.29;两者随着个体生长逐渐增长,在性腺功能成熟时达到最大值。雄性个体性腺指数为0.007 5~0.084,平均值0.038;精荚复合体指数为0.000 79~0.035,平均值0.012;两指数在繁殖期时达到最大值。     

牙鲆养殖群体遗传变异的微卫星标记研究

应用10对微卫星引物对中国牙鲆一个养殖群体的30个个体进行了群体遗传结构分析。结果显示，微卫星标记比其他标记具有更高的多态性，10个微卫星座位的等位基因数在4～10之间，有效等位基因数在2．23～5．82之间，平均等位基因数为7．6，群体平均杂合度为0．6960，Hardy-weinberg遗传偏离指数的平均值为0．1774。     

西南大西洋阿根廷滑柔鱼两个群体耳石重量变化特性研究

根据2007年2～5月和2010年1～3月我国鱿钓船在西南大西洋公海采集的阿根廷滑柔鱼(Illexargentinus)样本,提取574对耳石并进行称重,利用方差分析(ANOVA)法和最小显著差多重比较法(LSD)对南巴塔哥尼亚群体(South Patagonic Stock,SPS)和布宜诺斯艾利斯—巴塔哥尼亚群体(Bonaerensis-Northpatagonic Stock,BNS)分别进行分析,研究不同性别、不同性腺成熟度、不同胴长组和耳石外部形态对耳石重量变化的影响。结果表明,BNS群体不同性别耳石重量不存在差异(P>0.05),SPS群体耳石重量性别间差异极显著(P<0.01);BNS群体耳石重量在不同性腺成熟度间存在极显著差异(P<0.01),SPS群体雌性在不同性腺成熟度间存在着极显著差异(P<0.01),雄性则无差异(P>0.05);两个群体在不同的胴长组间均存在极显著差异(P<0.01),240～260 mm和220～240 mm分别为BNS群体雌、雄性胴长范围所对应的耳石增重变化的拐点,220～240 mm和200～200 mm分别为SPS群体雌、雄性胴长范围所对应的耳石增重变化的拐点;两个群体的耳石总长(TSL)、背侧区长(DLL)和侧区长(LDL)与耳石重量的相关性较大,并且它们之间的关系符合对数生长曲线,两个群体在不同的耳石长度组之间均存在极显著差异(P<0.01),耳石总长1 000μm左右是阿根廷滑柔鱼耳石总长所对应耳石重量的变化拐点。     

西南大西洋公海阿根廷滑柔鱼渔业生物学初探

根据2012年1-4月西南大西洋公海鱿钓渔船随机采集的666尾阿根廷滑柔鱼样本,对其鱿钓渔获的群体组成、形态特征、雌雄性比、缠卵腺及性腺发育等渔业生物学进行分析。结果显示：调查期间鱿钓渔业阿根廷滑柔鱼渔获群体胴长为91～351 mm,呈双峰分布,雌、雄性平均胴长分别为243.6 mm 和214.5 mm,雌性个体显著大于雄性;雌雄性比为1.26：1,以雌性个体为主;雌性群体性成熟以Ⅱ期为主（57.9%）,Ⅲ期以上个体为42.1%;雌性性成熟度、缠卵腺发育程度与个体大小密切相关,进一步研究认为缠卵腺长与其重量存在幂函数关系,且雌性性成熟个体缠卵腺指数明显大于未成熟个体;雄性个体性腺随着个体生长逐步发育。根据个体大小和性成熟状况推测,调查期间捕获的阿根廷滑柔鱼群体以南巴塔哥尼亚种群（ SPS）为主,混有少量的夏季产卵（ SSS）群体。     

2011年西南大西洋拖网渔获物阿根廷滑柔鱼生物学分析

根据2011年1月～4月双拖网船在西南大两洋作业时采集的901尾阿根廷滑柔鱼（lllex argentinus）样本,对其渔获群体组成、摄食等级、胴长-体质量关系以及性腺发育等进行了分析。结果表明,样本个体大小随采样时间的推移有明显增大趋势;小胴长组阿根廷滑柔鱼的摄食能力较大胴长组弱,摄食等级的高低与其繁殖高峰期有关。阿根廷滑柔鱼雌、雄初次性成熟胴长分别为191．6mm和182．6mm,性腺成熟度为Ⅴ期个体的平均胴长小于处于Ⅲ、Ⅳ期个体的平均胴长。综合分析推测,该研究采集的901尾样本为南部巴塔哥尼亚群体和夏季产卵群体的混合样本,在拖网作业后期,渔场补充了部分大个体的夏季群体。     

西南大西洋鱿钓作业渔获物——阿根廷滑柔鱼生物学分析

本文通过海上生产调查分析了西南大西洋鱿钓作业渔获物-阿根廷滑柔鱼的生物学特性。结果表明：⑴公海渔场3月前后的渔获物的雌雄比例、性成熟度、盼望生渔获物性成熟个体体长方面都有所不同，据此推测3月前后公海渔场的阿根廷滑柔鱼可能分属两个不同的种群，1-2月以SSS种群的个体为主，3月后则为SPS种群的个体代替；福克兰渔场渔获物的雌雄比例、性成熟度和雌性渔获物成熟个体体长情况表明福克兰渔场的阿根廷滑柔鱼群体和公海渔场3月后的群体同属SPS种群。⑵体重测定的结果表明渔获物的个体大小随时间的推移逐渐变大，生产者应据此在不同的渔汛阶段调整对钓钩和钓线的使用。⑶阿根廷滑柔鱼主要在夜间捕食，尤其以黄昏刚入夜和黎明前为主，生产者应注意对昼夜间生产时间的把握。     

阿根廷专属经济区海域阿根廷滑柔鱼(Illex argentinus)渔业管理现状及发展趋势

阿根廷滑柔鱼(Illex argentinus)(以下简称“阿鱿”)属浅海-大洋“跨界”头足类,主要分布在阿根廷大陆架和陆坡海域。阿鱿属单一种群种类,可分为4个亚种群。阿鱿亚种群的栖息、分布与阿鱿渔业及管理密切相关。阿鱿渔业由鱿钓和拖网2类渔业组成,分别为专业捕捞阿鱿和底拖网兼捕阿鱿。阿根廷专属经济区海域分为44°S以南(南渔区)、44°S以北(北渔区)2个阿鱿管理区域。阿根廷鱿钓渔业管理措施主要有：规定南、北渔区对鱿钓渔汛不同的开捕与关闭日期;在渔汛中开展阿鱿资源调查与评估;安排观察员登临渔船检查以及渔业检查员在港口核查、记录阿鱿的卸鱼量。拖网渔业规定航次阿鱿兼捕率不超过10%。近年来,阿根廷鱿钓渔业管理出现新的趋势,南、北渔区鱿钓渔汛开捕与关闭日期不断提前,鼓励鱿钓船进入毗邻公海作业,强化履行阿鱿陆地加工规定,暂不开放外国鱿钓船入籍阿根廷。最后,分析认为阿根廷南渔区鱿钓渔汛开捕提前将影响公海鱿钓船队的可利用资源,阿根廷渔业当局鼓励阿根廷鱿钓船进入公海作业的政策难以奏效,建议加强中国公海作业渔船阿鱿资源调查与监测并简要地探讨了中资企业阿根廷鱿钓船的发展对策。     

阿根廷滑柔鱼夏季产卵种群繁殖力及其卵母细胞的生长模式

根据2012年12月~2013年3月渔汛期间我国鱿钓渔船在西南大西洋公海海域作业时采集的阿根廷滑柔鱼(Illex argentinus)夏季产卵种群样本,选取19 ind胴长180~266 mm、体质量90~283 g样本的卵巢和输卵管,进行繁殖力及其卵母细胞生长模式的分析研究。结果表明,阿根廷滑柔鱼夏季产卵种群潜在繁殖力为25.38×103~134.77×103cell卵母细胞,生理性发育期和性腺成熟期个体潜在繁殖力大小基本一致。输卵管载卵量性腺成熟期时为潜在繁殖力的4.04%~24.75%,产卵繁殖期时为潜在繁殖力的3.27%~30.10%。潜在繁殖力与胴长呈幂函数关系,相对繁殖力和潜在繁殖投入指数与胴长没有显著的相关关系。卵巢卵母细胞长径0.08~1.81 mm,输卵管成熟卵子长径0.94~1.68 mm。生理性发育期和性腺成熟期,卵巢卵母细胞呈双峰值区间分布,峰值区间分别为0.45~0.65 mm和0.95~1.35 mm(或0.55~0.75 mm和1.15~1.45 mm)。产卵繁殖期,卵巢卵母细胞呈单峰值区间分布,峰值区间为0.45~0.65 mm。研究表明,阿根廷滑柔鱼夏季产卵种群卵巢卵母细胞发育为批次同步成熟模式,每次排卵后潜在繁殖力及其排卵量逐渐减少。     

日本对虾养殖群体两个世代遗传结构的微卫星分析

利用8对微卫星引物对日本对虾养殖群体两个世代的遗传结构进行了分析,共检测到108个等位基因,等位基因长度为196-528 bp,各位点等位基因数为6-23个。亲本和子代群体每个位点平均等位基因数目分别为8.5个和11.5个,平均观测杂合度分别为0.721和0.632,平均期望杂合度分别为0.775和0.764,平均多态信息含量分别为0.732和0.729。根据标记信息,利用最大似然法对两个世代的个体分别进行系谱结构推断,亲本群体划分为6个群体,群体间遗传距离为0.277-2.356,均值为1.510;子代群体划分为17个群体,群体间遗传距离为0-2.593,均值为1.113。亲本和子代分群体间的遗传距离变化范围为0-3.089,均值为1.238。根据各分群体间的Nei's遗传距离,用非加权组平均法(UPGMA)构建了日本对虾两个世代的遗传进化树。其中18个分群体(4个亲本群体和14个子群体)经过聚类后形成3个分支,其余5个分群体(两个亲本群体和3个子群体)明显偏离于主支。研究发现,子代的观测杂合度明显低于亲本,说明子代在继承亲本遗传信息的过程中已经丢失了一定的杂合性。     

红鳍东方鲀两个群体的遗传结构及与经济性状的相关性分析

本文利用21对多态性微卫星标记对河北省红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)良种场引进的日本群体和选育的秦皇岛群体进行了遗传结构分析.日本与秦皇岛两个群体的有效等位基因数分别为3.3697和2.8593,期望杂合度分别是0.6516和0.6073,多态信息含量分别是0.6009和0.5509.研究结果表明这两...     

Genetic variation in farmed populations of the gilthead sea bream Sparus aurata in Greece using microsatellite DNA markers

Genetic variation in seven reared stocks of gilthead sea bream Sparus aurata, originating from Greek commercial farms, was assessed using five polymorphic microsatellite markers and was compared with that of two natural populations from the Ionian and the Adriatic Seas. The total number of alleles per marker ranged from 11 to 19 alleles, and hatchery samples showed the same levels of observed heterozygosity with samples from the wild but substantially smaller allelic diversity and expected heterozygosity. The global genetic differentiation for the cultivated samples was significant as indicated by F_st analysis, which might indicate random genetic drift and inbreeding events operating in the hatcheries. On the contrary, no significant difference was found between the two wild populations. Population pairwise tests between farmed and wild stocks were also significant, with the exception of one hatchery sample, the Central Greece 1, which was not significantly different from the two wild samples perhaps due to its recent use in aquaculture from wild‐caught animals. The UPGMA tree topology grouped the wild samples together with the Central Greece 1 stock, and showed a clear division between wild and farmed sample sets for the six remaining hatchery samples. Knowledge of the genetic variation in S. aurata cultured populations compared with that in the wild ones is essential for setting up appropriate guidelines for the proper monitoring and management of the stocks either under traditional practices or for the implementation of selective breeding programmes.     

基于SPiCT模型对数据有限短生命周期阿根廷滑柔鱼的资源评估

以西南大西洋阿根廷滑柔鱼(Illex argentinus)为研究对象,基于连续时间的随机剩余产量模型(a stochastic surplus production model in continuous time,SPiCT),分析了6种方案下参数估计的变化及其对资源评估的影响。对比6种方案中阿根廷滑柔鱼的产量和单位捕捞努力渔获量(catch per unit effort,CPUE)的估计值与观测值间的最小残差平方和,方案3(设置了K、r、q的先验分布)为最适方案。相应的资源评估结果显示,2010年西南大西洋阿根廷滑柔鱼捕捞死亡系数小于最大持续产量时捕捞死亡系数F_(MSY),渔获量小于最大持续产量MSY,预期平衡生物量EEB大于最大持续产量时的生物量B_(MSY),这表明该资源在2010年尚未被过度开发利用。SPiCT模型综合考虑了环境因子、种群间相互作用和网具选择性等因素引起的观测和过程误差,较S、F-EDSP、S-F-EDSP模型及其他离散模型对数据要求低,计算方法简单,更适合数据有限、短生命周期渔业种类的资源评估。另外,可捕系数q值的设置严重影响了SPiCT模型K、B的估计,优化估计可捕系数q将有利于提高其资源评估的准确性。