柑橘黄龙病病原DNA提取方法比较

【目的】筛选出一种快速高效获取柑橘黄龙病病原DNA的提取方法,为黄龙病亚洲种病原的检测奠定基础。【方法】选取5份疑似黄龙病症状柑橘叶片样品,分别采用4种试剂盒（快捷型基因组DNA提取系统、新型植物基因组DNA提取试剂盒、植物基因组DNA提取试剂盒、快速DNA提取扩增套装）及CTAB法提取柑橘叶脉基因组DNA,并用柑橘黄龙病亚洲种的16S rDNA特异引物fD1/fD2和OI1/OI2c进行PCR扩增,DNA提取产物及PCR扩增产物在1%琼脂糖凝胶电泳上检测。【结果】快捷型基因组DNA提取系统获得的DNA质量最好,植物基因组DNA提取试剂盒和CTAB法提取DNA方法提取得到的DNA质量较好,新型植物基因组DNA提取试剂盒所获得的DNA质量较差,快速DNA提取扩增套装所获得的DNA质量最差。除快速DNA提取扩增套装外,其余4种DNA提取方法均扩增出黄龙病亚洲种病原。【结论】快捷型植物基因组DNA提取系统试剂盒操作简单快捷,耗时短,提取的DNA效果较好,能够满足黄龙病病原PCR检测的要求。     

4种水稻基因组DNA微量提取方法对ISSR-PCR试验的影响

[目的]找出适用于ISSR试验的效果好、操作简便的水稻DNA提取方法。[方法]采用高盐十二烷基硫酸钠（SDS）法、十六烷基三甲基溴化铵（CTAB）法及2种型号试剂盒（DP305、DP320）法提取基因组DNA,利用核酸蛋白检测仪及琼脂糖电泳法测定其纯度与浓度,并比较其作为模板用于ISSR-PCR的效果。[结果]发现SDS法与CTAB法提取的DNA浓度与纯度均不高,在ISSR-PCR中虽能扩增出条带,但结果不能重复;试剂盒DP305与DP320提取的DNA浓度与纯度较好,其中试剂盒DP320效果更优,PCR结果能稳定重复。[结论]试剂盒DP320提取DNA的方法是最适合水稻ISSR试验的DNA提取方法。     

柑橘黄龙病病原DNA提取方法比较

【目的】筛选出一种快速高效获取柑橘黄龙病病原DNA的提取方法,为黄龙病亚洲种病原的检测奠定基础。【方法】选取5份疑似黄龙病症状柑橘叶片样品,分别采用4种试剂盒（快捷型基因组DNA提取系统、新型植物基因组DNA提取试剂盒、植物基因组DNA提取试剂盒、快速DNA提取扩增套装）及CTAB法提取柑橘叶脉基因组DNA,并用柑橘黄龙病亚洲种的16SrDNA特异引物fD1／fD2和01I／012c进行PCR扩增,DNA提取产物及PCR扩增产物在1％琼脂糖凝胶电泳上检测。【结果】快捷型基因组DNA提取系统获得的DNA质量最好,植物基因组DNA提取试剂盒和CTAB法提取DNA方法提取得到的DNA质量较好,新型植物基因组DNA提取试剂盒所获得的DNA质量较差,快速DNA提取扩增套装所获得的DNA质量最差。除陕速DNA提取扩增套装外,其余4种DNA提取方法均扩增出黄龙病亚洲种病原。【结论】快捷型植物基因组DNA提取系统试剂盒操作简单快捷,耗时短,提取的DNA效果较好,能够满足黄龙病病原PCR检测的要求。     

濒危兰科植物DNA的提取方法

濒危兰科植物组织富含多糖和多酚类物质,提取高质量的DNA较困难。为优化濒危兰科植物基因组DNA提取方法,采用改良CTAB法、改良SDS法和试剂盒法对多种濒危兰科植物基因组DNA进行提取,对获得的DNA质量、浓度和纯度进行比较。结果表明,用改良CTAB法和试剂盒法可有效去除多糖类和多酚类物质的干扰,DNA提取效果较理想,改良SDS法较差;CTAB法获得的DNA浓度高于试剂盒法,且后续PCR扩增效果也优于试剂盒法。     

3种试剂盒提取烤后烟叶DNA的效果比较

【目的】筛选出简单、快速及高效的烤后烟叶DNA提取试剂盒。【方法】选用3种不同的DNA提取试剂盒提取烤后烟叶DNA,通过比较DNA的纯度和浓度、实时荧光定量PCR扩增Ct值以及凝胶电泳图谱分析的方法,综合评价DNA提取效果。【结果】AxyPrep基因组DNA小量试剂盒所提取的DNA,其纯度和浓度较高,用时短,DNA质量好,适用于小量DNA的提取;磁珠法植物基因组DNA试剂盒提取DNA,其浓度和纯度虽然略高于前者,但用时很长,比较适用于批量DNA的提取;Gene Pure新型植物基因组DNA快速提取试剂盒提取DNA,其纯度高、但浓度低。【结论】烤后烟叶DNA的提取推荐使用AxyPrep基因组DNA小量试剂盒。     

黄花石蒜花蕊和花葶组织中总RNA提取方法的比较

目的筛选适合黄花石蒜花蕊和花葶组织中总脱氧核糖核苷酸(RNA)的提取方法。方法采用CTAB法、SDS法和植物总RNA提取试剂盒法对黄花石蒜花蕊和花葶组织中总RNA进行提取并比较其效果。结果 CTAB法和SDS法均不能提取到完整的RNA;植物总RNA提取试剂盒能有效地去除蛋白质、多糖及DNA,28S条带的荧光亮度是18S条带的2倍左右,OD260/280值在1.8~2.0之间,花蕊和花葶的产率分别为304.1μg/g和255.8μg/g,并且试剂盒法提取的总RNA通过RT-PCR扩增能获得特异性条带。结论试剂盒法适合黄花石蒜花蕊和花葶组织总RNA的提取,提取的总RNA质量高、完整性好、产率高,符合后续实验的要求。     

核桃乳DNA提取方法优化与DNA条形码鉴定

随着乳饮料行业快速发展,掺杂使假现象层出不穷,对核桃乳真实成分的准确鉴定变的尤为重要。核桃乳属深加工食品,DNA破坏严重,DNA提取是开展核桃乳DNA条形码鉴定的首要环节。为优化核桃乳DNA提取方法,并基于psbA-trnH基因DNA条形码建立核桃乳的掺假造假鉴定方法。以10种不同品牌的核桃乳为样品,采用3种方法(静置抽提、异丙醇沉淀、抽真空冻干)进行预处理,再用2种CTAB裂解沉淀方法和3种试剂盒方法(康为新型植物基因组DNA提取试剂盒、爱思进植物基因组DNA提取试剂盒和天根深加工食品DNA提取试剂盒)提取核桃乳DNA,并在此基础上创新尝试了CTAB与爱思进试剂盒结合方法。以提取的市售核桃乳DNA为模板,利用自行设计的特异性基因psbA-trnH-wal鉴定样品中是否含有核桃成分,确定造假情况;选择常见植物候选基因psbA-trnH鉴定样品中是否含有其他成分,确定掺假情况。结果表明,抽真空冻干预处理方法优于其他2种预处理方式。CTAB与爱思进试剂盒结合方法能提取到纯度好、得率高、扩增能力强的核桃乳DNA,是最佳的核桃乳DNA提取方法。扩增及比对结果显示,1款核桃乳样品中含有花生,属于掺假产品。抽真空冻干预处理、CTAB与爱思进试剂盒结合为优化后的核桃乳DNA提取方法,psbA-trnH-wal基因和psbA-trnH基因结合能够对核桃乳及其掺假造假品进行快速准确的鉴定。     

油菜茎基溃疡病菌基因组DNA提取方法的比较

比较了油菜茎基溃疡病菌基因组DNA的尿素提取法、SDS-CTAB提取法、CTAB提取法和试剂盒提取法的提取过程、DNA纯度和对PCR扩增的影响,旨在筛选能替代昂贵试剂盒法的方法.结果表明,尿素提取法可以满足DNA的PCR扩增要求,并取得与试剂盒提取法相似的效果.尿素提取法还具有操作简便、成本低廉等优点,在植物检验检疫中...     

一种改良的旱地土壤微生物DNA提取方法

为了寻求一种快速、简便、经济且高效的旱地土壤微生物DNA提取方法,在QIN等的稻田土壤DNA提取方法基础上,进行改良试验:(1)称0.3 g干土加入300μL无菌水,于-80℃过夜;(2)研究加入CTAB和SDS的最适配比,CTAB、SDS的总体积为500μL,并设置加玻璃珠和不加玻璃珠试验,最后将改良方法与试剂盒法进行土壤微生物DNA提取效果对比分析。结果表明,将称取的0.3 g干土中加入300μL无菌水于-80℃过夜,并调整CTAB与SDS的体积配比为100∶400,所提取的红壤旱地土微生物DNA含量最高达到6.29μg/g(略低于试剂盒法的7.46μg/g),纯度较试剂盒法高,PCR扩增效果良好,此法相对于试剂盒提取法更经济、高效。因此,该改良QIN法适合于红壤旱地土壤微生物DNA的提取。     

草菇培养料中微生物总DNA的高效提取

比较了化学裂解与酶裂解相结合法、氯化苄法、CTAB法、改良CTAB法、MP土壤试剂盒法和植物试剂盒法6种提取草菇培养料总DNA的方法.结果表明:不同方法的A260/A280比值有较大差异,其中化学裂解与酶裂解相结合法提取DNA的产量最高,而新型植物基因组DNA提取试剂盒提取培养料DNA的产量最低,分别为(2372.72...     

适合软枣猕猴桃花蕾转录组测序的总RNA提取方法研究

为了得到符合转录组测序要求的软枣猕猴桃花蕾RNA,比较了Trizol法、十二烷基苯磺酸钠(SDS)法、天根植物总RNA提取试剂盒以及改良十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法的提取效果。结果表明,Trizol法、SDS法和天根植物总RNA提取试剂盒均不能有效提取到软枣猕猴桃花蕾总RNA,改良后的CTAB法提取的RNA 28S和18S条带清晰,通过RT-PCR方法扩增出软枣猕猴桃Actin基因片段。将纯化后的RNA送样至测序公司,经深度检测样品合格,可以上机进行转录测序。     

马蹄金总DNA的快速提取

利用E .Z .N .A微量植物DNA提取试剂盒 ,在 1h内可快速可靠地从马蹄金 (DichondrarepensForst)植物样本或组织中提取纯度较高的总DNA。这套系统利用速度和多变的旋转技术来结合DNA吸附旋转柱中基质的核酸内容物 ,从而除去植物组织中的多糖、酚化合物、酵素抑制剂。所得DNA产物纯度高可直接用于PCR ,RAPD、AFLP等各种下游分析技术     

三种核酸提取试剂盒效果比较试验

比较三种核酸提取试剂盒效果,取2400μL稀释好的猪繁殖与呼吸综合征活疫苗,分为12份,200μL/份。将12份样品分为4组(A、B、C1和C2),每组3个样品,分别用A、B、C三种试剂盒(共四个批次)进行提取。A和B试剂盒各提供一个批次,C试剂盒提供2个批次(C1和C2)。用超微量核酸分光光度计测定四批次的RNA含量;用实时荧光定量RT-PCR扩增提取的RNA。发现三种试剂盒提取RNA效果有明显差异。提取的RNA含量分别是1.7 ng/μL(A组)、4.4 ng/μL(B组)、3.3 ng/μL(C1组)、4.1ng/μL(C2组)。荧光定量检测的Ct值分别为23.49(A组)、21.71(B组)、24.97(C1组)、25.29(C2组)。结果显示:B试剂盒相对较好,推荐使用B试剂盒进行核酸提取。     

玉米叶面微生物DNA提取方法及PCR引物的筛选

传统的微生物培养方法在反映叶面微生态信息上具有局限性,因此逐渐被分子生态学所代替,而获得高质量、大片段、无偏好的总DNA是研究叶面环境微生物的基础。本文采用改进的Sambrook法、CTAB法、改良的化学法以及试剂盒法对玉米生长初期、中期、末期的叶面微生物总DNA进行提取,并对4种方法提取的DNA片段的大小和产量进行综合评价。将得到的DNA用引物357/518以及984/1387对细菌16S rDNA进行扩增;用5种常见引物NS1/fung、ITS1-F/ITS2、NS1/AM1、EF4/fung5、SSU-0817/SSU-1196对真菌18SrDNA进行扩增。结果表明:4种方法提取的DNA片段均适用于PCR,但DNA的得率和纯度有一定差别,其中以试剂盒提取效果最好。PCR结果显示,除化学法外,其他3种方法提取的DNA均能够获得目的条带;并通过比较得出引物984/1387对16S rDNA以及ITS1-F/ITS2对18S rDNA扩增效果较好且扩增量最大。     

三种试剂盒提取粪便隐孢子虫微量DNA的效果比较

[目的]筛选一种高效、简单、快速、价格合理的粪便微量DNA提取试剂盒。[方法]用3种不同的试剂盒提取粪便DNA,通过比较所提取DNA的浓度、纯度、提取率及巢式PCR产物等评价提取效果。[结果]Genmed试剂盒提取的DNA浓度最高、PCR产物条带最亮,但提取时间相对较长,成本相对较高。天根试剂盒提取的DNA纯度最高,DNA浓度适中,成本适中,提取时间最短。碧云天试剂盒提取的DNA纯度、浓度均不高且提取时间最长,但成本最低。[结论]Genmed试剂盒提取粪便微量DNA最灵敏。天根试剂盒提取DNA适于DNA纯度要求较高的分子生物学研究。     

条斑紫菜叶状体DNA提取方法的研究

以常用的植物基因组DNA提取方法—LiCl法、SDS法、CTAB法、高盐脲法和试剂盒法提取条斑紫菜叶状体DNA,对不同提取方法的效果进行了比较分析,同时探讨了SDS法的细胞破碎方法和不同样本量提取条斑紫菜DNA的效果。对DNA纯度、DNA浓度、DNA得率等分析表明,SDS法效果较好,其次是LiCl法;在使用SDS法时,液氮研磨破碎细胞效果好于其他方法;在小样本量提取DNA时,SDS法比LiCl法效果好。     

鱼糜制品中基因组DNA提取方法的比较

将分别采用普通酚-氯仿抽提法和试剂盒(柱吸附法)提取DNA的两种方法加以比较,以确定最适提取鱼糜制品DNA的方法.将鱼肉和鱼糜制品作为原料,用两种方法提取基因组DNA,利用分光光度计测定其A260与A280的吸光值,计算比率估计核酸的纯度,并利用琼脂糖凝胶电泳观察DNA片段在凝胶中的位置;并用线粒体16S rRNA基因PCR扩增产物鉴定所提取的基因组DNA.     

适用于SSR-PCR试验的水稻基因组DNA提取方法的比较

为了寻找操作简便、耗时短、成本低的适用于简单重复序列-聚合酶链式反应(SSR-PCR)试验的水稻基因组DNA提取方法,试验以3种类型的水稻样品(叶片、米粒、米粉)为材料,比较了十六烷基三甲基溴化铵(CTAB)法、试剂盒法、蔗糖法、碱法4种基因组DNA提取方法对水稻基因组DNA提取质量的影响.结果表明,CTAB法提取的叶片、米粒和米粉的基因组DNA含量最高,其次为试剂盒法提取的叶片、米粉和碱法提取的米粉的基因组DNA含量.通过4种方法得到的水稻基因组DNA纯度均不高,但不影响后续的SSR-PCR试验.SSR-PCR结果表明,CTAB法、试剂盒法和碱法提取的3种样品类型的水稻基因组DNA的扩增均表现出了良好的重复性.其中试剂盒法的提取成本最高,CTAB法耗时最长.整体而言,碱法是最适合水稻SSR-PCR试验的基因组DNA提取方法,且以米粉为提取材料时效果最佳.     

成熟油菜种子RNA提取方法的改良

[目的]从成熟油菜种子中抽提出高质量的RNA。[方法]该研究通过将天根植物总RNA提取试剂盒与康为世纪植物总RNA提取试剂盒相结合,使用β-巯基乙醇抑制酚类物质氧化,DNA酶去除DNA,并采用吸附柱有效去除多糖类物质等措施,对油菜种子RNA的提取方法进行有效改进。[结果]采用该方法能提取出质量高且完整性好的RNA,可一次满足后续分子生物学研究的要求。[结论]该研究提出了一种高效快捷的成熟油菜种子RNA提取方法。     

绿色木霉基因组DNA不同提取方法的比较研究

为获得提取绿色木霉Tr9701孢子培养物DNA的简便方法,选取8种方法(破壁酶消解法、超声破碎法、-80℃冻融法、高盐溶液法、尿素溶液法、CTAB法、改良CTAB法、试剂盒法)提取DNA,再通过对提取物进行比色定量和PCR测定评价各种提取方法的优弊。结果表明,改良CTAB法和试剂盒法提取DNA的效果最好,可用于绿色木霉的后续分子生物学研究。