中国农科院领衔揭示芸薹属作物多倍体基因组不对称进化规律

<正>近日,从中国农业科学院油料作物研究所获悉,由我国科学家领衔的白菜、甘蓝和油菜全基因组测序项目再次取得阶段性重大成果,完成了甘蓝基因组测序和分析,并在此基础上与其他近缘种植物基因组比较,发现了作物种间和种内基因组呈现多层次的不对称的进化规律。该研究成果在线发表在最近一期国际权威学术期刊《自然-通     

我科学家领衔破译白菜甘蓝油菜全基因组遗传密码

由我国科学家领衔的白菜、甘蓝和油菜全基因组测序项目已取得阶段性重大成果,目前已获得白菜全基因组精细图,甘蓝和油菜全基因组框架图。研究表明,白菜、甘蓝和油菜的基因组大小分别约为5亿、6.5亿和11亿个碱基对,白菜和甘蓝含有的基因总数目分别约4.2万和4.5万个,油菜基因覆盖度85%以上。该项成果是国际上首次对三个近缘作物物种进行的整体测     

甘蓝与白菜种间杂交的双二倍体后代

作者利用胚培养法获得甘蓝与白菜种间杂种和杂种后代。有意义的是由幼胚发育成的胼胝体中获得双二倍体的后代。在本实验中对于杂种和双二倍体杂种后代所表现的性状和细胞学(染色体)的现象进行了观察和比较,并且对于甘蓝的基因组(CC)和白菜的基因组(AA)之间的亲合性(Affinity)作了一些探讨。     

王晓武团队揭示多倍化和结构变异对白菜种内分化的影响

正2021年5月31日,Genome Biology在线发表了中国农业科学院蔬菜花卉研究所王晓武团队完成的题为"Impacts of allopolyploidization and structural variation on intraspecific diversification in Brassica rapa(异源多倍体和结构变异对白菜种内分化的影响)"的研究论文。这是王晓武研究团队继白菜基因组草图和基因组重测序分析成果之后,在白菜泛基因组研究方面的最新研究成果。白菜是芸薹属重要蔬菜,种内多样性极高。本研究基于重测序数据,选择了大白菜、小白菜、菜心、     

科技文摘

<正>园艺作物基因组测序研究进展回顾了园艺作物全基因组测序的发展历程,介绍3代测序技术的特点和应用现状。总结了葡萄、番木瓜、草莓等果树,黄瓜、白菜、番茄等蔬菜以及莲、康乃馨等花卉在内的25种园艺作物基因组测序简况。重点介绍了全基因组测序在基因注释、比较基因组学研究、重测序、全基因组关联分析、转录组学、SNP芯片开发等方面的应用。最后讨论了全基因测     

中国农科院等专家完成芥菜基因组解析

正中国农业科学院蔬菜花卉研究所王晓武科研团队与浙江大学张明芳研究团队10月联合完成了芥菜和黑芥基因组测序与序列解析。芥菜属于芸薹属的一类重要蔬菜,包括榨菜、大头菜、雪里蕻等。芥菜由芸薹属的两个二倍体基本种白菜(A基因组)和黑芥(B基因组)通过杂交和基因组加倍形成,属于异源四倍体基因组     

专家完成芥菜基因组解析

正日前,中国农业科学院蔬菜花卉研究所王晓武科研团队与浙江大学张明芳研究团队联合完成了芥菜和黑芥基因组测序与序列解析。芥菜属于芸薹属的一类重要蔬菜,包括榨菜、大头菜、雪里蕻等。芥菜由芸薹属的两个二倍体基本种白菜(A基因组)和黑芥(B基因组)通过杂交和基因组加倍形     

我国科学家破解蔬菜驯化的秘密

正中国农业科学院蔬菜花卉研究所王晓武科研团队,对白菜和甘蓝两类芸薹属作物的驯化进行了深入研究,揭示了驯化与古多倍化形成的亚基因组间的关系。白菜和甘蓝类蔬菜是我国百姓餐桌上最常见的蔬菜。这两类蔬菜最大的特点就是类型极其丰富多样。白菜类常见的有大白菜、小白菜、芜菁、菜心,而甘蓝类常见的则包括结球甘蓝、苤蓝、羽衣甘蓝、芥蓝、花椰菜、青花菜、孢子甘蓝等。但是这两个     

我国科学家破解了白菜类和甘蓝类蔬菜作物驯化的秘密

正中国农业科学院蔬菜花卉研究所王晓武科研团队,对白菜和甘蓝两类芸薹属作物的驯化进行了深入研究,揭示了驯化与古多倍化形成的亚基因组的关系,相关研究结果于8月15日在线发表于《自然·遗传》(Nature Genetics)上。白菜和甘蓝类蔬菜是我国人民餐桌上最常见的蔬菜,类型极其丰富多样。但是这两个物种为什么能被驯化出如此多样     

研究揭示小白菜维生素C等营养物质的代谢机制

2020年12月28日,南京农业大学园艺学院教授侯喜林团队在《HorticultureResearch》上在线发表研究论文,以不结球白菜"苏州青"为材料,利用最新的测序手段,获得了396.83 Mb近完整的高质量染色体级基因组,并对其功能进行注释。此基因组质量高于现有其他白菜基因组。根据这一新基因组,研究发现重复序列占全基因组的比例约为53%,并且注释得到了48158个蛋白质编码基因。     

研究人员确定白菜和甘蓝类蔬菜叶球形成和根(茎)膨大相关基因

正白菜和甘蓝类蔬菜是我国人民餐桌上最常见的蔬菜,其类型丰富多样。白菜类常见的有大白菜、小白菜、芜菁、菜心、紫菜薹、乌菜、乌塌菜和薹菜,此外还有日本的水菜、小菘菜,欧洲的意大利菜心等。而甘蓝类常见的蔬菜则包括结球甘蓝、苤蓝、羽衣甘蓝、芥兰、花椰菜、青花菜、孢子甘蓝等。此外,在500年前中国人将白菜驯化出结球大白菜,欧洲人将甘蓝驯化出结球甘蓝;2 000年前欧洲人将白菜驯化出根膨大的芜菁,500年前又将甘蓝驯化出茎膨大的苤蓝。这2个物种为什么能被驯化出如此多     

浙江大学绘制全球首张榨菜全基因图谱

正浙江大学农业与生物技术学院园艺系张明方教授团队通过高通量测序技术,绘制了世界上第一张榨菜全基因图谱,这一进展将对芥菜类蔬菜作物的改良产生重要意义。菜用芥菜是我国重要的加工蔬菜,榨菜和雪里蕻、大头菜等都属于不同的变种。通过高通量测序技术,结合构建的高密度遗传图谱,首次完成了芸薹属中异源多倍体榨菜(AABB基因组)的高质量基因组图谱,并进一步丰富和深化了对榨菜的"家谱"的认识。研究发现,芥菜物种形成于3.9万~5.5万年前,为单一地理起源,其A亚基因组与白菜型油菜亲缘关系更近,然后演化成蔬菜用和油用芥菜2个     

白菜、甘蓝和甘蓝型油菜PAP1/2同源基因的鉴定及分析

PAP1/2转录因子是参与形成MBW复合体从而调控花青素合成的主要MYB转录因子。以拟南芥PAP1/2转录因子核酸和蛋白序列比对及Pfam验证，研究白菜、甘蓝和甘蓝型油菜等芸薹属植物中PAP1/2转录因子调控花青素代谢的确切同源拷贝数、进化关系及表达情况：在白菜、甘蓝及甘蓝型油菜中鉴定到的PAP1/2转录因子同源拷贝数分别为3、4和9个；通过进化分析和PAP1/2转录因子同源拷贝所在区段微共线性分析进一步明确了其不同拷贝间的进化关系，厘清了A7和C6染色体上PAP1/2转录因子不同拷贝的相互关系；结合白菜、甘蓝和甘蓝型油菜不同组织转录组测序数据进行表达情况分析，阐明了PAP1/2转录因子同源拷贝在不同组织中的表达情况。     

白菜炭疽病的发生与防治

白菜炭疽病是十字花科蔬菜的主要病害。在我国除为害白菜外,还为害油菜、野油菜、紫菜薹、芥菜、瓢儿菜,萝卜等多种蔬菜。在国外还报导为害球茎甘蓝、球芽甘蓝、羽衣甘蓝、花茎甘蓝等。该病在我国南北方均有发生。北京郊区白菜炭疽病60年代即有发生。     

甘蓝NLR家族全基因组鉴定、进化分析及在不同病害胁迫下的表达分析

从全基因组水平鉴定了87个甘蓝NLR基因家族成员,并对其进行了进化分析和表达分析。基因结构和motif组成分析表明,87个基因可分为5个亚类:NB-LRR(34个)、CC-NB-LRR(6个)、TIR-NB-LRR(45个)、RPW8-NB-LRR(1个)和CC-TIR-NB-LRR(1个);染色体定位分析表明,该家族基因在9条染色体上呈不均匀地单一或成簇分布;进化分析表明,甘蓝35个NLR基因与白菜NLR基因存在同源关系,其余52个基因为甘蓝特有;利用转录组数据分析了参与甘蓝枯萎病、黑腐病、根肿病、霜霉病、白粉病等抗性应答相关的差异表达基因,发现参与不同病害胁迫抗性应答反应的NLR基因差异较大,这可能与不同NLR基因对不同病原特异性识别有关。     

拟南芥叶绿体SSR引物在甘蓝上的应用

 根据拟南芥的叶绿体全基因组序列,搜索获得89个叶绿体基因组SSRs（cpSSRs）,平均每1.736 kb出现1个SSR。针对这些SSR设计cpSSR引物58对,其中32对能在甘蓝上应用。5对引物在甘蓝C300、C322和波里马油菜N478、N479间有多态性,这些片段均位于基因内含子区或基因间隔区。测序结果显示单核苷酸A/T重复数从8个到13个不等。同源性比较表明C300、N479之间的同源性大于两者与拟南芥之间的同源性。     

有机磷农药在不同品种高原夏菜中的残留动态研究

为探索有机磷农药在不同品种蔬菜中的降解速率和安全间隔期,本试验结合大田农药喷施试验和实验室农药残留定量检测两种手段,研究了敌敌畏和辛硫磷农药在不同品种高原夏菜中的残留量变化情况。结果表明,不同农药在不同蔬菜中的降解速率不同,推荐剂量下,敌敌畏在喷药1d后的降解速率分别为甘蓝43.65%、芹菜50.05%、菜花29.34%、白菜54.01%;辛硫磷在喷药1d后的降解速率分别为甘蓝71.36%、芹菜54.84%、菜花44.78%、白菜51.65%。不同有机磷类农药在不同品种蔬菜中的安全间隔期不同,敌敌畏在不同品种蔬菜中的安全间隔期分别为甘蓝3~5d,芹菜3~5d,菜花5~7d,白菜5~7d。辛硫磷在不同品种蔬菜中的安全间隔期分别为甘蓝5~7d,芹菜14~21d,菜花7~14d,白菜7~14d。     

甘蓝胞质雄性不育系育性相关线粒体DNA片断的克隆及序列分析

以甘蓝结球期叶球内叶为试材,利用PCR方法在甘蓝新型胞质雄性不育材料CMS451的线粒体基因组中扩增出与细胞质雄性不育相关的片断,并克隆测序.结果表明:该片断和NCBI发布的Ogura胞质不育系特异片段高度同源,说明CMS451的不育机理与Ogu-CMS相似,也反映了CMS基因的相对保守性.     

甘蓝夜蛾的危害及防治

一、分布与为害 甘蓝夜蛾(Barathra brassicaeL.)又名甘蓝夜盗蛾,各地都有分布,以北方发生较重。 甘蓝夜蛾是多食性害虫,主要为害甘蓝、白菜等十字花科蔬菜,以及瓜类、豆类、茄果类蔬菜和甜菜等,其中以甘蓝、秋白菜、甜菜受害最重。幼虫共6龄,具有群集性、夜出性、暴食性。初孵幼虫集中在叶背取食,啃食叶肉,使叶片残留表皮,     

国际马铃薯和番茄基因组测序进展

 国际番茄基因组项目计划精细测定220 Mb的常染色质区域,马铃薯基因组项目计划测定全基因组840 Mb的DNA序列。中国是两个项目的参与国,负责番茄染色体III,XI和马铃薯染色体X,XI的测序工作。基于番茄和马铃薯基因组间存在着高度的相似性,在二者染色体XI的测序的同时运用了比较测序的方法。