黄麻品种数量性状主成分及其聚类分析

对57个圆果黄麻品种的12个产量与品质性状作主成分和聚类分析,有4个主成分对变异的贡献达86.19％。57个品种被分为6类,距离大小与品种的地理分布无直接关系。系谱分析证实了品种间的距离能较真实地反映品种的遗传差异。比较2种不同相关矩阵的主成分聚类结果,认为用基因型值相关阵为基础进行主成分和聚类分析,所得到的结果比较符合客观实际。     

33个三色堇品种遗传差异的初步分析

对试验调查的33个三色堇品种的9个重要农艺性状,研究各品种间的遗传差异,并采用欧氏距离和UPGMA法,对33个品种进行了聚类。结果表明,33个三色堇品种间的平均遗传距离为3.611,08-H2与09-C13之间遗传距离最大,为9.404,08-C2与09-C3之间遗传距离最小,为0.244;33个品种可被聚为4类,其中08-H2单独为一类,08-H5和09-H5聚为一类,09-C1单独聚为一类,其余品种聚为一类。聚类结果与品种地理来源基本吻合。     

42个春小麦品种数量性状的聚类分析

定义品种标准化主成分间的欧氏平方距离为遗传距离,采用类平均法对42个地理来源不同的春小麦品种进行了聚类分析.当阈值为9时,供试的42个春小麦品种被划分为5个品种类群.表明品种地理分布对遗传差异有一定的影响,但两者并不存在必然联系.认为春小麦杂交亲本应在遗传距离较大的类群间进行选择.     

亚麻遗传距离分析

应用多元统计方法对40个亚麻品种的13个性状进行方差分析。结果表明各性状的F值均达到极显著水平。然后进行主成分分析,得到7个主成分因子,按主成分因子评价亚麻品种的优劣,并按照40个亚麻品种间的遗传距离进行聚类分析,得到5大类群。     

苦荞品种(系)聚类分析

为了直观地揭示苦荞品种(系)间的遗传差异和类群农艺性状特点,并发掘其中的良好资源,避免杂交育种过程中选配亲本的盲目性。对来自全国11个荞麦育种单位的45个苦荞品种(系)的6个主要农艺性状,进行主成分和聚类分析。结果表明:应用主成分分析将6个性状简化为3个主成分,其累计贡献率为83%。采用聚类分析,将45个苦荞品种(系)在2.76水平上聚为4大类:髙秆、中产、小粒型;中秆、高产、大粒型;中秆、低产、小粒型和髙秆、中产、中粒型。其中第2类综合性状表现较好,是良好的品种或良好的育种材料。苦荞品种(系)间遗传差异与原产地和地理距离无任何必然的联系,杂交育种选配亲本时,除考虑性状互补、地理距离等因素外,还应考虑其遗传差异(不同类群)。     

苦荞品种(系)农艺性状的主成分分析和聚类分析（英文）

为直观地揭示苦荞品种(系)间的遗传差异和类群农艺性状特点、并发掘其中的良好资源、避免杂交育种过程中选配亲本的盲目性,对来自全国11个荞麦育种单位的45个苦荞品种(系)的6个主要农艺性状,进行主成分和聚类分析。结果表明:应用主成分分析将6个性状简化为3个主成分,其累计贡献率为83%。采用聚类分析,将45个苦荞品种(系)在2.76水平上聚为4大类:髙秆、中产、小粒型;中秆、高产、大粒型;中秆、低产、小粒型和髙秆、中产、中粒型。其中第2类综合性状表现较好,是良好的品种或良好的育种材料。苦荞品种(系)间遗传差异与原产地和地理距离无任何必然的联系,杂交育种选配亲本时,除考虑性状互补、地理距离等因素外,还应考虑其遗传差异(不同类群)。     

四川大豆地方品种资源初步研究Ⅲ遗传距离测定及聚类分析

本研究选用了来自四川不同生态地区的７４个大豆地方品种为材料，利用主成份分析评价了四川大豆地方品种的综合性状，测定了各地方品种主要数量性状上的遗传距离，根据遗传距离的大小利用类平均法将７４个大豆地方品种聚为８类。同一类内品种间的遗传距离较近，类间的遗传距离大；但这种差异与品种地理上的差异并不一致。     

草莓品种的遗传距离研究

利用多元统计方法对５０个草莓品种进行了主成分分析，测定了品种间的遗传距离并加以聚类。根据主成分值初选出１２个综合性状较好的品种，以遗传距离大小进行聚类分析，结果将５０个品种归为７个类群，类群间的遗传差异大于类群内，可作为草莓育种过程中亲本选配时的参考依据。     

中国抗枯、黄萎病陆地棉材料分子水平的遗传差异评价

 采用SSR和AFLP分子标记技术，对中国不同年代培育的54个抗枯、黄萎病陆地棉品种（系）分子水平的遗传差异进行了研究。22对SSR引物和20个AFLP引物组合共扩增出446个多态性标记，每个品种平均8.26个。采用SPSS11.5软件计算欧氏距离，中国抗病品种间欧氏距离分布在5.568～11.790之间，平均值为8.906；单一品种欧氏距离平均值为8.530～10.011，高于欧氏距离总平均值的品种共10个，占品种总数的18.52%；85.55%的品种欧氏距离值分布于7.000～10.000之间，表明中国供试抗病品种群体的遗传基础较为狭窄。作为比较对照的4个国外品种间欧氏距离变化在9.055～10.724之间。国内品种与国外品种之间的欧氏距离介于6.481～12.490，82.02%的品种欧氏距离值分布于8.000～11.000之间，表明国外品种与国内品种之间遗传差异较大。基于SSR和AFLP整合数据的聚类分析，58个品种被划分为5个SAG（SSR&AFLP-based groups）分子类群，SAG的划分与品种系谱来源有较强的相关性。     

25份羽衣甘蓝材料的亲缘关系与遗传多样性分析

【目的】探寻羽衣甘蓝材料间的亲缘关系和遗传多样性,为进一步利用国外羽衣甘蓝商业品种和自主选育新品种奠定基础。【方法】选取25份羽衣甘蓝材料,包括7个切花、17个地被和1个食用类型,分别测定24个营养性状和11个生殖性状,按照数值、二元和多态性状特征进行编码和赋值,应用UPGMA聚类法进行分析。【结果】根据营养性状的UPGMA聚类结果,当欧氏遗传距离为9.87时,25份材料被聚类为2大类群,叶型为圆叶、皱叶、裂叶的24份材料聚为一类,叶型为裂皱叶的1份材料单独聚为另一类群;当欧氏遗传距离为7.20时,25份材料被聚类为3大类群,叶型为圆叶的11份材料聚为第1类群,皱叶与裂叶的13份材料聚为第2类群,裂皱叶的1份材料单独为另一类群;当欧氏遗传距离为6.82时,25份材料依据叶型被聚类为4大类群,即圆叶类、皱叶类、裂叶类与裂皱叶类。根据生殖性状的UPGMA聚类结果,当欧氏遗传距离为4.35时,25份材料依据子房颜色被聚类为2大类群,即子房颜色为黄绿色的归为一类,紫红色的归为另一类。【结论】在24个营养性状中,叶型是决定亲缘关系远近的第1要素,其次是叶色。在4种基本叶型中,皱叶与裂叶的亲缘关系相对较近,裂皱叶与其他3种叶型的亲缘关系较远。在11个生殖性状中,子房颜色为决定亲缘关系远近的最主要因素。     

谷子主要分量的模糊聚类

主成分分析是现代数量遗传学中对品种资源分析评价的一种常用方法。因为主成分分析可以将一个多变量互相关联的资料系统转换成一组互相独立的变数,每个主成分包括一部分品种资源的遗传信息,而且其重要性可以按照顺序排列起来,这样可以用前面少数几个主成分值来代表亲本资源的基本情况,从而简化工作量。数量性状属“模糊性状”,用模糊聚类法聚类亲本比用其他聚类法要符合实际情况,所以主成分析和模糊聚类法相结合可得到科学的结论。本研究通过主成分分析选出了10个较好品种,并用模糊聚类法将45个谷子亲本聚为7类,可供谷子育种者参考     

Phenotype Character Analysis and Evaluation of Modern Rose Cultivars

【Objective】The objective of this study was to analyze 11 phenotype indexes of 60 rose cultivars and to illustrate the variation rules and the genetic diversity coefficient of each index and the correlation between them. The principal component analysis was used to select an optimal evaluation and calculation method to provide reference for rational clustering of rose cultivars. 【Method】Taking 11 statistical characters of 60 modern rose cultivars in field as the research object, the variation index and Shannon-wiener genetic diversity index of each character data in rose cultivars were analyzed with SPSS19.0 and Microsoft Excel 2007, and the correlation analysis and principal component analysis of each character were carried out. Based on the composite score of principal components and each principal component score, the clustering of the rose cultivars were done.【Result】The statistical results of phenotypic traits showed that, the majority of the tested roses were erect and expanded shrubs, which accounted for 53% and 35% of the total cultivars respectively. The number of leaflets of mature leaves was 5, accounting for 68% of total cultivars. The average whole leaf length, top leaflet width, internode length and average flower diameter of 60 rose cultivars were 11.6, 3.2, 3.6 and 7.6 cm, respectively. The variation coefficient of each quantitative index ranged from 21% to 25%, which was not large. The main color of rose was pure color, accounting for 82% of the total. Among them, purple and yellow flowers were the most. The cultivars with successive flower heads accounted for 65% of the total number, and the flower shapes were mainly ball-shaped and cup-shaped, accounting for 33% and 32% of the total cultivars, respectively. The main senescence modes of rose flowers were petal abscission and flower withering, accounting for 47% and 43% of the total cultivars, respectively. The variation range of the genetic diversity coefficient of each index was between 0.62 and 3.73, among which the diversity index of 8 traits was above 1, the highest was the whole leaf length, and the lowest was the leaflet number. The genetic diversity coefficient of flower color among qualitative traits was the highest. There was an extremely significant positive correlation between whole leaf length and the top leaflet width, the internode length and the whole leaf length, the internode length and the top leaflet width. The flower head number was very significantly negatively correlated with the internode length. There was a significantly positive correlation between the senescence type and the growth habit, the number of flower heads was significantly positive correlated with the number of leaflets and the flower type, but significantly negative correlated with the flower diameter. The results of principal component analysis showed that the 11 phenotype indexes could be simplified into 4 principal component factors, and the variance contribution rate of the 4 principal components was up to 63.28%, among which the variance contribution rate of the first principal component was up to 21.1%. Each principal component factor mainly represented the index variables, such as leaf shape, flower shape, number of flower heads, number of petals and flower aging mode. Based on the composite score of principal components and each principal component score, the 60 cultivars of roses were clustered, and the distribution range of the composite score of principal components of each cultivar was from -1.878 to 1.522. The rose cultivars could be divided into 4 clusters according to the scores, and each cluster was represented by 8, 36, 15 and 1 cultivars, respectively. The classification of each cluster reflected the comprehensive performance of roses in the field. 【Conclusion】Modern rose had a rich diversity of flower color and leaf shape indexes, and some flower shape indexes were significantly related to leaf shape or growth habit. The conclusions would contribute to rose breeding and selecting. The four principal component indexes and the clustering of cultivars selected in the study provided theoretical basis for the preservation and application of the existing rose cultivars.     

川西南豌豆地方品种产量性状遗传差异研究

对搜集于川西南12个县具代表性的50个豌豆地方品种9个产量性状进行了主成份分析和聚类分析。结果表明，前四个主成份对变异的贡献率达91．7％，供试品种主成份载荷均不理想，产量性状差。50个品种被分为六类，遗传距离的大小与品种的地理分布有一定关系，但无必然联系。     

陆地棉数量性状遗传差异的研究

本研究对53个陆地棉品种（系）的15个数量性状进行了主成分分析和聚类分析。前6个主成分对变异的贡献率达87.9%。53个品种（系）被分为七类。距离的大小与品种的地理分布无直接联系。系谱分析进一步证实了品种间的距离能较真实地反映品种的遗传差异。     

陆地棉品种主要经济性状遗传差异研究

对96个陆地棉材料13个主要经济性状的遗传差异进行了多元分析。结果表明：96个材料可分为遗传特点不同的5个类型；材料（类群）同贵传距离大小与春具有显著差异性状数的多少及其差异大小有关。对品种（系）进行聚类分析及在此基础上进一步选择优异的材料评价比较其性状的优劣是种质遗传差异研究的两个重要方面，主要分分析与多元方差分析相结合是遗传差异研究的有效方法。     

玉米品种数量性状遗传差异分析及数值分类学研究

对２０１份湖北省玉米品种资源的２８个性状进行了主成分分析和遗传距离分析，结果表明：前 ７个主成分对变异的贡献率达７３．４％，遗传距离的大小与供试品种的地理分布无直接关系。以前 ７个主成分的指标进行聚类，２０１份品种被划为１８类。     

茎瘤芥(榨菜)数量性状遗传差异研究

对23份茎瘤芥品种资源的15个数量性状进行了主成分分析和聚类分析。结果表明:前5个主成分对变异的贡献率达85.32%,并筛选出6份综合性状表现优良的品种资源。23份品种资源被分为五类,配制组合宜在类间(D2>257.9)选择亲本。遗传差异的大小与品种的地理分布和熟性无直接联系。     

不同大豆杂交后代新品系产量性状的主成分分析

对来源于不同亲本组合的13个大豆新品系产量相关性状和遗传距离进行综合分析,旨在为区域性大豆生产中品种更新、筛选和亲本选配工作提供理论依据。通过主成分分析探讨了各产量相关性状以及各品系综合主成分值的大小与产量高低的关系;根据品系间的遗传距离,通过聚类分析将13个品系分为4类,结果表明亲本来源与遗传距离没有必然联系。在选择大豆品种时,应根据育种目标确定各个主成分值的大小;在评价品种间遗传差异时,应根据育种过程中对品种的选择方向和环境因素进行综合评价。     

谷子的聚类分析及其在育种上的应用

本文根据春谷两年试验资料的10个性状值及它们的遗传相关阵,分别进行了主成分分析、聚类分析和二维排序。分析表明:前三个主成分具有良好的生物学意义,以此综合评价的优良品种也和实践相符。聚类结果二年都分为9类,类群间各具特色,优良品种多聚集于第6类群,基本上反映了品种的实际情况。从排序图上看到:谷子的遗传差异和地理差异有一定的平行关系。最后根据上述分析所提供的信息,提出了一部分培育高产品种的杂交参考组合,并讨论了这一信息在谷子三系配套中的可能应用。     

玉米品种资源的数值分类研究

应用主成分分析法对湖北省份玉米品种资源的２８个性状进行分析，结果表明，前７个主成分对变异的贡献率达７２．７％，以前７个主成分为综合指标进行逐步聚类，２０１份品种资源被分成１２大类，不同类群具有明显的性状差异，而类群内状特征相似。其中Ｄ、Ｅ、Ｆ、Ｉ类为综合性状较好的种质类群。