微卫星DNA标记在川渝山羊品种遗传多样性研究中的应用

微卫星，又称短串联重复序列（Short Tandem Repeat，STR）或简单重复序列（Simple Sequences Repeat，SSR），是20世纪80年代末期发展起来的一种新型DNA标记。常用于检测个体基因型，统计群体中微卫星位点等位基因的数目和频率，并结合分子遗传学和数量分类学原理，计算各个品种的遗传变异程度、生存稳定性，初步评估品种的遗传多样性及品种间的亲缘关系与分化关系。论述了遗传多样性的研究进展及微卫星在遗传多样性研究中的应用，并以川渝山羊品种（类群）为重点进行了系统讨论，以期为今后的相关研究提供理论基础。     

荧光标记通用引物在银狐微卫星基因分型中的应用

微卫星又称短串联重复序列(STR)或简单重复序列(SSR),由侧翼序列和串联重复核心序列组成,一般其串联重复核心序列长度为1～6 bp[1]。由于微卫星遗传标记具有多态信息含量高、基因组内分布广泛及呈共显性遗传等优点,因而已被广泛应用于遗传图谱的构建[2-3]、QTL定位[4]、亲缘关系鉴定[5]及遗传多样性评估等[6]。微卫星标记的基因分型主要     

蓝狐和貉WT1基因第8内含子(GAAA)n微卫星序列的克隆及分析

微卫星又称简单序列重复(SSR)或短串联重复(STR),其核心序列一般由1～6个核苷酸组成[1],例如(CA)n、(GAAA)n或(AG)n。由于微卫星序列广泛分布于真核生物的基因组中,且具有多态性高、呈共显性遗传等特点,因而自M.Litt等[2]首次报道微卫星基因分型以来,很快被广泛应用到遗传图谱构建、数量性状基因座(QTL)定位、遗传多样性分析、亲     

家禽微卫星标记研究进展

有关微卫星的报道始见于Skinner等(1974)在研究寄生蟹的卫星DNA时发现一种简单的串联重复序列。Ali等(1986)首次将合成的寡聚核苷酸用于人的指纹研究，才受到重视。Jeffreys等和Gao等(1988)进一步将其发展成为一种新的遗传标记系统。Tautz等(1989)报道微卫星具有丰富的多态性。早期将微卫星称为“简单序列”、“简单序列重复(SSR)”、“简单串联重复(STR)”等。     

畜禽微卫星的特性

1微卫星及其研究简史微卫星（Microsatellitte）DNA（以下简称微卫星）是以1—6hP的核着酸序列（称为核心序列，COreSequence）为基本单位，呈串联重复状散在分布于整个基因组中的一种高度重复序列，又称简单串联重复（STR，SimpleTandenlRepeat）或简单序列重复（SSR，SimpleSequenceRepeat），它J一泛存在于真核生物及部分原核生物的基因组中，是多拷贝均匀分布的，就某一微卫星而言，其重复数是可变的，这构成了微卫星多态性的基础。有关微卫星的报道始见于1974年，Skinner等［”1在研究寄生蟹的卫星DNA时发现了一类简单串联重…     

微卫星标记技术的研究进展及其在家兔研究中的应用

微卫星标记DNA是简单串联重复序列(simple sequence repeas,SSR),它的组成基元为1～6个核苷酸,例如(CA)n、(CGA)n、(GACG)n等.由于这些序列广泛存在于真核细胞的基因组中,且由于串联重复的数目是可变的而呈现高度的多态性,以及在单个微卫星点上可作共显性分析.近年来,微卫星序列作为比较理想的分子标记广泛应用于遗体图谱的构建、居群遗传学以及系统发育的研究.     

微卫星DNA标记技术在养猪业中的应用

1微卫星DNA的结构 微卫星DNA又称短串联重复或简单重复序列,由侧翼序列和重复串联的核心序列2部分组成,核心序列长度一般为1～6个碱基,首尾相连组成重复串联序列[1],其中最常见的是2个碱基的双核苷酸重复,即（TG）n和（CA）n,每个微卫星DNA的核心序列结构相同     

微卫星分子标记的研究进展

微卫星是指以少数几个核苷酸(一般1～6个)为单位多次串联重复的DNA序列，是1974年Skinner在研究寄居蟹的卫星DNA时发现的。微卫星广泛均匀地分布在基因组上，其重复数和重复单位序列都是可变的，故多态信息含量大。但由于微卫星无位点特异性，无法确切定位。因此以微卫星核心序列为中心，两侧各加上1个侧翼序列，形成所谓的序列示踪微卫星位点(STMS)。由于侧翼序列在基因组中是单拷贝的，具有位点特异性，而微卫星本身又使STMS具有多态性，只需根据微卫星侧翼序列设计一对PCR引物，通过PCR反应从模板DNA中将该位点扩增出来，然后用聚丙烯酰胺凝胶电泳分离，溴乙锭或银染法显色进行研究。     

微卫星电泳及银染检测中的常见问题分析及对策

微卫星DNA,又称短串联重复序列(short tandemrepeat STR),是一类广泛存在于原核/真核生物基因组的DNA串联重复序列。它是继RFLP之后兴起的一种新的分子遗标记技术。因其多态信息含量高,检测快速,重组率低,已被越来越多的应用于基因定位及构建基因组图谱和群体遗传结构分析及杂交优势预测等诸多方面[1]。尽管微卫星标记方法操作简便、快捷,但因其灵敏度高、操作时间短,在实际操作中出现的一些问题常常会影响最终的检测结果。笔者总结了一年来STR工作中所遇到的一些有关于微卫星电泳及银染的常见问题,做出了相应的分析和对策,对于保证…     

SSR及其在家蚕中的应用

微卫星DNA(Microsatellete DNA),又称为简单重复序列(SSR,single sequence repeats),是一类由2～6个核苷酸为重复单位组成的长达几十个核苷酸的重复序列如(GA)n ,(AC)n,(GAA)n等,广泛存在于原核及真核基因组中.本文针对SSR标记的原理、操作程序及其在家蚕中的研究现状作了简要介绍.     

微卫星标记BMS2508在4个山羊品种中的遗传多样性研究

微卫星DNA又称简单序列重复、短串联重复序列和简单序列长度多态性,广泛存在于真核生物基因组中.微卫星多态性是由于减数分裂过程中不等交换造成变异而产生的,具有保守性,其核心序列为2～6 bp,重复约10～20次,属于等显性遗传.自1989年在人类基因组研究发现微卫星多态性后,目前在马、牛、猪、绵羊和鸡等动物基因组中也筛选出了大量的微卫星标记,但山羊等动物中则相对较少.     

分子标记与鸡生产性能的研究进展

随着基因组学时代的到来和各种生物技术的飞速发展 ,分子标记技术在鸡的育种和生产中愈来愈显示其重要性。近几年来 ,国内外学者对微卫星标记进行了广泛而深刻的研究 ,在基因作图、数量性状位点 ( QTL)定位、群体遗传距离测定、抗病品系的选育等方面得到了广泛应用。作为第三代分子标记的 SNPs,为探索鸡的某些疾病的产生机理和生产性能差异的遗传基础提供了新方法。1　微卫星标记微卫星是在生物体基因组以 2～ 6bp为其核心序列 ,头尾相连组成的串状重复序列。核心序列一般重复 1 0～ 2 0次 ,多态性的产生是因重复次数的不同造成的 ,通常…     

猪EST序列的微卫星标记定位

通过对 Gen Bank中猪的表达序列标签数据库进行序列扫瞄 ,结果检测到大约 10 0个包含一个微卫星重复或简单重复 (SSR)的序列文件。这些重复单元多数是二核苷酸(CA/GT)重复 ;而且检测到 3～ 6个核苷酸的重复序列。通过 6个二核苷酸和 14个中度串联重复序列的初步分析 ,仅二核苷酸重复序列标记产生丰富的标记信息。 (二核苷酸为10 0 % ,中度串联重复序列为 14 % )。另外对 5 0个二核苷酸和 1个三核苷酸 SSRs设计了几对引物 ,结果在 MARC的参考家系中 ,发现 4 2个标记具有多态性 ,17个标记不具有多态信息 ,12对引物没有扩增产物。通过二核苷酸和 3～ 6个核苷酸重复单元的比较 ,二核苷酸标记 72 %能够反映标记信息 ,而其它重复单元仅有 7%。不同的是 ,在 3～ 6个碱基重复单元中 ,非多态标记占较高的比率 (6 4 % ) ,而 2个碱基重复单元仅 14 %。这或许是因为在猪基因组 DNA中 ,中度重复单元的多态性较少 ;或是由于我们选择 17个以上连续重复碱基长度的标准太低。本研究将定位的微卫星标记加入猪的遗传图谱上 ,并为人和猪的基因组之间提供了有用的联系     

肉牛经济性状关联的微卫星标记研究进展

微卫星序列是以1～6个短核苷酸为基本重复单位的重复序列,呈共显性、重复性好、多态性丰富和操作简单,在基因定位与QTL分析、亲权分析、分子标记辅助选择等方面应用广泛.本文综述了与肉牛部分经济性状(生长发育性状、胴体性状、肉质性状、多胎性状和出生重)相关的微卫星标记研究进展.     

微卫星标记及其在家畜遗传育种中的应用

微卫星DNA（Microsatellite DNA）是指以少数几个核苷酸（多数2～4个）为单位多次串连重复的DNA序列, 也称简单重复序列（simple sequence repeat, SSR）、短串联重复（short tandem repeat, STR）或简单序列长度多态性（simple sequence length polymorphism）.早在上世纪70年代初, Skinner在寄居蟹的DNA中发现了一类简单串联重复序列, 1980年Singh等人又在蛇W染色体的性别特意性卫星DNA中发现了一类GATA和GACA的简单重复序列, 1982年Singh等人在人心肌肌动蛋白（Ha-25）的内含子中发现了一个重复25次的（dT-dG）序列,同时指出这一序列在人及其它真核生物的基因组中广泛存在,并与Z-DNA的形成有关.     

微卫星DNA标记与乌骨鸡屠宰性能的相关分析

微卫星(mierosatellite)DNA标记是由重复单位为2～6 bp的核苷酸序列所构成的串联重复序列,由于重复单位的重复数目不同,形成了微卫星标记的丰富多态性.微卫星标记普遍存在于真核生物基因组中,由于具有数量多、分布广、多态性丰富、呈共显性遗传方式及检测快速和方便等优点而成为当今包括人类在内的各物种基因作图的首选标记,并在基因诊断、物种的演变追踪、QTL分析、系谱的确定、群体遗传结构分析、标记辅助选择等方面显示出巨大的应用价值.     

藏鸡基因组微卫星特征分析

藏鸡为我国高原特有地方品种,为了保护其地方品种资源,开发高原特色产业,本研究采用MISA软件检测藏鸡全基因组序列中存在的微卫星位点,并找出其SSR开始分析。研究结果发现:共找到411 761个微卫星序列,含微卫星的序列共14 295条,微卫星平均每隔2 607.56 kb出现一个序列,其中1 055种重复基元模式在藏鸡DNA序列中被找到,所占比例份额最高的是(TA)n(47.49%),10~15 bp的是微卫星序列长度所在的主要区域。因此,藏鸡微卫星标记的开发利用为藏鸡品种的分子鉴定打下基础,可以加快藏鸡杂交选育进程,以便获得较好的开发前景和产生巨大的经济效益。     

应用荧光标记技术鉴定1例史宾格幼犬毛色遗传异常

<正>短串联重复序列(short tandem repeat,STR)是广泛分布于真核生物基因组一类具有长度多态性的DNA序列,多态性片段长度400 bp,其核心重复序列为2~6 bp。由于其具有分布广、多态性高、单个位点基因呈共显性遗传等特点,广泛应用于人类法医DNA检测、动物个体识别及亲权鉴定。STR广泛分     

微卫星标记技术及其在家禽遗传育种中的应用

1 标记的技术原理 微卫星DNA分布在整个基因组不同位置上,由于重复次数或重复程度不完全,而形成每个座位的多态性。SSR所揭示的多态微卫星DNA标记一般不直接用作探针,由于每类微卫星两端的序列多是相对保守的单拷贝序列,因此可根据两端序列设计一对特异引物,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增每个位点的微卫星序列,经聚丙烯酰胺凝胶电泳,检测其多态性。其多态信息含量高达0.7以上。     

梅花鹿表达序列标签资源的微卫星信息分析

微卫星标记(simple squenee repeat,SSR)是真核生物基因组中l～6个核苷酸的串联重复,被公认为是各类遗传标记中最有效的分子标记之一.快速增长的表达序列标签(expressed sequence tags,EST)为微卫星标记的开发提供了巨大的来源.