波尔山羊FSHR5’端序列的SNP多态性及超排效果分析

为探索波尔山羊超排个体排卵数差异与个体遗传特性的相关性,对波尔山羊的FSHR基因(950 bp),分成四段分别设计引物进行PCR-SSCP多态性分析,结果发现一个SNP位点,导致5-’1出现两种基因型。序列分析显示该突变位点位于转录起始点上游-739bp处,属于远端转录启动调控区。统计分析表明AA型个体的平均排卵数与AB型个体的平均排卵数差异极显著(P<0.01),平均胚胎可利用率差异显著(P<0.05),这说明个体的超排潜力可能与其本身的FSHR基因的遗传特性有关。     

波尔山羊不同超排方法效果的分析

对20只供体波尔山羊实施不同方法的超排处理,结果全部发情。1组黄体数为14.00±4.67个/只,采集胚胎数11.30±4.50枚/只,可用胚胎数为9.40±4.14枚/只;2组黄体数为17.40±5.87个/只,采集胚胎数13.40±4.62枚/只,可用胚胎数为11.60±4.45枚/只。统计分析表明,两种超排方法的黄体数、胚胎数、可用胚胎数差异均不显著(P>0.05)。     

泌乳期波尔山羊的重复超排及胚胎移植效果分析

对26只泌乳期波尔山羊实施2次重复超排处理。其结果如下:①第一次超排有效率为84.62%,平均排卵数为19.5±6.42(枚/只),平均采集胚胎数为15.86±1.84(枚/只),平均采集可用胚胎数为10.5±8.32(枚/只)。第二次重复超排处理时有1只羊推迟发情,超排有效率为96.15%,平均排卵数为28.36±5.26(枚/只),平均采集胚胎数21.48±7.42(枚/只),平均采集可用胚胎数为18.64±4.12(枚/只);②两次重复超排所获得的可用胚胎数差异极显著(P<0.01)。泌乳期供体羊第一次采集的可用胚胎数量[10.50±8.32(枚/只)]显著低于断奶后供体羊[18.64±4.12(枚/只)];③胚胎移植后的2组羊产羔率差异不显著(P>0.05)。     

波尔山羊超排和胚胎移植的研究

波尔山羊(Boergoat)是优良的肉用山羊品种,原产南非,该品种具有早期生长速度快,繁殖率高,肉质好,产肉量高,杂交效果好等特点[1]。目前,利用波尔山羊作为终端父本,与当地山羊品种进行经济杂交,已经取得了十分理想的效果[2]。我国山羊品种资源丰富,存栏量大,但平均胴体体重较低。     

波尔山羊不同卵泡发育阶段超排效果的比较研究

研究结果表明:波尔山羊小、中、大卵泡发育阶段的超排效果即供体羊黄体平均数(个/只)、羊均可用胚胎数(枚/只)、可用胚比率(%)分别为:16.18±7.46、16.92±7.15、15.80±6.49,13.18±6.60、13.76±6.52、12.05±4.98、81.46、81.32、76.26。大卵泡发育阶段的超排效果比中、小卵泡发育阶段略差,但并无显著差异(P>0.05)。     

超排程序对波尔山羊超排效果的影响

本试验以波尔山羊为研究对象,对超排时间、超排程序等方面的因素对供体超排效果的影响情况进行了研究.结果表明,在供体发情周期12～17天中任一天开始超排均能取得较好的超排效果,可用胚平均数为11.50～18.91.超排程序对超排效果的影响极显著（P＜0.01）,超排供体注射1针PGF2α同期发情时的超排效果最好,可用胚平均数为18.0.用240IU FSH对经产波尔山羊进行超排,注射1针PGF2α同期发情时能取得最佳的超排效果.     

超排程序对波尔山羊超排效果的影响

本试验以波尔山羊为研究对象,对超排时间、超排程序等方面的因素对供体超排效果的影响情况进行了研究。结果表明,在供体发情周期12~17天中任一天开始超排均能取得较好的超排效果,可用胚平均数为11.50~18.91。超排程序对超排效果的影响极显著(P<0.01),超排供体注射1针PGF2α同期发情时的超排效果最好,可用胚平均数为18.0。用240IU FSH对经产波尔山羊进行超排,注射1针PGF2α同期发情时能取得最佳的超排效果。     

激素对波尔山羊超排效果影响的研究

以波尔山羊为研究对象,研究激素对供体超排效果的影响。结果表明,FSH剂量对供体超排效果有显著影响,随FSH剂量的增加,育成羊的黄体数极显著增多,经产羊的可用胚数显著增加;国产和进口激素对超排效果影响不显著(P>0.05),国产激素完全可以代替进口激素用于波尔山羊的超排;供体发情配种时用LHRH-A3促排的效果比LH、hCG好。     

波尔山羊超数排卵处理的效果分析

结合生产实践，对波尔山羊超数排卵效果的差异性进行了分析，总结了供体羊产后的间隔时间、自然发情周期、山羊的体质、环境、季节等诸多因素对超排处理效果的差异性的影响，并提出了具体的解决方案。     

牛FSHR基因5′端侧翼序列的分析和多态性研究

以中国西门塔尔牛基因组DNA为模板，参照绵羊的FSHR基因序列设计和合成引物、PCR扩增获得长度为931bp，包括5′端侧翼797bp和结构基因第一外显子区134bp的牛FSHR基因片段，将该片段克隆于PUC18载体中，作序列分析发现：牛的FSHR基因转录启动子的遗传结构与人和鼠的FSHR基因不同，它的基因转录启动区含有TATA盒和类CAAT盒序列。在检索出的转录调节元件、或特征性序列位点，牛与绵羊在5个序列位点有碱基变异，这可能与牛和绵羊的产仔率高低不同相关，对34头份中国西门塔尔牛的扩增产物，应用PCR－RFLP方法进行多态性分析，TaqⅠ酶切出现了多态性，酶切产物电泳呈现3种基因型，由2种等位基因构成，通过对基因频率和基因型频率在种用公牛，双胎母牛和随机牛类群中分布的比较研究结果，认为该基因与牛的繁殖性状存在连锁相关。     

GSTs-Mu基因的单核苷酸多态性与种公牛精液品质的相关性分析

谷胱甘肽S-转移酶(GSTs)在致癌物质解毒及基因诱变等的过程中都发挥非常的重要的作用,因此可能影响公牛个体的精液品质。本实验选用长春中信集团种公牛繁殖中心的33头种公牛,通过PCR-SSCP技术,检测谷胱甘肽S-转移酶基因7个外显子扩增位点中是否存在突变;并对多态片段进行了测序,以确定突变的碱基类型和突变位点变异的位置;同时结合精液品质测定记录,对长春中信集团种公牛繁殖中心公牛的精液品质进行了相关分析。根据PCR-SSCP检测及测序结果得知:在谷胱甘肽S-转移酶基因外显子中,第5外显子的56bp位存在C→T的突变,但是由于该处的碱基位于密码子第2位,氨基酸由脯氨酸突变为亮氨酸。分析了33头种公牛谷胱甘肽S-转移酶基因的遗传多态性与精液品质的相关关系,谷胱甘肽S-转移酶基因的第5外显子AA型的鲜精活力、冻精活力、冻精活精子比率要显著高于AB型以及BB型。     

AQP7基因第二外显子的单核苷酸多态性与牛精液品质的相关分析

采用PCR-SSCP技术分析了AQP7基因的第2外显子在西门塔尔牛和夏洛莱牛群体中的遗传多态性。结果表明:在所扩增的AQP7基因的第2外显子中发现PCR-SSCP多态,有2种等位基因A和B,有2种基因型AA型和AB型。对多态片段测序分析表明:在AQP7基因第2外显子中存在有一碱基A→G突变,导致编码氨基酸(天冬氨酸→丝氨酸)的改变。适合性卡方检验表明,该位点的不同基因型频率处于Hardy-Weinberg平衡状态。用最小二乘法分析AQP7基因第2外显子不同基因型与西门塔尔牛和夏洛莱牛精液品质的相关性,发现AQP7不同基因型对冻精顶体完整率有极显著影响,AA型极显著高于AB型(P<0.01)。AA型的冻精活精子比率显著高于AB型(P<0.05),对其它性状的影响差异不显著。因此,西门塔尔牛和夏洛莱牛AQP7基因应是影响精液品质的一个主效基因或与影响精液品质的主效基因紧密连锁。     

肉鸭Six1基因第2外显子单核苷酸多态与屠体性状的相关性分析

Six1基因是调控肌肉形成过程中的重要基因。为研究Six1作为肉鸭生长发育候选基因的可行性,本实验以42日龄大型肉鸭为研究对象,采用PCR-SSCP技术检测肉鸭Six1基因第2外显子的多态性,并对所检测到的多位点组成的基因型与肉鸭屠体性状进行关联性分析。结果表明:在鸭Six1基因的编码区第729 bp处存在C→T突变,属同义突变,该突变位点在大型肉鸭群体中表现为AA与AB 2种基因型。肉鸭AA和AB基因型间,胸肌重、腿肌重和其他屠体性状差异不显著(P>0.05)。以上结果表明,鸭Six1基因第2外显子区没有适用于遗传标记的多态位点。     

如皋鸡EX-FABP基因遗传多态性及其与肌内脂肪含量的相关分析

以60周龄和自繁后的12周龄的如皋鸡作为试验材料,采用PCR-SSCP技术对细胞外脂肪酸结合蛋白（EX-FABP）基因进行单核苷酸多态性及遗传特异性分析。结果检测到2个SNP突变,分别为4271 G/A、4281 G/A突变,有3种基因型。最小二乘差异显著性检验结果表明,在60周龄时,AA型含量最高,显著高于AB型（P<0.05）;12周龄时,AB型含量最高,BB型最低;60周龄的肌内脂肪含量显著低于12周龄时的含量（P＜0.05）。     

单核苷酸多态性及其在牛育种中的应用

单核苷酸多态性(SNPs)被公认为是最新的第3代分子标记,它将成为理想分子标记之一.本文介绍了SNP的概念、特点以及在牛生长发育性状、胴体和肉质性状、产奶性能、抗病性状中的应用.     

鸡H-FABP基因多态性及其与肌内脂肪含量的相关研究

根据GenBank发表的鸡H-FABP基因序列设计引物,以广东省农科院畜牧研究所提供的4个地方优质肉鸡品种,2个培育品种和1个引进的肉鸡品种为试验材料,通过测序和PCR-SSCP的方法进行SNP检测和基因型分析,探讨H-FABP基因多态性与肌内脂肪含量(IMF)之间的关系。结果发现在H-FABP基因260 bp和675 bp处存在T/C和G/A的突变位点,对2个突变位点在研究群体中进行基因型分析,结果产生3种基因型。基因型与IMF的相关分析结果表明:在T260C位点上,所有品种中AA基因型的IMF含量显著(P<0.05)高于BB基因型个体,但对于不同的品种来说,AA和BB基因型只对封开杏花鸡和岭南黄鸡II号的IMF含量有显著影响(P<0.05),而对其他各鸡种均无显著影响(P>0.05);在G675A位点上,所有品种中AA型和AB型肌内脂肪含量差异显著(P<0.05)。     

The Analysis for the Single Nucleotide Polymorphism of TGF-β1 and Its Association with Reproduction in Different Sheep Breeds

A single nucleotide polymorphism(SNP)of 805 bp region in the intron 6 of transforming growth factor β1(TGF-β1)gene was identified by polymerase chain reaction-single-strand composition polymorphism(PCR-SSCP)in 196 sheep among Small-tailed Han sheep,Tong sheep,Tan sheep and Oula sheep.Comparative sequence analysis of cloned products revealed an AGAC deletion at 294 bases upstream of exon 7 of the TGF-β1 gene(site 14201 in gi76871756).Statistical results of the genotype and allele frequencies in different breeds showed that genotype AB was dominant in the Small-tailed Han sheep.Genotype BB,however,was in majority in low-fecundity sheep.The results of a Chi-square test indicated that all the populations were in Hardy-Weinberg equilibrium.     

绵羊心脏脂肪酸结合蛋白基因单核苷酸多态性分析

试验旨在探讨心脏脂肪酸结合蛋白（heart fatty acid-binding protein,H-FABP）基因在绵羊中的遗传多态性,并寻找可用于辅助选择的分子标记。本研究以滩羊（250只）及滩羊×湖羊杂交F1代（174只）为试验动物,利用SNaPshot分型技术对H-FABP基因（GenBank登录号：AY157617）的多态位点进行单核苷酸多态性（SNP）分析,统计基因频率和基因型频率,进行Hardy-Weinberg平衡性检测,计算期望杂合度（He）、多态信息含量（PIC）和有效等位基因数（Ne）等遗传多态指标,分析候选基因不同基因型与体重、体长、体高、胸围、胸深、胸宽和管围等生长性状的关联性。结果显示：①检测到9个多态位点：939[A/G]、980[G/A]、1018[T/C]、2878[C/T]、2956[C/T]、3017[G/A]、3341[G/C]、3394[T/A]、1056[-/G],其中有6处转换、2处颠换、1处单碱基插入。②939[A/G]、980[G/A]、2956[C/T]、3341[G/C]、3394[T/A]和1018[T/C]的He为0.3200~0.4666,PIC为0.2688~0.3577;2878[C/T]、3017[G/A]位点的He为0.0283~0.1272,PIC为0.0279~0.1191,为低度多态;1056[-/G]位点的He在滩羊、滩羊×湖羊杂交F1代群体中分别为0.0120和0,PIC在滩羊、滩羊×湖羊杂交F1代群体中分别为0.0119和0;9个多态位点在滩羊、滩羊×湖羊杂交F1代群体中均符合Hardy-Weinberg平衡定律。③5个多态位点：939[A/G]、980[G/A]、2956[C/T]、3341[G/C]、3394[T/A]处于紧密连锁（D'>0.99）,将H-FABP基因分为3个单倍型：AA、AB和BB。④在41只滩羊×湖羊杂交F1代羊中,BB单倍型在各生产性状上具有最大值,但各单倍型间差异不显著（P>0.05）。结果表明,绵羊H-FABP基因具有丰富的遗传多态性,939[A/G]、980[G/A]、2956[C/T]、3341[G/C]、3394[T/A]5个位点紧密连锁,BB单倍型可能是与绵羊生产性状相关的优势单倍型。     

单核苷酸多态性及其应用

单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphisms,SNPs）是一种新的分子标记，是指基因组由于单个核苷酸的变异所产生的差异。由于其多态性高，便于自动操作等特点，在基因组、后基因组时代具有广泛的应用前景。本文对SNPs的概念、特点、分析方法及应用等方面做了简要的概述。