浅谈BLUP方法及其三种形式的应用

BLUP (Best Linear Unbiased Prediction,最佳线性无偏预测)方法是目前进行育种值估计最好的方法,它已经在各个国家得到了广泛应用,有利于各国畜牧业的发展.本文主要介绍BLUP的基本原理、特点、基本步骤;并简述目前常用的BLUP三种形式(E-BLUP、R-BLUP、M-BLUP)的模型、原理以及BLUP的应用和未来的发展前景.     

仔猪初生窝重性状的遗传评估

本文旨在计算温氏某育种场大白猪初生窝重性状的遗传参数,并评估基因组选择不同计算方法对初生窝重性状的选择准确性。利用DMU软件和动物模型估计初生窝重的方差组分,包括加性方差组分和永久环境效应方差组分,并计算性状的遗传力。通过简化基因组测序分型方法,构建大白猪基因组选择参考群体,并利用GVCBLUP和BLUPF90软件,验证群体分别使用BLUP、GBLUP和ssGBLUP方法计算估计育种值的准确性。结果显示：初生窝重的遗传力为0.08,为低遗传力性状。初生窝重与总产仔数、产活仔数、健仔数和弱差猪仔数遗传相关系数分别为0.59,0.68,0.88和-0.17。基因组选择结果显示,验证群体ssGBLUP育种值估计的准确性最高,达到0.38,比常规BLUP方法提高了15.79%,与BLUP估计育种值秩相关达到0.63。对初生窝重的选择,可有效提高产仔数;且结合ssGBLUP方法的基因组选择,能够有效提高估计育种值的准确性。     

运用动物模型BLUP法估计荷斯坦牛育种值及制定总性能指数

[目的]探讨动物模型BLUP法在估计新疆地区荷斯坦牛育种值中的应用,为荷斯坦牛的选种选配计划提供理论依据.[方法]利用新疆呼图壁种牛场牧一场、牧二场及牧三场1996～2010年共15 a荷斯坦牛生产性能记录资料,运用动物模型BLUP法,对荷斯坦牛进行单性状育种值估计.[结果]估计得到公牛产奶量育种值、乳脂率育种值、乳蛋白率育种值排名第一的分别为94166、8466、11100120号;母牛产奶量育种值、乳脂率育种值、乳蛋白率育种值排名第一的分别为120030103、120040007、320030159号;并根据产奶量、乳脂率、乳蛋白率育种值制定了荷斯坦牛总性能指数公式(TPI).[结论]为使种牛评定更准确,需综合考虑产奶量和乳成分等性状,制定荷斯坦奶牛总性能指数公式.     

应用动物模型BLUP估计猪育种值的简介

畜禽的多数经济性状受到环境和微效多基因的控制.其中环境因素不能传递给后代,如果人们从个体的测验成绩、谱系(祖先)成绩、同胞测验成绩和后裔测验的成绩中,剔除非遗传的环境因素,并将充分利用所有资料来源来评定种畜--进行正确的选种,这一直是育种工作者多年来努力探讨的问题.在过去的几十年中育种值估计的理论和方法不断更新、发展和完善.50年代末美国学者Henderson提出了BLUP方法,即最佳线性无偏预测法,并已成为多数国家牛育种值估计的常规方法.80年代中期,一些国家开始把这一方法应用于猪的育种值估计中,有效地提高了猪的遗传改良速度,如在加拿大,从 1985年应用BLUP方法以来,背膘厚的改良速度提高了50%,90kg体重日龄的改良速度提高了近 100%～200%,目前在加拿大、丹麦、荷兰、西班牙等国 BLUP已成为猪育种值估计的常规方法.随着计算技术和计算机技术的发展与普及,BLUP已成为当今世界范围内种畜遗传评定的主要方法.     

最佳线性无偏预测估计种畜育种值（BLUP）可视化计算机程序

应用VB6可视化编程软件,设计较先进的最佳线性无偏预测估计种畜育种值(BLUP法)程序,增强了软件的功能,使其更具易用性、广泛性.     

种猪现实育种值的估测

取杭州市种猪试验场2000-2002年共1 443头长白猪个体性能测定资料,用4种方法估测了90kg体重校正背膘厚估计上代亲本公猪的育种值,其中用25头以上后裔平均值与同期群体平均值之差的2倍定义为现实育种值.结果表明:现实育种值的数值和方向与后裔测定育种值十分一致,与一次测定值的育种值差很大,现实育种值的方向与BLUP值比较一致.现实育种值不受表型值的影响,是猪真正育种值的最佳估计值.估测青年公猪的育种值,用BLUP法比较好.     

种母猪遗传评估软件的研制

采用筛选出的混合模型及相应的遗传参数,应用多性状动物模型BLUP法用FORTRAN计算机语言编制出种母猪遗传评估软件(MTSOWEBV).计算种母猪各重要繁殖性状的估计育种值(EBV),并按各性状的经济重要性,估计种母猪年生产能力的综合育种值指数.     

蜜蜂主要数量性状遗传参数估计的研究进展

遗传参数估计是蜜蜂遗传育种工作中不可或缺的部分,蜜蜂遗传力估计的复杂性在于许多经济性状同时受到大量工蜂和蜂王的共同影响,同时交尾的特殊性——蜂王的多雄交配和雄蜂单倍体的情况,也使得亲缘关系的计算十分复杂。蜜蜂遗传参数估计方法从母子回归、姐妹回归,一直发展到现在的BLUP动物模型,系谱信息愈发完善,亲缘关系的计算更加成熟,遗传参数估计更加准确,这些工作对蜜蜂的主要性状取得较大遗传进展贡献巨大。介绍了蜜蜂遗传参数估计的特殊性、亲缘关系的计算和BLUP动物模型在蜜蜂遗传参数估计中的使用。BLUP动物模型已在其他国家蜜蜂育种中使用并取得明显的遗传进展,对我国蜜蜂数量遗传育种的发展具有借鉴意义。     

奶牛繁殖性状的育种值估计

[目的]奶牛繁殖性状的育种值估计及比较不同育种值估计方法的准确性。[方法]利用北京市8个黑白花奶牛群的头胎繁殖性状资料,用BLUP法估计了公牛繁殖力的育种值;利用20头公牛的2299条与配母牛头胎繁殖性状资料,估计了公牛雄性繁殖力的育种值;利用19头公牛的2001条女儿的头胎繁殖性状资料,估计了公牛雌性繁殖力的育种值。分别比较了考虑场、年、季之间互作效应的和未考虑场、年、季之间互作效应,用最小二乘法事先矫正了场、年、季效应这3种方法的育种值估计准确性。[结果]考虑场、年、季之间互作效应时的准确性最高,未考虑时的准确性最低。[结论]估计公牛繁殖性能的育种值时,应事先或模型中加以剔除这些固定效应。     

主要海水养殖生物的BLUP育种技术体系取得重要突破

国家“863计划”现代农业技术领域通过攻关,在主要海水养殖生物的BLUP育种技术体系取得重要突破,鱼类、贝类水产动物多性状复合育种技术达到世界领先水平,打破了国外水产发达国家的技术垄断和封锁,率先建立了我国自主知识产权的水产生物BLUP育种体系。