猕猴桃种质资源表型性状遗传多样性分析

以66份猕猴桃种质资源为材料,对其枝条、叶片和果实的19项表型性状进行观测和描述,采用因子分析和聚类分析对表型性状分布频率、变异系数等进行研究。结果表明：10个描述型性状平均变异类型为4.9个,最丰富为果形（9个）;9个数量性状中果柄长度的变异系数最大,为41.04%,果实纵径的变异系数最小,为12.14%。Q型聚类分析将66份猕猴桃资源分成4个组群,组群内的种质资源以1年生枝颜色、单果质量和果形指数等聚类。     

EST-SSR标记与人工接种鉴定黄瓜种质褐斑病抗性

利用EST-SSR引物CSFR33对231份黄瓜资源进行抗病性检测,有109份资源抗病。通过对30份资源与人工接种抗性鉴定结果相比较,二者的符合率达93.33%。在实际应用中可通过标记初步进行大量材料的抗性检测,在此基础上根据需要有针对性地做人工接种抗病性鉴定,可以大大提高黄瓜种质资源抗性筛选的效率。抗病资源的获得可为抗褐斑病黄瓜新品种的选育奠定基础。     

猕猴桃EST-SSR引物筛选及通用性分析

应用SSRHunter软件对NCBI公共数据库中的猕猴桃EST序列进行筛查,利用Primer5．0软件设计引物并进行筛选,同时对其在部分柑橘类植物的通用性进行分析。以漓江猕猴桃DNA为模板,对所设计的97对EST-SSR引物进行筛选,结果表明其中77对引物能扩增出清晰条带,有效扩增率为79-38％。随机选取20对引物对...     

红肉猕猴桃种质资源果实性状及AFLP 遗传多样性分析

 对中国红肉猕猴桃种质资源进行收集和调查,并对其进行果实性状变异分析和AFLP 遗传多 样性及遗传关系分析。结果表明,红肉猕猴桃野生资源主要分布于湖南省、湖北省、河南省、江西省、 四川省和陕西省等地,共采集到52 份野生资源和2 份品种资源（包括软枣猕猴桃红肉类型、中华猕猴桃 红肉类型和美味猕猴桃红肉类型）。红肉猕猴桃种质资源在果实性状和DNA 分子水平上都存在丰富的变 异和较高的遗传多样性水平,4 对AFLP 引物共扩增出259 个多态性位点,多态性位点百分率为90.56%, Nei’s 基因多样性和Shannon’s 信息指数分别为0.318 和0.477;资源间遗传相似性系数介于0.568 ~ 0.883 之间,平均为0.714。聚类分析和主坐标分析将54 份资源划分为4 个组,软枣猕猴桃红肉类型单独聚为 一类;中华猕猴桃和美味猕猴桃红肉类型亲缘关系较近且有按地理来源优先聚类的趋势。果实性状数据 和AFLP 数据之间具有极显著的相关性,二者可结合用于红肉猕猴桃资源评价和保护利用工作中。     

江西省野生猕猴桃种质资源调查

对江西省野生猕猴桃资源进行实地调查,了解了其分布、种类和数量等情况,共收集不同野生猕猴桃资源369份,其中中华野生资源345份,占调查资源总量的93. 50%,其他的野生猕猴桃资源中,美味猕猴桃3份,占调查资源总量的0. 81%;软枣猕猴桃1份,占0. 27%;京梨猕猴桃8份,占2. 17%;毛花猕猴桃8份,占2. 17%;阔叶猕猴桃4份,占1. 08%。野生猕猴桃资源为猕猴桃育种提供了丰富的材料。     

基于SSR标记的浙江地方柚类种质资源遗传关系分析

【目的】对浙江地方柚类种质资源进行遗传多样性分析,为其搜集保护和合理利用提供参考。【方法】利用23对SSR引物进行遗传多样性分析并构建种质鉴定图。【结果】23对引物共检测到91个等位变异位点,变异范围为2~7,平均每对SSR引物可检测到4.0个等位位点;23个SSR位点的观察杂合度、期望杂合度和多态性信息含量分别为0.51、0.54和0.47。UPGMA聚类结果显示:18份供试材料在遗传相似性系数为0.71时分成A1~A3、B1、C1和D1共6个组群,其中A1组包括‘四季柚’‘红肉四季柚’和‘佛香柚’等7份种质,A2组包括‘永嘉红心柚2号’‘青田红心柚’和‘木兰柚’3份果肉颜色为粉红色的种质,A3组包括‘处红柚’‘永嘉红心柚1号’‘古磉柚’和‘官南红柚’4份果肉颜色为红色的种质,‘官南土柚’和‘文成红心柚’自成B1和C1组,‘常山胡柚’和‘槾文柑’2个杂种柚类型聚为D1组。【结论】浙江地方柚类种质资源有丰富的遗传多样性,基于AG14、CAG01、CMS-16和CMS-26 4对引物组合构建浙江地方柚类资源的种质鉴定图,可将18份柚类种质进行区分。     

基于EST-SSR标记的怀地黄遗传特性

以怀地黄新品种"怀中1号"和道地产区5个主流品种"金九""怀丰""北京3号""沁怀""85-5"共60个样本为试材,采用EST-SSR分子标记方法,研究不同怀地黄品种间遗传特性,以期为分子标记辅助育种提供参考依据.结果表明:从68对引物中筛选出9对具有多态性的引物,每对引物R检测到的等位基因数8～25个,平均15个.共检测到137个等位基因(分子量变异范围为100～500 bp),多态位点百分率97.08％.SSR多态信息量(PIC)分布范围为0.850 1～0.926 4,平均为0.900 7.有效等位基因1.153 1～1.201 2,Nei's 基因多样性为0.085 7～0.111 3,Shannon 指数为0.124 6～0.160 5,不同品种的遗传距离范围0.148 6～0.590 9.聚类分析结果显示,遗传相似系数为0.59时,6个品种分为3类,在遗传相似系数0.79处,每个品种的10个样本单独聚为一类.表明SSR分子标记可以用于地黄不同品种之间的亲缘关系鉴定以及品种纯度的验证.     

基于EST-SSR标记与果实品质性状的贵州野生刺梨核心种质构建

采用10对EST-SSR引物和9个果实品质性状指标对收集的220份野生刺梨(Rosa roxburghii Tratt)资源的遗传多样性进行分析,结果表明:10对EST-SSR引物共扩增出多态性条带27条,多态百分率为76.67%;9个品质性状中平均单果质量、可滴定酸、固酸比、维生素C和类黄酮含量的变异系数达到20%以上;说明该220份贵州野生刺梨种质资源遗传变异丰富,遗传多样性分布范围较广,适于进行核心种质的构建研究。进一步将9个品质性状指标进行6级分类,并处理为9个品质标记共产生54条多态带,与EST-SSR标记一起,采用Nei’s遗传距离进行UPGMA聚类,同时采用位点优先取样策略进行核心种质构建,以表型保留比例、均值差异百分率、方差差异百分率、极差符合率、变异系数变化率、多态性位点百分率、Nei’s基因多样性指数、Shannon’s信息指数等对核心种质进行评价,并利用主坐标分析法对核心种质进行确认。结果表明:构建的32份核心种质在分子水平,表型水平及地区分布上都能够代表原种质的遗传多样性。     

江西省五府山野生猕猴桃种质资源调查

为探明江西省五府山野生猕猴桃种质资源分布现状并发掘具有育种价值的优异种质,为野生猕猴桃资源保育及合理开发利用奠定基础,2017—2018年对五府山野生猕猴桃种质进行收集与评价。结果表明:五府山野生猕猴桃种质资源丰富,其中以野生毛花猕猴桃居多,占收集种质的78.88%。2年共收集161份野生猕猴桃种质,其中毛花猕猴桃雄株77份、雌株50份;中华猕猴桃雄株6份、雌株14份;长叶猕猴桃雄株3份、雌株11份;野生猕猴桃种质分布海拔跨度为636～1 041 m,雌雄株交叉分布。从供试野生猕猴桃种质中挖掘出20份单花药花粉数均大于6 000个、雄蕊数均大于120枚、花粉活力均高于80%的优良授粉雄株种质;3份大果型种质,其单果质量为20 g以上;3份高干物质类型种质,其果实软熟后干物质含量均大于17%。该研究可为后期优良种质选育及品种遗传改良提供原始材料。     

应用cpSSR和EST-SSR标记进行柑橘特异种质资源遗传背景研究

将叶绿体SSR 和EST-SSR 标记用于揭示柑橘及其近缘属的系统发育关系,并阐明保存在重庆国家果树种质柑橘圃内一些特异种质资源的遗传背景。其中50 份材料和44 份材料分别用cpSSR 和EST-SSR 分析。22 对cpSSR 引物产生146 个多态性条带,平均检测到6.64 个多态性条带,平均Shannon’s多样性指数为0.32;18 对EST-SSR 引物产生240 个多态性条带,平均检测到 13.3 个多态性条带,平均多态信息含量（PIC）为0.73,平均期望杂合度为0.78。根据cpSSR 和EST-SSR 分析,结合形态学证据,阐明一些特异柑橘种质资源的遗传背景,同时证明莽山野橘、元橘、宜昌橙有较近的亲缘关系。     

Genetic diversity and relationships within Citrus and related genera based on sequence related amplified polymorphism markers (SRAPs)

Sequence related amplified polymorphism (SRAP) markers were used to detect molecular marker polmorphisms among 86 citrus and their relatives in Aurantioidea. Twenty-one SRAP primer combinations produced a total of 376 polymorphic fragments with an average of 17.9 per primer combination and an average polymorphism information content (PIC) of 0.86. The unweighted pair group method arithmetic average (UPGMA) analysis demonstrated that the accessions had a similarity range from 0.28 to 1.00 with a mean of 0.64. The subtribe Clauseninae (tribe Clauseneae) separated from the subtribes of the tribe Citreae. The subtribe Balsamocitrinae (tribe Citreae) was the most distant from the others. In the Citrinae, ‘primitive citrus fruit trees’ and ‘near citrus fruit trees’ groups did not clearly separate from each other but all genera in these groups were distinct. On the other hand, subgenus Papeda and subgenus Citrus were not separated clearly in the dendrogram. C. maxima, C. medica and C. reticulata separated into three distinct clusters in agreement with three ‘true basic species’ thesis. Similarity-based analyses supported the theory of few ancestral species in Aurantioidea.     

EST-SSR标记及其在果树研究中的应用

近年来大量ESTs数据的出现已成为开发SSR标记的重要来源。EST-SSR作为一种新型的分子标记,不仅具备传统基因组SSR标记的特点,而且以其开发经济和通用性高等优势已在很多植物中得到开发和应用。简要介绍了EST-SSR标记的原理和特点,重点综述了其在果树的遗传多样性分析、遗传连锁图谱的构建、比较作图和分子系统发育等研究领域的应用现状,期望为今后该项技术在果树研究上的应用提供参考。     

杧果种质遗传多样性的RAPD分析

对杧果不同生态型、不同胚性、不同果形与果色的38份品种和1个近缘种—扁桃进行了RAPD分析,19个引物在39份种质中共扩增出223条带,其中多态性带为196条,多态性带的百分率为87.89%,表明品种间存在着广泛的遗传基础。利用UPGMA进行聚类分析,在相似性系数0.755的水平上将38个品种分成3组,该结果与传统上以胚型为依据进行品种类群划分比较吻合。发现了多个与胚性密切相关和1个与果皮颜色密切相关的RAPD标记,并就部分品种的系谱关系、胚性和果皮颜色的遗传进行了探讨。     

不同生态类型西瓜种质资源遗传多样性的SSR分析

采用SSR分子标记技术对96份不同生态型西瓜种质资源的遗传多样性进行研究。从398对引物中筛选出38对扩增条带清晰、多态性高的引物分析供试材料,共得到7043条清晰可辨条带,其中多态性条带826条,占11.7%。平均每对引物对96份材料扩增出185.34条带,其中21.74条具有多态性。96份材料间的相似系数为0.42～0.99。聚类分析结果表明,野生西瓜与栽培西瓜的亲缘关系较远。在栽培品种内华北生态型、华南生态型和西北生态型西瓜的亲缘关系较近,说明我国西瓜种质资源同源性较高,遗传基础狭窄,有必要引入更多种质资源以拓宽西瓜育种背景。     

适合我国南方地区栽培的枣优良品种亲缘关系研究

利用荧光AFLP分子标记技术,对适合我国南方地区栽培的26个枣优良品种亲缘关系进行研究。结果表明,8对引物共扩增得到886条带,其中多态性条带为817条,多态性比例达到了92.2%,体现了非常丰富的遗传多样性。系统聚类结果表明大部分来源于北方地区的鲜食品种聚为一类,彼此间亲缘关系较近;制干、兼用品种和南方本地品种表现出较近的亲缘关系。酥脆枣与孔府酥脆枣亲缘关系很近,而河南鸡蛋枣与湖南鸡蛋枣之间存在着较远的遗传距离。     

Genetic diversity and relationships of lotus (Nelumbo) cultivars based on allozyme and ISSR markers

Genetic diversity and genetic relationships of lotus (Nelumbo Adanson) cultivars were evaluated using allozyme and ISSR markers. The samples used covered 11 accessions of possible hybrids between Nelumbo nucifera and Nelumbo lutea and 92 accessions of N. nucifera including 69 flower lotus, 13 rhizome lotus, 5 seed lotus and 5 wild lotus. For allozyme studies, a total of 31 alleles at 23 loci of 18 enzyme systems were detected of which 5 (21.7%) loci Aat, Idh, Mdh-2, Pgd, Sod were polymorphic. The loci of Aat and Idh included two alleles, Mdh-2, Pgd and Sod included three alleles. Eighteen genotypes were detected with the 13 alleles of the 5 polymorphic loci. The parameters of average allele number, observed heterozygosity, expected heterozygosity and Shannon information index of 92 N. nucifera samples were 1.35 ± 0.71, 0.06 ± 0.21, 0.05 ± 0.14, 0.10 ± 023, respectively. Thirteen ISSR primers generated 93 loci, of which 37.63% were polymorphic across all samples. The percentage of polymorphic loci, average allele number, expected heterozygosity and Shannon information index of 92 N. nucifera samples were 26.67%, 1.30 ± 0.46, 0.10 ± 0.18 and 0.15 ± 0.25, respectively for the ISSR data. The ‘Bottleneck effect’ and rapid propagation of clones after the ice ages may explain the low genetic diversity of lotus. The dendrograms based on ISSR and allozymes were not congruent. Based on the ISSR data, the 103 samples were divided into the N. nucifera group (Group I), and the group containing inter-specific hybrids between N. nucifera and N. lutea (Group II). The flower lotus, rhizome lotus, and seed lotus each has multiple sources of origin. Plant size, a criterion commonly used in the classification of cultivars of lotus, is not correlated with genetic variation. Flower color is correlated with the cultivar classification to some degree, but its variation is complex in the hybrids.     

Assessment of genetic diversity of Highland bananas from the National Banana Germplasm Collection at Rubona,Rwanda using RAPD markers

The genetic similarities of 49 accessions of bananas from The National Banana Collection at Rubona were investigated using random amplified polymorphic DNA markers. A total of 120 primers were screened for their usefulness in amplifying DNA fragments of four cultivars belonging to the subgroup Mutika–Lujugira. Fifteen random primers were selected for more detailed analysis, on the basis of providing reproducible amplification and revealing a high level of variation between the four cultivars. The genetic similarity was estimated using a simple matching coefficient which showed the lowest value of 0.46 between ‘Ingumba’ and ‘Ishika’ and the highest value of 0.85 between ‘Kirayenda’ and ‘Inyabukuwe’. The data of matrix of coefficient of similarity was subjected to cluster analysis using the unweighted pair group method with arithmetic average (UPGMA). Each accession was clearly separated. The results of this study are important for the curation of the banana germplasm collection in Eastern Central Africa and for future breeding of this crop.     

30份莲种质资源的RAPD遗传多样性分析

采用RAPD分子标记技术对30份莲(Nelumbo nueifera Gaertn.)种质资源的遗传多样性进行鉴定.筛选出14对有效引物进行PCR扩增,共产生2 146条带,其中有1 516条为多态性条带,各对引物的平均多态性条带为108.29条,扩增条带的多态率达70.64％.对所得到的30份莲种质资源的RAPD图谱...     

黄瓜种质资源遗传多样性及其亲缘关系的AFLP分析

 采用AFLP分子标记技术，对中国黄瓜种质资源遗传多样性及其与外来种质的关系进行了分析， 结果表明8对AFLP引物在70份黄瓜种质中共扩增出425条带，多态性带的比例为66％。供试黄瓜种质的平 均期望杂合度为0．376，中国种质的平均期望杂合度为0．387，明显高于国外种质的n 291。西双版纳黄瓜和印度野生黄瓜具有一些栽培种质没有的特异位点，中国栽培种质的特异位点多于外来栽培种质，后者也有一些中国栽培种质没有的特异位点。聚类分析将70份种质分为三大组群，即西双版纳黄瓜(Cucumis sativus L.vaF．xishuangbannanesis Qi et Yuan)组群，e sativus var．hardwickii野生黄瓜组群和栽培黄瓜组群。西双版纳黄瓜与栽培黄瓜的距离最远，与野生黄瓜次之。按一定的遗传距离可以将中国和外来栽培种质分开。大多数 华南型和华北型种质归属于不同的亚组。这些结果有助于有目的地利用这些变异拓宽育种材料的遗传背景。     

蓝靛果忍冬(L on icera caeru lea)种质资源研究进展

 简述了蓝靛果忍冬种质资源的研究进展。并对俄罗斯的品种和我国东北地区的野生植株引种栽培的情况进行了初步观察和分析, 指出了今后对其开发利用的研究方向。