Prepro-orexin基因多样性与猪产仔数的相关性

为了研究Prepro-orexin基因多样性与繁殖性能的关系,确立其在分子标记育种中的应用价值。采用PCR-RFLP法分析猪Prepro-orexin基因第62位多态性位点在二花脸、香猪、淮猪和姜曲海猪4个品种中的多样性,并分析其不同基因型对二花脸猪产仔数的影响。结果表明,二花脸和香猪分别检出三种基因型,姜曲海猪有两种基因型,而淮猪只有一种基因型。各等位基因频率和基因型频率在不同品种间存在显著差异;二花脸猪不同基因型群体间产仔数差异不显著,说明该基因多样性对产仔数的影响不显著。     

Prepro-orexin基因多样性与猪产仔数的相关性

为了研究Prepro-orexin基因多样性与繁殖性能的关系，确立其在分子标记育种中的应用价值。本研究采用PCR-RFLP法分析猪Prepro-orexin基因第62位多态性位点在二花脸、香猪、淮猪和姜曲海猪4个品种中的多样性，并分析其不同基因型对二花脸猪产仔数的影响。结果表明，二花脸和香猪分别检出三种基因型，姜曲海猪有两种基因型，而淮猪只有一种基因型。各等位基因频率和基因型频率在不同品种间存在显著差异；二花脸猪不同基因型群体间产仔数差异不显著，说明该基因多样性对产仔数的影响不显著     

猪的21—羟化酶基因位点限制性片段长度多态性研究

采用纯种大约克和纯种二花脸猪血样提取基因组ＤＮＡ，分别用１１种限制必内切酶消化，以非放射性狄高辛试剂盒标记４．８ｋｂ２１－羟化酶（ＣＹＰ２１）基因方为探针，经Ｓｏｕｔｈｅｒｎ杂交对猪的ＣＹＰ２１基因位点的限制性片长度多态性（ＲＦＬＰＳ）进行了研究。结果在ＢａｎＩ、ＨｉｎｄⅢ、ＫｐｎⅠ、ＰｓｔⅠ和ＴａｑⅠ５种限制性内切酶位点检测出了ＰＦＬＰＳ，且ＢａｎⅠ和ＫｐｎⅠ酶切位点的多态性为首次发现；而在其他     

卵泡刺激素受体基因作为产仔数候选基因的研究

分析了FSHR基因2个位点（FSHRA、FSHRB）的PCR－SSCP、PCR－RFLPs多态性，利用SAS软件分析了多态性与母猪产仔数间连锁关系。找到了1个影响产仔数的新的变异位点FSHRB，该位点多态性显著地影响猪产仔数性状，即基因型BB的产仔数显著地高于AB、AA基因型。结果显示出该位点具有作为常规选育的辅助选择的有效的分子标记潜力。     

二花脸大约克纯种猪染色体C—带的定量比较

采用淋巴细胞培养和染色体Ｃ－分带方法，测定了二花脸，大约克纯种猪Ｎｏ．１３和Ｎｏ．１６染色体Ｃ－带的长度，面积和异染色质的量，以图揭示家猪染色体Ｃ－带的品种差异。结果表明，二花脸，大约克纯种猪在Ｎｏ．１６染色全上Ｃ－带的长度，面积和异染色质的量存丰着显著差异，以此可以作为区分两品种的重要依据。     

应用参考家系信息构建猪12号染色体部分微位星位点遗传图 …

为了提高猪１２号染色体遗传图的精度,选择德系大约克与二花脸猪通过回交方法建立了参考家系,采取了两胎共１５４头个体的血样,全血裂解法提取ＤＮＡ后,对每头猪的ＤＮＡ样品进行ＰＣＲ扩增后应用银染法检测了每头个体在猪１２号染色体上３个微卫星位点（ＳＷ１５５３,ＳＷ８７４,ＳＷ１３５０）的基因型,应用ＣＲＩＭＡＰ程序进行了统计分析,得到的３位点间的最佳排离为：ＳＷ１５５３－ＳＷ１３５０－ＳＷ８７５。其中在两     

应用参考家系信息构建猪12号染色体部分微位星位点遗传图的研究

为了提高猪１２号染色体遗传图的精度,选择德系大约克与二花脸猪通过回交方法建立了参考家系,采取了两胎共１５４头个体的血样,全血裂解法提取ＤＮＡ后,对每头猪的ＤＮＡ样品进行ＰＣＲ扩增后应用银染法检测了每头个体在猪１２号染色体上３个微卫星位点（ＳＷ１５５３,ＳＷ８７４,ＳＷ１３５０）的基因型,应用ＣＲＩＭＡＰ程序进行了统计分析,得到的３位点间的最佳排序为：ＳＷ１５５３－ＳＷ１３５０－ＳＷ８７４。其中在两个美国肉畜研究中心图中重组率为０的位点（ＳＷ１５５３,ＳＷ１３５０）上发现了重组,并与其他位点做了排序,提高了这一区域的定位精度。     

利用选择性清除方法鉴别影响太湖猪（二花脸、梅山猪）及野猪产仔数差异的SNP 位点

母猪的繁殖性状是一个重要的经济性状,它由一系列主效基因或数量性状位点(Quantitative trait locus,QTLs) 控制。产仔数是母猪繁殖性状中最重要的考量指标之一袁找到影响产仔数的基因或标记有重要的经济及科研价值遥针对猪60KSNP芯片扫描结果,采用Genepop软件检测太湖猪（二花脸、梅山猪）及野猪每个SNP位点的遗传分化系数（Fst值）,鉴别与产仔数相关的SNP位点。按照0.025%比例的原则挑选遗传分化系数最大的SNP位点,并将其所在基因及物理位置临近的2个基因提交到DAVID数据库进行GO（Gene Ontology）和KEGG（KyotoEncyclopedia of Genes and Genomes）分析。结果显示,关于猪产仔数最强的2个选择性清除信号位于猪8号染色体（SSC8）和13号染色体（SSC13）上。其中SSC13中检测到的2个SNP位点均位于IQCJ-SCHIP1基因内遥。SC8上的SNP位点位于NR3C2基因内,可能为新发现的SNP位点遥经KEGG分析,有2个基因位于赖氨酸合成通路中遥结果表明,利用选择性清除的方法,选择高产太湖猪、低产野猪这两个极端群体来鉴别影响产仔数的SNP位点,发现了新的SNP位点。IQCJ-SCHIP1、NR3C2基因及位于赖氨酸通路中的功能基因可能是影响母猪产仔数的候选基因。     

家猪不同品种,杂交组合间同源染色体C—带多态性差异研究

采用淋巴细胞培养和染色体Ｃ－分带方法，测定了二花脸、大约克纯种猪及其大二、二大杂交组合间端着丝粒染色体Ｃ－带的长度，面积和异染色质的量，研究了家猪不同品种，杂交组合间同源染色体Ｃ－带多态性的差异，结果表明，二花脸、大约克、大二、二大之间在同源染色体Ｃ－带长度，面积和异染色质的多态性方面存在着显著差异，具有品种或群体特征，可作为区分不同品种的重要依据。     

ESR、FSHβ、AHR基因多态性对二花脸猪产仔数的影响

[目的]本文旨在通过研究猪ESR、FSHβ和AHR基因多态性对二花脸群体产仔数的影响,鉴别出影响二花脸猪产仔数变异的关键基因。[方法]对303头二花脸猪进行ESR基因g.14418786、FSHβ基因g.30398474_30398475ins292(292 bp大片段插入)、AHR基因g.86550830位点分型(Sscrofa11.1),用Excel 2003软件进行基因多态性分布的分析和卡方检验,并利用SAS 9.2软件混合模型对ESR、FSHβ、AHR基因及其合并基因型与产仔数进行关联性分析。[结果]ESR基因g.14418786、FSHβ基因g.30398474_30398475ins292以及AHR基因g.86550830位点在二花脸群体中均具有多态性,且3个基因的不同等位基因频率差异很大,ESR基因g.14418786位点A、B等位基因频率分别为0.173和0.827,FSHβ基因g.30398474_30398475ins292位点A、B等位基因频率分别为0.889和0.111,而AHR基因g.86550830位点G、T等位基因频率分别为0.889和0.111。ESR基因g.14418786位点的AA、AB和BB基因型频率分别为0.050、0.248和0.703,FSHβ基因g.30398474_30398475ins292的AA、AB和BB基因型频率分别为0.808、0.162和0.030,AHR基因g.86550830位点的GG、GT和TT基因型频率则为0.792、0.194和0.013。ESR基因g.14418786与FSHβ基因g.30398474_30398475ins292位点显著偏离哈代-温伯格平衡(P0.05),而AHR基因g.86550830位点符合哈代-温伯格平衡(P0.05)。关联性分析未发现ESR、FSHβ、AHR基因以及3个基因的合并基因型显著影响二花脸猪的产仔数(P0.05)。[结论]本试验未能证明ESR、FSHβ和AHR基因是影响二花脸猪产仔数的主效基因,二花脸猪产仔数变异可能受其他基因影响。     

二花脸猪FSHR座位PCR-SSCP标记与产活仔数的关系

采用PCR－SSCP（PCR－单链构型多态性）作为遗传标记，对二花脸猪促卵泡素受体（FSHR）基因座位与产活仔数性状的关系进行了研究，结果表明，PCR－SSCP分型共产生2种等位基因，3种基因型，对不同标记基因型的二花脸猪群头胎产活仔数、头三胎产活仔数之和，及最高产活仔数进行单因子方差分析，发现该标记座位与最高产活仔数显相关，其贡献率达10.9%。基因效应分析表明，等位基因B的加性效应值为0.37头，等位基因A的加性效应值为－0.60头。     

猪催乳素受体基因3′-UTR多态性及其与产仔性能的关联分析

通过研究PRLR基因多态性与母猪产仔性能的关系,为该基因在标记辅助选择中的应用提供依据。采用PCR-SSCP技术检测了大白猪、长白猪、马身猪、山西黑猪和山西白猪5个品种(系)共计323个个体PRLR基因3′-UTR的多态性.并采用单变量动物模型,分析了多态位点对母猪产仔性能的影响。结果表明,PRLR基因3′- UTR存在多态性,在所研究的群体中检测到A、B两个等位基因和AA、AB、BB三种基因型。在马身猪和山西白猪中,A等位基因占优势,频率分别为0.97和0.88;而在大白猪、长白猪和山西黑猪中,A、B两个等位基因的频率基本相似,分布在0.47～0.53之间。PRLR基因3′-UTR多态位点对母猪产仔性能无显著影响(P>0.05),不同基因型母猪的头胎产仔数和产活仔数均没有显著差异,但均表现出AB>AA>BB的趋势。     

东北荷包猪FUT1基因多态性及其与产仔性能的关联分析

[目的]分析荷包猪Fun基因多态性及其与产仔性能的关系,为荷包猪资源保存、品种选育和开发利用提供参考依据。[方法]提取猪耳组织DNA,采用PCR-RFLP技术分析荷包猪FE们的基因多态性,并分析其基因型与产仔数的相关关系。[结果]用胁丽I限制性内切酶对扩增片段进行酶切,检测到GG、AG和AA3种基因型。抗性纯合子AA型个体1～5各胎次产仔数均值均高于AG和GG型个体,且第3胎和第4胎的产仔数均值显著高于AG型和GG型个体。[结论]荷包猪Fun基因具有多态性,其基因频率与国外杜洛克基本一致,与国外长白、大白和两者杂交猪差别较大。AA基因型对产仔性能而言是有益基因型。     

FSHR基因第10外显子多态性及其与小梅山猪产仔数的相关性

【目的】研究猪FSHR基因第10外显子的多态性及其与小梅山母猪产仔数的相关性。【方法】采用 PCR-SSCP和直接测序方法检测基因多态性,利用最小二乘法分析其对母猪产仔数的关系,同时对多态位点的方差组分进行分析,并预测选择反应。【结果】在小梅山猪、枫泾猪和大白猪这3个群体中,引物P1和P3上分别检测到1个多态位点,其中P1位点可导致氨基酸的改变;引物P6仅在大白猪中检测到1个多态位点;对小梅山猪而言,P1位点的A等位基因和P3位点的D等位基因为优势基因;在P1位点上,两胎以上小梅山母猪中,AA型个体的总产仔数（total number born,TNB）和产活仔数（number born alive,NBA）比BB型分别高出1.95和1.66头（P＜0.01）;在P3位点上,在两胎以上及所有胎次的母猪中,DD型个体的TNB和NBA均极显著高于CC型（P＜0.01）;小梅山母猪的TNB和NBA在P1和P3位点上的遗传主要受到加性效应的影响。【结论】FSHR基因第10外显子P1和P3位点的A和D等位基因对小梅山猪产仔数有显著影响。     

二花脸猪和大白猪产仔数加性—显性遗传模型以及基因效应的研究

对二花脸猪，大白猪及其杂交一代和回交一代4种群体共计2010窝产仔数的资料进行了加性一显性遗传模型以及基因效应的研究，方差分析结果显示，窝产仔数（总产仔数和活产仔数）具有极显的群体间差异，表明不同群体的遗传结构不同，多元回归结果表明：加性效应平方和占总产仔数和活产仔数总遗传变异平方和的比较分别为75．4％和69．8％，可见加性效应是群体间遗传变 异的主导因素，显性效应平方和占总仔数和活产仔数总遗传变异平方和的比例分别为18．3％和23．7％，表明显性效应在群体间遗传变异中是相当重要的，上位效应平方和点总产仔数和活产仔数总遗传变异平方和的比例分别为6．3％和6．5％，可见上位效应对窝产仔群体间遗传差异作用不大，猪总产仔数和活产仔数的群体平均值分别为13．01和12．42，二花脸猪总仔数和活产仔数基因加性值比大白猪分别高2．77和2．49头，二花脸猪高的总产仔数和活产仔数基因对大白猪等位基因均为显性，显性度分别为0．91和0．97，适合性检验结果表明，窝产仔数符合加性一显性遗传模式。     

猪雌激素受体基因PvuⅡ酶切片段多态性与产仔性能的关系

研究了雌激素受体(ESR)基因对苏钟猪和二花脸猪繁殖性能的影响。记录 93头母猪 660多窝产仔数用以分析雌激素受体基因型对总产仔数、产活仔数的影响。结果表明,雌激素受体基因A和B等位基因的频率,苏钟猪分别为 0. 536 6和 0. 463 4,二花脸猪分别为 0. 307 7和 0. 692 3;二花脸猪各雌激素受体基因型间头胎总产仔数和产活仔数差异显著(P<0. 05);苏钟猪头胎总产仔数AA基因型与AB、BB基因型之间差异显著(P<0. 05);二花脸猪经产总产仔数和产活仔数AB基因型与BB基因型之间差异显著(P<0. 05)。     

努比亚山羊KISS1基因多态性与繁殖性状的关联分析

【目的】明确转移抑制素基因（KISS1）多态性与努比亚山羊繁殖性状（产羔数、初生重和断奶重）的关联,为进一步展开山羊分子标记辅助选择育种提供参考依据。【方法】利用DNA混合池结合Sanger测序筛选出努比亚山羊KISS1基因SNP位点,再通过MTA-Seq测序对355只努比亚山羊群体进行SNP位点的基因分型,并采用SAS 9.2的一般线性模型（GLM）对KISS1基因SNP位点与努比亚山羊的产羔表型性状进行关联分析。【结果】在努比亚山羊KISS1基因内含子1发现2个SNP位点（g.1341600A>G和g.1341674C>G）。其中,g.1341600A>G位点处于中度多态（0.25P_HWE>0.05）;而g.1341674C>G位点处于低度多态（PIC<0.25）,已偏离Hardy-Weinberg平衡状态（P_HWE<0.05）。g.1341600A>G位点GG和AG基因型个体的第一胎、第二胎及三胎联合产羔数均高于AA基因型个体,且在第一胎达显著水平（P<0.05,下同）;g.1341674C>G位点CC基因型个体则表现为第一胎、第三胎及三胎联合产羔数均高于GG基因型个体,同样在第一胎达显著水平。g.1341674C>G位点GG基因型个体的第一胎、第三胎及三胎联合羔羊初生重均高于CC基因型个体,且在第三胎达显著水平;g.1341600A>G位点不同基因型与努比亚山羊各胎次羔羊初生重无显著关联（P>0.05,下同）。在羔羊断奶重方面,2个SNP位点不同基因型与努比亚山羊各胎次断奶重也无显著关联。g.1341600A>G位点和g.1341674C>G位点可形成连锁不平衡单倍型模块,其中GC、AC、AG单倍型的频率分别为0.645、0.265和0.090;单倍型模块与第一胎产羔数显著关联,AACC组合型产羔数显著低于其他组合型。【结论】努比亚山羊KISS1基因内含子1存在2个SNP位点（g.1341600A>G和g.1341674C>G）与其繁殖性状相关,其中g.1341600A>G位点的A等位基因和g.1341674C>G位点的C等位基因可作为努比亚山羊选育的潜在分子标记,且在今后的育种过程中应淘汰KISS1基因AACC组合型母羊。     

Analysis of Stillbirth in Different Types of Sows

Statistical analysis was conducted on sow stillbirth traits of three mating types with 1686 litters including Erhualian, Large White and F1. The number of stillborn piglets per litter (NSB) in Erhualian,Large White and Fl averaged 0.87, 0.32, 0.72, and the percentage born alive (PBA) averaged 95.1%,97.1%, 95.7%, respectively. The Erhualian pig with a higher litter size also had a higher stillbirth rate. The results of the variance analysis indicated that the mating type, parity, farrowing year × farrowing season interaction and the total number born had highly significant effects on both NSB and PBA in sows (P ＜ 0.001).Farrowing season had highly significant effects on NSB (P ＜ 0.01), and significant effects on PBA (P ＜0.05). Farrowing year had no significant effects on NSB ( P ＞ 0.05), and highly significant effects on PBA (P＜0.01). From parity 1 to parity 10, the least square means for NSB progressively increased with increasing parity, the least square means for PBA progressively decreased with increasing parity. The sows farrowed in winter had the highest NSB and the lowest PBA, the sows farrowed in autumn had the lowest NSB and the highest PBA. The least square means for NSB markedly increased with an increase in the total number born,indicating that the positive phenotypic correlation existed between them. The least square means for PBA markedly decreased with an increase in the total number born, indicating that the negative phenotypic correlation existed between them. The estimating results of the paternal half sib indicated that the heritabilities for NSB and PBA were 0.111 and 0.123, the genetic correlation, phenotypic correlation and environmental correlation between them were - 0.985, - 0.947 and - 0.942, respectively.