不同居群艾种质遗传多样性和遗传结构分析

以12个艾居群和22条SCoT引物为试材,采用NTSYS-pc2.1、Popegen 1.32等分析方法对12个居群的遗传多样性和群体结构特征进行研究,以期为艾新品种选育提供参考依据。结果表明：22条SCoT引物共检测出87个主要等位基因变异,平均每条引物3.95个;多态性信息含量PIC值、Shannon′s多样性指数I值和Nei′s基因多样性指数H平均值分别为0.690、0.483和0.317,表现出较高的遗传多样性。居群每个位点平均等位基因数(Na)、每个位点平均有效等位基因数(Ne)、I和期望杂合度(He)平均值分别为1.444、1.419、0.349、0.238,以安阳汤阴县艾居群Na、I、H值最高。居群遗传相似系数和遗传距离范围为0.795～0.975和0.025～0.229,平均值为0.909和0.097。其中,济源艾居群和黄冈蕲春艾居群的遗传相似系数最高、遗传距离最近。SCoT遗传分化系数(Gst)为0.293,表明群体间的遗传多样性水平较低,9%遗传差异源自群体间。居群间基因流水平(Nm)值为2.022,表明居群间存在一定的基因流,导致居群间的遗传差异小。12个艾居群在...     

基于SSR标记的清凉峰地区三叶海棠遗传多样性研究

【目的】评价清凉峰地区三叶海棠的遗传多样性水平,为其保护提供理论依据。【方法】利用10对SSR引物,对清凉峰地区的36份三叶海棠样品进行了遗传多样性分析,并从中随机抽取6,9,12,15,18,27,34株大小不同的样本,组成7个群体进行遗传多样性特征比较。【结果】(1)10对引物在36份样品中的多态性等位基因数(Na)平均值为7.1(5.0~10.0),有效等位基因数(Ne)平均值为3.954(1.527～5.786),平均观察杂合度(Ho)为0.781(0.194～1.000),平均期望杂合度(He)为0.699(0.345～0.827),香农多样性指数(I)平均值为1.458(0.662～1.918);(2)采用UPGMA法构建的系统树中,很明显地将36份供试样品划分为两组,与用贝叶斯聚类方法得到的结果一致,对三叶海棠所有样品进行的主成分分析进一步证实了以上结果;(3)群体样本量≥15株时,样本量就不会对群体内遗传多样性水平、遗传一致度及群体内等位基因数目产生明显的影响。【结论】清凉峰地区三叶海棠的遗传多样性水平较高,其群体明显分化为2个基因源,三叶海棠群体遗传多样性研究和种质收集保存中的适宜样本量为≥15株,研究供试样品可以反映清凉峰地区三叶海棠遗传多样性的总体水平。     

基于SSR 标记的四川野生中国樱桃遗传多样性和居群遗传结构分析

 采用SSR 分子标记技术对四川野生中国樱桃5 个居群共133 株的遗传多样性水平及居群的 遗传结构进行了研究。结果显示：10 对SSR 引物共检测到78 个等位基因,平均每位点等位基因7.8 个。 Nei’s 基因多样性指数（H）为0.6112 ~ 0.6689,Shannon’s 信息指数（I）为1.1984 ~ 1.3786。基于分子方 差分析（AMOVA）,92.53%的变异来自居群内,7.47%的遗传变异来自于居群间。居群间遗传距离（GD < 0.2416）、遗传一致度（GI > 0.7854）、遗传分化指数（Fst = 0.0844）以及较强的基因流（Nm = 2.7125）均 表明居群间的遗传分化水平较低,居群内存在显著近交现象（Fis = 0.3986）,且居群在大多数位点上偏离 Hardy-Weinberg 平衡。基于上述结果,分析讨论了居群较高遗传多样性和居群间较低遗传分化形成的可能 原因,并提出野生中国樱桃的保护利用策略。     

基于ISSR标记的江西野生寒兰居群遗传多样性研究

采用ISSR分子标记对江西省主要山脉12个野生寒兰居群共185个体进行遗传多样性和群体遗传结构研究。结果表明:12条ISSR引物共扩增出123个条带,其中多态性条带97个,多态性条带百分率(PPB)为78.9%。12个寒兰居群在物种水平上的遗传多样性较高,群体总观测等位基因数(N_a)为1.7967,有效等位基因数(N_e)为1.4461,N_ei’s基因多样性(H_e)为0.2649,Shannon’s信息多样性指数(I)为0.3995;在居群水平上遗传多样性较低,PPB平均值为43.97%,N_a平均值为1.4397,N_e平均值为1.2478,H_e平均值为0.1462,I平均值为0.2204;遗传分化系数(G_(ST))为0.4415,居群间基因流(N_m)为0.6325,表明居群内的遗传分化大于居群间的遗传分化;UPGMA聚类结果显示12个寒兰居群可聚为两支,第一支由资溪、武夷山大叶、武夷山小叶、崇义小叶、靖安、宜丰、井冈山、邵武大叶和邵武小叶9个居群组成;第二支由石城、安远和崇义大叶3个居群组成,聚类结果没有呈现出山脉分布的特点;Mantel检验结果表明遗传距离和地理距离之间无显著相关性(r=0.3791)。     

珙桐遗传多样性的AFLP 分析

 采用7对AFLP引物对中国珍稀濒危植物珙桐（Davidia involucrata Baill.）的6个天然居群和2个人工居群的229份材料进行扩增,共检测到100 ~ 500 bp的位点506个,其中多态性位点488个,多态性位点百分率96.44%;各居群多态位点百分率为52.77% ~ 79.25%,平均为67.00%。在物种水平上,珙桐的Nei’s基因多样性H_s = 0.3429,Shannon’s遗传多样性信息指数I = 0.5107。而居群水平上,各居群的Nei’s基因多样性介于0.2229 ~ 0.3389,各居群的平均Nei’s基因多样性H_s = 0.2748,各居群Shannon’s遗传多样性信息指数（I）介于0.3219 ~ 0.4877,平均Shannon’s遗传多样性信息指数I = 0.3995。居群间基因间分化度（G_st）为21.60%,基因流N_m为1.8。说明珙桐的遗传多样性较高,这8个居群间存在一定的遗传分化和基因流动,但遗传分化主要存在于居群内。在珙桐与其变种光叶珙桐之间未找到差异标记。     

福建省梨地方品种的遗传多样性研究

利用叶绿体DNA非编码区序列acc D-psa I和17对SSR引物对原产于福建省的49个梨地方品种的遗传多样性进行分析,旨在为育种利用提供参考。获得49份福建地方品种的acc D-psa I序列,并检测到4个多态性位点,包含5个叶绿体单倍型(Hap1~Hap5),其中核苷酸多态性(Pi)为0.00139,单倍型多样性(Hd)为0.660。TCS网络图显示Hap5是最古老的单倍型,其仅在两个样品中检测到。17个SSR位点共检测到211个等位基因位点,有效等位基因数(A)为5~23个,平均值为12.41;观察杂合度(Ho)和期望杂合度(He)的平均值分别为0.5802和0.7549;17个SSR位点的Shannon’s信息指数(I)值为0.5830~2.7683,平均值为1.8661,表现出较高的遗传多样性。基于Nei和Li的遗传距离的邻接法(Neighbor-Joining,NJ)将49份样品聚为9个组,其中大部分聚类结果与单倍型类型表现的亲缘关系较为一致。叶绿体单倍型和SSR多态性位点信息证实福建地方品种具有较为丰富的遗传多样性。     

利用SRAP和EST-SSR分析香椿资源的遗传多样性

利用SRAP和EST-SSR标记技术对中国9省10个香椿居群的遗传多样性和亲缘关系进行了分析,试图为香椿种质资源的保护和开发利用奠定基础。结果表明,33对SRAP标记共扩增出167个多态性位点,平均每对引物产生5.06个多态性位点;45对EST-SSR引物共检测到221个多态性位点,平均每对引物检测到4.9个多态位点;所选香椿居群的等位基因数和期望杂合度（EST-SSR,Na = 2.3506,He = 0.4632）及Shannon’s信息指数（SRAP,I = 0.6140;EST-SSR,I = 0.6752）较高,表明中国香椿资源具有较高的遗传多样性;居群间的遗传分化系数（SRAP,Gst = 0.3124;EST-SSR,Fst = 0.2462）表明所研究的香椿资源分化程度较高;聚类结果显示,10个香椿居群可分成3类,其中衡水、泰安和太和居群为一类,成都、昆明、武汉和汝阳居群为一类,德州和泉州居群聚为一类,南京居群的结果因两类引物略有不同;香椿居群间的遗传距离与实际的地理距离相关性不显著。     

板栗野生居群遗传多样性研究

使用从板栗中提取的10个微卫星引物对4个中国栗野生居群的69个个体进行扩增,共检测到84个等位基因,每个位点的等位基因数为4～13,每位点的平均等位基因数目为8.4个,平均有效等位基因数(Ne)为4.998,平均期望杂合度(He)为0.777,平均PIC值为0.739,Nei’s多样性指数(h)为0.771,以陕西汉中居群具有最高的遗传多样性。遗传分化系数Gst仅为0.141。UPGMA树状聚类图表明4个野生群体被分为两部分,其中云南、四川、安徽3个居群距离相近位于同一组,此结果与PCA分析结果一致,2种方法均显示居群间的遗传关系与实际地理分布不完全相关。     

云锦杜鹃自然居群遗传多样性的ISSR分析

 利用ISSR技术对浙江省境内的5个云锦杜鹃自然居群的遗传多样性进行分析。12个引物共检测到170个位点, 其中多态位点150个, 多态位点百分率P (% ) 为88.24%。物种水平的Shannon信息指数( I) 为0.4317, Nei指数( h) 为0.2848, 表明物种水平的遗传多样性很高; 而居群水平的遗传多样性较低, P%平均为48123%, I平均为0.2682, h平均为0.1818。AMOVA分子差异分析显示40.03%的变异存在于居群间, 59.97%的变异存在于居群内, 居群间的遗传分化明显。居群间的基因流较低, 为0.8824。居群隔离、自交衰退可能是导致云锦杜鹃居群间遗传分化的主要原因。5个居群间的平均遗传距离为0.1755。聚类显示, 括苍山居群和天台山居群组成一组, 凤阳山居群和百山祖居群组成另一组, 干坑居群单独成一组。     

不同栽培地芍药品种资源遗传多样性的SSR分析比较

依据33对SSR荧光引物的扩增结果，从遗传变异和遗传距离角度对中国4个主要栽培区的386个观赏芍药品种的遗传多样性进行评价。结果显示：(1)中国观赏芍药品种资源具有较高遗传多样性，所用SSR引物的多态信息含量(PIC)值介于0.62～0.84，平均观测杂合度(H_o)和期望杂合度(H_e)为0.73、0.78，香农信息指数(I)介于1.35～2.08。(2)各栽培地芍药品种的遗传多样性从高到低依次为山东菏泽、河南洛阳、江苏扬州和甘肃临洮。(3)方差分析显示变异主要来自栽培地内个体间，不同栽培地品种遗传分化系数(FST)为0.031，基因流(Nm)为7.795。(4)各栽培地品种间的遗传距离介于0.032～0.123，遗传一致性介于0.884～0.969；主坐标分析和聚类结果显示品种遗传分化情况与栽培地不完全相关。研究表明，中国观赏芍药品种遗传信息丰富，但4个栽培地间遗传分化小，各栽培地间的基因交流强。     

Current trends in the genetic engineering of vegetable crops

Vegetables play an important role in human nutrition and health. Cultivation of vegetable crops is an integral part of the agricultural economy of many developing countries. Vegetable crop productivity and quality are seriously affected by several biotic and abiotic stresses, which destabilize rural economies in many countries. Moreover, absence of proper post-harvest storage and processing facilities leads to qualitative and quantitative losses. In the past four decades, conventional breeding has contributed significantly for the improvement of vegetable yields, quality, post-harvest life, and resistance to biotic and abiotic stresses. However, there are many constraints in conventional breeding, which can only be overcome by advancements made in modern biology. In the last decade various traits such as biotic stress resistance, quality and storage life have been successfully engineered into vegetable crops and some of them have been commercialized. In recent years significant progress has been made to manipulate vegetable crops for abiotic stress tolerance, quality improvement and pharmaceutical and industrial applications. Although the progress in commercialization of transgenic vegetable crops has been relatively slow, transgenic vegetables engineered for nutraceutical and pharmaceutical use will contribute significantly to the value added agriculture in near future.     

植物基因转化方法的研究概况

综述了目前用来进行植物基因转化的各种方法及其优缺点 ,以期为植物转基因方法的选择提供借鉴     

我国杏种质资源及遗传育种研究新进展

简要介绍了杏的起源、分布及种质资源收集、保存情况,着重对杏种质资源的细胞学、孢粉学、授粉生物学、分子生物学、解剖学和抗寒机理方面进行了综述。揭示了国内外杏的最新研究动态、杏起源、演化、分类及抗寒、抗旱机理等,同时论述了国内外杏的育种目标、遗传规律及先进的育种技术,并提出了我国杏今后的发展方向。     

Influence of MTHFR genetic polymorphism on the indexes of vascular endothelial functions

AIM: To investigate the influence of methylenetetrahydrofolate reductase (MTHFR) 677 C→T mutation on angiotensin Ⅱ (Ang II), prostacyclin (PGI₂) and nitric oxide (NO). METHODS: By cluster sampling, 1146 adult Han people were selected from the residential communities. MTHFR 677 genotypes were identified by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism for each sample. Plasma levels of homocysteine were determined by fluorescence ration biochemical assay. Serum NO levels were determined by cadmium reduction method. Plasma AngⅡ and PGI₂ concentrations were determined by radioimmunoassay. SPSS 13.0 was used for data analysis. RESULTS: Total samples were divided into three groups according to the genotypes. No significant difference in PGI₂ and AngⅡamong the three groups was observed. The difference of serum NO level between the C/C and T/C genotypes was not significant (P>0.05). The serum concentration of NO of T/T genotype was significantly lower than that of T/C and C/C genotypes (P<0.01). CONCLUSION: The influence of MTHFR 677 C→T mutation on Ang II and PGI₂ is not significant in the people from the residential communities. The decrease in serum NO level might be one of the underlying mechanisms of MTHFR 677 C→T mutation causing myocardial infarction and ischemic stroke.     

Effect of historic landscape change on the genetic structure of the bush-cricket Metrioptera roeseli

This study investigates the impact of past and present landscape structure on the current genetic structure of the bush-cricket Metrioptera roeseli (Orthoptera, Tettigoniidae) in a rural landscape in Germany. Assuming that land-use types, such as grassland, arable land and forest, as well as linear structures, mainly roads, differentially affect the connectivity of the bush-cricket's habitat and therefore migration and gene flow, we correlated landscape parameters between sampling locations as derived from GIS-maps with genetic similarities between individual bush-crickets as estimated by RAPD-PCR. Fifty bush-crickets were sampled with distances between sampling locations varying between 15 m and 2 km. Corresponding landscape configurations were recorded in 8 years between 1945 and 1998. Landscape configuration 50 years ago appeared to have influenced the present genetic structure of the bush-cricket (R ² = 0.18). Crossing roads and land use other than grassland along the transect between sampling locations tended to decrease genetic similarity, whereas grassland and parallel roads tended to increase genetic similarity between bush-crickets. Following shifts in land use during 1953–1973 the correlation between landscape and present genetic structure decreased gradually. Our study suggests that it needs time for the landscape to build a visible effect on the genetic structure of the bush-cricket population, and that this effect cannot be detected if the landscape changes faster than the genetic structure responds to it.     

利用苹果SSR引物分析山楂属植物遗传关系

SSR引物在不同物种间具有通用性,从141对苹果属(Malus spp.)SSR引物中筛选出10对适合于山楂属(Crataegus spp.)植物的SSR引物,并对8个种37份山楂种质资源的遗传关系进行了分析。10对SSR引物共检测到91个多态性谱带,每个位点的等位基因数为3～13个,平均为9.1个。位点杂合度为0.432～0.790,平均为0.688。10对SSR引物可以将20份山楂资源区分开,17份不能区分的资源分为3组,第1组为3个伏山楂品种,第2组和第3组分别包括大果山楂的2个和12个品种。基于SSR标记构建的聚类树状图将供试37份山楂资源分成2个类群,第1类群包括6个山楂野生种,第2类群包括供试的所有伏山楂、山楂和大果山楂资源。该聚类结果与传统形态学分类一致。     

阔叶猕猴桃遗传转化技术参数的优化

为了提高阔叶猕猴桃的遗传转化效率,以阔叶猕猴桃叶柄为试材,通过根癌农杆菌介导法进行了遗传转化技术参数的研究。结果表明,叶柄预培养3～4d、用农杆菌悬浮液(D600nm值0.5)感染10min、共培养48h、共培养时在培养基中加入200μmol/L乙酰丁香酮处理可以获得较高的gus基因表达率。在供试的1200个叶柄中获得了49个抗性芽,转化频率为4.1%。对转基因抗性材料进行PCR检测和gus基因组织化学染色,证实了外源基因已整合到阔叶猕猴桃的基因组中,并得到稳定表达。     

猕猴桃属(Actinidia Lindl.)植物亲缘关系研究进展

猕猴桃为全世界范围内非常重要且大规模商业化栽培最为成功的果树种类之一,在世界果树产业中具有举足轻重的地位,其中越来越多猕猴桃新品种的选育及应用则是推动猕猴桃产业不断进步与发展的主要动力,因此种质资源研究一直以来均是果树研究尤其是育种方面最为重要的基础,主要包括种质源调查、收集、评价、分析与利用等,而有关亲缘关系的研究已经成为果树种质资源研究和利用的核心内容,可为进一步探讨物种起源与进化、系统分类、种质资源保护和利用以及果树育种提供科学依据。笔者立足猕猴桃育种需求与未来发展方向,综合概述了国内外有关猕猴桃属植物的起源与分布,并从形态学、孢粉学、细胞学、生化分析和分子生物学等方面介绍了当前猕猴桃属植物亲缘关系的研究进展,同时对存在的问题及其研究前景进行了讨论和展望。     

南瓜属作物遗传转化研究进展

南瓜属(Cucurbita)作物包括中国南瓜(C.moschata D.)、印度南瓜(C.maxima D.)和美洲南瓜(C.pepo L.)等许多重要蔬菜,在世界范围内广泛栽培,具有重要的经济价值。目前,南瓜属作物遗传转化技术普遍存在转化效率低、重复性差、假阳性和嵌合体干扰等诸多问题。随着分子生物学的迅猛发展,南瓜属作物遗传改良和基因功能验证亟需建立高效稳定的遗传转化体系。前人在南瓜离体再生、花粉管通道和农杆菌介导等转化方法上做过不少探索,普遍认为以农杆菌介导的子叶节离体再生是最具潜力的转化体系。笔者对现有的研究基础进行综述,为促进其在南瓜属作物遗传改良上的应用提供参考。     

转基因技术在苹果育种中的应用

综述了国内外苹果转基因技术的方法、育成品种等现状，提出了苹果基因转化技术的发展前景。