一株鹅细小病毒全基因特征分析

根据GenBank登录的鹅细小病毒基因序列和基因组结构特征,采用PCR技术扩增获得一株鹅细小病毒株（Goose parvovirus,GoPV）全基因序列,为中国大陆地区首次报道。GoPV株病毒全基因大小为5106nt,其基因组5’端和3’端均含有相同的末端倒置重复序列（inverted terminal repeats, ITR）,ITR全长为444nt。GoPV基因组主要由左右两侧两个开放阅读框组成,左侧编码非结构蛋白（non-structureprotein,NS）NSl和NS2,右侧编码3种结构蛋白（viral structural protein,VP）VP1、VP2和VP3。NS基因全长为1884nt（537-2420nt）,其中NS2全长1356nt（1065～2420nt）;VP基因全长2199nt（2439-4637nt）,其中Ⅵ叼全长1764nt（2874-4637nt）,VP3全长1605nt（3033-4637nt）,在其右侧的ITR前有一个Poly（A）的尾。GoPV株病毒全基因和欧洲疫苗株（EU583392（VG32／1,Europe））核苷酸同源性最高,高达98．6％。本研究为进一步研究GPV分类地位以及进化关系提供依据,也为研究GPV强毒株和疫苗株之间生物学特性以及GPV治病机理和开发基因工程疫苗奠定基础。     

犬细小病毒分子生物学研究进展

正犬细小病毒(Canine parvovirus,CPV)属细小病毒科细小病毒属,自主复制型病毒,是最小的线状负链单股DNA病毒,其基因组全长5 323 nt。CPV具有细小病毒属的典型形态和结构。病毒粒子为等轴对称的二十面体,无囊膜。在电镜下观察,病毒颗粒的外观呈圆形或六边形,直径约为26 nm。病毒感染症状以犬的剧烈呕吐、出     

口蹄疫病毒WFL株基因组全长cDNA的克隆及序列分析

根据口蹄疫病毒基因组的结构特点以及GenBank上公布的全序列，用DNAMAN分别设计了涵盖整个基因组序列的3对引物，从接种口蹄疫病毒WFL株的细胞培养液中提取了病毒基因组RNA，采用RT-PCR方法和RACE法分别扩增了3条基因片段，并将扩增片段分别与T载体连接，在体外分别进行了5-半分子和3’半分子的构建。最后将5’半分子和3’半分子连接成基因组全长cDNA分子。经PCR鉴定、酶切鉴定及全长cDNA测序，证实成功构建了口蹄疫病毒wFL株基因组全长eDNA分子。序列分析结果表明，供试口蹄疫病毒基因组全长为8155nt，5＇UTR长1059nt；具有一个大的读码框，其核苷酸长度为6969nt。包括201aa的前导蛋白基因和2122aa的聚合蛋白基因；3＇UTR长127nt，包括34nt的polv（A）。     

猪细小病毒病防控

<正>猪细小病毒病是由猪细小病毒（PPV）引起的，以怀孕母猪发生流产、死产、产木乃伊胎等为特征的繁殖障碍类疾病。该病毒基因组为单股线状DNA，无囊膜，抵抗力很强，90℃下5 min内不能使其灭活。根据基因型差异，PPV至少可分为6个亚型，包括PPV1、PPV2、PPV3、PPV4、PPV5以及猪博卡病毒（PBo Vs）。1流行特点     

猪细小病毒YK株NS1基因的克隆与序列分析

提取猪细小病毒（PPV）YK株基因组DNA，利用PCR技术扩增得到了NS1基因全序列，将其克隆到pMD 18-T质粒载体并进行了序列测定和分析。结果表明，NS1基因全长1989bp，编码662个氨基酸。氨基酸序列中含有在PPV复制过程中起重要作用的保守基序GKRN，并有3个潜在的糖基化位点NISN、NFSN和NLTR。PPV YK株的NSl基因与其他PPV毒株NADL-2（4973）株、NADL-2（5075）株、NADL-2（5034）株和Kresse株相比，核苷酸同源性分别为98．3％、99．9％、99．9％和99．7％，氨基酸同源性分别为99．7％、99．7％、99．7％和97．7％。结果说明，NS1基因具有高度保守性。     

猪细小病毒分子生物学研究进展

（接２００２年第４期）４．１．３Poly（A）：PPV基因组３’末端的Poly（A）信号与上述ATF结合位点和TATA元件一样，也具有顺式激活作用。Poly（A）信号转录终止和加Poly（A）尾所必需的序列，由于PPV所有转录物均用同一段Poly（A）信号，因此所有转录物的３’末端相同。４．１．４非结构蛋白的调节作用：PPVNS１蛋白含有ATP或GTP结合位点，并具有解旋活性，对PPVDNA的复制起重要调节作用。同时NS１还是细小病毒基因组本身编码的反式激活蛋白，对PPV早期和晚期转录都发挥着重要的调节作用。４．２转录后水平的调节由于P…     

猪细小病毒SY-99株非结构蛋白NS1基因的克隆及序列分析

猪细小病毒（Porcine parvovirus,PPV)SY-99株由本室分离，提取SY－99株的基因组DNA，利用PCR扩增出全长NS1基因，将该基因克隆到 核表达载体pET28a中并测序。结果表明，NS1基因全长1989bp，编码662个氨基酸，氨基酸序列中含有PP 制过程中发挥重要作用的保守基序GKRN，并有3个潜在的糖基化位点，分别位于356－359、446－449、513－516位氨基酸处，SY－99株NS1基因与其它PPV毒株NADL2－1、NADL2－2、Kresse株核苷酸同源性分别为98％、99％、99％，氨基酸同源性分别为97％、99％、995。SN1基因的克隆为研究NS1在PPV的复制中所发挥的功能及利用人工表达的NS1来制备诊断抗原提供了可能。     

猪细小病毒病研究进展

猪细小病毒（PPV）是属于细小病毒科，细小病毒属的无囊膜单链DNA病毒，成熟的病毒粒子为等轴二十面对称体，直径18～20nm。该病毒只有一个血清型，能够在PK15、新生仔猪肾细胞等生长，并产生细胞病变。PPV具有血凝活性，能够凝集人O型、大鼠、小鼠等的红细胞，其中以豚鼠的红细胞最敏感。PPV对高温的抵抗力很强，     

一株Asia 1型口蹄疫病毒的全基因组序列测定及比较分析

参考GenBank上已发表的口蹄疫病毒（FMDV）全长基因组序列,设计了覆盖基因组全长的数对引物,通过RT-PCR方法对1株Asia1型（简称As01）FMDV进行分段克隆及序列测定,将测序结果利用软件进行拼接。结果表明,该毒株的FMDV基因组[不合poly（C）]全长8180nt,其中编码区为6987nt,5’和3’非编码区（UTR）分别为1078nt和95nt,3＇UTR之后为20nt的poly（A）尾巴。将As01株与其他FMDV参考毒株利用分子生物学软件进行多序列比对分析表明,As01株与Asia 1／Jiangsu／China／2005、Asia 1／Isr 1／3／63、ZB／CHA／58等Asia 1型FMDV遗传进化关系较为密切,而与O型和A型FMDV遗传关系较远。     

猪细小病毒研究进展

猪细小病毒 (PPV)是引起母猪繁殖障碍的主要病原体之一。 PPV最早是从培养细胞中发现并分离得到的一种小 DNA病毒。PPV按照其致病性与组织嗜性大致可以分为 4个类型。研究表明 ,PPV不仅是引起母猪繁殖障碍的主要病原体之一 ,而且能够引起多种猪病。PPV基因组为单股负链 DNA,大小约为 50 0 0 bp,基因组有两个主要的开放阅读框架 ,基因组共编码 3种结构蛋白和两种非结构蛋白 ,即 VP1、VP2、VP3和 NS1、NS2。VP2蛋白是主要的免疫原性蛋白 ,可以诱导机体产生强烈的免疫反应 ,NS1蛋白是 PPV基因组本身编码的反式激活蛋白 ,对PPV早期和晚期的转录发挥着重要作用 ,另外有研究表明 ,NS1蛋白是具有多种功能的锚定蛋白 ,在 PPV体外感染过程中具有重要功能。随着对猪细小病毒研究的不断深入 ,目前已经在猪细小病毒病原学、诊断与防制以及分子生物学方面取得了进展。     

猪细小病毒VP区遗传元件在病毒复制效率中发挥关键作用

猪细小病毒(PPV)是引起猪繁殖障碍疾病的非外膜20面体病毒,和其他细小病毒的亲缘病毒类似,PPV非结构蛋白NS1与基因组复制、转录调控和细胞毒性相关,而NS2参与衣壳的组装和转运。     

猪细小病毒病

猪细小病毒（Porcineparvovirus，PPV）为引起母猪繁殖障碍（reproductivefailure）的主要病原体之一。主要特征是引起胚胎和胎儿的感染和死亡，导致母猪发生流产、死胎、胎儿木乃伊化及新生仔猪的死亡。PPV呈世界性分布。我国８０年代初在不同地区分离到了病毒，并查明其为危害养猪业的主要病原体之一。１PPV病原学特性１．１PPV理化特性猪细小病毒分类为细小病毒科（Parvoviridae）。PPV为DNA病毒，PPV对热具有强大的抵抗力。Mary和Bachmann等的研究表明：０．５％漂白粉或氢氧化钠５min可杀死PPV，而２％戊二醛则需要２０min…     

多重PCR检测猪细小病毒和猪伪狂犬病病毒的研究

根据GenBank上已发表的猪细小病毒（Porcine parvovirus，PPV）的VP2基因序列和猪伪狂犬病病毒（Porcine pseudorabies virus，PRV）的gH基因序列，设计合成了两对特异引物，分别建立了PPV和PRV的单项PCR诊断方法，通过对扩增条件的筛选，最终成功地建立了PPV和PRV的复合PCR诊断方法，即利用一次PCR反应，可同时扩增PPV的751bp和PRV355bp的特异性片段，而扩增猪圆环病毒Ⅱ型（PCV．2）及相应的培养细胞（PK-15）核酸结果均为阴性，对PPV和PRV的最低检出量分别为100Pg和10Pg的DNA。该方法适合对PPV和PRV的联合检测和鉴别诊断。     

猪细小病毒病研究进展

猪细小病毒（PPV）是属于细小病毒科,细小病毒属的无囊膜单链DNA病毒,成熟的病毒粒子为等轴二十面对称体,直径18～20nm。该病毒只有一个血清型,能够在PK15、新生仔猪肾细胞等生长,并产生细胞病变。PPV具有血凝活性,能够凝集人O型、大鼠、小鼠等的红细胞,其中以豚鼠的红细胞最敏感。PPV对高温的抵抗力很强,     

兔病毒性出血症病毒中国株(JX/CHA/97)全基因组分子克隆及序列分析

本研究首次完成了免病毒性出血症病毒（Rabbit hemorrhagic disease virus，RHDV）中国分离株JX／CHA／97全基因组序列的测定与分析。研究结果表明，JX／CHA／97株的全基因组由7437个核苷酸组成，其基因组构成为：5＇端有一个长度仅为9nt的非编码区，随后有2个阅读框架（ORFs）．分别编码一个聚合蛋白和一个结构蛋白。在基因组的3＇端也有一个非编码区，长度为59nt。另外，采用RACE方法获得了RHDV的poly（A）尾序，证明该结构至少含有27个A。根据RHDV衣壳蛋白的基因序列，将JX／CHA／97株与来自世界各地的22株RHDV分离株的基因组序列进行了比较与分析，并绘制了系统发生树。结果表明，RHDV各分离株之间存在较高的序列同源性，可以将它们至少分为6个拓朴群，提示RHDV有朝不同方向发生进化的趋势。     

猪圆环病毒基因组结构及其分子特征研究进展

目前,国际上已分离获得2个不同血清型的猪圆环病毒（PCV）,并命名为猪圆环病毒1型（PCV-1）和猪圆环病毒2型（PCV-2）。PCV-1对猪无致病性,而PCV-2被认为是引起断奶仔猪多系统衰竭综合征（PMWS）的主要病原。PCV基因组为单股环状双向DNA,由2个头一头相对排列的开放性阅读框和基因间隔区组成,包含rep基因、cap基因及病毒DNA复制起始区茎环序列。rep基因编码2种不同的复制酶相关蛋白,cap基因编码病毒结构蛋白或衣壳蛋白,茎环序列在病毒蛋白合成、DNA自身复制及子代病毒产生中发挥重要作用。PCV-2衣壳蛋白110位（P→A）和191位（R→S）氨基酸突变,提高PCV-2在体外组织培养中的增殖效率,而减弱其对动物的致病性和毒力。     

口蹄疫病毒O/LZ株的分子特性分析

采用RT—PCR方法对口蹄疫病毒O／LZ株基因组序列进行了分子克隆和序列测定。结果表明：获得的0／LZ株除poly（C）和poly（A）外基因组序列长8104nt，其中包括1042nt的5’非编码区和6969nt的多聚蛋白编码区。将O／LZ株与其它参考毒株进行序列比较，结果显示O／LZ株与O／HNK／2002、O／ES／2001、O／CHP／TW／97等遗传关系最近，而与其它毒株遗传关系较远，属于O型口蹄疫Cathay拓扑型。与ME-SA拓扑型PanAsia株的毒株比较，两者在主要抗原位点1和位点3呈现出明显的以拓扑型为特征的氨基酸差别，提示两拓扑型毒株之间有较高的抗原差异。     

猪繁殖与呼吸综合征病毒5’非翻译区中一顺式结构因子对病毒感染必要性的分析

人们广泛认为动脉炎病毒的基因组5’非翻译区(untranslated region,UTR)在病毒基因组RNA复制、亚基因组mRNA转录和蛋白翻译过程中发挥关键作用,然而其结构与功能仍然在很大程度上不为人知。现基于2型猪繁殖与呼吸综合征病毒弱毒(Porcine reproductive and respiratory syndrome virus,PRRSV)感染性克隆pAPRRS的基础,构建了一系列5’UTR的5’末端缺失突变体,利用RNA和DNA转染,分析了拯救病毒的遗传学与病毒学特征,发现拯救病毒的5’末端突变位点被一些不知来源的AU-rich外源序列所修复。基于T7启动子与CMV启动子转录起始位点的不同,我们人为引入一段GC-rich的序列以研究病毒的自我修复是否为模板依赖性,结果发现病毒的外源序列修复机制是非模板依赖的。通过二级结构预测分析发现,在PRRSV5’UTR中的第一个茎环结构是病毒感染性必不可少的。     

猪细小病毒SY-99株VP2基因的序列分析

克隆并测定猪细小病毒SY－99株VP2基因，与NADL－2（4973）株、NADL－2（5075）株、Kresse株和US－1株VP2基因核苷酸序列及其编码的氨基酸序列进行比较与分析，发现PPV SY－99株与Kresse株VP2基因核苷酸和氨基酸同一性最高，推测SY－99株可能为一强毒株。     

鸽圆环病毒福建株全基因组序列分析

运用PCR技术从福建省某地发病信鸽组织中获得鸽圆环病毒（Pigeon circovirus,PICV）福建株（简称fj1株）全基因组序列,并对鸽圆环病毒福建株基因组核苷酸组成、结构及其遗传进行分析。结果表明,所获fj1株全基因大小2037 nt,包含有2个主要的开放阅读框（open reading frame,ORF）：ORF-V1（41～994nt）编码复制相关结构蛋白（the replicated-associated protein,Rep）,ORF-C1（1987～1166nt）编码核衣壳蛋白（the putative capsid protein,Cap）;在V1和C1的5＇端之间存在一个与圆环病毒滚环复制有关的高度保守的环状发夹结构。fj1株与GenBank登录所有鸽圆环病毒核苷酸同源性在84.5%～93.8%之间,与中国浙江鸽圆环病毒分离株zj1和zj2核苷酸同源性分别为88.7%和88.9%。从遗传进化上看,中国3株鸽圆环病毒均处在Cap蛋白起始密码子＂ATG＂分支,但分居不同亚群。