ISSR标记鉴别砂梨种质资源的研究

为有效区分和利用亲源关系较近的砂梨品种,利用简单重复序列（ISSR）进行多态性、遗传相似性和聚类分析。从100多条ISSR引物对16份繁殖系材料DNA模板进行扩增和电泳检测,结果表明,有16条引物均能扩增出有较高稳定性、重复性和丰富多态性的条带,总数为135条,多态性达70.4%,每条引物扩增 3~8条条带;16个砂梨品种间的遗传一致度的变化范围在0.6667~0.9630,遗传距离的变化范围在0.0377~0.4055;‘华高’和‘新高’砂梨品种具有最高的遗传一致度（0.9630）,它们之间的遗传距离也最小（0.0377）;‘华高’和‘雪青’砂梨品种的遗传距离最大为0.4044,相应的最低遗传一致度为0.6667。     

ITS序列在苦荞麦种质资源鉴定中的应用

为了更精确有效地鉴定苦荞麦种质资源,根据ITS序列通用引物,以苦荞麦基因组DNA为模板通过PCR方法扩增出ITS(internal translation spacer)序列,在克隆测序的基础上对荞麦属5个栽培苦荞麦中进行分子鉴定与亲缘关系分析。结果表明：（1）5个供试材料ITS序列的变异小,序列长度在584~590 bp之间,G+C含量高,为67.5%~68.5%。（2）通过聚类方法分析发现‘建德苦荞麦’和‘红花苦荞麦’聚为一支,‘西荞2号’和‘西荞3号’聚为一支。     

烟台葡萄产区‘Cabernet’系列品系的遗传分析

探讨酿酒葡萄‘蛇龙珠’等‘Cabernet’品系之间的亲缘关系,为筛选优良酿酒葡萄品种提供依据。研究采用RAPD和SSR扩增技术,对6种‘Cabernet’进行遗传多样性分析。结果表明6种酿酒葡萄在系统树上划分为2大类群,虽然在遗传上4个‘蛇龙珠’品系与‘品丽珠’及‘赤霞珠’都存在差异,但这4个‘蛇龙珠’品系并未形成单独的类群;从系统树中可以初步推断,蛇龙珠品系很可能是逐步从‘品丽珠’中通过性状筛选而获得的品系;相对独立的‘蛇龙珠’品种聚集的现象为优良酿酒葡萄品种的选育提供了一定的依据。     

桃芽变品种的RAPD分析

为了从遗传学基础上对9个桃品种进行分类及亲缘关系研究。利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术对其基因组DNA进行标记,并应用SPSS11.0软件进行聚类分析。聚类分析结果表明：不同桃品种在欧氏距离平方系数阈值为2.0~6.0时,聚为两大类,第一大类由‘满园红’、‘中油4号’、‘中油9号’和07-9-6组成,均为油桃;第二大类由97-6-83、NJC83、‘皖83’、NJC19和07-9-19组成,均为黄桃。在欧氏距离平方系数阈值为1.0~2.0时,所有品种聚为4类,‘NJC83’和其营养系变异97-6-83、‘皖83’聚为一类,NJC19和其变异07-9-19聚为一类,‘中油4号’和其营养系变异‘满园红’聚为一类,‘中油9号’和其变异09-6-9聚为一类。RAPD分析认为：母本与营养系变异间的遗传距离短,具有很近的亲缘关系,其在DNA水平上产生了一定量的变异性条带,出现了较大范围的变异。     

14个八仙花品种亲缘关系的ISSR分析

利用ISSR技术对14个八仙花品种进行了亲缘关系的研究。从49个引物(引物选自加拿大哥伦比亚大学UBC公司公布的100条引物)中筛选了8个条带清晰、多态性高、重复性好的引物,对14个八仙花品种DNA进行扩增,共扩增出478条带(平均每个引物扩增59.75条DNA片段),多态性条带420条。用POPGENE分析数据得到14个品种的遗传距离为0.000 2～0.087 4,遗传相似性系数为0.916 3～1.000 0;利用NTSYSpc 2.1聚类分析,在遗传相似性系数约为0.38处将14个八仙花品种明显分为两大类,其中花园蕾丝、绿色夏天和圣代草莓被聚为第一类,其余11个品种被聚为第二类。     

贵州马铃薯引进品种SSR分子标记及遗传多样性分析

为了鉴定马铃薯品种间的亲缘关系,采用5对SSR分子标记引物,对18个贵州马铃薯生产品种进行SSR分子标记及遗传多样性分析.结果表明:5对SSR引物共扩增出77个多态性条带,每个组合的多态性条带数为10～24不等,平均每个引物组合产生15.4个多态性条带.18个马铃薯材料之间的遗传距离范围在0.376 6～0.909 0之间,平均为0.701 1.经聚类分析,18个马铃薯材料在遗传距离0.57水平上全部聚为一类,以遗传距离0.60为基准,可明显聚为4个类群.第Ⅰ类包括5个材料;第Ⅱ类仅1个材料;第Ⅲ类包括4个材料;第Ⅳ类包括8个材料.     

不同来源棉花种质资源遗传多样性的ISSR分析

 采取ISSR分子标记对48份棉花种质资源的遗传多样性进行分析,从60条ISSR引物中筛选出11条引物,这11条引物共扩增出92个条带,平均每条引物扩增出8.36个条带;其中多态性带77个条带,多态率达83.70％。UPGMA聚类分析显示,48份材料的相似性系数（GS）变化范围在0.27～0.93之间。聚类将48个种质资源划分为 4个大类(GS=0.55),湛江野生棉、廉江野生棉与其它品种在遗传上有很大差别,属于较原始类型,归为一类;长绒棉与陆地棉品种存在明显的遗传差异也单独归为一类;其它不同省份的陆地棉品种在遗传上有较高的相似性,归为其它类型。分析结果表明,ISSR具有丰富遗传多样性和稳定性, 是一种较好的遗传分子标记,适宜于棉花品种遗传多样性分析     

不同遗传背景下陆地棉衣分和子指性状QTL定位

为陆地棉产量性状有关的分子标记辅助育种奠定理论基础,以高品质中长绒棉品种‘新陆早24号’为父本,转基因抗虫棉常规品种‘鲁棉研28号’和高产、优质棉花新品种‘冀棉516’为母本,构建F2和F2:3分离群体;利用7638对SSR引物对‘鲁棉研28号’和‘新陆早24号’进行多态性进行筛选,共获得225对多态性引物,对238个F2单株DNA扩增获得238个多态性标记位点,其中185个构建了包括44个连锁群,总长为1509.38 cM的遗传连锁图谱,标记间的平均距离为8.16 cM,覆盖棉花总基因组的33.91%。根据已有图谱的定位结果,40个连锁群与染色体建立联系。利用复合区间作图法定位‘鲁棉研28号’与‘新陆早24号’分离群体F2单株和F2:3家系的衣分和子指性状QTL,其中得到3个衣分和5个子指的QTL;根据定位结果,选择了14对SSR引物,分析‘冀棉516’与‘新陆早24号’的多态性,其中6个标记构建了两个连锁群。1个衣分和1个子指的QTL在两个群体中均检测到,这些共同QTLs为分子标记辅助育种奠定了基础。     

西藏主要农区青稞品种的遗传多样性分析

采用内含子切接点引物（intron-splice junction primer）和长随机引物的PCR分子标记方法,对来自西藏主要农区的29个青稞育成品种和3个农家种的遗传多样性进行了分析。结果表明,选用的5个引物共扩增出稳定清晰的条带39条,其中26条（66.7%）为多态性条带。根据PCR扩增的条带建立[1,0]型数据矩阵,应用NTSYSpc2.1数据分析软件计算各品种间的遗传相似系数,并据此进行聚类分析,结果表明,西藏主要农区青稞品种间有一定的遗传差异,但总体遗传差异较小,遗传基础相对狭窄;聚类结果与各品种的实际生产利用情况较为接近,可以反映出这些青稞品种较为明显的区域特征。     

克新系列马铃薯遗传多样性的RAPD分析

利用RAPD标记技术对19份克新系列马铃薯品种进行了遗传多样性分析,分别提取19份马铃薯品种的DNA,进行随机引物多态性扩增,从1000条随机引物中初步筛选出7条有多态性的引物进行详细研究,每条RAPD引物扩增出4~9条带,共获得52条带,其中多态性条带为43条;19份马铃薯品种的遗传距离介于0.17~0.72之间,平均值为0.39,平均遗传距离介于0.31~0.51之间;聚类分析结果在GS=0.53处可将克新系列马铃薯品种划分为三类,聚类结果与系谱分析基本相符,同时也说明克新系列马铃薯的遗传基础有所拓宽。研究表明：RAPD标记简便、快速、成本低,适用于分析马铃薯遗传多样性,指导马铃薯育种实践中的亲本组配。     

Genetic diversity of hexaploid wheat cultivars estimated by RAPD markers, morphological traits and coefficients of parentage

Estimates of genetic diversity can be based on different types of data. The aim of this research were to study genetic diversity among Croatian wheat cultivars by random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers, morphological traits and pedigree records; to analyse differences between wheat cultivars from two breeding centres; and to evaluate usability of RAPD markers for estimation of genetic diversity among wheat cultivars in comparison with morphological traits and pedigree record data. Studies were conducted on 14 wheat cultivars and breeding lines from two breeding centres in Croatia. For the RAPD analysis 36 primers were screened and the 14 most polymorphic ones yielded 341 polymorphic bands. Twelve morphological traits were used for morphological analysis. Pedigrees were composed of seven generations of ancestors. RAPD markers showed a high level of polymorphism among the cultivars examined and the breeding lines. No significant correlations were observed among the methods tested.     

Random amplified polymorphic DNA variation among German and Dutch asparagus cultivars

DNA polymorphism among nine cultivars of Asparagus officinalis L. was measured using random amplified polymorphic DNA (RAPD). Of 69 reproducible amplification products from 12 arbitrary decamer primers, 49 RAPD markers were polymorphic and could be used to distinguish six German and three Dutch asparagus cultivars. Even with very small sample sizes, genetic similarity measurements based on the RAPD data allowed accurate grouping of the nine cultivars into distinct clusters, with the exception of two individuals which clustered to closely related varieties. Two German cultivars showed high genetic similarity and were distinct from the remaining German varieties. The German and Dutch cultivars were clearly separated by a relatively large genetic distance.     

千瓣莲品种资源的RAPD分析

¹School of Life Science, Northwest A & F University, Yangling 712100; ²Wuhan Institute of Vegetable Science, Wuhan 430065     

安徽野生香菇遗传多样性及杂种优势的RAPD分析

采用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,利用17个引物对26个安徽野生香菇菌株和6个香菇栽培品种进行了遗传多样性分析,并构建了遗传相关聚类图。在128个RAPD标记中,多态性标记为104个,占81.3%。聚类分析显示,当以相异距离0.25为阈值,32个菌株被划为5个RAPD遗传组,多数菌株之间遗传相似性较低。表明供试菌株在DNA水平上存在比较显著的遗传变异,具有较丰富的遗传多样性。杂种优势的检测表明亲本间遗传距离较大的组合其杂种优势也较强。     

龙眼种质资源的RAPD分析

利用RAPD技术对龙眼的95份种质资源和一份荔枝种质资源进行研究。从200条随机引物中筛选出18条多态性引物,共扩增出197条带,DNA扩增带的多态性为100%,这表明96份材料的遗传多样性和遗传资源的丰富性。利用SPSS13.0统计软件对RAPD表型数据矩阵进行分析。根据欧氏距离（ED）法计算各样品间的遗传距离,采用UPGMA（类平均法）,进行分析,建立亲缘关系聚类树状图。结果表明,RAPD标记能在分子水平揭示龙眼的遗传背景与亲缘关系     

应用RAPD标记检测小豆种质资源的遗传多样性初探

检测野生型、半野生型及栽培型小豆种质资源的遗传多样性,对进一步探讨小豆的起源地、品种分化和传播途径具有极其重要的价值。本研究用RAPD标记方法对来自中国、日本、韩国、不丹、尼泊尔、越南等6国99份小豆种质资源DNA的遗传多样性进行了检测。7个引物共检测到102条带,具有多态性的谱带100条,其中7条带仅存在于单个材料     

白菜种质遗传多样性与亲缘关系的ISSR标记分析

摘要：从分子水平用ISSR标记法对白菜遗传多样性进行分析,从100个ISSR引物中共筛选出11个多态性明显、条带清晰、反应稳定的引物,对65个样品DNA共扩增出107条谱带,平均每个引物扩增出9.72条带,其中多态性位点102个(93.5% )。种间遗传相似系数在遗传距离在0.40～0.65 之间,表明白菜栽培种内品种间的遗传基础相对较宽,存在较大的遗传变异性。利用UPGMA聚类分析表明：能将65个白菜地方品种划分为四大类。由ISSR标记聚类结果所表现出的大多种质之间的亲缘关系与其来源地有较大的相关性,但也有地理差别很大的白菜资源遗传关系较近的情况。本研究还表明,ISSR 标记比RAPD 标记具有更高的稳定性,在植物遗传多样性的分子标记或克隆研究中,可优先使用ISSR 标记。     

部分烟草种质遗传多样性与亲缘关系的ISSR标记分析

烟草遗传资源多样性与亲缘关系研究，是烟草遗传育种与起源演化研究的重要基础，本文首次应用ISSR标记，对烟草属（Nicotiana）4个种30份材料的遗传多样性进行分析。从70个ISSR引物中共筛选出16个多态性明显、条带清晰、反应稳定的引物，对30个样品DNA共扩增出309条谱带，平均每个引物扩增出19.31条带，多态性条带比率（PPB）达93.20%。种间遗传相似系数在0.26~0.96之间，表现出丰富的遗传多态性。系统聚类结果显示，N. glutinosa、N. suaveolens、N. gossei 3个野生种间存在较大的遗传差异，遗传相似系数在0.29~0.52之间；27份栽培品种种内遗传相似性相对较高，在0.54~0.96之间，显示出栽培种内的遗传基础相对比较狭窄，但其中白肋21、台烟7号与其他供试材料有较大的遗传差异。ISSR聚类分析表明，当L1取值为D = 0.475时，可将3个野生种与27份烟草栽培品种明显区分开，反映出种间的遗传差异；当L2取值为D = 0.776时，可将30份材料分为2个大类、3个小类和6个独立的个类，较好地揭示了烟草属种间或栽培种品种类型间的遗传多样性与亲缘关系，可为烟草遗传育种和遗传连锁图谱构建的杂交亲本选择提供科学依据。本研究还表明ISSR标记比RAPD标记具有更高的稳定性，在植物遗传多样性的分子标记或克隆研究中，可优先使用ISSR标记。     

Genetic diversity in mustard (Brassica juncea L.) germplasm from Pakistan as determined by RAPDs

The genetic diversity and the relationships among a collection of mustard (B. juncea) germplasm, including 41 accessions collected from Pakistan, 6 oilseed cultivars/ lines and 5 Japanese vegetable cultivars, were evaluated using random amplified polymorphic DNA (RAPD) markers. A total of 198 polymorphic amplified products were obtained from 30 decamer primers. Of these, 14 were unique to the accession PAK-85835 and 37 were specific to PAK-85839. Based on pair-wise comparisons of RAPD amplification products, genetic similarity was estimated using similarity coefficients of Nei & Li (1979) and a dendrogram was constructed using the unweighted pair-group method with arithmetic averages (UPGMA). Cluster analysis based on these genetic similarities placed most of the collected germplasm and oilseed cultivars/lines close to each other, showing a low level of polymorphism between the oilseed accessions collected in Pakistan. However, the clusters formed by the oilseed collections and cultivars were distinct from those formed by the vegetable cultivars. A low level of genetic variability of oilseed mustard in Pakistan was attributed to the selection for similar traits and horticultural uses. The farmers' preference for more remunerative crops and perhaps the close parentage of these accessions further contributed towards their little diversity. The study demonstrated that the RAPD is a simple and fast technique to compare the genetic relationships and the patterns of variation among accessions of this crop. This revised version was published online in August 2006 with corrections to the Cover Date.     

一串红品种（系）遗传多样性RADP分析

(农业应用新技术北京市重点实验室/北京农学院园林系,北京102206)