贵州地方猪BF基因遗传变异分析

本试验运用PCR和序列测定法对香猪、可乐猪、黔北黑猪3个贵州地方猪种共计95头猪进行BF基因检测及序列分析。3个品种猪群均在BF基因的第16外显子45 bp出检测出A→C的突变,命名为BF-exon 16-A45C,该突变产生了AA、AC、CC 3种基因型,并且致使编码氨基酸由谷氨酸(E)变为天冬氨酸(D)。3个品种猪群中等位基因频率分布不均匀,分别为:可乐猪(A:0.6667、C:0.3333),香猪(A:0.8788、C:0.1212),黔北黑猪(A:0.7812、C:0.2188)。经χ2适合性检验,只有可乐猪群体在该位点上达到了Hardy-Weinberg平衡,而香猪群体和黔北黑猪群体该位点偏离Hardy-Weinberg平衡。     

贵州白香猪BF基因多态性研究

贵州白香猪为贵州特有的地方品种猪,本研究采用直接测序法对贵州白香猪BF基因外显子15、16、17的733bp进行多态性分析。结果显示,在第16外显子41bp处存在A→C的碱基突变,导致编码的氨基酸由谷氨酸（Glu）突变为天冬氨酸（Asp）。在贵州白香猪群体内检测到AA、AC和CC3种基因型,等位基因A和C频率分别为0.88和0.12。     

贵州白香猪BF基因多态性研究

贵州白香猪为贵州特有的地方品种猪,本研究采用直接测序法对贵州白香猪BF基因外显子15、16、17的733 bp进行多态性分析。结果显示,在第16外显子41 bp处存在A→C的碱基突变,导致编码的氨基酸由谷氨酸(Glu)突变为天冬氨酸(Asp)。在贵州白香猪群体内检测到AA、AC和CC 3种基因型,等位基因A和C 频率分别为0.88和0.12。     

PRLR基因在5个猪种中的群体遗传特性分析

催乳素受体(PRLR)基因在动物繁殖过程中有重要生理功能,是猪繁殖性状上的一个候选基因。利用PCR-RFLP方法,以大白猪、长白猪、杜洛克猪、山西瘦肉型猪新品系(SD-III系)、大汉梅猪为试验动物,分析了PRLR基因在各群体中的遗传特性。结果发现各群体都存在AA、AB和BB 3种基因型,均处于中度多态,5个猪群体都处于遗传平衡状态。     

MyoD基因在不同猪种中的分布及群体遗传结构分析

利用RFLP法检测了MyoD基因在10个中外猪种及部分杂交群体中的分布情况,分析了各群体内MyoD基因的遗传分布、遗传变异、群体杂合性等群体遗传信息,并进一步以各群体基因频率为基础,计算出群体间遗传距离和进化距离,根据进化距离对群体进行聚类,重建了系统发生树。结果表明:MyoD基因内含子1的DdeI酶切位点上不同基因型的分布在多数群体中都服从Hardy-Weinberg平衡,但在杜洛克和DLY群体中发生偏离。总体上讲,各试验群体的遗传多样性较丰富,群体遗传变异性较高,进化过程中受到自然选择压的作用,选择潜力较大。在系统发生树上,10个群体被分为4个分枝。分别是长白猪血缘、原始地方品种、杜洛克血缘和高原藏猪分枝。这一结果与各猪种的育种过程有较高的吻合性。说明部分功能基因的RFLP数据可用于近缘物种间的遗传分化研究。     

猪CCKAR基因两SNP位点的遗传多态性分析

试验以9个猪品种/品系（5个地方品种：宁乡猪、大围子猪、沙子岭猪、桃源猪、五指山猪;3个外来品种：大白猪、长白猪、杜洛克猪;1个杜长大杂交品系）共计687头猪为研究对象,通过PCR-RFLP方法分析了CCKAR基因+179A/G Hpy8I酶切位点和+471C/G SatI酶切位点的基因频率和基因型频率,并进行了Hardy-Weinberg平衡检验。在所有猪种群体中,CCKAR基因+179A/G Hpy8 I酶切位点和+471C/G Sat I酶切位点均存在较丰富的遗传多态性。在+179A/G Hpy8 I酶切位点中除宁乡猪中没检测到AA基因型个体外,其他品种中都检测到AA、AG、GG 3种基因型个体的分布;而CCKAR基因+471C/G Sat I酶切位点都检测到了CC、CG、GG基因型个体的分布。     

RBP4基因在五个猪种中的群体遗传特性分析

RBP4基因是近年来在猪繁殖性状上发现的一个候选基因。利用PCR-RFLP方法,以大白猪、长白猪、杜洛克猪、山西瘦肉型猪新品系(SD-III系)、大汉梅猪为试验动物,分析RBP4基因在各群体中的遗传特性。结果发现各群体都存在AA、AB和BB3种基因型,均处于中度多态,除杜洛克猪外,其余各群体都处于Hardy-Weinberg遗传平衡状态。     

RBP4基因在五个猪种中的群体遗传特性分析

RBP4基因是近年来在猪繁殖性状上发现的一个候选基因。利用PCR—RFLP方法,以大白猪．长白猪、杜洛克猪、山西瘦肉型猪新品系（SD-Ⅲ）、大汉梅猪为试验动物,分析了RBP4基因在各群体中的遗传特性。结果发现各群体都存在AA、AB和BB3种基因型,均处于中度多态,除杜洛克猪外,其余各群体都处于Hardy—weinberg遗传平衡状态。     

MyoD基因在不同猪种中的PCR-RFLP遗传多态性及其遗传效应研究

采用PCR—RFLP的方法分析了MyoD基因在10个中外猪种及部分杂交群体中的分布情况，并分析了MyoD基因对肌纤维、胴体品质、胴体等级性状和肉质性状的遗传效应。结果表明：MyoD基因内含子1内的DdeI酶切位点多态性较丰富。在多数地方猪种群体中，C基因的分布具有绝对优势，且主要以杂合子AC形式存在。突变型A基因对胴体性状和胴体等级性状的影响较大，可极显著地增加胴体瘦肉率和眼肌面积，降低皮脂含量，提高腿臀比例，增加胴体长度（P〈0．01），同时会降低猪肉品质。具体讲，A基因对增加肌纤维面积的加性效应值和显性效应值分别为457．915μm^2和431．055μm^2；对增加嗣体瘦肉率的加性效应值和显性效应值分别为3．594％和-0．153％；对增加眼肌面积的加性效应值和显性效应值分别为3．084cm^2和-0．46cm。；对皮脂率的加性效应值和显性效应值分别为～3．916％和0．666％；对提高腿臀比的加性效应值为0．771％，显性效应值为0．068％。A基因对屠宰后45min和冷藏24h后的肉色评分的加性效应值分别为-0．145和-0．160，显性效应值分别为-0．052和-0.213．     

转基因猪的遗传特性

整合人生长激素释放因子(RH—GH)基因和人生长激素与小鼠WAP为启动子的融合基因的大白猪,其F_2代与F_1代相比较,外源基因的基因型数量减少。转基因公猪同非转基因母猪交配,所得到的转RH—GH基因猪中,雄性的占65%,雌性的占35%;而在转WAP—hGH基因猪中,雌性的占到82.8%.F_1、F_2和F_3代外源基因数量上的差别是明显的,在4月龄和6月龄时,转WAP—hGH基因猪的活重和平均日增重与对照组相比,明显提高.由于DNA重组技术的发展,通过外源基因定向整合、改变动物基因型的方法得到应用,使家畜出现新的、可以遗传的生物学特性.俄罗斯和德国的学者合作,从1990年起在实验农场,以大白猪为试验材料进行了繁殖转基因猪的实验,这些转基因猪是通过受精卵显微注射外源基因的方法得到的.用大学教授提供的转基因公猪的冷冻精液以及在该实验农场新得到的转基因公猪的精液进行人工授精.     

贵州白香猪apoA5基因多态性初步分析

贵州白香猪为贵州特有的地方品种,为了研究贵州白香猪apoA5基因多态性,试验采用直接测序法对贵州白香猪apoA5基因全序列2 473 bp进行单核苷酸多态性(SNPs)检测。结果表明:在apoA5基因的内含子2和外显子3中分别检测出1个、11个变异位点;有4个突变发生在氨基酸编码区内,其中3个突变为同义突变,而G1 185A突变为非同义突变,导致了密码子由CGC突变为CAC,从而导致氨基酸由精氨酸(Arg)突变为组氨酸(His);另外7个突变位点发生在3'-UTR;在检测出的12个变异位点中,G1 690C及G1 821C突变符合Hardy-Weinberg平衡状态,其余10个位点偏离了Hardy-Weinberg平衡。     

Effect of a genetic polymorphism in SREBP1 on fatty acid composition and related gene expression in subcutaneous fat tissue of beef cattle breeds

Sterol regulatory element-binding factor 1 (SREBP1) plays an important role in the lipogenesis which affects fatty acid (FA) composition in backfat and consequently influences beef nutritional quality. This study analyzed the association of 84 bp-indel, both short (S) and long (L) alleles in intron 5 of SREBP1, with FA composition and gene expression of SREBP1 in backfat of northern Spanish beef breeds (Pirenaica, Salers and Holstein-Friesian). Phylogenetic analysis suggests that 84 bp-indel of ruminants is a highly conserved region compared with those in the full-length sequence of intron 5 or mRNA of SREBP1 among species. Overall, higher content of polyunsaturated FAs was observed in SL genotype compared to LL genotype of 84 bp-Indel (p < .05). In particular, in Pirenaica, SL genotype was associated with a higher content of stearic (18:0), α-linolenic (18:3n-3) acid, and total n-3 content (p < .05). However, the gene expression of SREBP1 did not differ among genotypes of 84 bp-Indel (p > .05).     

猪TLR2基因Bi-PASA遗传标记的建立及多态性研究

根据人和小鼠TLR2基因序列设计了特异性PCR引物,优化PCR条件后扩增到中国梅山猪、欧洲约克夏猪、PIC-2系及PIC-3系商品猪的TLR2基因690 bp的基因片段,并对其进行序列分析。序列分析结果显示,猪TLR2基因多态性程度低,发现在猪TLR2基因编码区第1 255位点上存在1个单碱基突变位点。利用双向特定等位基因PCR扩增法(B i-PASA)建立了检测猪TLR2基因变异的遗传标记。利用猪TLR2基因的B i-PASA标记,分析了TLR2基因在大河乌猪、撒坝猪和黔邵花猪中的基因频率和多态性。研究建立的B i-PASA遗传标记和基因变异信息,将为进一步分析猪TLR2基因变异与疾病抵抗力及经济性状的相关分析提供基础资料。     

微卫星DNA标记在三个山羊品种中的遗传多态性研究

利用四个微卫星标记对波尔山羊、太行山羊和河北奶山羊的等位基因频率、群体多态信息含量、有效等位基因数和杂合度进行了遗传检测。结果表明：四个微卫星位点在波尔山羊、太行山羊和河北奶山羊三个品种中存在多态性。可以用于山羊遗传多样性的评估；位点OarFCB11变异最大，位点MCM38变异最小，从不同品种来看，太行山羊的遗传变异程度最大，而波尔山羊的遗传变异程度相对较小。     

11个猪品种生长激素(pGH)基因多态性及其遗传分化研究

利用PCR和测序技术,检测了11个猪品种共65个个体的生长激素(pGH)基因全序列多态性,发现43个SNPs和1个位于内含子3的7 bp缺失片段。分析结果表明,pGH基因DNA序列不同功能区变异程度各不相同,外显子区、内含子区、5′和3′端非编码区SNPs位点各占SNPs位点总数的18.60%、74.42%、6.98%;外显子区8个SNPs位点导致4个氨基酸位点变异,外显子2是编码区的高变域;各SNPs的变异属典型的中性突变;不同品种有其独特的单倍型。分子方差分析(AMOVA)结果表明,pGH基因DNA序列品种内的变异(方差比率73.45%)大于品种间的变异(方差比率26.55%),品种间差异极显著(P<0.01),存在较明显的遗传分化;pGH基因自身进化及品种进化主要体现在内含子区,品种间的遗传分化与地理分布和基因交流有关。     

苏太猪CAST基因多态性与肉质性状的相关性研究

采用PCR-RFLP方法对72头苏太猪的钙蛋白酶抑制蛋白(calpastatin,CAST)基因遗传多态性与肉质性状的相关性分析。对CAST基因第6内含子上MspⅠ、HinfⅠ、RsaⅠ三种酶切位点进行检测,结果表明:CAST基因第6内含子上,MspⅠ酶切位点的3种基因型间在肌肉的嫩度、pH值、系水力水平指标上均差异显著(P0.05);HinfⅠ酶切位点的3种基因型间在肌内脂含量指标上差异显著(P0.05),在肌肉嫩度上差异极显著(P0.01)。RsaⅠ酶切位点上也发现了3种基因型,但各基因型的不同性状间差异不显著(P0.05)。     

猪垂体特异性转录因子基因多态性的研究

对香猪、上海白猪、大约克夏猪的垂体特异性转录因子(PIT-1)基因进行了单核苷酸多态性(SNP)分析。结果显示:在3个猪种PIT-1基因的第5和第6外显子中均未发现SNP;而在第4外显子中出现SNP,即在公布序列的第272位上有1/2的大约克夏猪为碱基C,其余1/2的大约克夏猪和全部的香猪、上海白猪均发生了C→T突变,这是一个沉默突变。根据研究结果推测,PIT-1基因第4外显子中的碱基突变及这3个外显子的序列状况可能与香猪的矮小性无关。     

山羊品种遗传多样性的分析

利用6个微卫星标记对中西部7个山羊品种(陕南白山羊、陕北白绒山羊、西农萨能羊、关中奶山羊、太行山羊、黄淮山羊、伏牛山羊)共计322个个体进行了遗传多样性检测,并根据Nei氏遗传距离进行了聚类分析。结果表明:6个微卫星标记在这7个品种中存在高度多态性;陕北白绒山羊的遗传变异程度最大,平均杂合度和平均多态信息含量分别为:0.8401和0.8244;而关中奶山羊的遗传变异程度相对较小,平均杂合度和平均多态信息含量分别为:0.7990和0.7784。UPGMA聚类分析表明,黄淮山羊和伏牛山羊聚为一类,陕南白山羊,太行山羊,陕北白绒山羊依次加入,西农萨能羊和关中奶山羊作为一类最后加入。     

基于测序技术的海南地方猪TLR2基因多态性分析

为了解海南地方猪TLR2基因的多态性,本研究采用PCR法从五指山猪、临高猪和屯昌猪3种海南地方猪的血液中克隆Toll样受体2(TLR2)基因,并进行测序及序列分析。结果显示,3种海南地方猪TLR2基因的扩增长度均为2649bp,编码区长2358bp。3种猪TLR2基因序列的种内比对结果显示,五指山猪种内有7个核苷酸位点存在多态性,2处位于编码区;屯昌猪种内有5个核苷酸位点存在多态性,均在编码区外;临高猪种内有4个核苷酸位点存在多态性,1处位于编码区。种间比对结果显示3种猪有12个核苷酸位点存在多态性,其中3处为错义突变,导致氨基酸改变。同源性分析结果显示,3种猪的TLR2基因序列高度保守,同源性在99.6%~99.9%之间。蛋白质结构预测分析显示,海南猪TLR2基因在876、1454位点呈现的AG突变均引起了其蛋白质二级结构和三级结构的改变,提示可能存在TLR2功能的变化。本研究填补了海南地方猪TLR2基因多态性空白,为深入研究TLR2基因多态性与猪疫病易感性的关系提供基础研究资料。