南宁市肉牛的Y染色体遗传多样性分析

[目的]为了探究广西南宁市肉牛的父系遗传背景与遗传组成。[方法]利用PCR扩增、限制性酶酶切和生物信息学方法,对南宁屠宰场的73头肉牛Y染色体USP9Y基因的遗传多态性进行分析。[结果]发现73头公牛USP9Y基因的PCR产物具有多态性,2头牛显示471 bp带型,71头牛显示552 bp带型。在71个552 bp带型中,有28个可以被SspI酶切成2条带(338 bp和215 bp),表明这28头牛为Y3单倍型组(38.36%),而其余43个不能被SspI酶切,表明这43头牛为Y2单倍型组(58.90%)。仅有2头牛的PCR产物为471 bp,表明这2头牛为Y1单倍型组(2.74%)。屠宰牛群的单倍型多样度为0.5122±0.0309,表明屠宰牛群的Y染色体遗传多样度较高。[结论]南宁市屠宰牛群的来源比较复杂,有普通牛(Y1与Y2单倍型组)和瘤牛(Y3单倍型组)2个父系起源。     

高原型藏绵羊KAP基因单核苷酸多态性分析

试验旨在寻找角蛋白辅助蛋白(keratin-associated proteins,KAP)基因与产毛性状相关的多态位点,为藏绵羊产毛性状的分子标记提供理论依据。采用PCR-SSCP技术对高原型藏绵羊角蛋白辅助蛋白基因家族中KAP3.2、KAP7基因部分序列和KAP8基因外显子进行多态性分析。结果表明,3个基因座都存在多态性,均检测到AA、AB和BB 3种基因型。KAP3.2基因以A等位基因为优势等位基因,AA基因型为优势等位基因型;KAP7和KAP8基因均以B等位基因为优势等位基因,BB基因型为优势等位基因型。高原型藏绵羊在KAP3.2和KAP8基因座达中度多态,而在KAP7基因座为低度多态,在KAP3.2和KAP8位点上基因型频率处于Hardy-Weinberg非平衡状态。测序分析结果表明,KAP3.2和KAP8基因上分别存在1个C→T(271 bp)和1个T→C(1122 bp)的突变,均属于同义突变,KAP7基因5′调控区存在1个T→C(102 bp)的突变。     

南宁市屠宰场肉牛的Y染色体遗传多样性分析

[目的]为了探究广西南宁市屠宰场肉牛的Y染色体分子遗传多样性。[方法]利用PCR扩增、限制性酶酶切和生物信息学方法,对南宁屠宰场的73头肉牛Y染色体USP9Y基因的遗传多态性进行分析。[结果]发现73头公牛USP9Y基因的PCR产物具有多态性,2头牛显示471 bp带型,71头牛显示552 bp带型。在71个552 bp带型中,有28个可以被SspI酶切成2条带（338 bp和215 bp）,表明这28头牛为Y3单倍型组（38.36%）,而其余43个不能被SspI酶切,表明这28头牛为Y2单倍型组（58.90%）。仅有2头牛的PCR产物为471 bp,表明这2头牛为Y1单倍型组（2.74%）。屠宰牛群的单倍型多样度为0.5122±0.0309,表明屠宰牛群的Y染色体遗传多样度较高。[结论]南宁市屠宰牛群的来源比较复杂,有普通牛（Y1与Y2单倍型组）和瘤牛（Y3单倍型组）2个父系起源。     

宁夏黑绵羊血清碱性磷酸酶（AKP）多态性的研究

采用垂直板聚丙烯酰胺电泳技术，研究了宁夏黑绵羊血清碱性磷酸酶（AKP）的多态性。结果表明：宁夏黑绵羊AKP有A、B、C和D四种同工酶。其中AKPB和AKPC同工酶均具有多态性。说明宁夏黑绵羊血清碱性磷酸酶具有复杂的多态性，可将其作为宁夏黑绵羊种质特性的特征标记。     

中国西南7品种黄牛Y染色体微卫星多态性分析

对中国西南地区7个黄牛品种81头公牛在4个Y染色体特异微卫星的多态性进行了研究,发现4个微卫星中只有2个,即UMN2404和UMN0103具有多态性,UMN2404具有普通牛（104、91 bp）和瘤牛（120、110和85bp）所特有的单倍型,UMN0103也呈现出能够区分普通牛（155、140 bp）和瘤牛（1361、25 bp）的单倍型,2个标记对不同品种或个体的鉴别一致率达到100%。通过对UMN2404和UMN0103的分析揭示了西南地区黄牛中普通牛和瘤牛Y染色体的分布频率,瘤牛Y染色体单倍型频率（72.8%）显著高于普通牛（27.2%）。普通牛Y染色体单倍型频率在西藏牛（100%）和迪庆牛（81.8%）中占有优势;而瘤牛单倍型在西南地区其他牛种群中占有优势（76.5%~100%）。     

高原型藏绵羊KAP 基因单核苷酸多态性分析

试验旨在寻找角蛋白辅助蛋白(keratin-associated proteins,KAP)基因与产毛性状相关的多态位点,为藏绵羊产毛性状的分子标记提供理论依据。采用PCR-SSCP技术对高原型藏绵羊角蛋白辅助蛋白基因家族中KAP 3.2、KAP 7基因部分序列和KAP 8基因外显子进行多态性分析。结果表明,3个基因座都存在多态性,均检测到AA、AB和BB 3种基因型。KAP 3.2基因以A等位基因为优势等位基因,AA基因型为优势等位基因型;KAP 7和KAP 8基因均以B等位基因为优势等位基因,BB基因型为优势等位基因型。高原型藏绵羊在KAP 3.2和KAP 8基因座达中度多态,而在KAP 7基因座为低度多态,在KAP 3.2和KAP 8位点上基因型频率处于Hardy-Weinberg非平衡状态。测序分析结果表明,KAP 3.2和KAP 8基因上分别存在1个C→T（271 bp）和1个T→C(1122 bp）的突变,均属于同义突变,KAP 7基因5′调控区存在1个T→C（102 bp）的突变。     

宁夏黑绵羊血清碱性磷酸酶(AKP)多态性的研究

采用垂直板聚丙烯酰胺电泳技术,研究了宁夏黑绵羊血清碱性磷酸酶(AKP)的多态性.结果表明:宁夏黑绵羊AKP有A、B、C和D四种同工酶.其中AKPB和AKPC同工酶均具有多态性.说明宁夏黑绵羊血清碱性磷酸酶具有复杂的多态性,可将其作为宁夏黑绵羊种质特性的特征标记.     

黄牛Y染色体分子遗传多样性研究进展

Y染色体分子遗传多样性是追溯动物起源、驯化历史和迁徙路线的重要工具,也可以用来反映动物的父系遗传多样性及用于研究群体间父系介导的杂交情况。Y染色体单倍型多样性可以分别通过Y染色体单核苷酸多态性(Y-SNP)和Y染色体微卫星多态性(Y-STR)或这二者结合起来构建精确的Y染色体单倍型。黄牛有3种父系起源(普通牛Y1、Y2和瘤牛Y3单倍型组),可以通过Y-SNP来区分,通过-STR标记可以区分Y1、Y2和Y3所具有的丰富的精细单倍型。本文汇集了包括中国在内的国内外黄牛Y染色体遗传多样性与起源进化的研究进展。     

绵羊血清运铁蛋白多态性遗传的研究进展

遗传标记的研究正成为遗传育种领域新的热点,它可以用于动物基因组计划的完成,动物育种新技术的建立,动物资源的保护、开发和利用。血清运铁蛋白（TransferrinTF）属生物化学标记,本文就国内外有关绵羊血清运铁蛋白多态性遗传研究结果作一简述,以引起人们的重视。1绵羊血清运铁蛋白多态性遗传研究概况血清运铁蛋白是动物血清中的一种糖蛋白,它由两条多肽链构成,每条多肽链有一个铁的结合位点,分子星90000,在动物体内起到结合并运输钱离子的作用。具有α－2-球蛋白和β2-球蛋白之间的迁移率。Ashton（1958）首次在英国绵羊血清中…     

利用Y染色体AMELY基因分析中国马鹿的遗传多样性

本研究利用Y染色体AMELY基因分析中国马鹿的遗传多样性,对塔河马鹿、伊河马鹿、阿尔泰马鹿、东北马鹿、甘肃马鹿共200个个体的AMELY基因片段测序,分析马鹿Y染色体的单倍型多样性,通过构建系统进化树,研究中国马鹿的群体遗传多样性并对马鹿的父系起源进行探讨。结果显示:塔河马鹿变异位点最多,具有很高的核苷酸多样性,与其他马鹿间的遗传距离远;本试验共定义了6个单倍型,分别为A1、A2、A3、A4、A5、A6,其中塔河马鹿、阿尔泰马鹿和甘肃马鹿具有独有的单倍型;利用所获得AMELY基因序列,构建NJ和ML系统进化树发现:塔河马鹿自成一个单系;甘肃马鹿自成一个单系,伊河马鹿、阿尔泰马鹿、甘肃马鹿、东北马鹿聚成一类,阿尔泰马鹿、塔河马鹿、东北马鹿聚成一类,塔河马鹿、甘肃马鹿与其他马鹿之间可能存在基因交流。     

不同品种绵羊TGF-β1基因单核苷酸多态性及其与繁殖力关系的研究

以小尾寒羊、滩羊、同羊、欧拉羊共计196头为研究材料，采用PCR—SSCP技术，对绵羊TGF-β1基因6-7外显子区间内的805bp序列进行多态性分析，发现了一个多态位点。经克隆测序分析发现，第6内含子区内存在一个突变，该突变位点为第7外显子上游的第294位碱基处缺失了AGAC（序列：gi76871756中的14201位）。对不同绵羊群的基因型和等位基因频率统计结果表明，多胎品种小尾寒羊以AB基因型为主。x^2检验结果表明，单胎品种滩羊、同羊、欧拉羊以BB基因型为主，所有品种都处于Hardy-Weinberg平衡状态。     

不同绵羊群体间心脏型脂肪酸结合蛋白基因第2外显子单核苷酸多态性的研究

以东北细毛羊、小尾寒羊、杜泊和道赛特4个群体为研究对象,采用PCR-SSCP方法对心脏型脂肪酸结合蛋白(heart fatty acid binding protein,H-FABP)基因第2外显子单核苷酸多态性进行检测。结果发现,H-FABP基因第2外显子存在939(A/G)、980(G/A)、1013(A/C)和1018(T/C)4个SNP位点,表现出AA、AB、BB 3种基因型;在东北细毛羊、小尾寒羊和杜泊群体中,BB型为优势基因型,在道赛特群体中,AB型为优势基因型;经χ²检验后,4个绵羊品种群体的基因频率和基因型频率均处于Hardy-Weinberg平衡状态;群体遗传多态性分析结果表明,东北细毛羊、杜泊和道赛特3个群体中的多态信息含量(PIC)均处于0.25和0.50之间,为中度多态,小尾寒羊为低度多态(PIC＜0.25);进一步分析结果表明,各个群体存在不同程度的遗传变异。     

4个绵羊品种LHCGR基因单核苷酸多态性分析

为探究绵羊LHCGR基因在4个绵羊品种之间的多态性与基因功能,本研究以杜泊羊、滩羊、小尾寒羊、滩羊和小尾寒羊杂交羊4个绵羊品种为研究对象,利用Sequenom MassARRAYSNP技术对4个绵羊品种LHCGR基因g.75747421A>C、g.75748200T>A 2个位点进行检测,并利用相关生物信息学软件预测分析2个位点突变前后mRNA二级结构与其编码蛋白的理化性质、结构和蛋白互作等。结果表明,LHCGR基因g.75747421A>C位点在4个品种中存在3种基因型,分别是CC、CA和AA;g.75748200T>A位点在4个品种中存在AA、AT和TT 3种基因型;χ²适合性检验表明,g.75747421A>C、g.75748200T>A 2个位点在4个绵羊品种中均处于Hardy-Weinberg平衡状态（P>0.05）。生物信息学分析表明,该基因编码蛋白的相对分子质量为73 599.70,理论等电点为8.30,脂肪系数为98.90,总平均亲水性为0.191,推测该蛋白为疏水性蛋白;突变前后LHCGR基因的mRNA二级结构、编码蛋白二级结构及三级结构均发生了变化;蛋白互作的结果表明,与LHCGR蛋白相互作用的蛋白质主要包括骨形态发生蛋白15（BMP15）、嗜铬粒蛋白A （CGA）、甲羟戊酸激酶（MVK）、胆固醇侧链裂解酶（CYP11A1）、鸟嘌呤核苷酸结合蛋白α亚基（GNAS）等。本研究成功筛选出4个绵羊品种LHCGR基因多态位点,为绵羊繁殖力的标记辅助选择和育种提供一定的理论依据。     

秦川牛Y染色体多态性与精液品质,体尺及外貌特征关系的探讨

在秦川牛品种中，Ｙ染色体具有多态性，即中或亚中及近端着丝点Ｙ染色体。对不同类型Ｙ染色体公牛的精液品质，体尺及外貌特征进行了统计分析。结果表明，Ｙ染色体多态性与精液品质，体尺及外貌特征不存在一定的相关关系。并对其意义和原因进行了讨论。     

单核苷酸多态性的研究进展

染色体的某个位点上存在单个碱基的变化 ,称为单核苷酸多态性 ,即SNP。SNP是继限制性片段长度多态性和微卫星多态性以后 ,近年来出现的第三代遗传标记 ,广泛用于基因定位、克隆和遗传多样性研究。本文综合介绍了单核苷酸多态性的遗传特性、功能、研究意义及其在畜牧业中的应用     

绵羊心脏脂肪酸结合蛋白基因单核苷酸多态性分析

试验旨在探讨心脏脂肪酸结合蛋白（heart fatty acid-binding protein,H-FABP）基因在绵羊中的遗传多态性,并寻找可用于辅助选择的分子标记。本研究以滩羊（250只）及滩羊×湖羊杂交F1代（174只）为试验动物,利用SNaPshot分型技术对H-FABP基因（GenBank登录号：AY157617）的多态位点进行单核苷酸多态性（SNP）分析,统计基因频率和基因型频率,进行Hardy-Weinberg平衡性检测,计算期望杂合度（He）、多态信息含量（PIC）和有效等位基因数（Ne）等遗传多态指标,分析候选基因不同基因型与体重、体长、体高、胸围、胸深、胸宽和管围等生长性状的关联性。结果显示：①检测到9个多态位点：939[A/G]、980[G/A]、1018[T/C]、2878[C/T]、2956[C/T]、3017[G/A]、3341[G/C]、3394[T/A]、1056[-/G],其中有6处转换、2处颠换、1处单碱基插入。②939[A/G]、980[G/A]、2956[C/T]、3341[G/C]、3394[T/A]和1018[T/C]的He为0.3200~0.4666,PIC为0.2688~0.3577;2878[C/T]、3017[G/A]位点的He为0.0283~0.1272,PIC为0.0279~0.1191,为低度多态;1056[-/G]位点的He在滩羊、滩羊×湖羊杂交F1代群体中分别为0.0120和0,PIC在滩羊、滩羊×湖羊杂交F1代群体中分别为0.0119和0;9个多态位点在滩羊、滩羊×湖羊杂交F1代群体中均符合Hardy-Weinberg平衡定律。③5个多态位点：939[A/G]、980[G/A]、2956[C/T]、3341[G/C]、3394[T/A]处于紧密连锁（D'>0.99）,将H-FABP基因分为3个单倍型：AA、AB和BB。④在41只滩羊×湖羊杂交F1代羊中,BB单倍型在各生产性状上具有最大值,但各单倍型间差异不显著（P>0.05）。结果表明,绵羊H-FABP基因具有丰富的遗传多态性,939[A/G]、980[G/A]、2956[C/T]、3341[G/C]、3394[T/A]5个位点紧密连锁,BB单倍型可能是与绵羊生产性状相关的优势单倍型。     

凉山半细毛羊、山谷型藏绵羊染色体畸变研究

以凉山半细毛羊、山谷型藏绵羊为研究对象,以微量全血培养法制备染色体,经对大量分裂相的分析结果表明：凉山半细毛羊、山谷型藏绵羊二倍体细胞核型均为公羊2n=54,XY,母羊2n=54,XX;两品种羊染色体数目变异频率分别为33.00%,32.25%;结构变异频率分别为12.00%,17.60%,染色体结构变异主要表现为染色体断裂、染色单体臂断裂及着丝粒处变异等;将染色体或染色单体断裂位点与Ag-NORs特殊位点作比较发现部分位点间存在一一对应情况;同源染色体不等长现象在两品种羊中均有发现,且凉山半细毛羊较山谷型藏绵羊明显。