五指山猪小群体遗传学检测

本研究利用26个微卫星基因座对中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所保种场的五指山猪小群体58个样本进行了遗传学检测,用非变性(中性)聚丙烯酰胺凝胶电泳检测微卫星的PCR扩增产物,统计了群体平均基因纯合率、等位基因数,利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)。统计结果:全群平均基因纯合率为66.5%;平均多态信息含量、平均观测杂合度为、平均期望杂合度分别为0.807、0.338、0.835;每个位点平均等位基因数为11.92,此结果说明该群体虽然近交程度较高,但仍具有丰富的遗传多样性,遗传变异较大。     

五指山猪小群体遗传学检测

本研究利用26个微卫星基因座对中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所保种场的五指山猪小群体58个样本进行了遗传学检测,用非变性(中性)聚丙烯酰胺凝胶电泳检测微卫星的PCR扩增产物,统计了群体平均基因纯合率、等位基因数,利用等位基因频率计算出各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC).统计结果:全群平均基因纯合率为66.5%;平均多态信息含量、平均观测杂合度为、平均期望杂合度分别为0.807、0.338、0.835;每个位点平均等位基因数为11.92,此结果说明该群体虽然近交程度较高,但仍具有丰富的遗传多样性,遗传变异较大.     

近交系五指山小型猪泌尿系统的解剖学研究

采用大体解剖学方法对近交系五指山小型猪泌尿系统的解剖学结构特点进行观察研究，发现近交系五指山小型猪泌尿器官的大体形态和位置与人及其它小型猪的基本相似。从解剖学角度来看，成年近交系五指山小型猪肾脏更适合于异种肾移植，为比较医学和临床上异种肾移植提供形态学资料。     

近交系五指山小型猪消化器官的解剖学研究

本研究采用大体解剖学的方法观察了近交系五指山小型猪消化器官的解剖学特征，并对其消化器官的解剖学常数进行测量。结果显示：4月龄较2月龄五指山小型猪近交系部分消化器官的解剖学数据与人的更相似，小肠、大肠和胰腺的形态与人存在较大差异。表明4月龄五指山小型猪近交系部分消化器官比2月龄更适合用于异种移植，但其中一些器官在形态学上不适合整个器官的移植，可能适用于细胞的移植。本试验为比较医学和异种器官移植的研究提供基础资料。     

近交系五指山小型猪心脏的解剖学研究

利用大体解剖学方法对20头不同月龄近交系五指山小型猪心脏的解剖特点进行细致观察并测量，获得了心脏的有关解剖数据。结果表明：2和4月龄近交系五指山小型猪心脏的大体形态、腔室划分和内部结构是相同的，而且与人的基本一致，但心脏的大小和某些解剖学常数与成年人有明显差异，心基部各血管的直径与其它地方猪种和人的相比也有明显不同。本研究通过对心脏的解剖，为近交系五指山小型猪用于比较医学和临床器官移植提供了基础资料。     

剖腹产获取SPF五指山小型猪

为获得SPF五指山小型猪,本研究选择8头背景较好的五指山小型猪配种,在孕期(111±2)d采用剖腹产的方法取出整个子宫,迅速将子宫消毒后在隔离器中取出胎儿,立即进行复苏、断脐、打耳号、称重、断齿等处理。仔猪在隔离器中人工哺乳1²个月,然后转移进屏障环境饲养。对净化小型猪的18种主要病原进行检测。结果,手术共获得存活仔猪55头,仔猪存活率90.2%。18种主要病原检测结果全为阴性。本研究成功获得了SPF五指山小型猪,为进一步繁育建立SPF猪种群奠定了基础。     

荣昌猪和两种小型猪遗传背景的微卫星分析

荣昌猪是我国优良地方品种,巴马香猪和贵州小型香猪为我国独特小型猪品系。本研究采用美国猪基因组协作计划推荐的19个微卫星标记对荣昌猪、荣昌猪B系、巴马香猪、贵州小型香猪及外来猪种大白猪进行了遗传学检测和分析。结果表明:19个微卫星位点在群体中均表现为多态,每位点等位基因数10~23个。5个猪种中荣昌猪B系的遗传多样性最高,荣昌猪次之;2种小型猪的遗传多样性较低,其中巴马香猪的等位基因数(121个)略大于贵州小型香猪(114个),但其遗传多样性指数(平均期望杂合度0.6535±0.0347)小于贵州小型香猪(0.6919±0.0227),反映了巴马香猪较低的基因杂合度和较小的遗传变异;大白猪的遗传多样性最低。从品系的共有等位基因来看,荣昌猪B系基因背景组成中其亲本品系荣昌猪所占比例(30.22%)要大于大白猪(24.37%);大白猪和其他4个猪群体的共享等位基因数均较低(21.24%~25.12%);巴马香猪和贵州小型香猪之间共有等位基因数最高(45.06%)。采用基于遗传距离的NJ法和基于基因频率的最大似然法进行系统聚类,除了大白猪明显为独立分支及荣昌猪B系表现出较远的聚类关系外,其他3个猪种间的聚类有所不同。     

微卫星DNA标记技术及其在猪近交系遗传检测中的应用前景

首先对家畜核基因组中DNA微卫星标记作了简要的介绍 ,包括微卫星标记的定义、结构、分布、组成、保守性、优点及丰富的多态性等。其次主要介绍微卫星DNA标记技术在猪近交系遗传检测方面的应用。微卫星标记出现以前 ,只能通过公式来简单的计算近交系数 ,现在通过微卫星标记技术结合PCR(聚合酶链式反应 )技术和聚丙烯酰胺凝胶电泳技术 ,可以计算出近交系猪的等位基因频率 ,进一步得到它的多态信息含量。从而可以从分子水平上真正验证近交系猪的基因纯合度及同基因性 ,在转基因研究、异体器官移植和其实验动物化等方面奠定了坚实的遗传学基础     

国内小型猪的代表——五指山猪

五指山作为海南省第一高山，是海南岛的象征，被国际旅游组织列为A级旅游点，峰峦叠起呈锯齿状，形似五指，因此得名。自古以来，五指山就受到文人墨客的垂青，留下许多脍炙人口的诗篇。提到五指山．有人会联想到神化故事中的情节，有人会想到它是国家的旅游胜地，同样五指山猪作为我国特有的小型猪，也被诸多的畜牧工作者誉为优秀的地方品种。     

利用微卫星标记对中国4种小型猪的遗传多样性研究

本研究通过10个微卫星位点对我国特有的4个小型猪种（五指山猪、滇南小耳猪、贵州小型香猪、巴马香猪）进行了遗传学检测，结果表明：除S0003位点表现为单态外，其它9个位点均为高度或中度多态位点；4个小型猪种群体内的遗传多样性比较高，平均基因杂合度分别为0.7165，0.6611，0.6602，0.5990；多态信息含量在0.5774－0.6871之间；五指山猪与贵州小型香猪的遗传距离较近，与滇南小耳猪次之，它们与巴马香猪都较远。     

丝羽乌骨鸡群体遗传结构的微卫星标记分析

用9对微卫星引物对170只丝羽乌骨鸡的基因组DNA进行扩增,结果表明,9个微卫星标记在该品系中都表现出了丰富的多态性,所有扩增结果都能重复.微卫星标记平均每个座位检测到4.56个等位基因(3-7个).9对微卫星引物平均多态信息含量为0.6072,标记平均杂合度为0.7423.本研究的结果可以为进一步利用微卫星进行丝羽乌骨鸡种质特性等研究提供一定的参考.     

丝羽乌骨鸡群体遗传结构的微卫星标记分析

用 9对微卫星引物对 170只丝羽乌骨鸡的基因组DNA进行扩增 ,结果表明 ,9个微卫星标记在该品系中都表现出了丰富的多态性 ,所有扩增结果都能重复。微卫星标记平均每个座位检测到 4 .5 6个等位基因 (3～ 7个 )。 9对微卫星引物平均多态信息含量为 0 .6 0 72 ,标记平均杂合度为 0 .74 2 3。本研究的结果可以为进一步利用微卫星进行丝羽乌骨鸡种质特性等研究提供一定的参考     

10个云南地方猪种微卫星遗传多样性分析

为阐明保山猪、迪庆藏猪、高贡黎山猪、丽江猪、明光小耳猪、滇南小耳猪、撒坝猪、大河猪、昭通猪、大河乌猪10个云南省优良地方猪种的群体遗传多样性和遗传结构,本试验参考ArkDB数据库中家猪14条染色体上的15对微卫星引物,对549个云南地方猪个体的耳组织样品进行了检测分析,计算各微卫星座位等位基因数（Na）、有效等位基因数（Ne）、Shannon's信息指数（I）、表观杂合度（Ho）、期望杂合度（He）、F-统计量（Fis、Fit、Fst）、基因流（Nm）、群体遗传距离等相关参数及多态信息含量（PIC）,采用NTsys 2.10软件构建聚类树,并采用STRUCTRUE 2.3.3软件评估群体遗传结构。结果显示：15个微卫星座位共检测到293个等位基因,各座位等位基因数在5~38个之间,平均等位基因数为19个,平均有效等位基因数8.3682个;10个云南地方猪群体的Shannon多样性、表观杂合度、期望杂合度和多态信息含量分别在1.4374~2.0317、0.6389~0.7756、0.7021~0.8281和0.6647~0.7993之间。各座位单个群体内近交系数（Fis）、总群体近交系数（Fit）、群体间遗传分化系数（Fst）的变化范围分别为-0.0678~0.4594、0.0618~0.5567和0.0713~0.1801;群体间Fst平均值为0.1101,处于中度遗传分化状态,有11.01%的遗传变异来自于群体间,大部分遗传变异来自于群体内;每个座位基因流程度较高,变化范围在1.6392~3.2551之间,平均值为2.0214。基于Nei氏遗传距离构建UPGMA系统发生树显示,高黎贡山猪与迪庆藏猪聚为一支,并与丽江猪、保山猪和明光小耳猪聚为一大支,其结果得到了STRUCTURE分析的验证。综上所述,10个云南地方猪种遗传多样性丰富,群体内有近交现象,群体间处于中度遗传分化,存在着一定的基因交流。     

Complete Mitochondrial DNA D-Loop Sequence and Genetic Diversity of Wuzhishan Pig

In order to research the genetic diversity and phylogenies of Wuzhishan pig, 56 complete mtDNA D-Loop were analyzed.55 sequences were amplified by polymerase chain reaction (PCR) and 1 sequence was downloaded from GenBank.The results showed that repetitive sequence "TTATAAAACAC" appeared in the conservative regions of 21 mtDNA D-Loop sequences.13 haplotypes and 14 variable sites were observed in 56 sequences.Haplotype diversity and nucleotide diversity (Hd =0.838 and Pi=0.00334) indicated that Wuzhishan pig had high genetic diversity.Two branches in the phylogenetic tree and Network analysis diagram indicated that there were two maternal origins in Wuzhishan pig.The phylogenetic tree of Wuzhishan pig and other 23 species showed that Wuzhishan pig had close genetic relationship with the pig breeds in the south region of the Yangtze river.     

探讨微卫星作为地方山羊品种生长性状的遗传标记

采用微卫星技术及最小二乘拟合线性模型，利用崂山奶山羊、济宁青山羊、鲁北白山羊和莱芜黑山羊4个地方山羊品种中的10个多态性微卫星基因座，分析了微卫星基因座及其等位基因对山羊生长性状的关联效应。结果表明：与品种、性别和年龄等因子比较，标记因子对山羊体重和体尺性状的影响较小，但发现BM6404、BM1818、BM812和BM6444基因座对体重有显著影响（P〈0．05或P〈0．01），BM6404、BM1818、BMS12484、MAF70基因座对主要体尺性状有显著影响（P〈0．05或P〈O．01）。BM6404基因座的等位基因130可能对山羊的胸围、体高、尻宽均有正效应；120对胸围有较强的负效应，而对体高、尻长则有较强的正效应；168对尻长、尻宽均表现为负效应。MAF70基因座的等位基因142对体长有正效应，178对体长有负效应。BMS1248基因座的等位基因128对管围有正效应。     

应用21个微卫星标记监测马身猪遗传多样性变化趋势

本研究旨在通过对不同年份马身猪群体遗传多样性变化趋势分析,评价马身猪保种效果,制定有效的保种措施。选用FAO-ISAG联合推荐的21个微卫星标记分析不同年份马身猪群体的遗传多样性。结果表明,在马身猪群体中,共检测到105个等位基因,平均等位基因数为5个,平均有效等位基因数为2.244 0,平均观察杂合度和PIC分别为0.317 6和0.391 9。从1999年到2007年,平均等位基因数从4.285 7下降到3.428 6,平均有效等位基因数从2.509 5下降到1.977 0,平均观察杂合度从0.311 6下降到0.298 1,平均多态信息含量从0.441下降到0.341。马身猪群体基因纯度较高,遗传多样性有逐年降低趋势,在今后的保种和利用工作中,应对马身猪群体的遗传多样性进行实时监测,在世代更替中注意低频率等位基因的保护。     

五指山猪线粒体控制区序列分析及遗传多样性研究

为了研究五指山猪遗传多样性和系统地位,本研究采用PCR产物直接测序法得到55条五指山猪线粒体控制区(mtDNA D-Loop)全序列,并结合GenBank中发表的1条五指山猪mtDNA D-Loop全序列进行结构分析、遗传多样性研究及系统发育分析。结果发现,56条序列中出现21次保守区变异,即"TTATAAAACAC"序列重复,共定义13个单倍型,发现14个变异位点,单倍型多样度(Hd)和核苷酸多样度(Pi)分别为0.838和0.00334,表明五指山猪遗传多样性较丰富。五指山猪线粒体控制区序列构建的系统发育树和Network网络分析呈现两大分支,推测有两个母系起源,且与GenBank中其他23个猪种的聚类结果表明,五指山猪与长江流域以南地区的猪种有着较近的亲缘关系。