龙陵黄山羊屠宰性能及肉质研究

 对不同月龄的龙陵黄山羊进行了胴体和肉质理化特性的分析测定,结果得出,8月龄和18月龄龙陵黄山羊屠宰率和净肉率分别为45.52%±3.49,32.62%±0.64和48.51%±1.72,37.51%±0.52,显示出良好的胴体品质.不同月龄间羊肉的水分、干物质、肌间脂肪含量和肉色差异显着(P<0.05).背最长肌肌纤维直径分别为57.12μm和62.87μm.蛋白质中赖氨酸和组氨酸的含量丰富,8月龄占羊肉蛋白质7.73%±0.51和2.56%±0.29,18月龄占羊肉蛋白质8.16%±0.38和2.85%±0.12均高于理想蛋白中的含量.     

云南龙陵黄山羊线粒体DNA限制性酶切分析

 采用碱性变性法提取来自于龙陵县不同地区的18只黄山羊个体的线粒体DNA(mtDNA),并用ApaⅠ,AvaⅠ,BamHⅠ,BclⅠ,BglⅠ,BglⅡ,ClaⅠ,DraⅠ,EcoRⅠ,EcoRⅤ,HaeⅠ,HindⅢ,KpnⅠ,PstⅠ,PvuⅡ,SacⅠ,SalⅠ,SmaⅠ,StuⅠ和XhoⅠ等20种限制性内切酶进行酶切分析.结果发现龙陵黄山羊线粒体DNA的分子量大小约为15.8Kb;不同酶的酶切位点分别为:DraⅠ有7个酶切位点,AvaⅡ有6个酶切位点,EcoRⅤ和StuⅠ共有5个酶切位点,HindⅢ和HeaⅡ有4个酶切位点,BamHⅠ,BglⅡ,PstⅠ和PvuⅡ有3个酶切位点,ApaⅠ,ClaⅠ有2个酶切位点,其余有1个酶切位点.     

龙陵黄山羊羔羊的屠宰性能及肉质理化特性研究

对白天放牧,晚上补饲的6月龄龙陵黄山羊羔羊的屠宰特性及肉质理化特性进行研究。11头龙陵黄山羊用于本试验,所有试验山羊14日龄去势,90日龄断奶。断奶后采用"白天放牧、晚上补饲"的半放牧饲养方式,补充饲料粗蛋白18.5%,代谢能12.5 M J/kg。饲养至6月龄屠宰,测定屠宰性能和背最长肌理化特性。屠宰性能试验结果显示,宰前活重、胴体重、净肉重、屠宰率和净肉率分别为18.5 kg,8.8 kg,6.03 kg,47.51%和32.38%。背最长肌理化特性结果显示,粗水分、粗蛋白、粗脂肪、粗灰分的百分含量和pH值分别为78.04%,18.67%,1.81%,1.02%和6.86。试验结果显示,6月龄龙陵黄山羊羔羊具有较高的屠宰率和良好的产肉性能,肉质的各项理化指标均在正常范围内。     

成年龙陵黄山羊的屠宰性能及肉质理化特性研究

对白天放牧,晚上补饲的24月龄成年龙陵黄山羊的屠宰性能及肉质理化特性进行研究。6头龙陵黄山羊用于试验,所有试验山羊14日龄去势,90日龄断奶。断奶后采用"白天放牧、晚上补饲"的半放牧饲养方式,补充饲料粗蛋白18.5%,代谢能12.5 MJ/kg。饲养至24月龄屠宰,测定屠宰性能和背最长肌理化特性。屠宰性能试验结果显示,宰前活重、胴体重、净肉重、屠宰率和净肉率分别为38.13 kg,21.15 kg,15.67 kg,55.46%和41.10%。背最长肌的理化特性结果显示,粗水分、粗蛋白、粗脂肪、粗灰分的百分含量和pH值分别为75.04%,20.99%,2.86%,0.97%,6.42。试验结果显示,成年龙陵黄山羊在较大月龄(24月龄)有较高的产肉量,肉质的各项理化指标均在正常范围内。     

龙陵黄山羊羔羊的屠宰性能及肉质理化特性研究*

 对白天放牧,晚上补饲的6月龄龙陵黄山羊羔羊的屠宰特性及肉质理化特性进行研究。11头龙陵黄山羊用于本试验,所有试验山羊14日龄去势,90日龄断奶。断奶后采用“白天放牧、晚上补饲”的半放牧饲养方式,补充饲料粗蛋白18.5%,代谢能12.5MJ/kg。饲养至6月龄屠宰,测定屠宰性能和背最长肌理化特性。屠宰性能试验结果显示,宰前活重、胴体重、净肉重、屠宰率和净肉率分别为18.5kg,8.8kg,6.03kg,47.51%和32.38%。背最长肌理化特性结果显示,粗水分、粗蛋白、粗脂肪、粗灰分的百分含量和pH值分别为78.04%,18.67%,1.81%,1.02%和6.86。试验结果显示,6月龄龙陵黄山羊羔羊具有较高的屠宰率和良好的产肉性能,肉质的各项理化指标均在正常范围内。     

成年龙陵黄山羊的屠宰性能及肉质理化特性研究*

 对白天放牧,晚上补饲的24月龄成年龙陵黄山羊的屠宰性能及肉质理化特性进行研究。6头龙陵黄山羊用于试验,所有试验山羊14日龄去势,90日龄断奶。断奶后采用“白天放牧、晚上补饲”的半放牧饲养方式,补充饲料粗蛋白18.5%,代谢能12.5 MJ/kg。饲养至24月龄屠宰,测定屠宰性能和背最长肌理化特性。屠宰性能试验结果显示,宰前活重、胴体重、净肉重、屠宰率和净肉率分别为38.13 kg,21.15 kg,15.67 kg,55.46％和41.10％。背最长肌的理化特性结果显示,粗水分、粗蛋白、粗脂肪、粗灰分的百分含量和pH值分别为75.04％,20.99％,2.86％,0.97％,6.42。试验结果显示,成年龙陵黄山羊在较大月龄（24月龄）有较高的产肉量,肉质的各项理化指标均在正常范围内。     

云南龙陵黄山羊的核型及C－带和Ag－NORs研究

 采用外周血淋巴细胞培养及染色体分带技术,分析了龙陵黄山羊的核型,C-带和银染核仁组织区(Ag-NOR_s),结果表明:龙陵黄山羊染色体数为2n=60,常染色体及X染色体为端部着丝粒染色体,Y染色体最小,为中部着丝粒染色体。常染色体着丝粒区均显示C-带,性染色体未显C-带。雌性银染核仁组织区(Ag-NOR_s)分布于No.1,2,3,4,5,25号染色体,雄性分布于No.1,2,25号染色体,显示了性别及分布多态性。研究还发现三种不同的联合(ASSOCIATION)。     

云南龙陵黄山羊的核型及C－带和Ag－NOR_s研究

采用外周血淋巴细胞培养及染色体分带技术，分析了龙陵黄山羊的核型，Ｃ—带和银染核仁组织区（Ａｇ—ＮＯＲ＿ｓ），结果表明：龙陵黄山羊染色体数为２ｎ＝６０，常染色体及Ｘ染色体为端部着丝粒染色体，Ｙ染色体最小，为中部着丝粒染色体。常染色体着丝粒区均显示Ｃ—带，性染色体未显Ｃ—带．雌性银染核仁组织区（Ａｇ—ＮＯＲ＿ｓ）分布于Ｎｏ．１，２，３，４，５，２５号染色体，雄性分布于Ｎｏ．１，２，２５号染色体，显示了性别及分布多态性。研究还发现三种不同的联合（ＡＳＳＯＣＩＡＴＩＯＮ）。     

基于转录组测序对小麦抗叶锈性相关基因的筛选与分析

为了探明小麦‘TcLr19’抵抗小麦叶锈菌侵染的内在分子机制,挖掘与抗叶锈菌密切相关的功能基因,对接种叶锈菌后的小麦材料‘TcLr19’进行Illumina NextSeq500转录组测序。筛选到差异表达的基因(Differential expressiongenes,DEGs)8970个,其中上调差异表达基因4953个,下调差异表达基因4017个。差异基因通过GO(Gene Ontology)功能分类和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Gene and Genomes)Pathway富集分析,被归于1 790个GO类别,定位到84个代谢通路中。采用实时荧光定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)对转录组分析结果进行验证,结果表明,qRT-PCR与RNA-seq分析结果基本一致,为小麦TcLr19抗小麦叶锈菌新基因的挖掘提供了可靠的参考资料。     

龙陵黄山羊引种改良试验示范

石屏县山羊品种由于高度近亲和乱交配,品种严重退化,体格变小.石屏县山区有广阔的草场和一定的畜牧养殖基础,怎样利用草场优势,改良山羊品种,是山区人民脱贫致富的一条捷径.实践证明:只要加大山区科技示范力度,依靠和利用当地资源,用新的科学技术去发展畜牧业,必将是一项大有希望、大有作为的事业.     

利用转录组测序开发甘蔗SNP分子标记

【目的】利用转录组测序开发甘蔗SNP分子标记,为甘蔗建立一种高效和低成本的分子标记开发方法。【方法】以40个甘蔗栽培品种为试验材料,使用高通量测序平台获得其转录组数据,经质控后将其匹配到参考基因组,然后使用GATK软件检测和过滤SNP分子标记,并使用snpEff对SNP进行注释及统计分析。利用这些SNP分子标记进行系统发生分析、主成分分析和群体结构分析。最后,开发KASP标记并随机验证其有效性。【结果】转录组数据经质控后平均每个样本获得6.5 Gb的序列。通过变异分析和多重过滤筛选后,共获得220397个注释到染色体上的双等位基因SNP位点,平均密度为3 SNP/kb。SNP类型及分布特征分析结果表明,编码区错义突变与沉默突变的比值（N/S）为1.05,转换类型和颠换类型的比值（Ts/Tv）为1.89,杂合SNP占38.66%～49.91%,位于转录本的SNP比例为44.74%。系统发生分析、主成分分析和群体结构分析结果均表明,甘蔗栽培品种遗传来源较为单一,但群体分化较大。开发了11176个KASP分子标记,并随机合成25组KASP引物进行多态性验证,共有23组（92%）引物能检测到扩...     

贵州本地山羊POLRMT 基因启动子区 SNP 的生物信息学分析

为给贵州本地山羊肉质品质选育工作提供更好的科学依据,以贵州白山羊、贵州黑山羊及黔北麻羊为 试验对象,探究肉质相关基因POLRMT 启动子区SNP 位点对肉质品质的影响。通过构建DNA 池筛选出SNP 位点, 并采用多种生物信息学软件预测核心启动子范围、CpG 岛及转录因子。结果表明,POLRMT 基因启动子区存在2 个 SNP 位点,分别为T-81A、T-289C。POLRMT 基因核心启动子范围发生改变,SNP 位点导致部分转录因子结合位点消 失,MethPrimer预测到CpG 岛增加1 个。     

基于柿雌雄花芽转录组测序的SSR和SNP多态性分析

为深入开发柿SSR和SNP分子标记,进而推动柿品种鉴定和遗传多样性等研究,以‘禅寺丸’柿的雌雄花芽转录组序列为基础,对SSR和SNP位点进行发掘。结果表明:转录组测序获得了154 741条unigene,其中有38.49%unigene在数据库中得到注释。利用MISA软件进行SSR位点的搜索,共得到44 304个SSR,包含83种重复基元,其中以A/T类型为主的单核苷酸重复所占的比例最高(20 006个,占47.63%),其次是以AG/CT类型为主的二核苷酸重复(16 055个,占38.23%),再次是以AAG/CTT类型为主的三核苷酸重复(5 402个,占12.87%)和以AAAG/CTTT类型为主的四核苷酸重复(500个,占1.19%)。在转录组得到的unigene中共发现SNP 405 685个,发生频率为1/253bp。6种单核苷酸变异中,转换类型发生频率显著高于颠换类型,转换类型中的C/T(31.51%)和A/G(31.41%)发生频率最高,在颠换类型中A/T发生频率最高。柿SSR和SNP的位点是非常丰富的,可为柿遗传图谱构建、遗传多样性和亲缘关系研究提供丰富的基础数据信息。     

南江黄羊与贵州白山羊杂交改良试验

试验选取铜仁职业技术学院养殖场购入的南江黄羊作为父本,生产母本为本地饲养的贵州白山羊。测试羊50只,体型外貌、生产性能基本一致,发育整齐,健康无病,年龄为2~4岁,分成试验组(南江黄羊×贵州白山羊)和对照组(贵州白山羊×贵州白山羊),平均每组25只能繁殖母羊。主要观测两组羊后代的体型外貌、繁殖性能和初生、断奶(2月龄)、4月龄、6月龄、周岁(12月龄)体重及体长、体高、胸围等主要生产性能、经济效益指标。试验结果表明,试验组黄本杂羊F1代体型趋向父本,表现出良好的杂交优势和适应性,具有生长快、产肉性能好、耐粗放牧、合群易管理等特点。     

奶牛与肉牛不同生长发育阶段肝脏转录组比较分析

为探究奶牛与肉牛肝脏组织在不同生长发育阶段中的差异,利用RNA-seq技术和生物信息学的研究方法,分别对海福特肉牛与荷斯坦奶牛6、9和12月龄3个不同生长发育阶段的肝脏组织进行基因差异表达及表达趋势分析。结果表明：1）海福特肉牛与荷斯坦奶牛之间在6、9和12月龄分别获得的差异表达基因为699、486和769个;2）对海福特肉牛与荷斯坦奶牛之间的差异表达基因进行功能注释,发现细胞色素P450信号通路和PPAR信号通路中差异表达基因的表达量在肉牛与奶牛之间存在差异,并且在不同生长阶段表达也不同。其中与脂肪细胞增殖和脂质代谢有关的功能基因：ACOX1、APOA1和ACADM,与天然免疫相关的通路中BoLA-DQB、BLA-DQB和BoLA-DQA这3个基因在海福特肉牛中的表达均高于荷斯坦奶牛;3)STEM分析结果显示荷斯坦奶牛与海福特肉牛肝脏组织在生长发育阶段中具有相同表达趋势中,奶牛与肉牛的时序性表达基因与代谢途径相关信号通路上存在差异。综上,本研究表明与脂质代谢和脂肪生成等代谢过程有关的途径可能在协同调控奶牛与肉牛生长发育阶段中发挥的作用及表达模式存在差异,这为深入研究奶牛与肉牛在生长发...     

不同体细胞数对新鲜羊奶干酪品质的影响

体细胞(Somatic Cell Counts,SCC)是衡量乳质量和奶牛健康状况的指标。乳中SCC增加引起乳成分的改变,进而影响凝乳。本试验根据体细胞数的不同得到LSCC、MSCC、HSCC3组新鲜羊奶,对3组原料乳生产的干酪的组成成分及其质构指标进行测定。试验结果表明,从干酪真实出品率来看,LSCC组>MSCC组>HSCC组;从干酪组成成分来看,HSCC组干酪的脂肪、蛋白质含量显著低于其他两组,但HSCC组干酪水分含量最高;从干酪质构指标来看,HSCC组干酪软而粘。     

2022 年 3 期目录

  目的  木棉是我国南方地区重要的观赏植物,研究不同时期花蕾和花朵的花瓣基因表达差异,揭示花色变异的遗传调控机制,为建立花色定向育种技术提供科学依据。  方法  以木棉不同发育时期深红色花和黄色花的花瓣为研究对象,利用Illumina HiSeqTM 4000开展转录组测序;分别采用DESeq2和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes（KEGG）数据库进行差异表达基因鉴定和通路富集分析。  结果  测序共获得75 190个单基因,4 772个单基因能被公共数据库注释;基因功能富集分析显示,基因主要富集在基本功能预测、信号转导机制和转录后修饰、蛋白折叠、分子伴侣等通路。共获得不同时期差异表达基因10 397个,显著富集在29个生物学通路,主要包括光合作用、代谢和植物激素信号转导通路等。其中,参与苯丙烷生物合成通路的差异表达基因有72个,参与类胡萝卜素、黄酮类生物合成通路和苯丙氨酸代谢通路的差异表达基因分别为25个,这些通路和基因均与花青素的生物合成相关;另有4个差异表达基因显著富集在甜菜碱的生物合成通路中。qRT-PCR数据验证了转录组数据的可靠性。  结论  （1）光合作用、代谢、植物激素信号转导、黄酮类生物合成、苯丙烷生物合成、苯丙氨酸代谢及能量代谢等通路相关基因可能参与花瓣的发育过程。（2）黄酮类生物合成通路相关基因在深红色花发育的花蕾中期与花朵期显著高表达,可能是花色呈现红色的主要原因。（3）类胡萝卜素生物合成通路的关键合成酶基因的部分家族成员在黄色花发育的花蕾期和花蕾中期显著高表达,可能是导致花色呈现黄色的主要原因。      

基于转录组测序的棘胸蛙SSR和SNP分子标记开发

【目的】基于转录组开发SSR和SNP分子标记用于评价棘胸蛙（Quasipaa spinosa）遗传多样性,为其种质资源的创新利用提供理论支撑。【方法】采用TRIzol试剂盒提取棘胸蛙肝脏、肌肉和肾脏组织总RNA,构建cDNA文库后利用Illumina HiSeq 2500测序平台进行高通量测序,通过MISA对棘胸蛙转录组测序数据进行SSR检索,并以SAMtools和VarScan v.2.2.7进行SNP查找。【结果】棘胸蛙转录组测序共获得93887条非冗余基因（Unigenes）,序列总长度达91352712 bp,且所有转录组Q30均超过95.00%。在93887条Unigenes中发现33019个SSRs,其中21966条Unigenes含有SSR,6688条Unigenes含有超过1个SSR;以单核苷酸重复型SSR数最多,达25788个,且出现频率最高（27.47%）。SSR的平均长度以四核苷酸重复型最长,达35.47 bp;棘胸蛙SSR以（A/T）n为绝对优势重复基元,占总SSR的65.51%,然后依次为（C/G）_n、（AT/AT）_n、（AC/GT）n、（AG/CT）_n、（AAT/ATT）_n、（AGG/CCT）_n,分别占总SSR的12.59%、5.66%、5.55%、3.31%、1.55%和1.30%。在33019个SSRs中,核苷酸重复次数主要集中在5~25次,占总SSR的99.91%,且大部分SSR位于非编码区,仅有1633个SSRs位于编码区;长度≥12 bp的SSR共计17244个,占总SSR的58.53%。挑选120对SSR引物进行引物有效性验证,发现有57对引物扩增出单一条带,且条带大小与预期结果一致。对棘胸蛙转录组序列进行SNP检索,共发现87634个SNPs,其中,56300个SNPs属于转换位点、31334个SNPs属于颠换位点,转化/颠换比达1.80,碱基的转换频率明显高于颠换频率。【结论】利用高通量转录组测序开发棘胸蛙SSR和SNP分子标记是一种切实可行的方法,能开发出通用性较高、数量较多、覆盖性较广的分子标记。棘胸蛙具有中度偏高的遗传多样性,可作为种质材料进一步开发利用。