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相似文献
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1.
苹果RAPD标记的引物筛选与RAPD校正   总被引:4,自引:0,他引:4       下载免费PDF全文
为筛选适宜苹果的RAPD引物,以苹果富士与舞姿的杂交后代为试材,依据RAPD校正方法、利用引物OPAl3构建了苹果的RAPD校正图谱;在520个RAPD引物中找出了扩增稳定、条带清晰的246个引物,其中扩增条带数在8个以上的有91个引物,可用于苹果的遗传分析。探讨了RAPD-PCR反应条件与RAPD校正的关系,RAPD校正能够提高RAPD-PCR的扩增能力。  相似文献   

2.
[目的]为快速和准确地对鹧鸪茶种质材料进行ISSR分析提供有效引物。[方法]基因组DNA的提取采用改良的CTAB法。利用99个ISSR引物,对来自海南岛境内的10个居群中共20份鹧鸪茶种质材料进行PCR扩增,以筛选出适合于所有鹧鸪茶种质材料进行ISSR分析的有效引物。[结果]从99条供试引物中共筛选出15条多态性丰富、条带清晰且可重复性良好的有效引物。用筛选出的15条引物对66份鹧鸪茶种质材料进行ISSR-PCR扩增,均可获得带型丰富和清晰可辨的DNA指纹图谱;共扩增出286条DNA谱带,其中231条为多态性带,占总扩增带数的80.77%,平均每个引物扩增出19.1条谱带。[结论]所筛选的15条引物可以有效地应用于鹧鸪茶种质资源材料的ISSR分析。  相似文献   

3.
桂花RAPD分析的引物筛选   总被引:1,自引:0,他引:1  
从桂花4个品种群(银桂品种群、金桂品种群、丹桂品种群和四季桂品种群)中选取8个桂花样品,用于桂花RAPD分析的引物筛选试验。从Operon公司的OP系统的AB、AC、AD、Y、Z5组共80个10碱基引物中筛选出20个扩增条带多且多态性好的引物,20个引物共扩增116条DNA条带,用100~3000bp的DNAmarker标记片断长度在200~2000bp,多态性条带有72条,多态性位点比率为62.0%。不同引物的扩增带数不同,最多的可扩增出8条DNA条带。  相似文献   

4.
鹧鸪茶种质资源ISSR分子标记中的引物筛选(摘要)   总被引:3,自引:0,他引:3  
[目的]为快速和准确地对鹧鸪茶种质材料进行ISSR分析提供有效引物。[方法]基因组DNA的提取采用改良的CTAB法:先用0.8%琼脂糖凝胶电泳检测DNA完整性,EB染色,以Lambda DNA/HindⅢ+Eco RIMarkers为参照,电泳结果用Gel Doc XR型凝胶成像分析系统下照相并记录。再用Biophotometer紫外分光光度计分别测定OD_(260)和OD_(280),并计算出OD_(260)/OD_(280)值,每份样品的OD_(260)/OD_(280)比值均要求在1.8~2.0范围内。测定每份样品DNA浓度(ng/μl),并将其稀释至20 ng/μl,分装后置-20℃保存。利用99个ISSR引物,对来自海南岛境内的10个居群中共20份鹧鸪茶种质材料进行PCR扩增,以筛选出适合于所有鹧鸪茶种质材料ISSR分析的有效引物。[结果]从99个供试引物中共筛选出15个多态性丰富、条带清晰且可重复性良好的有效引物。用筛选出的15个引物对66份鹧鸪茶种质材料进行ISSR-PCR扩增,均可获得带型丰富和清晰可辨的DNA指纹图谱;15个引物共扩增出286条DNA谱带,其中231条为多态性带,占总扩增带数的80.77%,平均每个引物扩增出19.1条谱带。[结论]所筛选的15条引物可以有效地应用于鹧鸪茶种质资源材料的ISSR分析。  相似文献   

5.
[目的]提取女贞不同种质材料的基因组DNA,并筛选RAPD引物。[方法]采用改良CTAB法提取女贞基因组DNA,并以此种方法提取的女贞基因组DNA为模板,对RAPD引物进行PCR扩增,筛选有效引物。[结果]筛选出21个多态性丰富、条带清晰且重复性好的有效引物,经检测所获得的基因组DNA条带清晰,且OD260/OD280在1.8左右。用筛选出的21个有效引物对126份女贞种质材料进行RAPD-PCR扩增,均可获得带型丰富且清晰可辨的DNA指纹图谱。[结论]该方法为快速和准确地应用RAPD方法分析女贞种质材料的遗传多样性提供了依据。  相似文献   

6.
分别采用酚-氯仿法和改进的盐析法对藏獒血液基因组DNA进行了提取,并对可用于藏獒RAPD分析的随机引物进行了筛选.结果表明,酚-氯仿法提取的藏獒血液基因组DNA在浓度和纯度上均显著高于改进的盐析法(P<0.05),并且通过筛选得到了27条可用于藏獒RAPD分析的随机引物.  相似文献   

7.
以产自山东省枣庄市的18个石榴品种叶片为材料,采用CTAB法提取各石榴品种基因组DNA,对所提取的DNA采用紫外分光光度计测定D260nm和D280nm,并计算D260nm/D280nm,分析DNA的浓度和纯度.结果表明D260nm/D280nm均接近于1.8,纯度较高,能用于RAPD-PCR扩增的模板.以5种遗传背景差异大的石榴品种的DNA为模板,筛选用于石榴RAPD扩增的多态性引物,结果表明,通过分析多态性位点,筛选出重复性好、条带清晰的3条多态性引物S66、S1304、S1440,其多态性位点比例较高,分别为75.0%、60.9%、63.6%.  相似文献   

8.
山核桃基因组DNA提取及RAPD引物筛选   总被引:4,自引:0,他引:4  
分别用SDS法、CTAB法、简易CTAB法及高盐低pH法提取山核桃干叶的基因组DNA并进行了检测比较.结果显示,SDS法更适合于山核桃基因组DNA的提取;对600条10碱基的随机引物进行了初筛和复筛,结果筛选出了20条扩增多态性强、稳定性好的引物,作为全部基因纽的扩增引物.  相似文献   

9.
[目的]提取女贞不同种质材料的基因组DNA,并筛选RAPD引物。[方法]采用改良CTAB法提取女贞基因组DNA,并以此种方法提取的女贞基因组DNA为模板,对RAPD引物进行PCR扩增,筛选有效引物。[结果]筛选出21个多态性丰富、条带清晰且重复性好的有效引物,经检测所获得的基因组DNA条带清晰,且OD260/DD280在1.8左右。用筛选出的21个有效引物对126份女贞种质材料进行RAPD—PCR扩增,均可获得带型丰富且清晰可辨的DNA指纹图谱。[结论]该方法为快速和准确地应用RAPD方法分析女贞种质材料的遗传多样性提供了依据。  相似文献   

10.
11.
[研究目的]RAPD技术已广泛用于种质资源遗传多样性研究,中国梨属植物资源丰富,通过对RAPD多态性引物的筛选,为RAPD技术在梨属种质资源中的应用提供参考;[方法]以梨属44个种和品种为试验材料,通过RAPD扩增技术,筛选RAPD多态性引物;[结果]从50个随机引物中筛选出18个多态性引物,所选出的多态性引物每个引物扩增出的条带数在4~11之间,扩增出的DNA片段分子量大多在450~2000 bp之间,共扩增出118个条带,其中样品间相同的条带数有11条,呈现多态性的条带107条,所选引物的多态百分率达90.8%.[结论]所筛选的18个引物为梨属植物RAPD扩增多态性引物,可广泛用于梨属植物的RAPD扩增技术.  相似文献   

12.
Discrimination of 24 wild tea germplasm resources ( Camellia sp. ) using RAPD markers was conducted. The result showed that RAPD markers were very effective tool and method in wild tea germplasm discrimination. There were 3 independent ways to discriminate tea germplasms, a) unique RAPD markers, b)specific band patterns and c) a combination of the band patterns or DNA fingerprinting provided by different primers. The presence of 16 unique RAPD markers and the absence of 3 unique markers obtained from 12 primers made it possible to discriminate 14 germplasms. Using the unique band patterns of primer OPO-13 could discriminate 10 tea germplasms. It was of much importance using minimum primers to obtain maximum discrimination capacity. All the 24 wild tea germplasms could be discriminated easily and entirely by the band patterns combination or DNA fingerprinting obtained from OPO-13, OPO-18, OPG-12 and OPA-13, including two wild tea trees of very similar morphological characteristics and chemical components.  相似文献   

13.
大花蕙兰种质资源亲缘关系的RAPD分析   总被引:2,自引:0,他引:2  
 【目的】从分子水平研究大花蕙兰品种资源之间的遗传亲缘关系,为大花蕙兰种质资源的保存和利用及其杂交亲本的选配提供依据。【方法】利用RAPD标记方法对来自日本、韩国、中国和美国的48个大花蕙兰品种和2个国产兰属原生种的种质资源亲缘关系进行了检测。【结果】从100个10碱基随机引物中筛选出20个多态性高的引物,共扩增出258条DNA带,其中253条为多态带(占98.1%),平均每个引物扩增多态性带12.6条。50份种质之间的相似系数变化范围为0.364~0.817,平均相似系数为0.581。基于RAPD的扩增结果建立的UPGMA亲缘关系聚类图,50份种质在相似系数0.592处被划分为5大类群。【结论】供试50份种质间的遗传亲缘关系与其来源地、花色、花枝类型和杂交系谱有一定的相关性。RAPD技术能很好的用于大花蕙兰品种亲缘关系的研究。  相似文献   

14.
 由于番茄的遗传背景非常狭窄,实验采用两轮引物筛选,利用27个具有代表性的番茄供试材料,从200个引物中筛选出36个PCR扩增效果多态性丰富的引物,克服了以前一些引物在3~4个材料中具有多态性,但它们在用于大量材料的扩增中多态性差的缺点,为RAPD分子标记技术在番茄遗传研究中的广泛应用奠定了基础。  相似文献   

15.
The random amplified polymorphic DNA (RAPD) marker was assessed to detect the genetic relationships among 48 hybrid Cymbidium cultivars from Japan, Korea, China, and USA, and 2 species of native Cymbidium. Twenty primers were screened from 100 random decamer primers, and a total of 258 DNA bands were amplified, 253 of which (98.1%) were polymorphic. The average number of polymorphic DNA bands amplified by each primer was 12.6. All cultivars were distinguishable when a number of primers were considered. Genetic similarities among the cultivars and species were estimated based on the amount of band sharing ranging from 0.364-0.817 with an average of 0.581. According to the data, a dendrogram of genetic relationship, which was constructed using the UPGMA method, showed that all the tested cultivars and native species were classified into five cluster groups with the similarity coefficient of 0.592. It revealed that the genetic relationships among tested accessions were to some extent related with their origin, flower colour, branch type, and genealogy. It further indicated that the RAPD technique is a useful tool for studying the genetic relationships among hybrid Cymbidium cultivars.  相似文献   

16.
[目的]筛选可用的SSR分子标记,加快椰子分子辅助育种进程。[方法]采用改良CTAB法提取椰子基因组DNA,以基因组DNA为模板,对36对SSR引物进行筛选,以条带清晰、多态性丰富为引物筛选原则。[结果]共筛选出7对具有多态性的引物,其中2对多态性较丰富,可用于后续SSR分子标记分析。[结论]该研究为开展椰子种质资源遗传多样性系统分析提供了SSR引物。  相似文献   

17.
RAPD标记在植物种质资源研究中的应用   总被引:6,自引:0,他引:6  
通过阐述PAPD标记的原理及其特点,综述了该技术在大田作物、蔬菜作物、果树、树木等的遗传多样性及物种进化、品种鉴定、分类等种质资源研究中的应用,并对其在应用过程中存在的问题进行了分析、提出了解决问题的方法。  相似文献   

18.
利用RAPD标记鉴定绿豆组植物种间亲缘关系   总被引:3,自引:2,他引:3  
利用RAPD分子标记技术,对56绿豆组品种(系)进行亲缘关系研究。在选用的45个随机引物中,均发现有不同的扩增产物,通过聚类分析将它们分成黑吉豆、野生绿豆和栽培绿豆3个种群。在栽培绿豆中又可分出印度抗豆象、巴基斯坦抗黄花叶病毒、中国Ⅰ组、中国Ⅱ组和亚蔬绿豆5个类型组。获得绿豆组3个豆种及其代表品种的独特标记,为今后食用豆种质资源鉴定与分类和遗传分析提供理论依据。  相似文献   

19.
桃花种质资源亲缘演化关系的研究——RAPD分析   总被引:6,自引:0,他引:6  
利用36 个10 碱基随机引物首次对7 个桃花( Prunus persica) 近缘种和30 个品种进行RAPD 反应.对选出10 个引物扩增出的具有多态性、可重复的、清晰的56 条带进行数据统计分析.UPGMA聚类结果表明:毛桃( Prunus persica) 和新疆桃( P. ferganensis) 之间具有很近的亲缘关系,并与桃花品种间亲缘关系最近;寿星桃、垂枝桃类品种在聚类图上分别较早地聚合在一起,表明其类内具有较近的亲缘关系;直枝桃类品种没有在树系图上聚合成一类,表明直枝桃花品种群演化关系较为复杂,多样性较丰富.该文还从分子生物学角度探讨了桃花品种的演化关系和‘白花山碧’桃的起源问题.  相似文献   

20.
[目的]对30份山茶属种质资源进行分类分析.[方法]利用RAPD分子标记技术研究30份山茶属种质资源的遗传多样性,并进行分类分析.[结果]17个RAPD引物共扩增出138条带,多态性条带为129条,多态性比率为93.5%,材料间的遗传相似系数(GS)变化范围为0.605 ~ 0.855.[结论]利用NTSYS软件对RAPD扩增结果进行聚类分析,可将30份资源分为5大类群,其分类结果与张宏达分类体系基本一致.  相似文献   

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