地方鸡种与隐性白羽鸡遗传变异的AFLP指纹

利用6对AFLP引物组合对我国12个地方鸡种和引进鸡种隐性白羽鸡进行了遗传检测,统计了每个引物组合在各个品种中检测到的多态性条带和特异性条带,计算了13个鸡种的遗传相似系数和遗传距离,并据此构建了UPGMA聚类关系图,分析了所研究鸡种的遗传关系.结果表明:6对AFLP引物组合在13个鸡种中共检测到290条多态性条带,平均每个引物组合产生48.3奈多态性标记,同时在每个品种群体中还检测到了数量不等的特异性条带,其中寿光鸡和东乡黑鸡最多,为9条,旧院黑鸡、兴义矮脚鸡和隐性白羽鸡最少,为1条.13个鸡种聚为4类,其中隐性白羽鸡单独聚为一类,鸡种间的遗传相似系数及聚类结果与各个鸡种的地理分布、现实状况相吻合,从而表明AFLP指纹用于我国地方鸡种的遗传多态性分析、品种鉴定及品种间亲缘关系分析是可行的.     

贵州地方鸡种与隐性白洛克鸡遗传多样性对比研究

本研究运用微卫星DNA标记技术对贵州12个地方鸡种(类群)和引进鸡种-隐性白洛克的等位基因、平均杂合度和多态信息含量等指标进行了对比分析研究,结果表明,贵州地方鸡种的遗传多样性较隐性白洛克高,遗传基础更为丰富,更适宜培育不同的新品种(类型),满足多样化的市场需求。     

浅析贵州地方鸡种饲养管理要点

本文主要介绍了贵州地方鸡种放养饲养的基本管理方法,在保留贵州地方鸡种特有肉质与风味的基础上,通过农村传统的放养方式与现代高效养鸡技术有机结合,根据贵州的地势地貌及资源优势(荒山、林地、果园、草地等),发展林下养殖循环经济,进行贵州地方鸡的规模化饲养,进而获得品质优良的禽、蛋产品。     

贵州地方猪BF基因遗传变异分析

本试验运用PCR和序列测定法对香猪、可乐猪、黔北黑猪3个贵州地方猪种共计95头猪进行BF基因检测及序列分析。3个品种猪群均在BF基因的第16外显子45 bp出检测出A→C的突变,命名为BF-exon 16-A45C,该突变产生了AA、AC、CC 3种基因型,并且致使编码氨基酸由谷氨酸(E)变为天冬氨酸(D)。3个品种猪群中等位基因频率分布不均匀,分别为:可乐猪(A:0.6667、C:0.3333),香猪(A:0.8788、C:0.1212),黔北黑猪(A:0.7812、C:0.2188)。经χ2适合性检验,只有可乐猪群体在该位点上达到了Hardy-Weinberg平衡,而香猪群体和黔北黑猪群体该位点偏离Hardy-Weinberg平衡。     

贵州地方鸡种——长顺绿壳蛋鸡

<正>长顺绿壳蛋鸡是贵州省特有的一个珍稀鸡种,属于蛋肉兼用型,以产绿壳蛋著称。1长顺绿壳蛋鸡的产区及自然条件1.1中心产区及分布区主产于贵州省黔南州长顺县南部鼓扬镇马场村、岩纳村、格道村一带,分布于相邻的交麻乡、中坝乡、营盘乡、种获乡、长寨镇和代化镇等6个乡镇。     

贵州地方鸡种体重生长曲线的拟合分析

为探究贵州省赤水乌骨鸡、黔东南小香鸡、乌蒙乌骨鸡、威宁鸡和贵州黄鸡这5个地方鸡种生长发育规律,采用Logistic、Gompertz和von Bertalanffy 3种非线性模型对5个地方鸡种的生长曲线进行拟合,选取5个品种鸡各60只,公母各30只,测定0、2、4、6、8、10、12、14、16、18周龄时的体重。结果：5个品种鸡的生长趋势一致,3个模型均能较好地拟合5个品种鸡的生长变化情况,拟合度均在0.98以上,其中von Bertalanffy模型对5个品种鸡的生长曲线拟合效果最好;同时期的鸡体重以贵州黄鸡最重,黔东南小香鸡最轻,赤水乌骨鸡、乌蒙乌骨鸡和威宁鸡相近;5个品种鸡的拐点周龄分别为9.2、7.9、7.3、8.9和8.4,拐点体重分别为870.71、509.18、708.29、834.35和945.52 g。通过拟合的生长曲线模型对鸡体重进行评估,可为贵州省地方鸡的科学饲养、品种资源利用及选育提供依据。     

贵州地方鸡种遗传资源特点及品种评价

本文介绍了贵州地方鸡种的来源、产区、优良特性、生产性能、保护及研究利用。分析评价了贵州地方鸡种目前存在的问题和面临的危机．提出了如何开发和利用贵州地方鸡种,为本地鸡种新品系的培育贮备遗传素材。     

贵州地方鸡种资源现状及保护和利用对策

笔者在结合贵州地方鸡种资源研究和调查的基础之上,介绍了贵州地方鸡种资源现状,并提出贵州地方鸡种资源保护和利用对策,为贵州地方鸡种资源的保护和开发利用提供思路。     

FABP4基因在3个贵州地方鸡种中多态性研究

为系统筛查贵州地方鸡FABP4基因多态性。该试验以3个贵州地方鸡种（高脚鸡、百宜黑鸡和乌蒙凤鸡）为研究对象,构建品种DNA池,PCR扩增FABP4基因所有外显子及部分内显子区域,采用直接测序结合生物信息技术检测FABP4基因多态性。结果显示,在3个贵州地方鸡资源群体中共发现C51T和T1751C 2个SNPs位点,其中C51T位于第一外显子区,属于同义突变位点;等位基因频率估算发现,C51T位点在3个地方鸡种中多态丰度较高,T1751C位点在群体中多态丰度低;生物信息学得出,C51T位点突变后,鸡FABP4基因mRNA二级结构发生变化,自由能提升,稳定性降低。该试验成功挖掘出贵州地方鸡FABP4基因外显子及部分内含子区域变异位点,以期为贵州地方鸡分子标记开发利用提供参考。     

利用微卫星标记估计贵州地方鸡种遗传分化时间

笔者利用微卫星标记13个座位,以外来鸡种隐性白洛克为对照,使用逐步突变模型(SUM)估计贵州12个地方鸡品种群的遗传分化时间,以期为全省制定地方鸡种资源保护策略、遗传管理规划与利用提供科学依据。     

贵州兴义矮脚鸡遗传方式研究

本文对兴义矮脚鸡矮脚性状遗传方式进行了研究,结果表明:兴义矮脚鸡自交F1代中只出现矮脚和高脚两个性状,其分离比例接近2:1,经卡方检验.P>0.05,F1代观测数与期望数差异不显著,这是经典的孟德尔3:1比数的变异型.为了进一步确定其遗传方式,利用兴义鸡中高脚和矮脚进行正反交和高脚的自交.结果显示:正反交结果一致,矮脚、高脚的分离比接近于1:1.兴义矮脚鸡中的高脚自交F1代中全部为高脚.孵化过程中出现早期胚胎规律性死亡现象,我们对兴义矮脚鸡胚胎死亡时间和早期死亡率进行统计分析,结果显示:兴义矮脚鸡胚胎死亡时间主要集中在48～72h.早期胚胎死亡率平均达到24.3%,接近25%(P≥0.05).比较兴义鸡分离系矮脚鸡和高脚鸡0～12周龄胫长和体重变化,矮脚鸡胫长、体重显著低于高脚鸡(P<0.05).     

利用微卫星标记分析贵州5个地方鸡品种遗传多样性

通过选用30个多态性较好的微卫星标记,检测了贵州省5个地方鸡品种:竹乡鸡、威宁鸡、黔东南小香鸡、高脚鸡、乌蒙乌骨鸡的遗传多样性。计算了各群体的平均遗传杂合度(H)、多态信息含量(PIC)和群体间的DA遗传距离。结果表明:在5个品种中,杂合度最低的是高脚鸡,为0.501,杂合度最高的是竹乡鸡,为0.673,因此贵州各地方鸡品种的杂合度相差较大,据分析可能是由于交通闭塞,形成了家禽品种的多种多型,而且杂合度的高低与PIC值的大小体现了较高的一致性;用UPGMA法进行聚类分析,结果6个鸡品种被聚为3类:竹乡鸡、黔东南小香鸡和威宁鸡聚为一类,乌蒙乌骨鸡自聚为一类;高脚鸡独自聚为一类。这与几个鸡品种的来源、分化、选育历史及地理分布是一致的。     

Population Structure and Genetic Diversity of Seven Chinese Indigenous Chicken Populations in Guizhou Province

To investigate the population structure and genetic diversity of indigenous chicken breeds in Guizhou, a total of 150 individual samples were collected from 12 breeds, including seven local chicken breeds in Guizhou Province, three Chinese native breeds found in other provinces, and two commercial breeds. The genotype datasets were obtained using a 50K single nucleotide polymorphism array method, and then a series of population analyses were performed. The obtained population parameters and linkage disequilibrium decay indicated a higher degree of genetic diversity in Guizhou chickens than in commercial breeds. Two Guizhou local breeds, Wumeng black-bone and Weining, were clustered with a breed from a neighboring province, Xinwen black-bone, which exhibited similar ancestral composition patterns. A newly found breed, Wumeng crested, had high genetic diversity and displayed genetic differences from other Guizhou breeds. These findings provide insight into the establishment of efficient conservation and utilization programs for Guizhou chicken breeds.     

边鸡微卫星DNA标记遗传多样性的研究

利用鸡基因组中5个微卫星标记,检测了边鸡群体的遗传多样性,并以大骨鸡做了比较分析。同时探讨了边鸡在国内5个地方鸡种中的系统地位。结果表明,5个微卫星位点共检测到38个等位基因,其中ADL0146位点的等位基因数最少(5个),而ADL0136和ADL0185两个位点的等位基因数最多(9个),平均等位基因数为7.6个.边鸡群体内比大骨鸡群体有更丰富的遗传多样性。聚类分析结果显示,边鸡与大骨鸡亲缘关系最近。而与鲁西斗鸡亲缘关系最远。     

利用微卫星标记分析贵州地方鸡种的遗传多样性及亲缘关系

利用7个微卫星标记对12个贵州地方鸡种及1个引入鸡种的遗传多样性进行了检测，分析了各标记座位上的等位基因及频率、基因杂合度、平均基因杂合度、多态信息含量、平均多态信息含量及群体间的亲缘关系。结果表明：13个种群在7个标记座位上的等位基因及频率等均存在一定差异。其中，瑶山鸡的平均基因杂合度最高，引入鸡种隐性白洛克的平均基因杂合度最低，其余鸡种介于其间。平均多态信息含量的分析结果与此类似，说明瑶山鸡的遗传多样性最为丰富。模糊聚类的结果表明，13个鸡种分为2大类群，隐性白洛克独自为1个类群，12个贵州地方鸡种构成1个类群。12个贵州地方鸡种又可进一步分为2个小类群：其中1个小类群由兴义土鸡、矮脚鸡首先聚在一起，然后依次聚上黔东南小香鸡、黔东南小香乌骨鸡构成；高脚鸡、瑶山鸡、威宁鸡、竹乡鸡、竹乡乌骨鸡、黑羽乌蒙乌骨鸡、乌蒙鸡、麻羽乌蒙乌骨鸡则构成另一个小类群。     

华东27个地方鸡品种(品系)的遗传变异

应用30个微卫星标记对华东27个地方鸡品种（品系）进行了遗传多样性分析，计算了多态信息含量、平均杂合度和遗传距离等遗传参数，并用类平均法进行了聚类分析。结果表明：平均杂合度最高的是河田鸡，为0．6870，最低的是狼山鸡，为0．6170；27个地方鸡品种（品系）的杂合度都较高，反映了这些品种的多种多型；各品种的平均遗传距离反映了各品种分化时间的长短；UPGMA的聚类分析将27个品种（品系）聚为10类：丝绒乌骨鸡、济宁百日鸡、河田鸡、安义瓦灰鸡、仙居鸡、江山乌骨鸡、溧阳鸡、金湖乌风鸡、灵昆鸡、余干乌骨鸡、康乐鸡、萧山鸡、琅讶鸡、淮北麻鸡、淮南三黄鸡为第1类，白耳鸡为第2类，浦东鸡为第3类，崇仁麻鸡与丝羽乌骨鸡为第4类，狼山鸡与寿光鸡为第5类，鹿苑鸡、东乡绿壳蛋鸡、汶上芦花鸡各独自聚为第6、7、8类，鲁西斗鸡与宁都三黄鸡聚为第9类，漳州斗鸡独自聚为第10类。通过微卫星标记对华东27个地方鸡品种（品系）遗传变异的分析说明这些地方品种的遗传多样性极其丰富，各具特色，应促进资源优势向经济优势转化。     

用微卫星标记分析贵州地方鸡种的遗传多样性及亲缘关系

利用20个微卫星座位对贵州12个地方鸡种和隐性白洛克进行遗传分析,得到各品种的等位基因频率、平均杂合度、多态信息含量及品种间的Nei氏标准遗传距离,并进行了聚类分析。结果表明:13个鸡种在各微卫星座位上的遗传杂合度均有差异,平均遗传杂合度为0.6885(贵州地方鸡种为0.6915);平均多态信息含量为0.6297(贵州地方鸡种为0.6326),说明贵州地方鸡种遗传多样性较隐性白洛克丰富。UPGMA聚类分析结果显示,13个鸡种分为2大类群,隐性白洛克独自构成一个类群,12个贵州地方鸡种为另一个类群,12个贵州地方鸡种进一步可分为4个小类群。研究结果对贵州地方鸡种资源的评估、保存和利用具有一定的指导意义。     

Study on Genetic Diversity and System Evolution of mtDNA D-Loop Region in Xianglushan Chicken

This study was aimed to analyze the genetic diversity and phylogenetic evolution in Xianglushan chicken.The full-length sequences of mitochondrial DNA D-Loop (mtDNA D-Loop) region of 121 Xianglushan chickens were analyzed by PCR amplification combined with bidirectional sequencing,and the composition,variation and maternal origin of mtDNA D-Loop region were discussed.The results showed that the total length of mtDNA D-Loop region in Xianglushan chicken was 1 231-1 233 bp.The contents of A,T,C and G were 26.62%,33.55%,26.49% and 13.34%,respectively.The content of T was the highest,the content of G was the lowest,and the content of A+T was significantly higher than that of G+C,it indicated that region might have certain base hobbies.Analysis of 121 full-length sequences were found to coexist in 11 haplotypes and 26 mutation sites,of which 2 were single polymorphic information sites,24 were simple information sites,4 bases were inserted and 2 bases were missing.The genetic diversity analysis results showed that the haplotype diversity was 0.814,the nucleotide diversity was 0.00447,the average nucleic acid difference was 5.494,which indicated that the genetic diversity of Xianglushan chicken was relatively rich,the effect of preservation was better,which had a certain breeding space.Tajima's D was 0.39378 and the test results were not significant (P>0.10),in line with neutral mutations.The cluster analysis results showed that Xianglushan chicken and Gallus gallus gathered as one,indicating that Xianglushan chicken originated from Gallus gallus, and there were 4 branches inside the branch,indicating that Xianglushan chicken had many matrilineal origins.The results could provide some reference data for the protection and exploitation of pheasant germplasm resources in Xianglushan chicken.     

利用微卫星标记对两个世代百宜黑鸡遗传多样性的研究

采用微卫星标记对百宜黑鸡第4、第5世代的遗传多样性进行研究,结果表明：10个微卫星座位在百宜黑鸡群体中的等位基因频率变化范围较大,为0．0124-0．4876。百宜黑鸡第4世代和第5世代的多态信息含量（PIC）分别为0．6649和0．6418,呈高度多态（PIC〉0．5）,说明百宜黑鸡第4世代和第5世代均有丰富的遗传多样性。     

安卡纯系肉鸡六个微卫星位点遗传多样性研究

安卡肉鸡是生长速度最快的有色羽肉鸡之一,具有适应性强、耐应激、饲料报酬高等特点。为了了解其群体遗传结构,实验利用6个微卫星标记对3个品系共150只个体进行遗传多样性检测。结果表明3个品系都具有较高的多态性,反映了群体基本的遗传特征,为安卡肉鸡的育种和利用提供了基本的研究数据。