梨RAPD扩增产物两种凝胶电泳指纹特点及其序列分析

尽管RAPD技术已经应用于梨种质资源遗传多样性研究,但是尚没有对11个碱基引物的RAPD优化技术在梨品种鉴定方面的深入研究,也缺乏对梨RAPD的PCR产物特点进行分析的报道。鉴于此,该实验首次开展了选用11个碱基引物的RAPD鉴定梨品种上的研究,并对PCR扩增产物的琼脂糖凝胶以及聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳的指纹图谱加以比较分析。结果表明PAGE电泳检测出的谱带的总数量以及多态性谱带的数量均高于前者。两种电泳指纹标记资料进行梨品种聚类的结果存在一定差异。通过对随机挑取的21个片段进行克隆与测序分析,结果发现21个片段都是对应RAPD引物的扩增产物,其中3条为编码蛋白序列,18条为非编码蛋白序列。     

枇杷RAPD扩增产物的不同电泳检测及其序列特征分析

为了更好地将RAPD技术应用于枇杷品种资源的鉴定以及遗传基础的研究,在选用11个碱基引物以及严格筛选PCR退火温度的最新RAPD技术优化的基础上,以16个枇杷品种为试验材料,对琼脂糖凝胶以及聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳检测的RAPD PCR扩增产物效果进行比较。结果表明,聚丙烯酰胺凝胶(PAGE)电泳检测出的总谱带数以及多态性谱带数均高于琼脂糖凝胶。根据两种电泳系统获得的标记信息进行枇杷品种遗传聚类分析,结果表明PAGE电泳的分析结果与枇杷的分类情况更为一致。随机对挑选的38个片段进行克隆与测序,发现37个片段都是对应引物的RAPD扩增产物,其中有6条是编码蛋白的基因片段,说明RAPD不仅扩增基因组上的非编码蛋白序列,而且可以扩增编码蛋白的基因片段,是能够揭示枇杷品种间基因组信息异同的理想的DNA标记技术。     

李RAPD扩增片段的不同电泳检测及其序列特征分析

[目的]为更好地将随机扩增多态（RAPD）技术应用于李品种资源鉴定及遗传基础的研究提供理论依据。[方法]以16个李品种为材料,分别使用琼脂糖凝胶和聚丙烯酰胺凝胶（PAGE）对RAPD的PCR扩增产物进行电泳检测,并对检测效果进行比较。[结果]PAGE电泳检测出的谱带总数量以及多态性谱带的数量均高于琼脂糖凝胶。根据2种电泳系统获得的标记信息构建了2张树状聚类图,2张聚类图的聚类情况基本一致。通过对随机挑选的23个片段进行克隆与测序,结果发现23个片段都是对应引物的RAPD扩增产物。其中有4条是编码蛋白的基因片段,说明RAPD不仅扩增基因组上的非编码蛋白序列,同时可以扩增编码蛋白的基因片段。[结论]RAPD不仅能扩增基因组上的非蛋白编码序列,而且还可以扩增编码蛋白的基因片段,是能够较全面反映基因组序列信息理想的DNA标记技术。     

桃RAPD扩增产物的不同电泳检测及其序列特征分析

以16个桃品种为试验材料,选用11个碱基引物以及严格筛选PCR退火温度的RAPD技术,对琼脂糖凝胶及聚丙烯酰胺凝胶电泳检测的RAPD、PCR扩增产物进行比较.结果表明,聚丙烯酰胺凝胶电泳检测出的总谱带及多态性谱带数均高于琼脂糖凝胶,前者不存在或少存在共迁移性的现象.随机选取19个片段,发现其中有6条是编码蛋白的基因片段,说明RAPD不仅扩增基因组上的非编码蛋白序列,同时可扩增编码蛋白的基因片段,能够较全面客观地反映不同桃品种遗传上的差异.     

两种检测扁桃基因组RAPD扩增产物方法的比较分析

通过2;(w/v)的琼脂糖凝胶和8;(w/v)的聚丙烯酰胺凝胶电泳对扁桃品种基因组DNA的RAPD检测.结果表明:8;(w/v)聚丙烯酰胺凝胶优于2;(w/v)琼脂糖凝胶,主要表现在,8;聚丙烯酰胺凝胶对长度相差100 bp以下的DNA分子的分离较2;的琼脂糖凝胶电泳效果好;且8;聚丙烯酰胺凝胶的分辨范围广,在线性DNA分子(0.1～2.0 kb)范围内也能得到很好的分离效果;用8;的聚丙烯酰胺凝胶分离扁桃品种基因组DNA的RAPD扩增结果,表现出在扁桃品种间DNA水平上差异大,运用此方法提高了扁桃品种的鉴别能力.     

核桃RAPD扩增产物的不同电泳检测及其序列特点

1.3%琼脂糖凝胶和5%聚丙烯酰胺凝胶电泳对核桃RAPD扩增产物检测的结果表明,5%聚丙烯酰胺凝胶对RAPD扩增产物的分离效果较1.3%琼脂糖凝胶好。根据两者的电泳结果构建了树状聚类图,聚类结果大致相同,两种电泳方法都能正确地反映出品种间的遗传关系。通过挑选20个片段进行克隆,发现20条序列都来自核桃基因组。其中,编码蛋白基因的序列为5条,占所克隆片段的25%。     

杏属植物种间亲缘关系的RAPD分析

应用RAPD技术对西伯利亚杏(ArmeniacasibiricaL.)、普通杏(ArmeniacavulgarisL.)的葫芦杏、骆驼黄、大偏头、串枝红、山黄杏、北安河黄杏、青岛大红杏、早桔(Earlyorange)8个栽培品种,及重瓣杏(A.vulgarisL.var.MeixionensisZhang)、李光杏(A.vulgarisL.var.glabraS.X.Sun)2个变种和4个“大扁杏”的栽培品种龙王帽、一窝蜂、柏峪扁、优一进行了亲缘关系分析。研究结果支持了“大扁杏”系普通杏与西伯利亚杏的自然杂交种的观点。同时聚类分析结果还显示,“龙王帽”、“柏峪扁”和“一窝蜂”3个品种间有非常近的亲缘关系,而且与普通杏相比,“大扁杏”与西伯利亚杏有更近的亲缘关系。     

李与杏种间杂种的RAPD和SSR分析

[目的]探讨杂种苗与亲代之间的遗传变异及其真伪性,获取快速鉴定杂种的方法。[方法]利用RAPD和SSR分子标记技术对凯特杏和莫尔特尼李的种间杂交种进行分析。[结果]叶片形态、RAPD和SSR技术对杂种的鉴定分析,表明子代与亲代电泳图谱之间存在差异,所获杂种为真杂种。[结论]将RAPD及SSR技术结合可有效鉴定李杏种间杂交种,是一种快速鉴定杂种的方法,可缩短育种周期,提高育种效率。     

李、杏、樱RAPD分析鉴定

对东北主栽的李、杏、樱品种进行RAPD分子标记研究,建立了指纹图谱。RAPD分析结果表明:李的各主栽品种之间亲缘关系较近,而与黄干核李亲缘关系较远,这说明李各主栽品种间基因型相似;杏的各主栽品种间基因型相似;杏、樱亲缘关系较近,此二者与李亲缘关系较远。     

山茶属植物RAPD分析中琼脂糖凝胶电泳条件的研究

为了摸索适宜于山茶属植物ＤＮＡ琼脂糖凝胶电泳分析,分析了电压,缓冲液,琼脂糖密度、ＥＢ（Ｅｔｈｙｌｅ Ｂｒｏｍｉｄｅ）密度染色时间及操作方法对山茶属植物ＲＡＰＤ分析中琼脂糖凝胶电泳实验结果的影响。结果表明,适宜于山茶属植物ＤＮＡ琼脂糖凝胶电泳条件是：琼脂糖凝胶密度为１８ｇ／Ｌ,电泳缓冲液为ＴＢＥ,电压为６￣９Ｖ／ｃｍ,电泳时间为溴酚兰和二甲苯青之间跑出约５ｃｍ,电泳开始时先让缓冲液与凝胶保持水平电     

利用RAPD分子标记定位2个水稻稻瘟病菌非致病性基因

 选择日本鉴别品种新 2号和K5 9,对源于云南省的水稻稻瘟病菌可育性菌株CHL12 4(MAT1 1)和CHL12 5 (MAT1 2 )及其杂交后代 72个子囊菌株的非致病性 (无毒性 )进行了遗传分析。结果表明 ,菌株CHL12 4对新 2号 (含有效抗性基因Pish)和K5 9(Pit)的非致病性分别由非致病性基因Avr2 Pish和Avr2 Pit控制。通过对这 2个基因控制的非致病性反应进行列联卡方测验 ,显示这 2个基因连锁在一起 ,重组率为 2 6 .8%。进一步利用分离群体分析法 ,对这 2个基因进行了RAPD (随机扩增多态性DNA)分析。结果发现 ,2个RAPD标记OPW 0 6 64 5和OPW 1364 5与非致病性基因Avr2 Pish连锁 ,它们的重组率分别为 2 7.8%和 2 6 .5 %;另 1个RAPD标记OPR11517则与非致病性基因Avr2 Pit连锁 ,重组率为 2 3.5 %。     

杂种马褂木无性系随机扩增多态DNA指纹图谱的构建

利用随机扩增多态（RAPD）分子标记技术对31个杂种马褂木无性系的研究结果表明，23个随机引物共扩增出128条谱带，其中76条（59．38％）谱带在无性系间呈多态性，无性系间的遗传距离最小为0．0813，最大为0．3522，这说明无性系间的遗传多态性相对较小，从而认为在今后杂交工作中应注意扩大亲本的遗传基础。聚类分析的结果证明RAPD指纹图谱在一定程度上反映了无性系间的亲缘关系，因此，可用于谱系分析。利用所构建的RAPD指纹图谱成功地对各无性系进行了区分，这对于无性系鉴定和知识产权保护具有重要的意义。     

Analysis on Genotypic Differentiation of Phytophthora infestans by Using Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD)

A total of 104 isolates including two Korean isolates and three Japanese isolates of Phytophthora infestans collected from Heilongjiang and Jilin Provinces from 2006 to 2008 were used to determine their mating types,metalaxyl resistance,and RAPD genotypes.All the isolates of P.infestans collected from Heilongjiang and Jilin Provinces belonged to A 1 mating type,and no A 2 mating type was detected.Frequencies of metalaxyl resistant isolates were 94.4%,47.8% and 75.0% in 2006,2007 and 2008,respectively.Accord...     

随机扩增多态DNA(RAPD)技术及其在农业上的应用(综述)

随机扩增多态DNA技术是近年发展起来的一种DNA多态性检测技术。它以一系列不同的随机排列碱基顺序的寡核苷酸单链(通常是十聚体)为引物,对所研究的基因组DNA进行单引物扩增。扩增DNA片段的多态性反映了基因组相应区域的DNA多态性。RAPD技术可以在对物种没有任何分子生物学研究的情况下,对其进行DNA多态性分析,同RFLP及DNA指纹图谱法等其他DNA多态性检测技术相比,RAPD具有检测效率高、样品用量少、灵敏度高和检测容易的优点。RAPD技术已广泛的应用于农作物和畜禽品种及品系的遗传纯度的测定、品种和品系的鉴定、品种和品系遗传关系的确定、基因的定位和分离以及构建基因图谱等方面的研究。