裸燕麦种质遗传完整性SSR分析中样本量的研究

利用SSR分子标记技术分析裸燕麦品种定燕9号和燕科1号的不同样本量群体对遗传参数的影响,确定适宜样本量。以10、20、30、40、50、60、70、80、90为样本量梯度,对不同样本量群体的等位基因数、有效等位基因数、香农指数等遗传参数的变化趋势进行研究,结果表明:用20对SSR引物对定燕9号、燕科1号的90个单株进行扩增,分别检测到43个、32个等位基因,平均每个位点检测到2.09个、1.60个等位基因。样本量大小与等位基因数、多态位点百分率相关。两个材料的样本量分别大于70和50时,等位基因数、多态位点百分率的"S"形拟合曲线变化趋于平缓,其他遗传参数的标准差减小。因此,定燕9号、燕科1号遗传完整性SSR分析的适宜样本量为70和50,确定裸燕麦种质在进行遗传完整性研究时所需的样本量为70。     

蒙古冰草SSR遗传完整性分析中适宜样本量及标记数量筛选

以蒙古冰草2个自然群体为实验材料,通过对15对微卫星分子标记DNA扩增效果的比对分析,探讨遗传完整性分析研究中所需的最适宜样本量。实验设置9个样本量梯度,对不同样本量的等位基因数、杂合度等遗传参数的变化趋势分析。结果表明,样本量的大小与等位基因数(Na)、Nei's遗传多样性指数(H)呈显著相关。两份材料分别在样本量达到60和50时,各遗传参数变化较小,拟合曲线趋于平稳。综合分析表明,蒙古冰草自然群体的遗传完整性分析取样在60株以上。     

大白和长白猪大样本群体的繁殖性状遗传参数估计及影响因素分析

旨在解析不同因素对大白和长白猪大样本群体繁殖性能的影响。同时估计大白和长白猪繁殖性状的遗传参数。本试验选取温氏2013-2018年5年间大白共65 546窝母猪繁殖记录、长白共9 552窝母猪繁殖记录进行研究。采用SAS软件GLM过程对母猪8个繁殖性状进行分析,解析母猪分娩胎次、出生胎次和情期3个因素对其繁殖性能的影响。同时利用DMU软件估计这些性状的遗传力、遗传相关和表型相关。结果表明:1)在影响因素分析中:在两个品种中,母猪分娩胎次对所有繁殖性状都有极显著影响(P0.001);在大白猪中,母猪出生胎次对5个繁殖性状影响显著(P0.05),情期对所有繁殖性状影响均不显著;而在长白猪中,母猪出生胎次对弱仔数和出生窝重有显著影响(P0.05),情期对5个繁殖性状影响显著(P0.05)。2)在遗传参数估计中:在大白猪中,出生窝重遗传力最高,为0.281,总仔数、活仔数、健仔数、弱仔数和死胎数的遗传力在0.117～0.179范围内;而在长白猪中,总仔数遗传力最高,为0.190,活仔数、健仔数、弱仔数和出生窝重的遗传力在0.100～0.176范围内;在遗传相关和表型相关上,大白猪的总仔数与活仔数、总仔数与健仔数、活仔数与健仔数、健仔数与出生窝重等遗传相关均在0.738以上,其表型相关在0.717以上,长白猪的总仔数与活仔数、总仔数与健仔数、活仔数与健仔数的遗传相关在0.895以上,表型相关在0.791以上。本研究结果为提高母猪的繁殖性能和加速繁殖性状的遗传进展提供了试验数据和理论基础。     

基于SSR标记的木豆种质资源遗传多样性与群体结构分析

种质资源遗传多样性和群体结构分析是作物种质资源保护和作物遗传育种的前提条件.本研究从96对简单序列重复(Simple sequence repeat,SSR)标记中筛选出42对多态性标记,对不同地理来源的72份木豆(Caj anus caj an)种质资源遗传多样性和群体结构进行了分析.结果表明:42对SSR标记在72...     

基于SSR标记的柱花草种质资源遗传多样性与群体结构分析

种质资源遗传多样性和群体结构分析为复杂性状关联分析提供基础。本研究通过SSR分子标记技术,对68份柱花草(Stylosanthes spp.)种质资源的遗传多样性与群体结构进行分析。结果表明,30个多态性SSR标记在68份柱花草种质中共检测到146个等位基因,平均为4.867个,每个SSR标记的Shannon信息指数(I)和多态性信息含量(PIC)分别为0.676～1.690和0.363～0.764,平均为1.195和0.577。根据SSR标记数据进行遗传多样性分析,可将68份柱花草种质资源分为6类,群体结构分析中在ΔK达到最大时,K=6,因此将68份柱花草材料划分为6个群体,与遗传多样性分析结果基本一致。本研究将为柱花草遗传背景研究、种质资源评价和优良种质筛选提供依据。     

非遗传因素对母猪繁殖性能的影响分析

现代养猪生产的经济效益的好坏在很大程度上取决于母猪繁殖性能的优劣,母猪繁殖性状多为低遗传力性状,因而探讨非遗传因素对繁殖性能的影响对改善母猪繁殖性能具有积极意义。文章从胎次、日粮营养、输精方式、初配日龄、饲养管理、母猪背膘厚以及环境等非遗传因素对母猪繁殖性能的影响展开综述,通过分析各非遗传因素对母猪繁殖性能的影响,旨在为实际生产中改善母猪繁殖性能提供可靠理论依据。     

基于SSR标记的苜蓿种质资源遗传多样性与群体结构分析

种质资源遗传多样性和群体结构的分析是进行复杂性状关联分析的前提条件.从140对SSR引物中筛选到16对多态性引物,对82份苜蓿(Medicago spp.)材料进行遗传多样性与群体结构分析.结果表明;16对SSR引物共检测出190个等位变异,平均11.88个;多态性比率66.67％～100％,平均为83.05％;基因多样性为0.1447～0.3637,平均为0.2577;PIC为0.0079～0.9432,平均为0.5501.群体结构分析表明,当K=5时△K最大,即82份苜蓿材料可划分为5个类群,其中75.61％的种质遗传组分相对比较单一,24.39％的种质遗传背景比较复杂.苜蓿种质资源遗传多样性丰富,群体结构的划分与种质的来源不完全相关.     

利用SSR和Indel对大翼橙种质的遗传多样性及群体结构分析

元江宜昌橙(Citrus ichangensis Swingle)是云南元江县新发现的一类原始野生宜昌橙资源,为了解元江宜昌橙与长江流域来源的宜昌橙的遗传差异,以及云南元江野生宜昌橙种群内个体间的遗传差异,本研究利用21对SSR和InDel引物对元江宜昌橙、长江流域宜昌橙、大翼橙、香橙等4个群体的48份资源材料进行了遗传多样性分析。研究结果表明,21对引物共产生了131条多态性条带,平均每对引物检测到6.2个多态性条带,多态性标记位点的香农信息指数为0.14~1.11,平均期望杂合度为0.04~0.97。群体遗传结构分析、UPGMA聚类分析和主成分分析均表明元江野生宜昌橙是不同于长江流域宜昌橙资源的新类型,4个群体间的遗传差异较大,但群体间的基因流较低。在元江宜昌橙种群内存在遗传异质个体,但种群内的遗传多样性比长江流域宜昌橙群体的遗传多样性水平低,香橙群体的遗传多样性水平较高,大翼橙群体中的马来西亚大翼橙与宜昌橙遗传距离较远,而红河大翼橙与元江宜昌橙的遗传距离较近。本研究证实了元江野生宜昌橙是有别于长江流域宜昌橙的新类型,在进行元江宜昌橙野生资源的收集时,以居群为单位加以资源材料的收集对遗传多样性的保护更为有利。     

AFLP分析人工老化对扁蓿豆遗传完整性的影响

采用AFLP分子标记对经过人工老化处理的不同发芽率水平的扁蓿豆(Trigonella ruthenica L.)种质(00-408)进行分析,以探索人工老化在分子水平上对扁蓿豆种质遗传完整性的影响。结果表明:老化处理群体的多态位点百分比、有效等位基因数、遗传多样性指数和Shannon指数均低于对照群体(P>0.05)。因此,人工老化处理使扁蓿豆种质的遗传多样性水平有所下降,但对其遗传完整性没有显著影响,由此表明扁蓿豆种质的耐贮性较强。     

基于SSR标记的河南省狗牙根遗传多样性及群体遗传结构分析北大核心CSCD

应用SSR分子标记,对河南省15个居群共288份狗牙根材料进行遗传多样性及群体遗传结构分析,结果表明,10对引物共扩增出173条条带,其中163条为多态性条带,多态性条带百分率为94.29%,表明河南省狗牙根具有丰富的多态性。15个居群间的遗传分化系数为0.3857,即发生在居群间的遗传变异达到38.57%,大部分的遗传变异发生在居群内部,居群间基因流为0.7964,居群之间存在一定程度的基因交流。不同居群间遗传一致度的变化范围是0.746~0.964,平均为0.767。15个居群间的UPGMA聚类分析结果表明居群间没有完全按照地理来源进行聚类,遗传距离和地理距离矩阵之间的Mantel检验结果表明狗牙根居群间的遗传距离与地理距离之间无相关性。288份狗牙根材料之间的遗传距离为0.0173~0.5205,平均为0.3113,UPGMA聚类结果将所有材料分为3组。基于Structure软件的群体遗传结构分析结果表明,可将288份狗牙根材料分为2个亚群和一个混合型群体,与288份材料的UPGMA聚类结果基本一致,由此可判断两个亚群的遗传背景单一,混合型群体存在一定的种质基因渗透,遗传背景较为复杂。     

大汉梅猪群体遗传结构及繁殖性能的RAPD分析

选用20对引物在大汉梅群体中进行RAPD扩增,共检测出185个位点,其中多态性位点39个,群体的多态频率为21.1%.数据分析结果显示:群体内个体之间的遗传相似系数为0.566～0.979,平均值为0.846,遗传信息较为稳定.通过对群体遗传结构特点及繁殖性能生产记录进行分析,群体总产仔数和活产仔数均达到显著水平(P＜0.05),可为其建系和选育提供依据,并为以后进一步研究提供理论基础.     

应用4个繁殖性状候选基因对太湖猪群体遗传结构分析

采用PCR-RFLP技术分析雌激素受体(ESR)基因、促卵泡素β亚基(FSHβ)基因、催乳素受体(PRLR)基因和视黄醇结合蛋白4(RBP4)基因在太湖猪不同类群中的分布情况。结果表明:ESR基因在小梅山猪、二花脸猪、枫泾猪中B基因频率较高,分别为0.629,0.762,0.649;FSHβ基因在小梅山猪、二花脸猪、枫泾猪中AA基因型频率较高,分别为0.875,0.881,0.833;PRLR基因在小梅山猪、二花脸猪、枫泾猪中AA基因型频率分别为0.631,0.571,0.281;RBP4基因在小梅山猪、二花脸猪、枫泾猪猪群中AA基因型频率较高,分别为0.593,1.000,0.900。对不同基因的特性分析表明:ESR、FSHβ、PRLR和RBP4在3个类群中的多态信息含量和杂合度均不高,大多为中低等多态位点。     

大汉梅猪群体遗传结构及繁殖性能的RAPD分析

选用20对引物在大汉梅群体中进行RAPD扩增,共检测出185个位点,其中多态性位点39个,群体的多态频率为21．1％。数据分析结果显示：群体内个体之间的遗传相似系数为0．566～0．979,平均值为0．846,遗传信息较为稳定。通过对群体遗传结构特点及繁殖性能生产记录进行分析,群体总产仔数和活产仔数均达到显著水平（P〈0．05）,可为其建系和选育提供依据,并为以后进一步研究提供理论基础。     

基于SSR标记分析四川省桑树种质资源的群体结构和遗传多样性

利用14对SSR引物对四川省89份桑树种质资源的基因组DNA进行PCR,分析种质资源间的群体结构和遗传多样性。共扩增出迁移率不同的条带65条,多态性条带65条,多态性条带比率达100%;Structure群体结构分析将89份桑树种质资源划分为4个群体,4个群体的多态性信息含量在0.552 0~0.599 8之间,总体为0.657 7;基因多样度在0.554 8~0.600 3之间,总体为0.579 0;等位基因数目在66~76个之间,总体为134个;等位基因丰富度在3.327 2~3.549 1之间,总体为3.983 1;遗传多样性主要来源于品种内,属中等偏高水平;14对SSR引物位点的总基因多样度Ht在0.291~0.931之间,整体为0.699;Nei’s种群内基因多样度Hs为0.287~0.910,整体为0.662;种群间基因多样度为0.003~0.098,整体为0.037;种群间基因分化系数为0.008~0.047,整体为0.053;基因流为2.901~62.000,整体为8.934,遗传变异主要发生在群体内,群体间分化程度低,基因流大。UPGMA聚类分析与群体结构分析结果大致相同,2种分析结果都显示分群无地理迁移规律。     

母猪早产对其繁殖性能的影响

有研究表明母猪早产会降低母猪窝产仔猪数和仔猪成活率。本研究的目的是调查母猪早产（妊娠期不足114天）的发生率及其对母猪繁殖性能的影响。     

申农1号猪群繁殖性能分析

对申农1号猪群四世代到七世代母猪的初产和经产共计2829窝的产仔数和产活仔数进行统计分析，结果表明：申农1号猪群四世代到七世代母猪的繁殖性能差异不显著，说明经过近10年的选育，申农1号猪群的繁殖性能已基本稳定。     

基于SSR的154份梨地方品种的遗传多样性与群体结构分析

利用荧光SSR引物分析154份梨地方品种的遗传多样性和遗传结构,为梨种质资源收集保存、品种改良、种质创新和资源利用提供理论依据。17对SSR引物在154份梨地方品种中检测到多态性位点303个,不同引物的扩增位点在10 ~ 27间不等,平均等位基因数为17.824个;观测杂合度Ho变异范围0.312（NAUpy09t）~ 0.851（NAUpy08t）之间,平均值为0.690;期望杂合度He变异范围0.613（NH029a）~ 0.919（位点NAUpy08t）,平均值为0.822;多态性信息含量（PIC）值变异范围0.578（位点NH029a）~ 0.913（位点NAUpy08t）之间,平均值0.805;12个群体的遗传距离为0.181~1.576,遗传相似系数为0.207 ~ 0.834;贝叶斯遗传结构分析表明,当K=4时,△K值最大,154个梨地方品种可以划分为4个亚群,140份（90.91%）供试材料的Q值≥0.6,血缘相对单一,另外14份材料的Q值<0.6具有混合来源,遗传背景较为复杂。广东品种群与其他地区品种亲缘关系较远,基因来源单一且独特,属于特殊基因群。个体聚类分析显示在0.54处将154个品种分为8个类群,个体聚类结果与其遗传背景相关。     

非遗传因素对母猪繁殖性能的影响

母猪的繁殖性能决定养殖场的生猪繁殖。以往研究主要集中在遗传因素对母猪的繁殖性影响,但是一些非遗传因素同样会对母猪的繁殖性能造成影响,例如养殖方式、母猪的胎次等。     

GNRHR、IGF-1基因对文昌鸡繁殖性状的遗传效应分析

以控制文昌鸡繁殖性状的促性腺激素释放激素受体基因（GNRHR）和胰岛素样生长因子-1基因（IGF-1）为候选基因，采用PCR—RFLP技术检测GNRHR基因和IGF-1基因在文昌鸡中的单核苷酸多态性（SNP），同时对这2个基因与文昌鸡繁殖性状的相关性进行了研究。结果表明，GNRHR基因内含子1的537bp位置有C→T碱基的变异，在文昌鸡中检测到AA、Aa、aa3种基因型，A等位基因的频率为0．69，a等位基因的频率为0．31；在IGF-1基因5′非翻译区（5′UTR）发现C→T碱基的变异，改变了限制性内切酶PstⅠ识别位点，经PCR-RFLP分析，在文昌鸡中检测到BB、Bb、bb3种基因型，B等位基因的频率为0．53，b等位基因的频率为0．47。对其基因型与所检测个体相应的繁殖性状采用GLM分析进行遗传效应研究，结果表明，GNRHR基因对300日龄产蛋数、400日龄产蛋数有显著影响（显性作用），IGF-1基因对300日龄产蛋数有显著影响（加性作用）。因此，推测GNRHR基因和IGF-1基因可能是影响鸡繁殖性状的主效基因或与主效基因紧密连锁的标记基因，并且能够在分子标记辅助选择中用于对鸡繁殖性状的遗传改良和固定。     

种子老化对美洲狼尾草种质资源遗传完整性的影响

为确定适合美洲狼尾草(Pennisetum glaucum)种子更新的发芽率,采用人工梯度老化的方法,对其在45℃、99%相对湿度条件下分别处理0、4、8、12、16、20、24 h,再对梯度老化后的材料进行遗传完整性分析。结果表明:与对照组相比,经人工梯度老化后的美洲狼尾草的发芽率、多态性条带百分率(percentage of polymorphic bands,PPB)、等位基因数(number of alleles, Na)、有效等位基因数(effective number of alleles, Ne)、Nei’s基因多样性指数(Nei’s gene diversity index, H)和Shannon-Wiener多样性指数(Shannon’s information index, I)均有不同程度降低,且与老化时间负相关;发芽率为68.23%时,除等位基因数以外,其他遗传多样性相关参数均与对照组差异显著(P <0.05),说明美洲狼尾草种子更新的发芽率为68.23%。综上,当美洲狼尾草种子的发芽率为68.23%时,应进行种质资源的更新;gSSR分子标记可以作为探究种...