PCR方法检测奶牛粪便中鼠隐孢子虫

从含有鼠隐孢子虫卵囊的奶牛粪便中,直接提取 Ｄ Ｎ Ａ 用作 Ｐ Ｃ Ｒ 模板,用 １ 对人工合成的寡核苷酸作为 Ｐ Ｃ Ｒ 引物,扩增大小为 ５４０ ｂｐ 的特异片段。 Ｐ Ｃ Ｒ 产物经电泳鉴定,表明可从含隐孢子卵囊的奶牛粪便标本 Ｄ Ｎ Ａ 抽提物中扩增出目的片段,而其他几种寄生虫及阴性对照均不能扩增出特异片段。本方法的敏感性最低可检测到含卵囊 ４００ 个／ｍ Ｌ 的样本,具有敏感性高、特异性强的特点。     

奶牛隐孢子虫的检测技术

隐孢子虫病是一种重要的人畜共患原虫病。在家畜中以对反刍动物—奶牛的危害最大。当前，奶牛隐孢子虫主要还是以粪便检测为主，如改良抗酸染色法、金胺一酚改良抗酸复染法等。现在还有应用日趋广泛的免疫学检测方法，如ELISA、IFA、McAb等；分子生物学检测方法。如常规PCR、巢式PCR等。本文对上述各种检测方法作一综述，以供广大寄生虫病学和兽医工作者参考。     

应用巢式PCR检测隐孢子虫

应用巢式聚合酶链反应(Nested PCR)建立了一种检测隐孢子虫(Cryptosporidium)的方法。试验中隐孢子虫卵囊纯化采用庶糖密度梯度离心法,以液氮-热水浴反复冻融及酚-氯仿抽提冷乙醇沉淀法制备模板DNA,根据隐孢子虫18S rRNA序列高度保守区设计2对引物,建立Nested PCR诊断方法。该方法特异性强,可检出牛源微小隐孢子虫(C.parvum)、羊源微小隐孢子虫(C.parvum)、牛源安氏隐孢子虫(C.andersoni)、鸡源贝氏隐孢子虫(C.baileyi)及猪源隐孢子虫(C.suis);敏感性高,该方法最低核酸DNA检测量达到10fg。初步应用结果表明,所建立的Nested PCR方法适合于隐孢子虫病的诊断和分子流行病学调查。     

巢式PCR检测隐孢子虫卵囊的研究

隐孢子虫病是一种重要的人畜共患原虫病。为了在临床样品中更准确、快速地检测隐孢子虫卵囊,从初步纯化的含有不同数量隐孢子虫卵囊的样品中和含有不同数量隐孢子虫卵囊的奶牛粪便中,直接提取DNA或用DNA纯化试剂盒对提取的奶牛粪便中卵囊DNA进行纯化之后用作起始PCR(Primary PCR)模板,以起始PCR的产物为模板进行巢式PCR(Nested PCR),用2对人工合成寡核苷酸分别作为两个PCR的引物,扩增片段大小分别为1325bp和820bp。优化了Mg2+浓度、引物浓度和dNTP浓度,并进行了特异性检验。建立的巢式PCR具有隐孢子虫属特异性,不仅扩增出新鲜样品DNA提取物中的目的片段,而且扩增出放置6年之久的DNA提取物中的目的片段。样品经过初步纯化之后,起始PCR和巢式PCR最低检测值卵囊分别为2 86×103个/ml和≤2 86个/ml;从含有隐孢子虫卵囊的奶牛粪便中提取DNA,尔后经过DNA纯化试剂盒纯化,其起始PCR和巢式PCR粪便中卵囊最低检测值分别为2 86×107个/g和≤2 86个/g。有望发展为试剂盒。     

PCR技术在检测隐孢子虫中的应用

隐孢子虫可造成多种动物的腹泻及其它症状，给畜牧业造成了巨大损失。作者就PCR在隐孢子虫的病原鉴别、活性确定、环境检测、药物筛选等方面的应用作一综述。     

巢式PCR-RFLP法检测奶牛隐孢子虫及虫种鉴定

采进口奶牛粪样200份,收集每份样品中的卵囊液,采用巢式PCR检测隐孢子虫(Cryptosporidium)18S rRNA基因,并用RFLP进行虫种鉴定,将目的片段克隆到pEGM-T easy vector,测序并进行同源性分析以进一步佐证虫种鉴定结果。结果表明,进口奶牛隐孢子虫阳性率为3.5%(7/200),514bp的目的片段不能被EcoT14 Ⅰ酶切。测序分析表明,获得的18S rRNA基因序列与NCBI上公布的微小隐孢子虫(C.parvum)相应序列同源性高达99.4%~100%,与安氏隐孢子虫(C.andersoni)同源性仅为91.1%。说明进口牛粪样中检测出的隐孢子虫为微小隐孢子虫。     

隐孢子虫PCR检测中模板DNA提取方法比较

用4种不同方法抽提隐孢子虫卵囊DNA作模板，以1对人工合成的寡聚核苷酸为物进行聚合酶链反应，均能扩增出540bp特异性DNA片段，比较这4种方法的操作过程和卵囊最氏检测量对它们进行综合评价，其中20g/L二硫苏糖醇冻融法最佳，具有敏感，简便，快速等优点。     

贝类单孢子虫半套式PCR检测方法的建立及初步应用

根据GenBank中单孢子虫的基因保守序列,设计了3条特异性引物,通过对半套式PCR扩增条件的优化,本研究建立了检测贝类单孢子虫的半套式PCR方法。该方法对单孢子虫模板进行扩增,得到与预期相符的333 bp特异性条带,而对折光马尔太虫、派琴虫、副溶血弧菌、溶藻弧菌和河弧菌等病原体的扩增,结果均为阴性。敏感性试验结果表明,该技术最低能检测到0.011 fg单孢子虫质粒DNA。用该半套式PCR对青岛沿海的贝类样品进行检测,结果从牡蛎和菲律宾蛤仔中分别检出单孢子虫6和8份,提示青岛沿海的养殖贝类中存在单孢子虫感染。结果表明,本研究建立的半套式PCR方法可用于贝类单孢子虫的临床快速检测。     

隐孢子虫病检测技术研究进展

隐孢子虫是动物和人腹泻的重要病原,也是人类艾滋病患者的主要致死因素之一.当前,对隐孢子虫病的研究已成为全球寄生虫学研究领域的热点由,于迄今尚无治疗隐孢子虫病感染的特效药物,因此,快速、简便、准确地发现隐孢子虫是控制该病的关键.随着分子生物学技术的应用,隐孢子虫病的检测技术得到了极大的发展.笔者就近年来隐孢子虫病检测技术进行了简要综述.     

应用PCR诊断隐孢子虫病

应用聚合酶链反应（ Ｐ Ｃ Ｒ）建立了一种诊断人及牛等哺乳动物隐孢子虫病的方法。试验采用甘油漂浮 Ｇ３ 耐酸漏斗过滤法纯化隐孢子虫卵囊,以液氮冻融法制备模板 Ｄ Ｎ Ａ,根据隐孢子虫 １８ Ｓｒ Ｒ Ｎ Ａ 序列设计 Ｐ Ｃ Ｒ 引物建立其诊断方法。该方法特异性强,可检出鼠隐孢子虫（ Ｃｒｙｐｔｏｓｐ ｏｒｉｄｉｕｍ ｍ ｕｒｉｓ）和小球隐孢子虫（ Ｃ．ｐａｒｖｕｍ ）卵囊;敏感性高,每克粪便可检出 ４００ 个卵囊。初步应用结果表明,所建立的 Ｐ Ｃ Ｒ 方法适合于人、牛等哺乳动物隐孢子虫病的临床诊断和流行病学调查。     

鼠隐孢子虫卵囊及子孢子的纯化

应用不连续蔗糖密度梯度离心法，对犊牛粪便中的鼠隐孢子虫卵囊进行了提取，经过两次漂浮和一次不连续蔗糖密度梯度离心，得到纯净的卵囊，其中含有极少量的杂质，不含其他微生物。卵囊的回收率为３７％。纯化的卵囊脱囊后，经过一次不连续蔗糖密度梯度离心，得到很纯的子孢子。子孢子的回收率为４７．６％。纯化的卵囊及于孢子可用于隐孢子虫的核酸分析、生物化学、免疫学及细胞培养等方面的研究。该法具有简便、快速、大量分离卵囊的优点。     

Nested PCR检测微量隐孢子虫卵囊

根据隐孢子虫18SrDNA序列，设计出隐孢子虫属和鼠隐孢子虫种的特异性引物，进行PCR和Nested PCR反应，先后分剐扩增出1条540bp和1条250bp的条带。研究表明，NestedPCR具有高度的特异性和敏感性。应用NestedPCR可检测1～10个鼠隐孢子虫卵囊，其敏感性是饱和蔗糖漂浮法的10^5倍以上。     

隐孢子虫（Cryptosporidium）病毒的鉴定及其特性

根据已发表的隐孢子虫病毒的序列,设计合成2对引物,对小球隐孢子虫(Cryptosporidiumparvum)、鼠隐孢子虫(C.muris)、贝氏隐孢子虫(C.baileyi)、火鸡隐孢子虫(C.meleagridis)进行RT-PCR扩增,结果发现仅小球隐孢子虫(C.parvum)含有大小约为1.7×103nt和1.3×103nt2个片段的dsRNA病毒.将其PCR产物连接到pMD18-T载体上进行克隆测序,经与GenBank比较,含这2个片段的dsRNA病毒与已发表的该虫病毒的同源性分别为96%和98%.电泳鉴定发现,该病毒对低浓度RNA酶不敏感,且不能被DNA酶降解.依赖RNA的RNA聚合酶活性测定结果表明,该病毒具有该聚合酶的活性.电镜观察未发现存在病毒样粒子.     

PCR-RFLP鉴定隐孢子虫种类研究

为快速、准确鉴别人畜隐孢子虫种类，建立了巢式PCR扩增隐孢子虫18S rRNA基因的特殊区域，扩增片段测序结果表明：安徽牛源分离株(Cryptosporidium muris)781bp；北京鸡源分离株(C.baileyi)776bp；北京牛源分离株(C.muris)781bp；河南牛源分离株(C.muris)725bp；长春牛源分离株(C.muris)776bp；宁夏鸡源分离株(C.baileyi)725bp.该片段位于18SrRNA全序列271～1103bp之间。使用Ssp I限制性内切酶消化发现C.muris产生418～420bp和305～363bp两个片段，C.baileyi产生544～545bp和185～231bp两个片段。所检测的6个分离株可以显著区分为C.muris和C.baileyi两个种，所建立的PCR-RFLP可以有效鉴别隐孢子虫种类。     

伊犁河谷新疆褐牛隐孢子虫感染情况调查

为了解伊犁河谷区域新疆褐牛隐孢子虫病流行情况,从该地区的伊宁市和察布查尔锡伯自治县的4个养殖场采集356份粪便样品,提取基因组DNA,以隐孢子虫小亚基核糖体DNA(SSU rDNA)为靶基因,进行套式PCR扩增,并对阳性样品进行序列分析.结果显示:伊宁市和察布查尔锡伯自治县各有1个养殖场的新疆褐牛发现隐孢子虫感染,总的...     

隐孢子虫检测方法研究进展

隐孢子虫是一种能引起人、畜和野生动物共同感染的原虫.由于隐孢子虫卵囊很小,在光镜下观察缺乏明显的特征,检测比较困难,为寻找高效的检测方法,国内外学者在隐孢子虫检测方面进行了大量的研究.文章综述了近年来用于检测隐孢子虫的主要方法,并初步分析了各种方法的 优、缺点.     

Detection of Ehrlichia muris DNA from sika deer (Cervus nippon yesoensis) in Hokkaido, Japan

Ehrlichia muris DNA was detected in the blood of sika deer (Cervus nippon yesoensis) by species-specific PCR based on the citrate synthase gene, which was shown to be more sensitive than species-specific PCR based on the 16S rRNA gene. Among 102 deer examined, one deer was positive. Deer may be a possible mammalian reservoir of E. muris.