野生秦岭羚牛瘤胃产甲烷古菌多样性研究

[目的]了解野生秦岭羚牛瘤胃产甲烷古菌的组成及其多样性。[方法]提取野生秦岭羚牛瘤胃内容物总DNA,选用产甲烷菌特异性引物Met86F和Met1340R,对总DNA进行16S rRNA特异性扩增,构建秦岭羚牛瘤胃产甲烷古菌16S rRNA克隆文库,对阳性克隆进行PCR-RFLP(限制性内切酶片段长度多态性)分析,并对HaeⅢ酶切带谱不同的菌液进行测序,构建系统发育树。[结果]根据酶切带谱分析和测序结果的不同,将随机挑取的105个阳性克隆归为14个不同的可操作分类单元(OTUs)。系统发育分析表明,这些克隆序列均位于广域古菌门(Euryarchaeota),隶属甲烷杆菌科(Methanobacteriaceae,65.71%)、Methanomassiliicoccus(29.52%)和Methanosarcinaceae(4.76%)3个科。其中有57个序列与可培养菌相似度在97%以上,分属于Methanobrevibacter millerae、Methanobrevibacter olleyae和Methanobrevibacter thaueri。其余48个序列与未培养菌相似度较高,占11个OTUs。[结论]野生秦岭羚牛瘤胃产甲烷古菌多样性比较丰富,且可能存在新的分类单元。     

应用PCR-RFLP技术研究云南楚雄地区嗜盐古菌生物多样性

采用限制片段长度多态性-聚合酶链式反应(PCR-RFLP)技术对从我国云南省楚雄市一平浪盐矿样品中所分离的39株极端嗜盐古菌进行生物多样性分析研究.提取39株嗜盐古菌染色体DNA,将其作为模板,进行PCR扩增,PCR产物再用Hinf Ⅰ 酶切,琼脂糖凝胶电泳,结果显示电泳的条带和数目存在较大差异,说明云南地区嗜盐古菌资源丰富,且有较显著的遗传多样性.根据39株菌株所形成条带的相对位置和数目,初步将它们分为11个类群.     

分子生物学技术在活性污泥微生物多样性研究中的应用

对分子生物学技术在活性污泥微生物多样性研究中的应用情况进行了综述,重点对利用非培养方法直接分析活性污泥微生物多样性进行了较为全面的总结.其中就应用较多的RAPD、DGGE、T-RFLP、ERIC、SSCP、16S rDNA序列分析方法的优缺点进行了剖析,强调今后活性污泥微生物多样性研究应以多种分析方法综合应用为主.     

分子生物学技术在白粉菌分子遗传研究中的应用

介绍了几种常用的分子生物学技术（如RFLP、RAPD、SSR、ISSR、AFLP和对ITS的分析）的原理和特点,综述了这些方法在白粉菌遗传多样性、系统分类和构建遗传图谱等分子遗传学方面的研究进展 同时,阐述了上述方法在小麦白粉病抗性基因研究中的应用。     

分子生物学在媒介生物研究中的应用

随着分子生物学及其技术迅猛发展,分子生物学已成为现代生物学研究领域的热点之一,在媒介生物研究中也得到了越来越多的应用,为媒介生物的分类鉴定提供了可测量的指标,对媒介生物的分类地位和进化关系有了更准确的定位.就分子生物学在媒介生物研究中应用的一些新进展做了综述,以期为媒介生物资源的检测开发利用、虫媒病毒的检测分析及所传疾病的诊断和防制策略提供理论依据.     

分子生物学技术在植物病毒检测中的应用

为了实现植物病毒的预防和控制,需要建立起快速、高灵敏度、高通量的检测技术,对植物病毒进行高精度的检测.随着分子生物学技术的发展,其在植物病毒检测领域获得了重要应用,当前植物病毒检测领域常用的分子生物学技术包括核酸杂交技术、反转录PCR技术、荧光定量PCR技术和DNA微阵列技术,本文对这几种技术及其在植物病毒检测技术中的...     

瘤胃古菌的多样性研究进展

反刍动物瘤胃内由古茼驱动的甲烷生成不仅消耗了6%～10%的日粮能量摄入,而且生成甲烷气体是重要的温室效应气体.在全球气候变化的背景下,瘤胃古茵甲烷代谢调控成为关系畜牧业可持续性发展的重要课题.全面认识瘤胃中古菌多样性是寻找广谱、长效的瘤胃产甲烷调控方法的基础.通过对公共数据库中收录的3 112条瘤胃古茵16S rRNA基因序列进行分类和多样性预测分析,发现现有的古茵特异性引物与一些古菌种属的16S rRNA基因序列之间存在许多错配.瘤胃古茵群落在种属水平上的多样性较低,甲烷短杆茵(Methanobrevibacter)占到总数的70.1%,嗜酸球茵(Picrophilus)和甲烷球形茵(Methanosphaera)分别占13.5%和5.8%.瘤胃产甲烷古菌群落的组成也因受到宿主类型、日粮和环境等多重因素的影响而表现出较大的差异.这些结果拟为寻找一种高效、广谱的瘤胃古菌产甲烷活性的调控方法提供依据.     

几种主要分子生物学技术在菌物系统学研究中的应用

对几种主要分子生物学技术的基本原理及其在菌物发子系统学研究中的应用现状做一概述。     

利用白腐菌生物预处理强化秸秆发酵产甲烷研究

白腐菌对农业固体废物秸秆中的木质素具有较强的降解能力。采用秸秆生物预处理强化产甲烷试验装置进行了白腐菌对秸杆生物预处理后发酵产甲烷试验。结果表明,经白腐菌预处理后,秸秆的结构受到破坏,木质素含量降低,从而大大缩短了厌氧发酵周期,提高了甲烷转化效率。室温下用白腐菌预处理20d、厌氧发酵15d,甲烷转化率为47.63%,继续发酵至30d,甲烷转化率高达58.74%;39℃的温度下预处理10d、发酵5d就可以达到53.3%的甲烷转化率。采用秸秆预处理液作为连续序批式预处理的菌源时,甲烷产量显著下降,预处理液一次转接甲烷转化率为22.6%,二次转接仅为12%,检测分析显示白腐菌难以在后续的批处理中保持优势。     

分子生物学技术在营养学研究中的应用

随着生命科学的飞速发展，尤其是人类基因组测序工作的完成，分子生物学技术几乎渗透到生命科学的每一个领域，成为研究和揭示生命本质和规律的一种重要工具。就核酸分子探针与核酸分子杂交技术、基因芯片技术、mRNA差异显示技术等分子生物学技术在营养学研究中的应用及发展前景加以综述。     

天山北坡垂直自然带土壤古菌多样性分析

[目的]了解天山北坡垂直自然带土壤古菌多样性、优势种群及影响其分布的主要因素.[方法]利用末端限制性片段长度多态性(Terminal Restriction Fragment Length Polymorphism,T- RFLP),对天山北坡垂直自然带(山地荒漠带(H1),山地草原带(H2),山地森林带(H3),亚高山草甸带(H4),高山草甸带(H5),冰雪带(H6))土壤古菌多样性及主要影响因素进行研究.[结果]古菌多样性指数在山地森林带最低,高山草甸带和冰雪带最高;聚类分析表明,山地荒漠带、亚高山草甸带、高山草甸带和冰雪带聚为一类,山地草原带和山地森林带聚为一类;典范对应分析(CCA)表明:香依指数(Shannon index,H)和均匀度指数(Evenness,E)均与C/N,土壤湿度及海拔成正相关,与pH,土壤温度成负相关;T- RFs与pH,全氮,有效磷成正相关.[结论]天山北坡垂直自然带土壤古菌多样性丰富度较低,土壤pH、湿度、全氮及植被类型可能是影响其多样性的关键因素.     

志贺菌分子生物学检测方法研究现状

志贺氏菌又称痢疾杆菌,是细菌性痢疾的病原菌。多年来,志贺氏菌引起的鸡腹泻对养鸡经济效益的影响很大,已引起高度重视。着重介绍了志贺氏菌分子生物学检测方法的研究现状,为临床诊断治疗志贺氏菌引起的腹泻病提供可靠依据。     

生物多样性在生态农业中的应用

生物多样性是指生物圈中多个物种之间共存、共融、协同发展的基本规律.生物多样性广泛存在于生物圈的动物、植物、微生物界中.例如森林中由于生物多样性的存在,保持了森林的自然生长和繁茂;稻田养鱼、养鸭,鱼塘中多种鱼类共养等都属生物多样性的应用.又如同一地区同一季节,不同种类的作物多样分布种植;或同一地块两种或两种以上不同种类的作物搭配种植,它们能够互相促进,良好生长,也正是生物多样性原理的体现.     

分子生物学技术在瘤胃纤毛虫研究中的应用

综述了分子生物学技术在反刍动物纤毛虫研究中的应用,介绍了包括PCR-RFLPP、CR-RAPD、AFLPS、AP在内的分子标记技术和以SSU rRNA为主的实时定量PCR、单链构象多态性、变性梯度凝胶电泳等技术的原理及对纤毛虫多态性研究的贡献。     

分子生物学检测技术在我国进出境植物检疫中的应用及展望

综述了目前国际植物检疫上常用的实时荧光定量PCR技术、DNA条形码技术的发展和技术特点,分析了这2种技术在进出境植物检疫中的应用现状、存在不足以及技术局限性,并对分子生物学检测技术在我国进出境植物检疫中的应用前景做了展望。     

分子生物学技术在鞘翅目昆虫分类研究中的应用

随着生物技术的迅猛发展,分子生物学技术已越来越多地被应用在昆虫的分类学研究中.笔者概述了核酸序列分析、RFLP技术、RAPD技术、分子杂交技术、同工酶电泳技术、SSCP以及DSCP技术在鞘翅目昆虫分类研究中的应用情况,并展望了分子生物学技术在鞘翅目昆虫研究中的广阔前景.     

分子生物学技术在斑潜蝇研究中的应用

斑潜蝇是当今世界重要的检疫性害虫之一。分子生物学技术在潜蝇中的运用多集中在斑潜蝇属,且主要在种群分化和种类鉴定两方面。用于种类分子鉴定的技术有很多,新的方法也在不断地发表。主要介绍了分子生物学技术在斑潜蝇种群分化和种类鉴定两方面的国内外研究。     

GIS技术在生物多样性评价中的应用

针对生物多样性传统指标评价法无法全面、科学地反映微观尺度生物多样性空间特点进而影响其评价准确性的问题,基于土地利用数据和县域生物多样性分值,以贵州省为例,提出一种利用地理信息系统技术的区域生物多样性评价方法。结果表明,贵州省生物多样性分值为0.45,呈现北部、东北部和东南部较高,中西部较低的特点,自然植被和威胁地类比例的高低是影响生物多样性空间格局的重要因素。该方法可以将较大尺度的生物多样性水平进行微观、精细化空间表达,提高区域生物多样性保护能力。     

分子生物学技术在植物病毒检测中的应用

建立快速、高灵敏度、高通量的病毒检测体系是预防和控制植物病毒病的先决条件。综述了包括核酸杂交技术、反转录聚合酶链式反应、荧光定量PCR、DNA微阵列技术在内的分子生物学技术的特点及其在植物病毒检测和植物病毒病诊断中的应用。     

基于Biolog ECO板技术的小麦内生菌多样性研究

采用Biolog ECO板法研究小麦不同生育期、不同器官的内生菌多样性。结果表明,小麦整个生长周期中,叶部内生菌多样性水平显著高于根、茎部位;扬花期小麦内生菌多样性水平较高,其次是苗期和成熟期;且各组织部位内生菌种群丰度和均一度均较高。该研究了解了小麦各生育期、各器官内生菌的多样性,为小麦内生菌多样性与宿主关系的进一步研究奠定基础,同时为小麦病虫害的生物防治提供材料。