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维甲酸诱导基因1(RIG-1)是细胞质中侦测病原相关分子模式的识别受体。论文旨在扩增北京鸭RIG-1编码基因,并对其进行序列分析。通过PCR方法,从北京鸭脾脏中扩增得到RIG-1基因cDNA,并使用LaserGene分子生物学分析软件进行序列分析。结果发现北京鸭的RIG-1基因cDNA开放阅读框全长2 802bp,编码933个氨基酸。结构预测发现鸭RIG-1结构与哺乳动物类似,N端有两个串联CARD区,中间为DExD/H解旋酶区,C端为抑制区,各功能区起重要作用的氨基酸较为保守。同源性及进化树分析发现鸭RIG-1与鹅和斑马鱼的同源性最高分别为93.7%、78.4%,与哺乳动物同源性高于50%,与其他鱼类的同源性低于50%。成功扩增出北京鸭RIG-1基因cDNA编码序列,为鸭RIG-1的深入研究奠定了基础。 相似文献
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将禽流感病毒H9N2 亚型毒株核蛋白(NP)基因3′端较为保守的、约350bp 的编码序列通过限制性内切酶HaeⅢ切割、分离后,用随机引物法制备Digoxigenin11dUTP标记探针。测定该探针的浓度为100μg/m l。特异性试验发现该探针只能与实验室构建的、含有NP基因的重组载体pGEMTENP和pBacPAKNP以及A 型流感病毒H9N2亚型、H3N2 亚型以及H9N3 亚型毒株基因组RNA 结合出现特异性的颜色反应,而与实验室常用的载体pGEMT easy、pBacPAKHis 3、pTARGET 和pGEMEX2 以及新城疫病毒、传染性支气管炎病毒和传染性喉气管炎病毒基因组不发生反应。应用该探针检测含NP基因的重组载体和重组病毒证明该探针是有效的,可用于含禽流感病毒样品或材料的检测。 相似文献
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以口蹄疫病毒核酸为模板。在 AMV 反转录酶及底物的作用下合成cDNA,经聚合酶链反应(PCR)直接将生物素化脱氧核苷酸(Bio-11-duTP)掺入底物进行扩增,其产物即为寡聚核苷酸探针。将此探针应用于斑点杂交试验。检测口蹄疫病毒. 相似文献
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PCR扩增invA基因特异性检测沙门氏菌 总被引:14,自引:2,他引:12
建立了扩增invA基因检测沙门氏菌的PCR方法。对收集的50个血清型123株沙门氏菌及7种27株非沙门氏菌进行PCR,2%琼脂糖电泳检查,结果所有沙门氏菌都扩增出了300bp的特异性产物,非沙门氏菌都未扩增出此目的条带。产物的特异性由slot blot杂交进一步证实。通过电泳判定结果,该法可检出扩增体系中10pg染色体DNA及10~2cfu的纽波特沙门氏菌50029。为下步克隆而设计的两个酶切点(Bam HI,Eco RI)对引物的特异性没有影响。本研究为沙门氏菌的检测提供了简洁、敏感、特异的新方法,同时为克隆invA基因做属特异性探针打下了基础。 相似文献
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狍Sry基因PCR扩增的初步研究 总被引:3,自引:3,他引:3
为研究狍性别决定机制,采用聚合酶链式反应(PCR)技术对野生狍(Capreoluscapreolus)(n♀=2,n♂=2)Sry基因(哺乳动物Y染色体DNA雄性特异区)进行扩增。根据人的SRY基因核心序列设计合成了1对引物1,2。结果在野生狍雄性个体中扩增出1条带,大小约为220bp,而在雌性个体中未见扩增带,表明了Sry基因的性别特异性,为探讨野生狍的性别决定机制提供了分子资料。 相似文献
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用家兔外周血提取基因组DNA,根据欧洲家兔SRY基因的cDNA序列中开放性阅读框部分设计引物,采用PCR技术对基因组DNA进行了SRY基因检测。结果显示,SRY基因(+)是雄性决定基因,这对于幼兔的性别鉴定、性别选择及在胚胎时期诊断性连锁疾病有重要意义。 相似文献
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ST_1肠毒素基因的合成、克隆及其融合蛋白的高效表达 总被引:1,自引:0,他引:1
用DNA合成仪合成了编码ST1肠毒素第58到72位氨基酸残基的DNA片段,并将其与表达融合蛋白的载体PGEMEX-1重组,转化受体菌JM109(DE-3)。筛选出的重组克隆经过1PTG4小时诱导,ST1融合蛋白的产量超过超过细菌蛋白总量的40%,最高达59.9%。 相似文献
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应用RT—PCR技术扩增禽传染性支气管炎病毒S1基因的研究 总被引:2,自引:0,他引:2
选择S1基因做为目的基因,运用RT-PCR技术分别扩增12株以非免疫鸡胚繁殖并通过超速离心浓缩的鸡胚尿囊液中的IBV,所用引物为IBV Beaudette株S1基因两侧的对应序列,跨幅为1.72kb。结果6株IBV毒株(SAIB3、F、D41、H52、Holte)扩增出了长约1.7kb的S1基因片段,而另6株IBV毒株虽经4次RT-PCR重复后也显阴性。用HaeⅢ内切酶对6个毒株的RT-PCR产物 相似文献