西藏牦牛和黑白花奶牛生长激素基因Alu I多态性的比较研究

利用聚合酶链式反应（PCR）技术，测定了西藏牦牛和黑白花奶牛生长激素基因的Alu I-RFLP（限制性内切酶片段长度多态性），并比较了2牛群的基因频率。在西藏牦牛和黑白花奶牛中，等位基因A的频率分别为0.935和0.905，等位基因B的频率分别为0.065和0.065，卡方检验差异不显著（P＞0.05）。     

甘南牦牛GH基因的SNPs分析

[目的]甘南牦牛是分布在甘南境内的牦牛类群,是当地优势畜种之一.为了揭示甘南牦牛GH基因的结构特征,[方法]采用PCR-SSCP技术,对202头甘南牦牛生长激素基因(GH)5个外显子及部分内含子序列进行SNPs分析.[结果]表明:甘南牦牛GH基因第1、第2和第4外显子无多态性,第3内含子及第5外显子表现遗传多态性,其中第3内含子有AA、AB、BB 3种基因型,第5外显子有CC和CD 2种基因型,未发现DD基因型.序列分析发现,第3内含子1 694 bp处发生T→C单碱基转化;第5外显子2 154 bp处发现G→A单碱基突变,导致由甘氨酸(Gly)变为丝氨酸(Ser).甘南牦牛在2个基因位点上均表现为低度多态(PIC<0.25),χ2检验表明其处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05).结论 初步推测甘南牦牛GH基因的多态性相对贫乏.     

以GH基因多态性探讨中国南北黄牛及牦牛系统

以中心产区典型群随机抽样的方法,采用PCR产物直接测序的方法测定了18头雷琼牛、19头巴音郭楞州蒙古牛和18头巴音郭楞州牦牛GH基因外显子654 bp核苷酸碱基序列,引用GenBank中牛属普通牛、瘤牛、牦牛以及亚洲水牛GH基因同源区资料,作外类群以最大简约（MP）法与邻接（NJ）法构建分子系统发育树。旨在为探讨牛亚科家畜GH基因变异特点、牦牛跟我国南北黄牛关系的亲疏,以及牛亚科物种进化特征提供部分客观依据,适应进化与分子进化之间的关系提供局部的原始试验根据。结果发现雷琼牛GH基因序列中存在3个变异位点,定义了5种单倍型。在巴音郭楞州蒙古牛GH基因序列中存在2个变异位点,定义了4种单倍型。在巴音郭楞州牦牛GH基因序列中存在2个变异位点,定义了3种单倍型。确认GH基因的分化早于普通牛,瘤牛和牦牛的分化,就GH基因本身而言,牦牛与中国南北黄牛的关系无远近之分。     

猪生长激素基因及其多态性的研究概况

就猪生长激素（PGH）基因的定位，结构，多态性研究概况作一简要地介绍，并对以后的研究方向作了展望。     

牦牛生长激素释放激素基因的克隆及序列分析

本文对牦牛GHRH基因进行PCR产物T—A克隆测序。通过GenBank中的Blastn分析表明：牦牛GHRH基因与普通牛同源性为98％，与猪同源性为89％。在所测序列中共有7个变异位点，变异率为1．6％，其核酸变异类型包括转换、颠换和插入，以转换最为常见。     

大通牦牛和天祝白牦牛DRA基因外显子的多态性分析

本实验通过对大通牦牛和天祝白牦牛DRA基因外显子的部分CDS区序列进行分析,测序分析后发现,两种不同牦牛的基因突变位点有所不同,大通牦牛的有一个错位突变,而天祝白牦牛只有沉默突变,从中可以看出两种牦牛在基因上的具体差异。可能是由于生活环境的差异,导致出现这种情况。     

西藏牦牛和黑白花奶牛生长激素基因AluⅠ多态性的比较研究

利用聚合酶链式反应 (PCR)技术 ,测定了西藏牦牛和黑白花奶牛生长激素基因的AluⅠ RFLP (限制性内切酶片段长度多态性 ) ,并比较了2牛群的基因频率。在西藏牦牛和黑白花奶牛中 ,等位基因A的频率分别为 0 935和 0 90 5 ,等位基因B的频率分别为 0 0 65和 0 0 65 ,卡方检验差异不显著 (P >0 0 5)。     

草原红牛生长激素基因遗传多态性研究

为寻找可用于标记辅助选择的分子标记,研究以草原红牛为试验群体,采用单链构象多态性（PCR—SSCP）方法检测了GH基因遗传多态性,并对GH基因多态片段进行了克隆、测序,确定了多态位点的变异位置和碱基类型。检测结果表明：在GH基因5’末端、第3内含子、第4内含子、外显子5和3’末端存在多态性位点,其中在5’上游431处有一个A→G碱基的突变,在1435处发生了T→C的突变,第4内含子1918处发生了C→A的突变;外显子5的2291处发生了碱基A→C突变;3’末端2639处发生了碱基C→G突变,并导致一个HaeⅢ酶切位点的增加;同时与GenBank中序列（accession numberM57764）相比较,草原红牛在1692处有C→T的突变,在2735处有碱基T→C突变,这些突变位点为草原红牛所特有。     

牦牛生长激素基因cDNA分子克隆及进化分析

根据GenBank中登录的牛、山羊和绵羊等动物的生长激素基因序列的比对结果,设计特异性引物,分别从甘南黑牦牛和天祝白牦牛脑垂体中提取RNA,采用RT-PCR技术克隆,测序获得707 bp的片段。结果表明:该片段包含牦牛生长激素基因完整的开放阅读框,长654 bp,编码217个氨基酸。与牛的核苷酸序列相比,牦牛第607位碱基为A,而牛为C,但这一碱基差异并未导致氨基酸残基的变化,均编码精氨酸。牦牛生长激素基因编码区序列与牛、山羊、绵羊、马、猪、猫和犬的同源性分别为99.8%、98.6%、97.7%、90.6%、90.1%、89.1%和88.9%,氨基酸序列同源性分别为100%、99.1%、98.6%、88.9%、88.5%、88.9%和89.4%,表明生长激素基因在进化上非常保守。基于CDS序列和氨基酸序列建立的系统进化树结果一致,且与比较形态学和比较生理学分类结果一致。     

研究猪品种生长激素(pGH)基因的多态性

本文在对猪品种生长激素基因多态性进行研究的同时,借助于PCR和测序技术,对11个猪品种的生长激素基因全序列多态性进行检测,43个SNPS和1个位于内含子3的7bp缺少片段被检测出,结果表明,猪品种之间的某种遗传分化在某种程度上不仅仅与地理的分布有关,同时和其基因的交流也有着直接性的关系。     

牦牛LHB基因的分子克隆与序列分析

采用PCR法成功克隆出牦牛LHB基因的序列,在NCBI上的登录号为DQ508150。牦牛LHB基因的cds长426bp,编码141个氨基酸的产物。同源性分析,多个物种间LHB基因编码区的序列相似性在80％以上。通过牦牛与奶牛在LH的氨基酸序列上的比对发现,存在三处残基的差异,精氨酸-谷氨酰胺、甲硫氨酸-缬氨酸、苏氨酸-丙氨酸。     

牦牛垂体特异转录因子-1、生长激素和α-乳清蛋白基因多态性的分析

利用PCR-RFLP技术分析了麦洼牦牛、九龙牦牛和西藏牦牛GH、Pit-1和α-LA基因的多态性。采用普通牛所用的PCR引物均能在牦牛上正确地扩增出上述几个基因相应大小的片段。GH、Pit-1和α-LA(-1689)基因特定位点均未检测到多态性,基因型分别为AA、BB和AA;利用PCR-RFLP分析牦牛乳蛋白基因型具有准确、快速的特点,并能对新生牦牛和公牦牛乳蛋白或泌乳相关基因型进行分析。     

鸡生长激素基因内含子4新等位基因的序列分析

试验以粤黄鸡矮脚黄系等不同肉鸡、蛋鸡品种（系）作为试验材料，对新发现的生长激素基因内含子4等位基因的PCR产物作纯化测序，研究多态性产生的机理及碱基变异情况。结果发现cGH内含子4长约1170bp，内含子4的A、B、C、D等位基因长分别为1170bp、1164bp、1168bp，它们之间存在不同程度的碱基差异，而第580碱基的突变（A→G）和第688碱基的突变（A→G）分别产生了MspⅠ酶切位点，是多态性形成的根本原因。“PCR产物双带”的形成是由于cGH基因内含子4其中一条链上第420－470位碱基全部缺失，不同等位基因间存在碱基缺失、插入和替换，测序结果与酶切后电泳结果相吻合。     

蕨麻猪生长激素基因的同源性和多态性分析

为了探索蕨麻猪的遗传多样性,对蕨麻猪生长激素基因序列的多态性进行研究,并选择GenBank中14条序列作为比较研究对象;首次成功克隆了7条蕨麻猪生长激素基因,测出5条蕨麻猪生长激素基因DNA序列,其多态性是内含子1有1个转换和1个颠换;内含子2有2个转换。说明蕨麻猪之间的差异可能与内含子的控制有关。蕨麻猪与其他14种猪之间在编码区和非编码区共检测到核苷酸的变异为155个,内含子有119个,外显子有28个,5′端有8个。其中,颠换104个,转换14个,缺失23个,插入14个。出现碱基取代的位点中,大多数是颠换型突变,颠换与转换之比为7.43∶1,存在颠换偏倚现象。对蕨麻猪生长激素基因同源性百分数和趋异数分析,结果发现,蕨麻猪与小型猪相比同源性较近,蕨麻猪与大型猪同源性较远。蕨麻猪等15 种猪生长激素基因序列树状图分析,结果表明,蕨麻猪与Vize猪有较远的亲缘关系;蕨麻猪与贵州榕江香猪亲缘关系最近。     

鸭生长激素(GH)基因编码区及调控区多态性分析

根据鸭生长激素基因编码区及调控区的序列设计8对引物,利用PCR-SSCP方法对北京鸭、西湖野鸭、樱桃谷鸭、金定鸭、山麻鸭、荆江鸭、绍兴鸭、缙云麻鸭等8个鸭种进行单核苷酸多态性分析。结果共发现3个突变位点,分别为230处（C→G）、244处（C→A）和3 701处（C→T）。前两处突变位于5′调控区,3 701处突变位于编码区第4外显子,但该编码区的突变是沉默突变,3′调控区表现了高度的保守性。统计结果发现：⑴在5′调控区基因座上,金定鸭的等位基因B频率显著高于其他品种;⑵在外显子4基因座上,基因型频率的分布与品种有关,且肉用型鸭的CC基因型频率显著高于蛋用型。可以推测,本研究所检测到的基因座可能与生产性能相关。     

鸭生长激素基因5’-UTR和3’-UTR多态性分析

作者根据生长激素基因5’-UTR和3’-UTR的序列设计5对引物,用PCR-SSCP的方法对北京鸭、西湖野鸭、樱桃谷鸭、金定鸭、山麻鸭、荆江鸭、绍兴鸭、缙云麻鸭等8个品种共436个样本进行了单核苷酸多态性分析,并在第1对引物中检测到了多态性。对2种类型的片段纯化测序,结果发现在5’-UTR第230位和244位碱基发生了突变,分别由C突变为G、由C突变为A。但只在金定鸭、荆江鸭、绍兴鸭中发现多态，统计分析结果显示金定鸭的AB基因型频率显著高于荆江鸭和绍兴鸭，且金定鸭A等位基因的频率也显著高于荆江鸭和绍兴鸭。     

肉牛生长激素基因Hae Ⅲ座位多态性与主要生产性能的相关研究

本研究利用PCR RFLPs标记技术 ,对 6 3头杂种肉牛的生长激素基因的第 5外显子和 3’端区域进行了分析研究 ,发现HaeⅢ酶切座位具有多态性 ,并分为三种基因型 (即AA、BB和AB型 ) ,通过构建最小二乘线性模型 ,分析了生长激素基因型与杂种肉牛 12月龄体重和 6 - 12月龄日增重的关系。结果表明 :生长激素AB基因型的效应稍高于AA、BB型 ,但差异不显著     

不同季节高原型牦母牛生殖激素水平的测定

通过对非发情周期中不同生理状况高原型牦母牛在青草期和枯草期四种生殖激素水平的测定,发现空怀母牛、青年母牛的雌激素、孕酮、促黄体素的基础水平青草期高于枯草期。说明营养的供给影响雌激素、孕酮、促黄体素的基础水平。     

鹅生长激素基因内含子2多态性分析

利用PCR-SSCP方法对籽鹅、皖西白鹅、浙东白鹅和狮头鹅4个地方鹅种进行了单核苷酸多态性分析,共检测到4个突变位,最,即360处A／G、474处C／G、551处T／C和554处C／T,产生EE、EF和FFS三种基因型。Х^2检验结果表明：4个鹅种均处于Hardy—Wenberg平衡状态（P〉0．05）,籽鹅基因型频率的分布与浙东白鹅差异显著（P〈0．05）,与狮头鹅差异极显著（P〈0．01）,皖西白鹅基因型频率的分布与狮头鹅差异显著（P〈0．05）。