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以春兰为研究材料,对春兰基因组DNA的提取以及RAPD-PCR反应体系进行了优化.结果表明,在提取液中加入PVP和β-巯基乙醇去除酚类物质,采用高盐沉淀DNA和多次洗涤去除糖类,可以得到高质量春兰基因组DNA.电泳检测表明,所获得的DNA完整,无降解,完全可以满足RAPD等分子标记分析的需要.同时对春兰RAPD-PCR反应体系中各个影响因素进行了优化,建立了适合春兰RAPD分子标记的最佳反应体系,即20μl反应体系中含1UTaqDNA聚合酶,60μmol/L dNTPs,2.25mmol/L Mg2+,1.0μmol/L引物,1.5ng/μl模板DNA. 相似文献
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橡胶草基因组DNA提取及RAPD反应体系的优化 总被引:1,自引:1,他引:0
为探索适合橡胶草基因组DNA的提取方法和RAPD反应体系。采用改良CTAB法提取橡胶草叶片总DNA,得到的DNA能满足RAPD分析需要。通过单因子实验法分析DNA浓度、引物浓度、dNTPs浓度、Taq聚合酶以及Mg2+浓度对RAPD扩增结果的影响,建立了适合于橡胶草RAPD分子标记的最佳反应体系,即20 μL体系中包括:模板DNA30 ng、Taq DNA聚合酶1.75 U、dNTPs浓度0.25 mmol/L、Mg2+浓度2.0 mmol/L、引物浓度0.5 μmol/L、10×PCR Buffer 2.0 μL。RAPD扩增反应程序为:94℃预变性5 min,94℃ 30 s,37℃ 30 s,72℃ 70 s,45个循环,最后72℃延伸10 min。该反应体系具有较好的稳定性及可重复性。 相似文献
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马蓝基因组DNA提取及RAPD反应体系的优化 总被引:1,自引:1,他引:0
摘 要:以马蓝为研究材料,对马蓝基因组DNA的提取以及RAPD-PCR反应体系进行了优化。结果表明,在提取液中加入PVP和β-巯基乙醇去除酚类物质,采用高盐沉淀DNA和多次洗涤去除糖类,可以得到高质量的马蓝基因组DNA。电泳检测结果表明,所获得的DNA完整,无降解,完全可以满足RAPD等分子标记分析的需要。同时对马蓝RAPD-PCR反应体系中各个影响因素进行了优化,建立了适合马蓝RAPD分子标记的最佳反应体系,即20μl反应体系中含有1.25UTaqDNA聚合酶,0.25mmol/LdNTP,2.5mmol/LMg2+,50ng模板DNA,1.0μmol/L引物;反应程序中最佳退火温度为38℃。 相似文献
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旨在筛选出绣线菊属 RAPD 反应的最佳体系,为绣线菊属植物种质资源遗传多样性和亲缘关系的研究奠定基础.试验以 10 种绣线菊属植物为材料,采用改良 CTAB 法进行冬芽和嫩叶的总 DNA 提取并对影响 RAPD 扩增效果的因素进行优化.通过单因素优化筛选出最佳的 20μl 反应体系10×Taq buffer 2μl,Taq 酶 1.0U,0.15mmol/L dNTP,DNA 2ng/μl,引物 0.21μ mol/L,Mg2 2.0mmol/L;反应程序94℃预变性 4min,然后进行 40 个循环94℃变性 45s,37℃退火 1min,72℃延伸 1min.最后72℃延伸5min,4℃终止反应.结果发现,采用改良 CTAB 法所提取绣线菊冬芽的 DNA 达到 RAPD 反应的要求.筛选体系扩增出清晰稳定的多态性条带,可用于对绣线菊属遗传育种方面的研究. 相似文献
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黄瓜DNA提取及优化SSR反应体系的建立 总被引:3,自引:0,他引:3
本文简化了黄瓜DNA提取程序并探讨了黄瓜SSR反应程序及体系.反应体系25 μL:10×buffer 2.5 μL,2.5 mmol/L MgCl2 2.0 μL,2 mmol/L dNTP 2.5 μL,gDNA模板(10 ng/μL)2 μL,forward primer(10 pmol/μL)0.5 μL,reverse primer(10 pmol/μL)0.5 μL,ddH2O 14 μL,Taq DNA聚合酶(1 U/μL)1 μL.反应程序:95℃预变性5 min,94℃变性30 sec,49℃退火1 min,72℃延伸90 sec,循环次数35,72℃延伸5 min. 相似文献
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香蕉RAPD反应体系的建立 总被引:2,自引:1,他引:2
利用改良的CTAB方法从香蕉叶片中提取高质量的DNA。在参考一般RAPD分析反应程序的基础上,经过反复试验,确定适合香蕉PCR扩增程序为:94℃预变性 5min;94℃变性 1min;38℃退火 1min;72℃延伸 2min;变性ó延伸,循环45次;最后72℃延伸 2min。PCR扩增的体系(总体积25μL)为:模板DNA 20ng,dNTP 200μmol/L,10×PCR Buffer2.5μL,引物0.20μmol/L,Taq酶0.75U,ddH2O17.85μL。 相似文献
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大白菜基因组DNA的提取及AFLP反应体系的建立 总被引:1,自引:0,他引:1
以大白菜嫩叶为材料,利用改进的CTAB法,提取到高质量的大白菜叶片总DNA,通过优化酶切、连接、预扩增、选择性扩增等试验条件,建立了大白菜AFLP银染反应体系,得到了清晰的大白菜AFLP指纹图谱为大白菜品种的分子标记和大白菜品种间亲缘关系等研究奠定了基础.研究结果表明:(1)DNA模板的质量影响酶切以及后续的连接扩增反应,改良的CTAB提取法可用于大白菜AFLP分析,形成清晰的AFLP指纹.(2)大白菜基因组DNA最佳酶切反应体系为:模板DNA总量150ng,反应体积为12.5μL,EcoR I 1.25 U,Mse I 1.25U,5xReaction Buffer,最佳酶切时间为:37℃酶切4h.连接反应于20℃连接2.5h即达最佳效果.(3)6对引物组合(E-AAC/M-CAG、E-AAG/M-CAC、E-ACA/M-CTG、E-ACT/M-CAC、E-ACT/M-CTT、E-ACT/M-CTC)均获得稳定、清晰的扩增图谱,可进行中国大白菜的遗传变异分析. 相似文献
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芥蓝RAPD反应体系的建立 总被引:2,自引:2,他引:0
利用改良的CTAB方法从芥蓝叶片中提取高质量的DNA。在参考一般RAPD分析反应程序的基础上,经过优化试验,确定适合芥蓝PCR扩增体系(总体积25μL)为:25mmol/LMgCl2 2.0μL、10×PCR Buffer 2.5μL、2.5mmol/L dNTPs2.0μL、5U/μLTaq酶0.25μL、5μmol/ L 引物1.2μL、模板DNA 25ng、灭菌双蒸水12.25μl。PCR扩增程序为:94℃预变性5min,94℃变性1min,36℃退火1min,72℃延伸2min,40个循环,72℃延伸10min。 相似文献
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冬虫夏草RAPD反应体系的建立及优化 总被引:1,自引:0,他引:1
为建立并优化冬虫夏草RAPD反应体系,通过改变RAPD反应体系中Mg2+、dNTP、引物、模板等主要成分的浓度,结合RAPD扩增效果,建立冬虫夏草RAPD反应体系,然后通过改变主要热循环参数,优化冬虫夏草RAPD反应体系。结果表明:适合冬虫夏草的RAPD反应体系为25 μL体系中内含1×PCR缓冲液、1.5 μmol/μL Mg2+、320 μmol/L dNTP、24 ng引物、20 ng模板、1 U Taq酶;扩增程序的优化结果为:95℃预变性5 min,然后35个循环(94℃变性45 s,36℃复性1 min,72℃延伸2 min),循环结束后72℃延伸7 min。综上,RAPD技术可用于冬虫夏草的鉴定、评价分析。 相似文献
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苏丹草RAPD反应条件的优化与应用 总被引:1,自引:0,他引:1
为研究不同因素对苏丹草随机扩增多态性DNA(RAPD)反应体系的影响,建立并优化反应体系;再利用优化体系绘制了DNA指纹图谱以区分两个高丹草品种。提取苏丹草的基因组DNA,分别设置Mg2+浓度为1.0 mmol/L、1.5 mmol/L、2.0 mmol/L、2.5 mmol/L、3.0 mmol/L;退火温度为34℃、35℃、36℃、37℃、38℃;Taq酶含量为0.6U、0.8U、1.0U、1.2U、1.4U进行PCR扩增。结果表明:Mg2+2.0mmol/L,退火温度36度,Tap酶活性值1.2U是进行苏丹草RAPD分析的最优反应条件。利用最优反应条件绘制了皖草2号和皖草3号的DNA指纹图谱,在该图谱中有A、B两条特征带,可以区分皖草2号和皖草3号。 相似文献
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黄花矶松基因组DNA的提取以及RAPD反应体系的优化 总被引:1,自引:0,他引:1
RAPD-PCR是从核酸水平鉴定DNA变异的一种快速、有效的方法,在植物的分子水平检测中得到广泛的应用。本文分别采用SDS法和CTAB法对黄花矶松基因组DNA进行了提取,筛选了适合黄花矶松的基因组DNA提取方法,研究了RAPD反应体系中不同Mg2+浓度,不同的退火温度等条件对PCR扩增的影响,建立了适用于黄花矶松基因组分析的一种简便、有效的RAPD方法。 相似文献
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杨树基因组DNA提纯方法的优化及其RAPD鉴定 总被引:7,自引:1,他引:6
xiangyan@ahau.edu.cn 《中国农学通报》2006,22(5):59-59
(安徽农业大学林学与园林学院,合肥 230036) 相似文献