贵州小香鸡生长激素基因单核苷酸多态性分析

本研究采用直接测序法对贵州小香鸡生长激素(growth hormone gene,GH)基因的2~3外显子区域进行多态性分析。结果显示,在第2内含子处出现4个SNPs位点:G47A、T170C 、T334C和G393A。卡方检测结果表明,T33C处显著偏离了Hardy-Weinberg平衡(P＜0.05),其它3个SNPs位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P＞0.05)。     

陇东绒山羊GH基因SNP与部分经济性状的相关性分析

以陇东绒山羊为研究对象,选择生长激素(GH)基因作为候选基因,采用PCR-SSCP分子标记技术和DNA测序技术检测GH基因多态性,然后运用最小二乘方差分析法对不同基因型间生长发育性状及产绒性状进行显著性检验。结果表明:在GH基因外显子4区域1 450 bp处发生了C→T的单碱基突变;该多态位点对产绒性状无显著影响(P0.05),而对部分体重、体尺指标有显著影响(P0.05);6月龄重、周岁重、胸围等指标,HH型显著高于GG型和GH型(P0.05)。由此推测:HH型可以作为陇东绒山羊早期生长发育性状辅助选择的标记基因型。     

贵州地方黄牛GH基因多态性及生物信息学分析

为分析贵州地方黄牛GH基因多态性,筛选出对本地黄牛生长性状有显著影响的SNPs位点,本研究以贵州4个地方牛种(关岭牛、思南牛、威宁牛、黎平牛)为研究对象,采用直接测序法检测贵州地方黄牛GH基因多态性,利用生物信息学软件对贵州黄牛GH基因进行分析。结果显示:4个地方牛种中共发现2个SNPs,分别为Exon5-G1570C和Exon5-A1720C,Exon5-G1570C为错义突变,Exon5-A1720C为同义突变;其中黎平牛仅存在1个SNPs位点(Exon5-A1720C),其余3个品种均有2个SNPs位点;生物信息学分析表明,牛GH蛋白相对分子质量为27 385.45,理论等电点为6.90,疏水值最大为3.133,亲水值最小为-2.767,属于跨膜蛋白,稳定性较高;突变前后GH基因mRNA二级结构发生改变,Exon5-G1570C位点mRNA自由能升高,稳定性降低;Exon5-A1720C位点mRNA自由能降低,稳定性升高。本实验成功筛选出贵州地方黄牛GH基因的多态位点,可为筛选贵州地方黄牛与生长相关的分子遗传标记奠定理论基础。     

黔东南小香鸡IGF1基因SNP的鉴定及对体重、体尺性状的影响

为了探究胰岛素样生长因子1(insulin like growth factor 1, IGF1)基因对家禽生长性状的影响,试验利用PCR扩增结合直接测序的方法,对黔东南小香鸡单核苷酸多态性(SNP)进行筛选,并对SNP位点所对应的基因型遗传学进行分析,同时运用SSPS 18.0软件中一般线性模型对基因型与体重、体尺指标进行关联性分析。结果表明：在试验群体中发现IGF1基因第3外显子62 bp处存在1个SNP位点,该位点属于同义突变,并未引起编码氨基酸改变,GA基因型为优势基因型,G等位基因为优势等位基因,该基因座满足Hardy-Weinberg平衡(P>0.05);该SNP位点与黔东南小香鸡体重、体尺性状不存在显著性关联。说明IGF1基因第3外显子62 bp处发生G>A突变,虽然其不影响黔东南小香鸡的生长性状,但可以考虑作为黔东南小香鸡分子遗传标记辅助选育参考位点之一。     

黔东南小香鸡生长曲线拟合研究

为探究黔东南小香鸡的生长发育规律,本研究用Logistic、Gompertz和von Bertalanffy3种生长曲线模型拟合分析不同性别黔东南小香鸡体重发育特征.结果 表明:3种模型均能较好地拟合黔东南小香鸡体重生长曲线,且拟合度(R2)达0.990以上.3种生长曲线模型对公鸡体重的R2分别为0.993、0.997...     

温岭草鸡GH基因多态性及其与生长和屠体性状的相关性研究

以温岭草鸡优质、中速和快大3个品系为试验材料,采用PCR-RFLP方法,研究其生长激素(GH)基因的多态性及其对生长和屠体性状的影响。结果表明:(1)PCR产物酶切得到AA、AB、BB、CC、AC和BC共6种基因型。优质系(Ⅰ)中,C基因频率最高,A基因频率最低;中速系(Ⅱ)中,各等位基因频率接近;快大系(Ⅲ)中,B基因频率最低,A、C基因频率接近。(2)3个品系PIC值均大于0.5,χ2检验显示3个品系中,6种基因型分布差异极显著(P<0.01);Hardy-Weinberg平衡检验表明,品系Ⅰ和Ⅱ符合平衡定律,品系Ⅲ不符合。(3)GLM分析表明,基因型对全净膛重、腿肌重和腹脂重影响显著(P值分别为0.039、0.047、0.016),对活重、屠体重、半净膛重及胸肌重影响不显著(P>0.05)。多重比较显示,BC基因型的活重、屠体重、半净膛重、全净膛重、胸肌重和腿肌重的平均值最大,AA基因型最小;BB基因型的腹脂重平均值最大,AA基因型最小,二者差异极显著(P<0.01)。     

黔东南小香鸡MEF2C基因外显子多态性及其与体重、体尺性状的关联分析

【目的】探究肌细胞增强因子2C(myocyte enhancer factor 2C,MEF2C)基因多态性对黔东南小香鸡体重和体尺性状的影响。【方法】试验以251羽300日龄黔东南小香鸡为研究对象,利用PCR扩增和直接测序技术对MEF2C基因全部(15个)外显子进行单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)位点筛选,并运用SPSS 18.0统计分析软件对不同SNPs位点所对应的基因型与黔东南小香鸡的体重、体尺性状进行相关性分析。【结果】黔东南小香鸡群体中仅在MEF2C基因外显子12上发现3个SNPs位点：g.1819 T>C、g.2426 T>C和g.2543 C>T,在其他外显子中未发现多态位点。χ²检验结果表明,3个SNPs在黔东南小香鸡群体中均偏离Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05)。关联分析结果显示,g.1819 T>C位点TC基因型个体体斜长、胸深和胫围均极显著高于TT和CC基因型,体重极显著高于TT基因型(P<0.01);TC基因型个体胫长显著高于TT和...     

撒坝猪SLA-DQA基因多态性与生长性状的相关性分析

应用PCR-RFLPs方法检测撒坝猪SLA-DQA基因突变位点多态性,通过最小二乘分析进行基因型与生长性状表型值的相关分析,结果表明SLA-DQA基因3种基因型在所分析的几个阶段体重和6月龄体尺性状上差异均未达到显著水平,且而在0⁴5日龄日增重和70日龄45日龄日增重和70日龄⁴月龄日增重上AA基因型与AB基因型间的差异达到显著水平,大多数生长性状都以BB型的较高。     

荆江麻鸭GH基因第4外显子SNP及其与体性状的关联研究

采用PCR-SSCP方法检测了96只荆江麻鸭生长激素基因第4外显子序列多态性,并分析了基因多态性与屠体性状间的关系.结果发现,在荆江麻鸭生长激素基因第4外显子中检测到1个突变位点,为3701 nt处C→T碱基转换,产生AA、BB和AB3种基因型,其中野生基因型BB为优势基因型(54.17%).卡方检验结果表明,群体该位点处于遗传平衡状态(P＞0.05).最小二乘分析结果表明,AA基因型个体全净膛率显著高于BB基因型(P＜0.05).初步推断,GH基因可作为影响荆江麻鸭部分屠体性状的候选基因(标记),其中突变基因型AA为有利基因型.     

西藏绒山羊GH基因的PCR-RFLP检测及其与生产性状的相关性

利用PCR-RFLP标记技术及序列分析,对245只西藏绒山羊的GH基因的多态性位点进行检测.结果发现:GH基因在西藏绒山羊群体中存在HaeⅢ内切酶位点多态性,存在AA、AB和BB三种基因型,基因型频率分别为0.012、0.610和0.378,PIC=0.339,属于中度多态,经x2适应性检验,该位点处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P＜0.05).AB基因型和BB基因型与生产性状相关性分析结果表明,基因型和性别的互作,对研究群体的十字部高、毛长和产绒量有极显著的影响(P＜0.01).由此可见,GH基因的HaeⅢ内切酶位点可能是影响西藏绒山羊生产性状的主效QTL或与之紧密连锁,可作为西藏绒山羊生产性状的辅助选择标记.     

STAT5b基因2个SNPs位点与京海黄鸡生长和繁殖性状的关联分析

采用PCR-SSCP方法检测京海黄鸡、AA鸡、尤溪麻鸡、边鸡4个鸡品种STAT5b基因5′调控区部分序列的多态性,并分析其对京海黄鸡生长和繁殖性状的遗传效应,利用PHASE软件对2个多态位点进行单倍型分析。在5′调控区检测到C-1591T、G-250A 2个SNPs;单倍型分析产生4种单倍型H1(CG)、H2(TG)、H3(CA)、H4(TA),单倍型组合H1H4对初生重有极显著影响(P0.01);单倍型组合H3H4与8、16周龄体重存在正相关(P0.05),单倍型组合H1H2对开产蛋重有极显著影响(P0.01);单倍型组合H3H4的开产体重极显著高于其他单倍型组合(P0.01);在300日龄体重上,单倍型组合H1H1和H1H3显著高于H4H4(P0.05)。京海黄鸡STAT5b基因5′调控区的多态性对其生长和繁殖性状有一定影响,但是否可以作为影响京海黄鸡生产性状的遗传标记需进一步研究。     

IGFBP-3基因在两个品种鸡组织中的表达及其与生长性状的相关性分析

为研究IGFBP-3基因表达与鸡生长性状的相关性,以生长速度差异较大的花山麻鸡和清远麻鸡两个黄羽肉鸡品种为研究素材,用实时荧光定量PCR法检测胚胎期和出雏后两个品种鸡胸肌和肝脏中IGFBP-3基因的表达规律,并将其与体重、胸肌重和肝脏重进行相关性分析。结果表明,在9胚龄时两个品种鸡胸肌和肝脏中均可检测到IGFBP-3基因表达,同一胚龄或日龄品种内组织间比较,胚胎期两个品种鸡胸肌IGFBP-3 mRNA表达量均高于肝脏,出雏后肝脏IGFBP-3 mRNA表达量迅速上升,胸肌IGFBP-3 mRNA表达量下降,两个品种鸡肝脏IGFBP-3 mRNA表达量均极显著高于胸肌（P<0.01）;组织中IGFBP-3 mRNA表达量与组织重量和体重相关研究表明,两个品种鸡肝脏IGFBP-3 mRNA表达量与其胸肌重、肝脏重和体重呈显著或极显著正相关（P<0.05;P<0.01）,胸肌IGFBP-3 mRNA表达量与其胸肌重、肝脏重和体重均呈极显著负相关（P<0.01）。研究结果揭示,IGFBP-3 mRNA在鸡中的表达具有品种、年龄和组织特异性,出雏前肝脏并不是鸡产生IGFBP-3的主要器官,出雏后鸡IGFBP-3可能主要由肝脏合成,肝脏中IGFBP-3 mRNA水平差异是导致两个品种鸡出雏后体重和胸肌重差异的重要因素。     

藏鸡IGF—I基因的SNPs检测及与生长性状的关联分析

通过PCR-RFLP技术对藏鸡和隐性白羽鸡类胰岛素生长因子-I（IGF-I）基因的5’非翻译区（UTR）的2个位点进行了多态性检测。检测结果显示，该基因具有HinfI和PstI多态现象.测序结果表明，HinfI识别位点发生了A→C突变，PstI识别位点发生了C→T突变，从而在2群体中分别产生了3种基因型，而出现了8种单倍型组合。单倍型组合的x^2检验结果表明，2个品种间存在极显著差异（P〈0．01）。方差分析结果显示，品种对所分析的17个生长发育性状都有显著影响（P〈0．05或P〈0．01），性别对6个生长发育性状有显著影响（P〈0．05或P〈0．01），而基因型或单倍型组合对5个生长发育性状（初生重、2周龄体重和胫围、7周龄体斜长以及16周龄胫围）有显著影响（P〈0．05或P〈0．01）。同时，基因型或单倍型组合与品种之间的互作对鸡的部分生长发育性状也有一定的影响。另外，基因型CT在鸡初生重和7周龄体斜长上显著（P〈0．05）或极显著地（P〈0．01）高于基因型CC和TT，而单倍型组合A＋T／C＋T在鸡初生重、2周龄体重和胫围以及16周龄胫围上显著（P〈0．05）或极显著地（P〈0．01）高于其它6种单倍型组合。     

中国西门塔尔牛GH基因SNPs与经济性状的关联分析

本试验采用PCR-RFLP和DNA测序等技术检测牛生长激素基因P3位点(growth hormone,GH-P3)在中国西门塔尔牛群体中的多态性,并利用最小二乘法拟合线性模型对该位点与牛经济性状进行关联分析。结果表明,BB基因型个体胴体重和净肉重极显著高于AA和AB基因型个体(P<0.01),屠宰率和净肉率显著高于AA和AB基因型(P<0.05),AA基因型背膘厚极显著低于AB、BB基因型(P<0.01)。本研究结果显示,GH-P3位点对中国西门塔尔牛个体胴体重、屠宰率、净肉重、净肉率及背膘厚等经济性状有显著或极显著的影响,为中国西门塔尔牛重要经济性状的分子标记辅助选择(MAS)及品系培育提供理论依据。     

三鸡种NLRC5基因编码区SNPs及其与部分免疫性状的关联分析

本研究通过检测鸡NLRC5基因编码区域单核苷酸多态位点,以期分析与免疫性状相关的遗传标记。采用PCR-SSCP方法对3个鸡品种NLRC5基因编码区SNPs进行检测,仅在外显子8区域发现多态位点,其中在文昌鸡中检测到AA、BB和AB 3种基因型,如皋鸡中检测到AA和AB 2种基因型,安卡鸡中仅存在AA基因型。序列分析结果显示,NLRC5基因外显子8存在G43A同义突变。测定部分免疫性状,分析不同鸡品种之间以及不同基因型与免疫性状间的关联性,结果表明:安卡鸡H/L值、ND抗体滴度、IL-1浓度均显著高于如皋鸡和文昌鸡(P0.05),AI抗体滴度极显著低于其他2个品种(P0.01),如皋鸡SBRC抗体滴度最高,但3个品种之间差异不显著(P0.05);不同基因型同免疫性状之间,AA型个体各项性状值均优于AB和BB型个体,但是差异不显著(P0.05)。综合分析,中国地方品种文昌鸡、如皋鸡的抗性优于安卡鸡种,AA型可能是NLRC5基因在机体免疫应答能力的有利基因型。     

Apo-AI基因多态性与鸡生长和体组成性状的相关研究

以明星肉鸡和丝毛乌骨鸡杂交产生的F2资源群体为试验材料，根据鸡载脂蛋白AI（Apo-AI）基因的5’端序列设计引物，采用测序和PCR—SSCP方法进行SNP检测和基因型分析，探讨Apo-AI基因多态性与鸡生长和体组成性状之间的关系。研究发现在Apo-AI基因序列起始密码子ATG上游163bp处存在一个A／T突变。该突变产生的不同基因型与鸡生长和体组成性状进行的统计分析结果表明，BB基因型个体的1、2周龄体质量显著高于AA和AB基因型个体的相应体质量（P〈0．05）；BB基因型个体腹脂质量显著高于AA基因型个体的腹脂质量（P〈0．05）；BB和AB基因型个体的腹脂率显著高：于AA基因型个体的腹脂率（P〈0．05）。可以尝试将Apo-AI基因应用于鸡生长和腹脂性状的分子标记辅助选择育种方案中。     

东佛里生羊MSTN基因多态性及其与生长性状的关联分析

试验旨在研究肌肉生长抑制素(myostatin,MSTN)基因多态性及其对东佛里生羊生长性状的影响。从324只东佛里生羊全血中提取DNA,对MSTN基因外显子序列和非翻译区(untranslated region,UTR)序列进行PCR扩增,采用一代测序技术鉴定单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,分析不同位点的遗传多态性,并将不同基因型与东佛里生羊的生长性状进行关联分析。结果显示,在东佛里生羊MSTN基因外显子中未检测到突变;在3'-UTR区的272 bp处存在G→A单碱基突变,该位点只检测到AG和AA基因型,且AA基因型频率高于AG基因型;在5'-UTR区的176 bp处存在C→A突变,该位点只检测到CC和AC基因型,且CC基因型频率高于AC基因型。遗传多样性参数分析结果表明,东佛里生羊群体MSTN基因3'-UTR-272和5'-UTR-176位点的纯合度分别为0.827和0.887,杂合度分别为0.173和0.113,2个位点的多态性均较低(PIC<0.25),其群体基因型分布均符合哈代-温伯格平衡(P>0.05)。关联分析发现,3'-UTR-272位点AG基因型体斜长显著高于AA基因型(P<0.05),5'-UTR-176位点CC基因型胸围显著高于AC基因型(P<0.05),其余指标均无显著差异(P>0.05)。综上,东佛里生羊MSTN基因3'-UTR和5'-UTR突变位点可作为其目标性状选育的分子标记。     

肌细胞生成素基因多态性对京海黄鸡繁殖性状的遗传效应研究

本研究旨在探讨肌细胞生成素(myogenin,MyoG)基因多态性与鸡繁殖性状间的相关性。以378只京海黄鸡为研究对象,采用PCR-SSCP技术研究MyoG基因外显子的多态性。运用最小二乘法分析这些突变位点形成的基因型与京海黄鸡繁殖性状间的相关性。结果表明,MyoG基因外显子1上存在1个G102A突变,外显子3上存在1个T36C突变,分别形成基因型AA、AB、BB和CC、CD、DD。关联分析结果显示,基因型AA、AB和BB在京海黄鸡繁殖性状上无显著差异（P＞0.05）;基因型CC和DD在京海黄鸡开产体重上存在显著差异（P＜0.05）,在其余性状上各基因型差异均不显著（P＞0.05）。因此,推测MyoG基因对京海黄鸡的繁殖性状无显著影响,为探索鸡育种过程中的标记辅助选择提供参考资料。