采用Illumina MiSeq测序技术分析断奶幼兔盲肠微生物群落的多样性

本试验旨在采用Illumina MiSeq测序技术分析断奶幼兔盲肠微生物群落的多样性。选取30窝同日出生、胎次相同和平均窝重相近的健康新生仔兔,于14日龄开始补饲,断奶当日(30日龄)从30窝仔兔中选取48只体重相近的健康幼兔作为试验兔,饲喂不添加抗生素的基础饲粮。分别于断奶当日及断奶后1、2和3周随机选取6只健康幼兔屠宰,无菌采集盲肠内容物,从中选取3个样本提取微生物基因组总DNA,采用Illumina MiSeq测序技术检测其中的微生物群落多样性。结果显示:1)健康幼兔盲肠微生物群落α多样性指数指标(ACE值、Chao1值、Shannnon值)随日龄的增长有升高的趋势(P0.10)。2)不同日龄健康幼兔盲肠微生物各菌门的相对丰度差异不显著(P0.05),且均主要由厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门和疣微菌门组成;在科水平上,厚壁菌门主要由瘤胃球菌科和毛螺旋菌科组成,拟杆菌门主要由拟杆菌科和紫单胞菌科组成;在属水平上,拟杆菌属、Barnesiella、Akkermansia、普雷沃氏菌属和4种未知菌属为优势菌属;拟杆菌属和Parabacteroides在断奶当天的相对丰度较高,且与其他日龄组差异显著(P0.05)。3)健康幼兔盲肠中均存在乳杆菌属,且相对丰度在各日龄组间差异不显著(P0.05)。由此得出,断奶时健康幼兔盲肠微生物区系已基本建立,相对丰度最大的优势菌属为拟杆菌属,但断奶后随着日龄的增长,微生物组成趋于复杂。     

高通量测序技术分析大骨鸡盲肠微生物组成

研究旨在利用高通量测序技术比较散养(OD)和笼养(ID)两种饲养方式下12、18周龄大骨鸡盲肠微生物组成差异。结果表明,随着日龄的增加,OD组操作分类单位(OTUs)数量变化不大,而ID组OTUs数量有所增加。从门的丰富度来看,各组中拟杆菌门最丰富,比例最大,其次为厚壁菌门和变形菌门;12周龄时,散养组与笼养组间有3个菌门差异显著(P0.05),18周龄时,有5个菌门差异显著(P0.05);在属的水平,共检测到60个属,12周龄时,散养组与笼养组间有10个属的含量存在显著差异(P0.05),18周龄时,散养组与笼养组间有6个属的含量存在显著差异(P0.05)。研究结果为大骨鸡养殖策略的制定及盲肠微生物区系的研究提供参考。     

饲粮中添加苹果渣对伊拉肉兔盲肠微生物多样性的影响

为研究饲粮中添加苹果渣对伊拉肉兔盲肠微生物多样性的影响,选取32日龄断奶肉兔100只,按照体重和性别,随机分为5组,每组20只兔。各组分别饲喂含0、6%、12%、18%和24%苹果渣的饲粮。试验期为30 d。饲养试验结束后,采用高通量测序技术对盲肠微生物多样性进行分析。结果表明:与对照组相比,添加苹果渣对门、科水平上菌群相对丰度影响不显著(P0.05);在属水平上,与对照组相比,试验Ⅱ组、Ⅳ组UCG-010属的比例极显著增加(P0.01);厚壁菌门一种未定义菌属的比例显著高于对照组及其他试验组(P0.05),添加苹果渣对其他菌属相对丰度没有显著影响(P0.05)。由此可见,饲粮中添加苹果渣可以改变生长肉兔盲肠微生物的丰度和多样性。     

饲粮中添加甜叶菊渣对宁都黄鸡盲肠微生物数量的影响

试验旨在探索饲粮中添加甜叶菊渣对宁都黄鸡盲肠微生物数量的影响,选用1日龄体质量相近的健康宁都黄鸡200羽,随机分为2组,每组4个重复,每个重复25羽。预饲7d后开始正式试验,试验期21d。对照组饲喂玉米-豆粕型基础饲粮,试验组在基础饲粮中添加0.3%的甜叶菊渣。结果表明,添加0.3%的甜叶菊渣可显著降低21日龄宁都黄鸡盲肠中大肠杆菌和沙门菌的数量（P<0.05）,并在一定程度上促进乳酸杆菌、双歧杆菌等有益菌的增殖。     

饲粮中添加丁酸梭菌和丁酸钠对产蛋鸡生产性能和蛋品质的影响

试验旨在研究在产蛋鸡饲粮中添加丁酸梭菌和丁酸钠对不同品种产蛋鸡产蛋率、鸡蛋雀斑、暗斑以及蛋品质的影响。选择270日龄狼山鸡、芦花鸡、北京油鸡各320只,随机分成2组,每组8个重复,每个重复20只鸡,对照组（CON）饲喂基础饲粮,试验组（EXP）饲粮中添加100 mg/kg丁酸梭菌＋500 mg/kg丁酸钠。预饲期3 d,试验期为5周。试验结果表明,与对照组相比,①试验组狼山鸡、芦花鸡、北京油鸡产蛋率分别提高12.5%、12.0%和24.9%（P<0.01）;②试验组狼山鸡鸡蛋雀斑3级率下降34.2%（P<0.05）,芦花鸡和北京油鸡鸡蛋各级雀斑率均无显著差异（P>0.05）,狼山鸡、芦花鸡、北京油鸡鸡蛋各级暗斑率均无显著差异（P>0.05）;③试验组狼山鸡蛋重降低1.7%（P<0.05）,蛋形指数增加2.3%（P<0.05）;芦花鸡蛋重增加1.5%（P<0.05）;北京油鸡蛋白高度增加13.9%（P<0.05）,哈氏单位增加4.7%（P<0.05）。综上,在产蛋鸡基础饲粮中添加一定量的丁酸梭菌和丁酸钠,可以提高狼山鸡、芦花鸡、北京油鸡产蛋率,对改善狼山鸡鸡蛋的雀斑也有一定的作用,且有助于提高芦花鸡、北京油鸡的蛋品质。     

三种乳酸菌对蛋雏鸡盲肠微生物区系的影响

试验旨在研究3种乳酸菌对蛋雏鸡盲肠微生物的影响。选取1日龄体重相近的健康罗曼褐蛋公雏432只,随机分成A、B、C、D 4个组,每组6个重复,每个重复18只鸡。A组为对照组,饲喂基础饲粮;B、C、D组为试验组,饲喂基础饲粮另分别添加粪肠球菌制剂、嗜酸乳杆菌制剂和乳双歧杆菌制剂(添加量均为:1×107cfu/g),试验期为42 d。试验结束后,每个处理组随机取6只鸡(每重复1只,共24只),收集盲肠食糜样,并应用Illumina-Mi Seq高通量测序技术分析微生物群落结构和组成的变化。结果表明:不同处理组间雏鸡盲肠菌群均以厚壁菌门、拟杆菌门及变形菌门3种为主。与对照组相比,试验组Faecalibacterium菌属的相对含量升高,而梭菌属、链球菌属、埃希氏菌属/志贺氏菌属等潜在致病性菌属的相对含量不同程度降低。从α多样性上看,粪肠球菌和乳双歧杆菌制剂组盲肠微生物丰度指数下降,而嗜酸乳杆菌制剂组丰度指数上升。同时,3种乳酸菌组多样性指数均下降。从β多样性上看,添加乳酸菌可使盲肠菌群差异变大,与对照组相比,粪肠球菌和乳双歧杆菌制剂组差异性大于嗜酸乳杆菌制剂组。由此可见,乳酸菌可改变蛋雏鸡盲肠菌群结构;添加乳酸菌一定程度上可促进有益菌生长,而抑制有害菌增殖;粪肠球菌和乳双歧杆菌添加效果优于嗜酸乳杆菌制剂。     

基于MiSeq高通量测序方法研究酵母壁多糖对断奶仔猪盲肠菌群结构的影响

本试验旨在探讨饲粮中添加酵母壁多糖对断奶仔猪盲肠菌群结构的影响。采用单因素试验设计,选取180头遗传背景相同、胎次相近、体重接近的21日龄断奶仔猪,随机分为4个处理,每个处理5个重复,每个重复9头猪。4个处理分别饲喂0%酵母壁多糖饲粮(对照组)、0.15%酵母壁多糖饲粮(0.15%组)、0.30%酵母壁多糖饲粮(0.30%组)和0.45%酵母壁多糖饲粮(0.45%组)。试验期为21 d。取盲肠内容物提取细菌DNA,PCR扩增获得16S r RNA基因V4标签片段,进行Mi Seq高通量测序。结果表明:当酵母壁多糖添加量达一定程度时,仔猪盲肠菌群多样性会发生改变;在不考虑群落中每个物种丰度的前提下,0.30%酵母壁多糖组仔猪盲肠菌群最丰富;仔猪盲肠优势菌群为拟杆菌门、厚壁菌门、螺旋体门和变形菌门;与对照组相比,添加0.30%酵母壁多糖能降低仔猪肠道拟杆菌门含量(P0.05),添加0.30%或0.45%酵母壁多糖能显著增加盲肠厚壁菌门含量(P0.05),添加0.45%酵母壁多糖还能提高仔猪盲肠软壁菌门含量(P0.05);酵母壁多糖具有降低盲肠变形菌门含量的趋势(P=0.066);普氏菌属为仔猪盲肠优势菌属,酵母壁多糖能显著提高仔猪盲肠厌氧弧菌属、瘤胃杆菌属、粪球菌属和考拉杆菌属的含量(P0.05),显著降低链球菌属的含量(P0.05)。由此可知,当酵母壁多糖添加量达到一定水平时,短期添加可提高断奶仔猪盲肠厚壁菌门以及瘤胃杆菌属和粪球菌属等优势菌群的含量。     

饲粮添加丁酸钠对海兰褐蛋公雏生长性能和血清抗氧化性能的影响

为研究饲料中添加丁酸钠对海兰褐蛋公雏生长性能、血清生化指标和抗氧化性能的影响,选择体重相近、健康的1日龄海兰褐蛋公雏80只,随机分为2组。对照组饲喂基础饲粮,处理组日粮添加500 mg/kg丁酸钠,试验周期21 d。结果表明：（1）丁酸钠可显著提高蛋公雏的生长性能,丁酸钠组日增重较对照组提高了7.78%,差异显著（P <0.01）,且料重比较对照组降低了7.05%(P <0.05),但日采食量两组间未表现出显著性差异（P> 0.05）。（2）饲喂丁酸钠的蛋公雏血清中葡萄糖和免疫球蛋白IgM含量均显著高于对照组（P <0.05）,血清中总蛋白、白蛋白、甘油三酯和门冬氨酸转氨酶含量均未表现出显著性差异（P> 0.05）。（3）丁酸钠提高了蛋公雏的抗氧化性能,血清超氧化物歧化酶活性较对照组提高了22.29%(P <0.05),丙二醛含量显著降低了18.26%(P <0.05),其他抗氧化物酶活性未表现出显著性差异（P> 0.05）。综上,饲粮添加500 mg/kg丁酸钠一定程度上提高了海兰褐蛋公雏的生长性能和血清抗氧化性能。     

饲粮添加微囊丁酸钠对母猪及后代生产性能的影响

试验旨在通过在母猪妊娠后期及泌乳期饲粮中添加微囊丁酸钠,研究其对母猪及后代生产性能的影响。试验选用18头胎次及配种时间相近的(长×大)二元杂交母猪,采用单因子完全随机设计,分为2个试验组,每个组9头,对照组饲喂基础饲粮,微囊丁酸钠组饲喂基础饲粮+微囊丁酸钠的饲粮。试验周期为妊娠85 d到断奶后再发情。结果表明:1在母猪妊娠后期及哺乳期饲粮中添加微囊丁酸钠后,母猪泌乳期日采食量提高了300 g,提高比例为6.67%,但差异不显著(P0.05);添加微囊丁酸钠后,母猪泌乳期掉膘较对照组降低了1.84 mm,降低比例为44.66%(P0.05);此外,微囊丁酸钠组母猪断奶后发情间隔较对照组缩短了0.5 d,缩短比例为11.60%,但无显著性差异(P0.05)。2添加微囊丁酸钠后,仔猪初生个体重提高了40 g(P=0.19),提高比例为2.7%;断奶个体重提高了200 g,提高比例为2.8%(P0.05)。结果提示,在母猪妊娠后期及泌乳期间添加微囊丁酸钠,能够提高母猪泌乳期采食量,减少泌乳期掉膘,缩短断奶后的发情间隔。同时,母猪饲粮中添加微囊丁酸钠,能够提高其后代仔猪的初生重及断奶重。     

冷应激对雏鸡盲肠微生物的影响

为探讨冷应激对雏鸡盲肠微生物菌群结构和多样性的影响,本试验选用健康状况良好的7日龄白来航蛋雏鸡60只,随机分为2组,每组3个重复,每个重复10只。对照组30℃饲养,冷应激组先将雏鸡置于15℃环境中4 h,随后将温度设置为20℃与30℃交替进行,间隔12 h,连续3 d。采用Illumina MiSeq测序技术对雏鸡盲肠内容物的微生物进行16S rRNA V3-V4区测序,并对群落结构和多样性进行比较分析;同时采集盲肠组织进行病理学观察。结果显示：冷应激组的Chao、Ace指数低于对照组（P<0.05）,而Shannon、Simpson指数无显著差异。Beta多样性分析显示对照组和冷应激组肠道微生物群落差异显著。盲肠菌群结构分析显示冷应激后雏鸡盲肠中乳杆菌属（Lactobacillus）细菌的比例由36.84%下降至18.91%,而unclassified＿f＿Lachnospiraceae及Blautia细菌占比增加,分别从对照组中的23.54%和13.55%增加至29.05%和23.96%。另外,雏鸡冷应激后盲肠绒毛长度明显变短（P<0.0001）。这些结果表明冷应激导致...     

饲粮大豆油添加水平对海兰褐蛋雏鸡生长性能及血清生化指标的影响

为探究饲粮大豆油添加水平对海兰褐蛋雏鸡生长性能及血清生化指标的影响,试验选取200只1日龄海兰褐蛋雏鸡,随机分成4组,每组5个重复,每个重复10只鸡。对照组饲喂基础饲粮,试验组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ分别在基础饲粮中添加1.0%、1.5%和2.0%大豆油,试验期42 d。结果表明：与对照组相比,三个试验组平均日增重（ADG）及血液生化指标均无显著差异（P > 0.05）,但试验组Ⅱ较其他组更优。1 ~ 42日龄阶段内,与对照组相比,试验组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ的平均日采食量（ADFI）分别降低了6.6%、13.7%和9.8%（P < 0.05）,料重比（F/G）分别降低了6.8%、14.1%和10.2%（P < 0.05）。由此可见,在1 ~ 42日龄海兰褐蛋雏鸡基础饲粮中添加1.5%大豆油,能显著降低雏鸡日采食量和料重比,可在实践生产中应用。 [关键词] 蛋雏鸡|大豆油|生长性能|生化指标     

饲粮添加菜籽粕对不同含黄素单氧化酶3基因型蛋鸡盲肠微生物的影响

为了评估饲粮添加菜籽粕对不同含黄素单氧化酶3基因型(FMO3)蛋鸡盲肠的三甲胺(TMA)和微生物的影响,采用3×2的2因子设计,使用3种含黄素单加氧酶3基因型(野生型、杂合型和突变型)和2个菜籽粕添加水平(0和14%)。在50周龄时,分别将36只杂合型和36只突变型母鸡随机分配到2个菜籽粕水平饲粮处理组,每组3个重复每个重复6只鸡。另外12只野生型母鸡也随机分配到2个菜籽粕水平饲粮处理组,每组3个重复每个重复2只鸡。在开始6周饲养试验前试鸡先饲喂1周不含有菜籽粕的玉米豆粕型饲粮。结果表明,饲粮添加菜籽粕会增加蛋黄中三甲胺浓度(P0.0001)和盲肠食糜(P0.0001)。饲粮添加菜籽粕会增加细菌丰度和多样性(P0.0001)。通过加权UniF rac、非度量多维标度和相似性分析(R相似性=0.1516;P值=0.014)表明微生物明显聚集依赖于饲粮而不是FMO3基因型。此外,在盲肠样本中鉴定了二十个门(最优势的是:拟杆菌、厚壁菌和变形菌)和229个属。与玉米豆粕型饲粮相比,饲粮添加菜籽粕显著增加了厚壁菌门比例(P=0.004),变形菌门比例(P=0.006),和厚壁菌:拟杆菌(P=0.001),并降低一些低丰度门的比例(P0.01),而拟杆菌门丰度较低(P=0.0002)。42个属的丰度与饲粮类型不同而不同。6个门和35个属与盲肠食糜中的TMA浓度呈正相关。总之,盲肠中主要的产生TMA的微生物来自于厚壁菌门和变形菌门,并与TMA浓度呈正相关。     

饲粮中添加溶菌酶对蛋雏鸡生长性能、肠道形态和抗氧化能力的影响

试验研究饲粮中添加溶菌酶对蛋雏鸡生长性能、肠道形态和抗氧化能力的影响.将6日龄体重相近京粉1号蛋雏鸡720只,随机分为4组,每组6个重复,每个重复30只,分别为对照组、甲基盐霉素组、混合抗生素组和溶菌酶组.试验期42 d.结果 显示,各试验组蛋雏鸡的生长性能无显著差异(P＞0.05).与对照组相比,溶菌酶组蛋鸡十二指肠...     

采用Illumina MiSeq测序技术分析葡萄籽原花青素对奶牛体外瘤胃发酵产甲烷菌区系的影响

本研究旨在基于Illumina MiSeq测序技术分析葡萄籽原花青素对奶牛体外瘤胃发酵产甲烷菌区系的影响。试验分为6组,以500 g精粗比为40∶60的全混合日粮为发酵底物,分别添加0(对照)、0.1、0.2、0.3、0.4、0.5 g/kg的葡萄籽原花青素。体外发酵24 h后提取各发酵液总DNA,采用Illumina MiSeq PE300高通量测序平台进行测序。结果表明:1)与对照组相比,添加0.1、0.2 g/kg葡萄籽原花青素降低了产甲烷菌的分类操作单元(OTUs)数量,添加0.3、0.4、0.5 g/kg葡萄籽原花青素增加了产甲烷菌的OTUs数量,但差异并不显著(P0.05);葡萄籽原花青素添加量对Chao1指数和Shannon指数均无显著影响(P0.05),即对产甲烷菌的多样性没有显著影响。2)在门水平上,与对照组相比,添加0.3、0.4、0.5 g/kg葡萄籽原花青素显著降低了广古菌门的丰度(P0.05)。在科水平上,与对照组相比,甲烷杆菌科的丰度随着葡萄籽原花青素添加量的增加有降低的趋势,且在添加量为0.4 g/kg时丰度显著降低(P0.05); Methanomassiliicoccaceae的丰度随着葡萄籽原花青素添加量的增加而增加,且当添加量为0.3、0.4 g/kg时显著增加(P0.05)。在属水平上,与对照组相比,甲烷短杆菌属的丰度随着葡萄籽原花青素添加量的增加而降低,且当添加量为0.4 g/kg时显著降低(P0.05),当添加量为0.5 g/kg时有回升的趋势,但是仍低于对照组;甲烷杆菌属的丰度随着葡萄籽原花青素添加量的增加而降低,且当添加量为0.4、0.5 g/kg时显著降低了该属的丰度(P0.05); Candidatus_Methanoplasma的丰度随着葡萄籽原花青素添加量的增加有上升趋势,且当添加量为0.3、0.4 g/kg时显著增加了该属的丰度(P0.05);甲烷球形菌属的丰度随着葡萄籽原花青素添加量的增加而降低,且当添加量为0.3、0.4、0.5 g/kg时显著降低了该属的丰度(P0.05)。由此可知,添加葡萄籽原花青素在门、科、属水平上均对奶牛体外瘤胃产甲烷菌区系有一定的影响。     

饲粮添加硫酸锌对京红蛋鸡产蛋性能的影响

本试验通过在基础饲粮中添加不同水平的硫酸锌,研究其对京红蛋鸡产蛋高峰期产蛋性能和组织中金属硫蛋白含量的影响。选择20周龄540只健康产蛋高峰期的京红蛋鸡,随机分为6个组,每组6个重复,每个重复15只鸡。对照组饲喂基础饲粮(含锌25 mg/kg),试验组在基础饲粮中分别添加25、50、75、100和125 mg/kg硫酸锌(以锌计)。预试期2周,正试期24周。结果显示:1)在基础饲粮中添加不同水平的硫酸锌对整个试验期的产蛋率、平均日耗料量、平均蛋重、料蛋比和死淘率均无显著影响(P0.05);2)在基础饲粮中添加不同水平的硫酸锌显著提高了胸肌中金属硫蛋白含量(P0.05),但对心肌中金属硫蛋白含量无显著影响(P0.05);3)二次曲线回归预测,京红蛋鸡饲粮中硫酸锌添加水平为75 mg/kg时,整个产蛋高峰期平均日耗料量最低。结果提示,饲粮添加不同水平硫酸锌对京红蛋鸡产蛋高峰期产蛋性能无显著影响。     

高通量测序分析酵母培养物对肉仔鸡盲肠菌群的影响

本实验旨在探讨酵母培养物对肉仔鸡盲肠菌群的影响。选取336羽健康且体重相近的1日龄AA肉仔鸡,随机分7个处理组,每组6个重复,每个重复8只。A组(对照组)饲喂基础日粮,B、C、D、E、F组分别在基础日粮中添加发酵时间为12、24、36、48、60 h的酵母培养物,G组在基础日粮中添加达农威益康V XP酵母培养物产品。预试期7 d,正试期42 d。采用Illumina Miseq高通量测序技术对肉仔鸡盲肠内容物菌群分析。结果表明:与A组(对照组)相比,C、D组肉仔鸡的平均日增重显著提高(P0.05),耗料增重比显著降低(P0.05);而D组肉仔鸡盲肠菌群物种多样性最高,C组最低;在Phylum(门)的水平上,各组中的Firmicutes(厚壁菌门)比例最高,而C组样品中Verrucomicrobia(疣微菌门)含量较其他组显著增加;在Genus(属)的水平上,7组样品的盲肠内容物中以Bacteroides、Faecalibacterium、Lactobacillus、Blautia等菌属为主。综上,不同发酵时间的酵母培养物对肠道菌群有显著影响,可通过调整发酵时间来控制其代谢产物,进而影响动物的生产性能。     

饲粮中不同沸石粉添加量对蛋鹌鹑生产性能的影响

沸石粉含有畜禽生长发育所必需的多种矿物质元素,并且由于其独特的三维硅（铝）四面体格架结构,具有极强的吸附和阳离子交换性能。自１９６５年日本首次将沸石粉应用于畜牧业至今,世界上许多国家对其作为矿物质饲料添加剂作了较深入的研究,并在猪、鸡、鸭、牛、兔、鱼...