植物LTR类反转录转座子的研究概述

LTR类反转录转座子是植物基因组中的重要成分,对基因组的大小、结构、功能和进化都有重要影响.文中从结构特征、转座机制、分类、分离鉴定及对基因组的影响等多个方面概述了植物LTR类反转录转座子的研究进展,为进一步揭示LTR类反转录转座子在植物基因组中的功能奠定基础.     

果蔗Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因的多样性分析

【目的】分析Ty3-gypsy类反转录转座子反转录酶基因（RT）序列特征、多样性、系统进化关系及转录活性,为深入研究果蔗Ty3-gypsy类反转录转座子全长序列、转录转座活性及生物学功能提供理论参考。【方法】以果蔗品种拔地拉为试材,根据Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因保守区设计简并引物对,利用其进行PCR扩增,将目的条带回收纯化后连接至pMD18-T载体,并转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,挑取阳性克隆进行测序。依据测序结果对RT基因序列进行生物信息学分析。【结果】从果蔗拔地拉中扩增获得51条序列（SoRT4-1~SoRT4-51）,去除重复序列和非RT基因序列后共获得44条RT基因序列,长度为423~433 bp,AT含量为56.84%~64.97%,AT:GC比值为1.32~1.85,核苷酸序列间相似性为44.4%~99.3%,其编码的氨基酸序列间相似性为10.8%~100.0%,说明氨基酸序列比核苷酸序列表现出更高异质性。44条RT基因序列被划分为4个家族,其中Ⅰ和Ⅲ为主要家族。44条RT基因编码的氨基酸序列中有20条发生了无义突变,说明其突变率较高。44条RT基因编码蛋白序列存在5种保守基序,其中,有29条序列同时包含Motif 1~Motif 4,其余15条序列的保守基序变异较大,说明保守基序存在一定异质性。4个家族代表性序列编码蛋白的三级结构在氢键和转角的数量方面差异较大;系统发育进化树分析结果显示,44条RT基因序列被分为七大类,Ⅰ类和Ⅱ类中的果蔗RT基因序列分别占序列总数的40.91%和27.27%,Ⅱ类和Ⅵ类中的部分果蔗RT基因序列与拟南芥的BAB40828.1、粳稻的BAB40824.1、菠菜的BAB40833.1和大豆的BAB40834.1亲缘关系较近,推测这些物种在进化过程中发生了Ty3-gypsy类反转录转座子的横向传递。初步发现1条Ty3-gypsy类反转录转座子（SoRT4-40）具有转录活性。【结论】获得44条果蔗Ty3-gypsy类反转录转座子RT基因序列,其中仅有1条序列具有转录活性,这些RT基因序列可用于开发基于Ty3-gypsy类反转录转座子的甘蔗分子标记。     

植物LTR类反转录转座子在植物基因组学研究中的应用

LTR类反转录转座子是植物基因组中的重要转座元件,对植物基因组的结构及功能有重要的影响。综述了近年来植物LTR类反转录转座子的类型和结构、在基因组中表达和调控,并探讨了它们在植物基因组学研究中的应用前景。     

植物反转录转座子的研究进展

反转录转座子几乎是所有植物基因组的主要成分,不仅对基因组的大小、结构、功能和进化,而且对两翼基因的表达水平都有重要影响。该文从反转录转座子的类型和特征、分离鉴定、活性及其对基因组的影响、应用现状等多个方面概述了植物反转录转座子的研究进展,以期为进一步揭示反转录转座子在植物基因组中的功能奠定基础。     

植物反转录转座子分子标记及其应用

植物反转录转座子具有存在广泛和多态性丰富的特点,可用于植物基因组研究。本文对植物反转录转座子的结构与功能、反转录转座子分子标记的主要种类及其在农作物遗传改良中的应用进行了综述。     

基于反转录转座子的REMAP和IRAP指纹图谱技术

基于反转录转座子的REMAP和IRAP技术自1999年由Kalendar等发展起来后,在系统发生学及生物进化学等研究领域起着重要作用。笔者对REMAP及IRAP技术的原理、应用等方面进行了综述。     

香菇反转录转座子间扩增多态性（IRAP）PCR反应体系的研究

为了开发香菇反转录转座子间扩增多态性标记(IRAP),建立稳定的IRAP-PCR反应体系,对影响IRAP-PCR的主要因素进行了优化筛选.确定了最佳反应体系为:20μl反应体系中,包含30ng模板DNA,0.30μmol/L引物,0.3mmol/L dNTPs,2.0 mmol/L Mg2+及0.75UTaq酶.梯度PCR试验筛选得到的最佳退火温度为56.1℃.采用上述最佳反应体系和引物LTR1L-MarY1L对香菇18个菌株进行了IRAP-PCR扩增,验证了该体系的可靠性.     

我国猴头栽培菌株的反转录转座子间扩增多态性

IRAP作为一种新的DNA分子标记技术,具有简便、稳定、中等产率和容易得到选择性条带序列的特点。利用基于反转录转座子的分子标记技术,即反转录转座子间扩增多态性(IRAP)技术分析我国34份栽培猴头菌菌株种间遗传差异,为猴头菌道地性研究、种质资源鉴定、亲缘关系研究、品种选育和引种栽培提供了分子生物学依据。结果表明,34个猴头菌菌株间均有遗传上的差异,但遗传相关性极高,同时表明我国猴头菌栽培菌株间的遗传背景较单一。     

用基于反转录转座子的分子标记IRAP分析茄子品种的遗传多样性

IRAP（Inter Retrotransposon Amplified Polymorphism）是一种基于反转录转座子的分子标记技术。本文应用几种Copia类型的反转录转座子进行引物设计,封35份茄子栽培品种进行了基于IRAP的遗传多样性分析。根据Tnt1,Tto1,Tnd-1和Bare-1设计的6个引物共扩增出195条带,多态性带179条,多态性比率平均为91．8％,每个引物检测到多态性带25．33条,平均为29.8条。Nei’s遗传相似系数在0．3540-0．7752之间,平均相似系数为0．5901。多维尺度分析从分子水平将供试品种分为4个类群。     

籽粒苋饲喂肉鸡的营养评价及试验研究

该试验制取了籽粒苋（美国红苋）籽粉和颖壳、茎、叶按１∶１∶１的混合粉，用２×３设计方法配合加入肉仔鸡饲粮中，籽粉水平为０％，５％，１０％，混合粉水平为０％，２％，４％，对肉仔鸡生产性能未产生明显的正负效应．籽粒克籽粉的营养价值丰富，含粗蛋白１４．４％，粗脂肪７．８％，代谢能为１３．７ＭＪ／ｋｇ。箱前采收籽粒后的植株地上部分别制取的混合粉仍含粗蛋白质９．２％和丰富的钙源，但粗纤维含量达２９％，代谢能５．２７ＭＪ／ｋｇ，故适用于低能量饲粮中使用。     

氟磺胺草醚对野苋菜和灰绿黎的室内活性测定

在室内条件下,测定了氟磺胺草醚对野苋菜和灰绿黎的杀草活性。结果表明:氟磺胺草醚对野苋菜和灰绿黎的EC50值分为200.282 8 mg/L和233.529 8 mg/L,氟磺胺草醚对野苋菜和灰绿黎具有很好的抑制效果。     

苋菜愈伤组织诱导的研究

以苋菜种子为试材诱导无菌苗,取幼苗期下胚轴、子叶和壮苗期茎段、叶片作为外植体,比较不同组织部位对愈伤组织诱导效果的影响,并探讨不同质量浓度NAA对苋菜愈伤组织诱导的影响。结果表明,以苋菜壮苗期叶片和茎段为外植体的愈伤组织诱导率比幼苗期下胚轴和子叶高,表现为叶片>茎段>下胚轴>子叶;苋菜壮苗期茎段、叶片在MS+6-BA 0.5mg/L+NAA 3.0mg/L培养基上诱导愈伤组织的效果最好,诱导率分别为98.7%和99.3%。     

铜对苋菜气孔气体交换的影响

[目的]探究铜胁迫对苋菜生理过程的影响。[方法]用土培的方法,研究铜对苋菜幼苗气孔气体交换和光合色素的影响及铜在植物体的分布。[结果]0.5 mmol/kg铜处理对苋菜生长有利;随着铜浓度的增加,苋菜净光合速率明显降低,主要归因于非气孔限制;蒸腾速率、光饱和点、表观量子效率和光合色素含量下降,光补偿点升高;暗呼吸速率在0.5~2.0 mmol/kg下升高,在4.0 mmol/kg下降低;苋菜根系铜含量远高于叶片,且随着铜处理浓度的升高,根系和叶片铜含量明显增加。[结论]该研究为苋菜种植和探讨铜对植物毒害的生理机制提供依据。     

苋属入侵植物在北京的分布状况及风险评估

很多苋科苋属植物都是入侵植物,并且是农田及撂荒地主要杂草。对在北京地区发现的6种苋属植物,利用层次分析法对其入侵风险进行了评估。评估结果表明:反枝苋、皱果苋、凹头苋为高风险入侵植物,长芒苋、刺苋、合被苋为中等风险入侵植物,可为开展以上6种苋属植物防控提供参考。     

铅对繁穗苋幼苗生长的影响

[目的]研究重金属铅对繁穗苋幼苗生长的影响。[方法]以繁穗苋幼苗为材料,研究不同浓度的铅处理对其生长的影响。[结果]在50 mg/L Pb2+处理下,繁穗苋幼苗新生根数受到促进;随着Pb2+浓度的增加,繁穗苋的根长、苗长、苗重和叶绿素含量均降低;高浓度Pb2+对繁穗苋根生长的抑制作用大于其对茎轴的抑制作用。[结论]铅对繁穗苋幼苗的生长表现出抑制作用,而且该抑制作用而随着铅离子浓度的增大而加大。     

硫酸铜对苋菜生长及食用安全性的影响

为了研究铜制剂是否会对蔬菜产量和品质产生影响,本研究以苋菜为材料,分析硫酸铜处理下苋菜种子萌发及幼苗生长和品质的变化。结果显示,硫酸铜的大量使用导致基质铜积累大幅提高。0.05~1.50 mmol/L硫酸铜处理对苋菜种子发芽率无显著影响,但其胚根和下胚轴的伸长受到了抑制,种子活力指数急剧下降。1.00~15.00mmol/L硫酸铜处理下,苋菜幼苗没有表现出明显的毒性症状,但幼苗株高、叶面积、生物量、根系活力、光合色素含量、最大荧光、最大光化学效率和PSⅡ潜在活性均随着处理浓度的增加而降低;幼苗各器官铜含量及叶片丙二醛含量、电导率、O2·-含量、H2O2含量、硝态氮含量和硝酸还原酶活性则是随着硫酸铜处理浓度的升高而升高。     

加拿大一枝黄花对紫花苜蓿和红苋菜的化感效应研究

研究了加拿大一枝黄花地上部分（茎和叶）、地下部分（根茎和细根）和根际土壤的水浸提液对紫花苜蓿和红苋菜两种经济作物种子萌发和幼苗生长的影响。结果表明：（1）地上部分、地下部分和根际土壤的浸提液对紫花苜蓿种子的萌发均起抑制作用,而对红苋菜种子的萌发具有一定促进作用。（2）地上部分的浸提液对紫花苜蓿和红苋菜的苗高、根长以及紫花苜蓿的根重均表现出抑制作用,而对红苋菜的根重更多的是表现出促进作用。（3）地下部分的浸提液对紫花苜蓿和红苋菜的苗高、根长以及根重（粗）均表现出抑制作用。（4）根际土壤的浸提液对紫花苜蓿的根长以及根重均表现出抑制作用,而对苗高起促进作用;对红苋菜的根长起抑制作用,而对苗高和根重既起促进作用又起抑制作用。（5）相同浓度的水浸液对作物幼根的影响大于对作物苗高的影响。（6）当浸提液的浓度变化时,不同作物种子的萌发和幼苗生长的响应对策呈显著差异。     

百脉根小GTPase ROPs 基因反转座子插入突变体的分离和鉴定

为研究ROP(Rho-related GTPase of plants,ROP)在豆科植物共生固氮过程中的功能和作用机制,从百脉根逆转录转座子LORE1插入突变体库(http://www.kazusa.or.jp/lotus)中搜索到6个ROP相关基因突变体,通过分离和鉴定,得到不同突变体的M1代和M2代纯合体种子,对M2代进行表型鉴定及统计分析。结果表明:在早期共生表型的鉴定中,突变体与野生型植株相比,rop-like1植株的根瘤原基数明显下降,rop-like4植株的侵入线数和侵入线密度也明显下降;但仅rop-like1植株在接种14d后的结瘤数明显减少。     

苋菜培养细胞中角鲨烯的提取与含量测定

[目的]建立苋菜培养细胞中角鲨烯提取与含量测定的方法。[方法]以苋菜叶片为外植体诱导愈伤组织,用皂化和不同有机溶剂浸泡的方法提取苋菜愈伤细胞中角鲨烯,并用HLPC测定其含量。[结果]用皂化法提取苋菜愈伤细胞的角鲨烯含量高于用有机溶剂浸泡方法提取的含量。苋菜愈伤细胞提取的角鲨烯在HLPC上与标准品出峰时间一致,而且该峰与其他峰有很好的分离。[结论]皂化法是提取苋菜愈伤细胞中角鲨烯较好的方法。用HLPC测定苋菜愈伤细胞中角鲨烯含量可行。