月季种质鉴定和多样性分析

 利用RAPD 技术对28 个月季品种和2 个蔷薇品种进行了遗传多样性分析, 从145 个引物中筛选出12 个引物, 可以扩增出清晰、稳定和多态性高的产物。其中3 个引物从30 个材料中扩增出3 个品种特异的RAPD 分子标记, 并将其中的一个成功地转换成了SCAR 标记。利用筛选出的12 个引物扩增出的65 条多态性片段作了聚类分析, 对这些月季品种的亲缘关系和进化作了初步探讨。     

中国北方引种的部分越橘品种的RAPD分析

利用RAPD技术对我国北方引种的15份越橘(Vaccinium spp.)栽培品种进行了遗传多样性分析。从70条随机引物中筛选出15条引物,共扩增出94个位点,其中多态性位点83个(88.3%)。材料间遗传相似系数变化为0.5426～0.8936,表明各品种间具有一定的遗传差异。UPGMA聚类分析结果可将供试材料分为2大类、5个亚类。聚类结果与各品种的杂交系谱相对应,从分子水平揭示了品种间的亲缘关系。     

基于SSR分子标记的油梨种质遗传多样性分析

用23对SSR多态性引物对收集的54份油梨种质材料进行PCR扩增,利用Popgene 1.32计算遗传多样性参数,采用NTSYSpc 2.1计算种质间的遗传相似系数,并进行UPGMA聚类分析和主成分分析.结果表明,23对SSR引物共扩增出多态性位点119个,每对引物扩增的多态位点在2?10个之间,平均为5.17个,多态...     

云南芋种质资源遗传多样性的AFLP分析

 采用荧光标记引物的AFLP分子标记技术, 用筛选出的“3 + 2”引物组合, 对48份云南芋种进行遗传多样性分析, 3对引物共扩增出184个DNA位点, 平均每对引物可检测出56.3个多态性位点,多态性位点高达91.8% , 云南芋种质资源在DNA分子水平上表现出极为丰富的遗传多样性。聚类分析表明: 野生种质和栽培种质的亲缘关系较远, 栽培种质基于AFLP标记的分类结果与形态性状基本一致, 少数材料差异较大。     

彩色甘蓝型油菜指纹图谱构建

采用SSR和特异性分子标记,构建彩色甘蓝型油菜的指纹图谱,并进行聚类分析。从509对SSR引物和30对特异性引物筛选出13对多态性位点丰富、稳定性和重复性高的引物,对引物构建10份彩色甘蓝型油菜DNA指纹图谱,利用NTSYS软件构建聚类分析图并进行分析。结果表明,13对引物可扩增32个多态性等位位点。其中,引物P13构建的指纹能将参试材料中的普通黄花油菜与彩色油菜分开;引物P21构建的指纹能将10份材料彼此分开;聚类分析结果与其遗传背景相吻合。本研究可为彩色甘蓝型油菜品种（系）真伪性和纯度鉴定提供依据,以期为进一步进行彩色油菜分子标记辅助育种鉴定基础。     

24个大果沙棘品种的RAPD分析

为了解沙棘种质资源的遗传多样性和品种间的亲缘关系,以24个大果沙棘品种为材料,利用随机扩增多态性DNA(RAPD)方法进行沙棘的遗传多样性分析。从120个随机引物中筛选出多态性丰富的18个引物用于扩增反应,在24个大果沙棘品种中检测到171个RAPD位点,其中多态性DNA带112条,多态位点百分比为65.5%,表明大果沙棘品种具有丰富的遗传多样性;在RAPD分析的基础上,对大果沙棘品种进行了聚类分析,结果表明,以相似系数0.58处作为分界,可将供试的24份大果沙棘种质分为4类。     

3个番茄品种及其6份亲本材料指纹图谱的构建

用CTAB法提取3个番茄品种及6份品种亲本材料的DNA,通过AFLP-PCR分子标记方法,构建亲本及品种的指纹图谱。其结果利用如下:从分子水平构建了3个品种及其6份亲本材料的指纹图谱,6份亲本材料扩增的多态性条带从10~27条不等,平均17.56条,多态性位点比率为41.3%。通过符合率测定,亲本纯度符合率为100%,杂种一代为98.7%。利用NeiLi法计算番茄遗传相似系数,3个品种及亲本的遗传相似系数分别于0.37~0.61和0.53~0.62,采用UPGMA法进行聚类分析,对3个番茄品种及其亲本的遗传关系进行分析,为番茄杂交育种提供理论参考。     

梨品种资源遗传差异的RAPD分析

明确种质间的遗传差异,对杂交育种中亲本的选择和搭配具有重要意义。利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,从40个随机引物中筛选出了33个多态性好的引物,在21个品种间进行了分析,最终得到339个清晰稳定的扩增位点,其中多态性位点为292个,占86.1%。利用UPGMA(非加权配对算术平均)法进行了品种间相似系数的计算以及聚类分析,揭示了这些品种间遗传上的差异程度。     

我国南方长茄种质资源的ISSR标记分析

从分子水平用ISSR标记法对南方长茄资源的遗传多样性进行分析,从100个ISSR引物中共筛选出12个多态性明显、条带清晰、反应稳定的引物,对57个样品DNA共扩增出116条谱带,平均每个引物扩增出9·67条带,其中多态性位点84个(71%)。品种间遗传相似系数在0·51~0·98之间,表明茄子栽培种内品种间的遗传基础相对较狭窄。利用UPGMA聚类分析,能将57个南方长茄品种划分为6个类群,类群的划分与地方来源没有很大的关系。     

葡萄种质遗传多样性的SSR分析及指纹库构建

以取自郑州果树研究所的45个葡萄品种为试材,利用SSR标记技术对其进行了遗传多样性分析.结果表明:利用19对基本核心引物对位于不同染色体上的SSR位点进行PCR扩增,共扩增出76条带,其中包括74条多态性条带.每对引物可检测到等位位点数为2～5个,多态率为66.7％～100％.通过聚类分析结果表明,在遗传距离为0.41处,45份葡萄材料可分为三大类群.对供试葡萄品种的不同引物的扩增产物进行检测,得到了每个品种在一组位于不同染色体的SSR位点上的基因型图谱,从而初步建立一个供试葡萄品种的SSR基因型指纹库.这为利用SSR标记鉴定葡萄品种或品系提供了基础数据.     

草莓品种亲缘关系的AFLP分子标记分析

 利用AFLP技术对我国国家草莓资源圃内保存的107个草莓品种进行了DNA多态性分析。从64对“2 + 2”引物中筛选出10对引物应用于扩增基因组DNA, 共获得清晰可辨的581条带, 其中412条为多态性带。UPGMA方法聚类分析结果显示, AFLP分子鉴定结果与其系谱关系非常一致, 表明AFLP指纹图谱分析能很好地鉴别草莓品种之间的遗传关系。     

Genetic relationships of gladiolus cultivars inferred from fluorescence based AFLP markers

Gladiolus is one of the important commercial flowers with a large number of cultivars. However, genetic relationships among its genotypes have not been reported. This study analyzed genetic relatedness of 54 gladiolus cultivars using amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers. A total of 24 AFLP primer pairs with three samples were initially screened, from which 9 primer sets that showed clear scorable and highly polymorphic bands were selected for AFLP reactions. Fluorescence-labeled amplification products were subjected to electrophoresis and then analyzed using an automated sequencer. A dendrogram was constructed by the unweighted pair group method using the arithmetic average (UPGMA). The number of AFLP fragments generated per primer set ranged from 10 to 151 with fragment sizes varying from 50 to 450 bp. A total of 660 AFLP fragments were detected, of which 658 (99.70%) were polymorphic. All the primers except E-AGG/M-CTA displayed 100% polymorphism. All cultivars were clearly differentiated by their AFLP profiles. The AFLP data were compared with previously obtained RAPD data and combined to generate a common dendrogram. The first cluster was dominated with indigenously bred cultivars while the second was dominated with exotic cultivars. This shows that most of the exotic cultivars as well as indigenous cultivars are closely related with each other. However, two indigenous cultivars viz., Pusa Suhagin and Pusa Archana share genetic similarity with exotic cultivars. Among the genotypes selected for the investigation, Pusa Gunjan was identified as the most distinct genotype. The AFLP markers developed will help future Gladiolus cultivar identification, germplasm conservation and new cultivar development. The assessed genetic relationships among gladiolus cultivars may enhance the efficiency of breeding program by selecting desirable parents with reduced breeding cycle.     

茄子单性结实基因的遗传分析及AFLP分子标记

以茄子单性结实自交系D-10和非单性结实自交系03-2为试验材料,研究了单性结实基因的遗传特性及其AFLP标记。对杂交后代F₁、F₂、BC₁单性结实性表现型分离比例的分析表明,茄子D-10的单性结实性由单显性核基因控制,其基因用符号Pat表示。采用AFLP分析技术和改良BAS法,通过512对E/M引物组合的筛选,获得1个与茄子单性结实基因紧密连锁的AFLP标记E75/M53-70,该标记与单性结实基因间的遗传图距为15.38 cM,可用于茄子单性结实性的鉴定和单性结实分子标记辅助育种,加速茄子单性结实基因的转育和利用。     

利用大白菜DH群体构建AFLP遗传连锁图谱

 以大白菜‘汴早- 26’和‘光90E16’的F₁ 代进行游离小孢子培养所获得的含有59个株系的DH群体为试材, 利用AFLP技术通过63对引物筛选共获得346个AFLP多态性标记, 运用JoinMap 3.0软件构建大白菜遗传连锁图谱。该图谱主要包括10个连锁群, 总图距为708 cM, 平均图距为2.0 cM。     

美洲南瓜AFLP反应体系的优化与建立

以美洲南瓜(Cucurbita pepo L.)为试材,通过对AFLP反应体系中的关键因素进行研究,获得了稳定的南瓜AFLP反应体系。优化后的体系能扩增出稳定条带,可用于基因定位、南瓜遗传多样性分析、遗传图谱构建等研究,为南瓜分子辅助育种奠定了理论基础。     

用AFLP标记分析广西龙眼种质遗传多样性

选用10对AFLP引物组合分析了广西38个龙眼品种（优良单株）和两个龙眼近缘亚种龙荔单株,以及10个来自国内外其他产区龙眼品种的遗传多样性。在所扩增的570条AFLP主带中,有485条具有多态性,占85.1%。所用引物可将供试的品种（优良单株）区分开来,供试材料的遗传相似系数在0.39（两个亚种间）到0.98之间。根据遗传相似系数（UPGMA, N-J）得到的分类树状图与传统方法的分类结果相类似。结果表明,广西龙眼种质具有较广泛的遗传多样性。     

西瓜遗传图谱构建及其强雌性状定位研究

以雌花率稳定在80%以上的强雌性品系BG1(Citrullus lanatus var.lanatus)和普通花性型非洲野生西瓜900134(C.lanatus var.citroides)为亲本杂交自交获得F2群体,通过AFLP、RAPD及SSR技术对该群体进行扩增,建立了一个包括4个RAPD标记、140个AFLP标记、6个SSR标记和1个强雌性位点(subgy)的遗传图谱。该图谱包含17个连锁群,覆盖基因组1073.1cM,标记间平均图距为7.2cM。subgy定位在第5连锁群中,与s1454-1100、GT-CTA270两个标记连锁,距离分别为5.8cM和14.3cM。将特异条带s1454-1100回收、克隆、测序,设计特异SCAR引物,再对F2单株基因组DNA扩增,只在大部分的纯合强雌性单株和杂合普通花性型单株中扩增出一条375bp的特异带,以JoinMap3.0软件分析,该标记与与强雌性状位点的连锁距离为6.1cM,连锁较为紧密,表明已成功地将与西瓜强雌性连锁的标记转化为操作简便、表现稳定的SCAR标记,命名为SR375。     

枇杷AFLP分析体系的建立与应用

为研究枇杷种质资源遗传多样性和亲缘关系的技术平台奠定基础,以来自5个不同国家43份枇杷种质为试材研究枇杷基因组AFLP反应体系。通过检测AFLP分析中DNA提取、酶切及连接、预扩增和选择性扩增的结果,对影响AFLP分析的主要因子进行分析,建立了AFLP分析体系。利用该体系并选用EcoRI—AGG+MseI—CAC引物组合对供试材料进行扩增,获得的条带清晰可辩,说明所建立的反应体系适合于枇杷进行AFLP分析。     

变叶海棠起源的AFLP分析

 利用4对AFLP引物组合( EcoRⅠAAC +M seⅠCAC, EcoRⅠACG +M seⅠCAG, EcoRⅠACC + MseⅠCTA, EcoRⅠACT +MseⅠCAG) 对花叶海棠、陇东海棠和变叶海棠不同的变异类型进行分析, 共得到扩增位点231个, 其中多态性位点211个, 多态性比例为91.34% , 区分率达100%; 利用AFLP标记对变叶海棠、陇东海棠、花叶海棠的亲缘关系进行分析, 结果与形态学、细胞学和同工酶的结果一致, AFLP数据表明变叶海棠是花叶海棠和陇东海棠的杂交种, 从而在分子水平上揭示了变叶海棠的杂种起源。变叶海棠的变异类型是在漫长的进化过程中变叶海棠与花叶海棠和陇东海棠产生渗入杂交的结果。     

苹果属部分观赏品种与中国野生种的亲缘关系

 采用AFLP分子标记技术对47种苹果属植物进行遗传多样性和亲缘关系分析，其中24个为国外引进的观赏海棠品种。结果表明，筛选出的10对分辨率强的引物共扩增出589条带，其中多态性带534条，多态位点百分率达90.66%。观赏海棠品种在DNA分子水平上表现出极为丰富的遗传多样性。基于Jaccard系数对AFLP扩增结果进行UPGMA (Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean)聚类，以相似系数0.60为标准，将供试材料分为8组，以相似系数0.59为标准，将观赏海棠品种分为4组。分析认为，供试的24个观赏海棠品种中有22个品种与我国原产的苹果属植物亲缘关系较近。