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《中国兽医学报》2016,(11)
本试验对临床上猪腹泻相关的病原进行了检测并对广东部分地区的猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)展开了分子流行病学的调查。对采集自广东地区的14个规模化猪场的19份腹泻病料进行了RT-PCR检测,并对检出的12株PEDV的COE、ORF3、M以及N基因进行测序和遗传进化分析。结果显示,临床的腹泻案列多为混合感染所致,检出的主要病原有猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)、PEDV、猪嵴病毒(PKV)、猪A群轮状病毒(PoRV)以及牛流行性腹泻病毒(BVDV)。与参考毒株CV777相比12株PEDV的COE、ORF3、M、N基因均存在不同程度、不同位点的氨基酸突变。COE、ORF3、M以及N基因的遗传进化分析显示:广东地区的12株PEDV毒株属于同一个分支彼此间的亲缘关系较近但与CV777疫苗毒株以及2012年之前广东地区分离的毒株CHGD-01、CH-GDGZ-2012、GD-1以及GD-A等毒株分属于2个不同的分支,亲缘关系相对较远。结果表明,广东地区现阶段流行的PEDV优势毒株与2012年之前相比可能已经发生了改变,CV777疫苗毒株的免疫效果如何还有待于通过更多的临床实验来验证。 相似文献
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《中国动物传染病学报》2020,(4)
本研究旨在初步了解河北省部分地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行和遗传变异情况,于2016-2017年从保定市及周边地区采集腹泻猪粪便样品327份,采用RT-PCR检测PEDV流行情况,同时对获得的11株PEDV的S基因部分基因(S1)进行扩增、测序和分析。结果显示:327份粪便样品中有84份检测为PEDV阳性,检出率为25.08%;获得的11株PEDV分离株S1基因序列核苷酸同源性为95.8%~100.0%,与疫苗株CV777、LZC株相比,核苷酸同源性为89.5%~90.8%;本次研究获得的11株PEDV分离株均位于G2亚群,与2010年后国内流行的PEDV分离株相距较近,但与PEDV经典毒株亲源性较远。本次研究表明,河北省流行的PEDV毒株多为变异株,生猪养殖企业(户)应注意且加强猪场生物安全。 相似文献
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为分析常州地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行和变异情况.本研究用RT-PCR方法对2014年3月至2015年12月从常州地区采集的104份病料进行病原学检测和流行病学调查,并对其中4株阳性材料所带病毒的部分M基因进行克隆、测序和分析.结果显示常州地区PEDV的个体阳性率为3.8%,猪场阳性率为7.7%;与经典病毒株CV777相比,4株病毒的核苷酸序列和氨基酸序列都有突变,同源性分析表明省内本地区毒株的核苷酸同源性为97.8~100.0%,但与欧洲毒株的同源性较低;遗传进化分析表明常州地区PEDV流行株和参考株可分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ3个群,3株常州毒株和一些其他国内毒株、泰国毒株、韩国毒株以及美国毒株属于Ⅰ群,另外1株常州株与2株泰国株构成了Ⅲ群,而现用疫苗株CV777则属于Ⅱ群,常州地区内PEDV有一定程度的进化和变异,并且需要选择更有效的疫苗株来控制PEDV的流行. 相似文献
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四川部分地区猪流行性腹泻的分子流行病学调查 总被引:1,自引:0,他引:1
本研究对四川猪流行性腹泻病毒(PEDV)开展了分子流行病学调查。参照毒株CV777的M基因序列,设计1对特异性引物(预期扩增大小为392bp),建立了快速检测PEDV的RT-PCR技术,对四川9个地区规模化猪场的75份仔猪腹泻病料进行检测与分析。再根据S基因的变异区域设计1对引物(扩增大小为947bp),选择扩增了四川9个地区的代表样品的S基因序列,并进行了进化与变异分析。结果显示,建立了检测PEDV的M基因的RT-PCR技术,并确定了最佳反应条件和反应体系,用该方法检测了四川75份腹泻病料,检出64份PEDV阳性,PEDV阳性检出率为86.67%,结果显示PEDV在四川地区发病季节除冬春季外,近年夏季也呈高发趋势。四川9株PEDV的S基因的核苷酸同源性为95.9%~100%,氨基酸同源性为95.1%~100%,四川毒株与14个国内外参考毒株的核苷酸同源性和氨基酸同源性分别为84.6%~99.5%和84.2%~99.5%;四川流行毒株的S基因(S蛋白)存在碱基(氨基酸)缺失和插入现象。结果表明,本研究从分子流行病学角度证实了四川部分地区PEDV的流行与变异情况,为指导该地区PEDV科学防控提供了依据。 相似文献
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广西猪流行性腹泻流行病学调查 总被引:2,自引:0,他引:2
对广西6个市的6个规模化猪场进行了猪流行性腹泻流行病学调查。对其中4个猪场统计,在11090头猪中,患流行性腹泻的猪4658头,发病率为42%;死亡265头,病死率为5.69%。对6个猪场的170头份血清检测,阳性血清14份,阳性率为8.24%。结果表明广西的一些规模化猪场有猪流行性腹泻存在。 相似文献
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为了解云南省部分地区2019—2021年猪流行性腹泻的感染状况,采用ELISA(酶联免疫吸附试验)检测方法,对采自云南省8个地区284个规模化猪场(户)的2 319份种猪血清进行猪流行性腹泻的抗体检测。结果表明,2019—2021年云南省部分地区猪流行性腹泻平均感染率为28.46%,2021年阳性感染率最高为37.43%。不同地区猪场(户)猪流行性腹泻感染情况存在一定的差异,文山和西双版纳地区猪流行性腹泻感染的猪场(户)所占比率,2019—2021年猪流行性腹泻阳性率呈现出逐年增高的趋势;丽江2020年猪流行性腹泻阳性的猪场(户)比率明显高于其他2年。不同类别猪流行性腹泻的感染情况存在一定的差异,仔猪群感染猪流行性腹泻的阳性感染率最高达31.65%,其次是母猪群,阳性感染率为27.81%;肥育猪群的阳性感染率为24.93%。说明云南省部分地区猪流行性腹泻感染情况比较严重,应引起高度重视。 相似文献
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为了解湖北地区猪流行性腹泻病毒(PEDV)的流行特征及变异情况。2021年3月-2022年2月,从湖北地区共收集腹泻症状的粪便-肛门棉拭子1580份,采用双重巢式PCR法进行检测,分析不同养殖阶段、季节间的感染差异;并选取部分阳性样品进行PEDV-N基因的扩增与遗传进化分析。1580份样品共检出阳性样品318份,阳性率为20.13%(318/1580)。其中0~28 d仔猪、28~70 d保育猪、70~120 d后备猪、120~270 d中大猪和>270 d猪只的阳性率分别为40.27%、26.89%、10.33%、8.07%和5.50%。冬季为PEDV感染的高发期(36.66%),其次是春季(19.00%)和秋季(11.49%),夏季(5.55%)的检出率相对较低。将部分阳性样品进行PEDV-N基因测序,随机挑选12株测序序列与24株参考株进行遗传进化分析,测序序列间N基因的核苷酸同源性为94.0%~99.7%,氨基酸同源性为93.9%~100.0%;测序序列与参考毒株的核苷酸同源性为94.5%~99.8%,氨基酸同源性为94.6%~100.0%。通过系统性发育进化树分析,PE... 相似文献
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为了调查2017—2020年华北地区规模化猪场猪流行性腹泻(PED)流行情况,试验收集来自河北、山西、内蒙古、北京、天津等省(自治区和直辖市)的218个规模化猪场的4 030份腹泻仔猪病料样品并进行RT-PCR检测,对猪流行性腹泻病毒(PEDV)阳性样品S1基因部分片段进行扩增和测序,将测序结果与国内外参考毒株进行同源性分析并构建遗传进化树。结果表明:PED各季度都可以发生,以一季度和四季度多发。2017—2020年,样品PEDV核酸阳性率分别为20.21%、15.28%、10.88%、18.80%,总体呈逐年下降趋势,但2020年略有升高;猪场PEDV核酸阳性率分别为34.78%、28.00%、25.00%、22.73%,也呈逐年下降趋势。本研究测序毒株与以Vaccine CV777为代表的GⅠ基因型毒株的核苷酸相似性为87.9%~91.9%;与以AJ1102为代表的GⅡ基因型毒株的核苷酸相似性为95.7%~99.0%。测序的31个毒株都属于GⅡ基因型毒株,其中20株为GⅡa基因亚型,8株为GⅡb基因亚型,其余3株为GⅡc基因亚型。说明2017—2020年华北地区PED发生率总体上呈... 相似文献
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以四川省7个市县地区14个猪场为研究对象,采集疑似圆环病毒2型感染的死猪、病料、精液、血样等样品181份,进行PCR检测。结果显示:猪圆环病毒2型(PCV2)阳性有89份,阳性率49.2%;14个规模化猪场中均检测出了PCV2阳性。在死亡的43头猪中有21头PCV2阳性。病料中PCV2的阳性检出率54.0%。该病在春夏季节感染率最高,并存在病毒混合感染和继发细菌感染情况。根据临床症状和病理变化分析,大部分猪场因感染PCV2而致断奶仔猪多系统衰竭综合征(PMWS),其中遂宁市和绵阳市的6个规模化猪场中检测到PCV2感染所引起的猪皮炎肾病综合征(PDNS)。结果表明,四川省部分地区的规模化猪场中已经广泛存在猪圆环病毒2型感染。 相似文献
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宁夏某猪场猪流行性腹泻紧急流行病学调查 总被引:1,自引:0,他引:1
2017年5月10日,宁夏回族自治区动物疾病预防控制中心接到青铜峡市某规模化猪场发生大规模腹泻的报告。经流行病学调查和实验室检测,确定猪流行性腹泻病毒是导致该猪群发生大规模腹泻的主要原因,生物安全管理水平不高、运输车辆或人员进场管理不严是疫病传入的主要风险因素;场内管理不严是疫情扩散的原因。按照调查建立的病因假设,采取了针对性防控措施,包括对猪场的入场清洗消毒设施等进行升级改造,加强饲养管理等。半年内该场未再发生大规模猪腹泻疫情。 相似文献