中国5个矮马品种的瓶颈效应分析

利用13个微卫星基因座对中国5个矮马品种(德保、贵州、宁强、四川、云南)群体进行了遗传平衡检测。根据微卫星等位基因频率,应用无限等位基因模型(infinite allele model,IAM)、双相突变模型(two-phased model of mutation,TPM)和逐步突变模型(step-wise mutation model,SMM)3种模型,符号和Wilcoxon 符号—秩2种检验方法,对5个矮马群体的突变－漂移平衡进行分析。结果表明,在IAM下,Wilcoxon 符号－秩检验中,德保矮马和云南矮马达到了显著性水平(P<0.05);在SMM下,宁强矮马在符号检验中达到了显著水平(P<0.05);在TPM下,5个群体均未达到显著水平(P>0.05)。因此,德保、云南和宁强矮马近期可能经历了瓶颈效应。本研究结果对中国矮马的保护和利用具有重大意义。     

中部地区家养山羊线粒体遗传多样性与母系起源研究

为了解中国中部地区家养山羊遗传多样性及其起源分化,以中部地区伏牛白山羊、槐山羊、济宁青山羊、太行黑山羊和尧山白山羊为研究对象,对线粒体D-loop区遗传多样性及山羊母系起源进行研究,结果共发现140个突变位点,共定义63个单倍型。遗传多样性分析表明5个山羊品种总单倍型多样度(Hd=0.965±0.004)和核苷酸多样度(Pi=0.013 88±0.000 66)较高。系统发育树结果表明5个山羊品种母系起源为捻角野山羊,且大部分个体(89.65%)来源于支系A,少数个体(10.35%)来源于支系B。遗传距离分析结果表明,5个品种间遗传距离为0.013 6～0.018 8,未达到亚种间遗传距离。品种间遗传分化系数Fst为0.016 6～0.169 3,伏牛白山羊与尧山白山羊和太行黑山羊间Fst达到明显分化程度,其他品种间均为中度分化或分化程度很弱,说明品种间存在基因交流,与基因流(Nm=3.92)和遗传距离结果一致。中性检验结果表明伏牛白山羊、济宁青山羊和太行黑山羊近期经历过瓶颈效应,槐山羊和尧山白山羊符合动态平衡。本研究为进一步了解中国中部地区山羊起源分化以及遗传多样性提供理论支持,并为...     

太湖鹅群体遗传多样性研究

通过筛选的28个多态性较好的微卫星标记,检测了太湖鹅群体的遗传多样性,结果表明,28个微卫星位点均表现出多态性,总共检测到87个等位基因,平均等位基因数为3.1071个;群体多态信息含量为0.4450,杂合度为0.5206。瓶颈效应分析结果表明该群体已偏离了突变-漂移平衡,近期可能经历了瓶颈效应,种群数量曾经下降。根据遗传多样性检测数据,提出保护与开发建议。     

太湖鹅群体遗传多样性研究

通过筛选的28个多态性较好的微卫星标记,检测了太湖鹅群体的遗传多样性,结果表明,28个微卫星位点均表现出多态性,总共检测到87个等位基因,平均等位基因数为3.1071个;群体多态信息含量为0.4450,杂合度为0.5206。瓶颈效应分析结果表明该群体已偏离了突变-漂移平衡,近期可能经历了瓶颈效应,种群数量曾经下降。根据遗传多样性检测数据,提出保护与开发建议。     

利用微卫星DNA对绵羊群体进行遗传平衡检测

利用4个绵羊微卫星基因座分析10个绵羊种群(3个引入品种、1个本地品种和6个杂种)的群体遗传平衡.Hardy-Weinberg平衡检验表明,绝大多数种群各基因座上的基因型偏离Hardy-Weinberg平衡;连锁不平衡检验表明,除个别种群的个别基因座外,同一条染色体上的3个微卫星(BP33、CSSM018和MCM148)处于连锁平衡状态;微卫星进化的三种模型(IAM、ISM和SMM)下,符号检验和Wilcoxon符号-秩检验均表明,各种群未经受显著的瓶颈效应影响,处于突变-漂移平衡.     

山羊BMP15基因FecX~(Gr)和FecX~O突变的检测

为寻找有效的山羊高繁殖力性状分子遗传标记,以不同产羔率水平的19个山羊品种为对象,采用PCR-RFLP和测序方法,探测骨形态发生蛋白15(BMP15)基因最新发现的两个突变(FecX~(Gr)和FecX~O)在山羊品种中的多态性分布。结果显示,所检测的19个山羊品种个体均无FecX~(Gr)和FecX~O突变。     

广西三黄鸡群体遗传多样性研究

广西三黄鸡是我国著名的地方鸡品种,其肉质优良,具三黄特征。本研究采用30对微卫星标记分析广西三黄鸡群体的遗传多样性。结果共检测到212个等位基因,30个微卫星位点均表现出多态性,每个座位的等位基因数从2～11不等,平均等位基因数为7.067个;期望杂合度在0.500～0.847之间,均值为0.734,说明该群体具有较高的遗传变异水平;FIS值表明该群体的近交水平低,瓶颈效应分析结果表明该群体近期未经历过瓶颈效应。     

川渝部分山羊品种(类群)遗传多样性微卫星标记研究

为分析川渝山羊品种(类群)的遗传多样性和系统发生关系,利用30个微卫星标记,对6个山羊品种(类群)进行分析。结果表明:金堂黑山羊遗传多样性最丰富,群体多态信息含量、平均杂合度和有效等位基因数分别为0.777、0.819和6.54;大足黑山羊各项指标最低,分别为0.736、0.787和5.57。对6个品种(类群)聚类分析表明,金堂黑山羊与南江黄羊的首先聚类在一起,然后依次与板角山羊、川东白山羊、大足黑山羊和波尔山羊聚类。各山羊品种(类群)的聚类关系与其来源、育成史及地理分布基本一致。     

利用微卫星标记分析云南省10个山羊品种的遗传多样性

本研究应用微卫星标记技术,选取15个微卫星位点分析云南省10个地方山羊品种(弥勒红骨山羊、圭山山羊、马关无角山羊、师宗黑山羊、威信白山羊、龙陵黄山羊、罗平黄山羊、云岭山羊、宁蒗黑头山羊、昭通山羊)以及参照群波尔山羊的遗传多样性及遗传关系。结果表明:除MCM200外,其他14个微卫星位点均属于高度多态位点;11个群体观测杂合度值(0.573～0.692)、期望杂合度值(0.608～0.696)、平均多态信息含量(0.562～0.655)均大于0.5,表明群体遗传多样性丰富;群体间遗传变异系数为0.112,处于中等以下分化程度,群体近交系数均为正值(除马关无角山羊),表明云南省地方山羊品种内都存在不同程度的近交;群体间的基因流大于1,说明品种间存在着一定程度的基因交流;基于Nei氏遗传距离计算和UPGMA聚类分析,波尔山羊与10个云南地方山羊品种亲缘关系较远,单独为一支;10个云南地方山羊品种分为2个类群,弥勒红骨山羊、圭山山羊和马关无角山羊聚为一支,师宗黑山羊、威信白山羊、龙陵黄山羊、罗平黄山羊、云岭山羊、宁蒗黑头山羊、昭通山羊聚为一支。     

科技

<正>中国、巴基斯坦和尼泊尔家山羊群体遗传关系被揭示近期,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所畜禽种质资源保护与利用科技创新团队研究揭示了中国、巴基斯坦和尼泊尔山羊群体的遗传关系,筛选出调控山羊热适应性、产绒和产奶的关键候选基因与SNP错义突变位点,为进一步研究山羊适应性及表型性状的遗传机制、促进地方品种分子育种提供理论基础。相关成果发表在《遗传学报（Journal of Ges）》。