2012-2013年广东猪流行性腹泻流行情况调查报告

为了解广东猪群流行性腹泻(PED)的发生状况,对全省120个不同养殖规模的猪场进行了猪群腹泻的流行病学调查和样品采集。共采集566份肠道和粪便样品,采用猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)-猪流行性腹泻病毒(PEDV)-猪轮状病毒(PRo V)三重荧光RT-PCR方法进行病原学检测。结果显示,TGEV、PEDV和PRo V的样品阳性率分别为0.88%、23.32%和16.78%,造成广东猪群爆发腹泻的主要病原是PEDV;PEDV的场阳性率和样品阳性率分别为35.83%和23.32%,PED已成持续感染的地方流行态势;从规模看,以存栏母猪100头以下的猪场群内PED发病率最高,为77.38%,生物安全措施好的场发病率较低;从生长阶段(用途)看,以哺乳仔猪的发病率最高,为50.33%,且现有PED疫苗的免疫已无法避免PED的发生。     

辽宁省仔猪病毒性腹泻的病原学调查

为了解辽宁省仔猪病毒性腹泻病原的流行情况,从而制订有针对性的防控措施,采用RTPCR方法对2013年4月份至2014年3月份辽宁省9个市采集的228份腹泻病料进行猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪轮状病毒(PRo V)的检测,根据采集病料的时间和地点进行统计。结果显示PEDV和TGEV的阳性率分别为37.72%和15.79%,说明辽宁省仔猪病毒性腹泻主要病原是PEDV,其次是TGEV;PEDV和TGEV在辽宁省感染分布广泛,污染程度较高,并且全年持续存在。     

2012年广东猪群腹泻流行病学调查

为了解2012年广东猪群腹泻的发病状况,对全省19个地级市102个不同养殖规模的猪场进行了猪群腹泻的流行病学调查。采集236份肠道和粪便样品,采用猪流行性腹泻病毒(PEDV)-猪轮状病毒(PRo V)-猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)三重荧光RT-PCR方法进行病原检测。结果显示,猪群腹泻的场阳性率高达68.63%,发病率为37.76%,病死率为50.26%。从规模看,以存栏母猪100头以下的猪场群内发病率和病死率最高,分别为63.55%和66.75%;从生长阶段(用途)看,以哺乳仔猪的发病率和病死率最高,分别为47.74%和61.11%;免疫率高、生物安全措施好的场发病率和病死率均较低。PEDV阳性率为33.05%(78/236),PRo V阳性率为17.8%(42/236),未检测到TGEV。因此认为,广东猪群腹泻流行面广,导致猪病毒性腹泻的病原以PEDV为主,且以哺乳仔猪发病和死亡最多。     

龙岩地区仔猪病毒性腹泻发病率调查

为了解闽西地区仔猪病毒性腹泻的流行情况,对2013年9月份—2016年3月份在龙岩市收集的99份疑似病毒性腹泻样品进行猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)和轮状病毒(RV)的RT-PCR检测。结果表明:TGEV、PEDV及RV阳性检出率分别为21.21%、38.38%和32.32%;TGEV和PEDV的混合感染阳性检出率为2.02%,TGEV和RV的混合感染阳性检出率为5.05%;PEDV和RV的混合感染阳性检出率为8.08%;TGEV、PEDV和RV三者混合感染的阳性检出率为1.01%。说明龙岩地区仔猪病毒性腹泻感染情况较严重。     

贵州省仔猪病毒性腹泻病原学调查

为了解贵州省仔猪病毒性腹泻病原流行情况,对2013—2015年贵州省7个市(州)采集的35个规模养猪场316份仔猪腹泻粪便样品进行病原核酸检测。结果显示,各地均存在猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪轮状病毒(PoRV)感染,PEDV阳性率为62.43%,TGEV阳性率为7.91%,PoRV阳性率为11.76%。不同病原在不同地区呈显著流行趋势,且存在不同程度的混合感染,PEDV与PoRV混合感染率为18.04%,PEDV与TGEV混合感染率为5.06%,TGEV与PoRV混合感染率为3.80%,PEDV、TGEV与PoRV混合感染率为1.90%,近3年主要流行病原为PEDV。为临床防控仔猪病毒性腹泻发生提供了理论依据。     

贵州地区仔猪病毒性腹泻流行病学调查

为分析贵州地区2013年~2015年仔猪病毒性腹泻发病情况和流行特征,本研究对2013年~2015年贵州省5个不同的地州(市)采集的27个规模养猪场7 153头猪进行发病时间、发病日龄、发病率、死亡率等发病状况调查,并采用RT-PCR方法对采集的203份仔猪腹泻粪便样品进行病原核酸检测。结果显示,猪群多在冬春季节发生腹泻,发病日龄为2日龄~7日龄,猪群腹泻发病率为61.07%,病死率为71.50%;病原核酸检测结果显示:猪流行性腹泻病毒(PEDV)的阳性率为63.54%,猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)的阳性率为0.98%,猪轮状病毒(Po RV)的阳性率为7.88%;PEDV与TGEV混合感染率为0.99%,与Po RV混合感染率为10.84%。该调查结果表明贵州地区仔猪病毒性腹泻发病率及病死率均较高,引起仔猪病毒性腹泻的主要病原为PEDV,并且出现PEDV/TGEV和PEDV/Po RV的混合感染。     

三峡库区仔猪传染性腹泻病原调查

为了弄清三峡库区仔猪传染性腹泻病原的感染及流行规律,本试验于2013-2015年从三峡库区的18个规模化猪场采集了180份发生腹泻的病料进行猪致病性大肠杆菌(EPEC)、猪流行性腹泻病病毒(FEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪轮状病病毒(RDV)4种病原的检测,结果表明,三峡库区6个地区4种仔猪腹泻传染性病原检出率由高至低顺序为PEDV、RDV、TGEV和EPEC,依次为22%、12.7%.5.5%和3.8%,表明三峡库区规模化猪场PEDV和RDV感染广泛,且三峡库区规模化猪场存在多种病原混合感染情况。     

哺乳仔猪病毒性腹泻的流行趋势和防治

引起仔猪腹泻的常见病毒有猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪轮状病毒(RV),三者均为RNA病毒[1].笔者多次采取腹泻哺乳仔猪小肠病料送浙江农林大学动物健康监测中心做病原检测,结果表明造成浙江省这几年产房哺乳仔猪严重腹泻的病原主要是流行性腹泻病毒(PEDV),其次是猪传染性胃肠炎病毒(TGEV).还有几次送检腹泻哺乳仔猪的同时挤该窝哺乳母猪奶水2 mL送检腹泻病原,发现多数所产哺乳猪发生腹泻的母猪奶水里面含有与腹泻乳猪一致的腹泻病原,说明导致乳猪腹泻的病原很可能是通过母猪奶水感染.本文对哺乳仔猪病毒性腹泻的流行趋势和防治提出以下观点.     

规模养猪场仔猪病毒性腹泻病原的分子检测

为了解保山市隆阳区规模养猪场仔猪病毒性腹泻的病原感染情况,应用RT-PCR或PCR方法对采自保山市隆阳区不同地方16家养猪场腹泻仔猪的肛门拭子样品进行了5种病毒性病原的检测。结果显示阳性检出率最高的为猪圆环病毒(PCV-2),16家猪场均检出阳性样品,阳性样品率最高达到100%,最低33.33%;其次为猪流行性腹泻病毒(PEDV),16家养猪场有4家猪场检出了PEDV阳性样品,占采样养殖场数的25.00%,阳性样品率分别为25.00%、33.33%、25.00%、20.00%。但此次所采样品中未检出猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪轮状病毒(PoRV)及猪瘟病毒(CSFV)3种病原,3种病原的阳性样品率都为0;检测的这93份样品中存在部分混合感染的情况。     

2017—2021年广西腹泻猪群主要病毒性腹泻病原检测

为掌握广西地区导致猪群腹泻的主要病毒性病原的流行态势,为养殖场猪病毒性腹泻的综合防控提供依据,用实时荧光RT-PCR检测方法,对2017年1月—2021年6月广西14个地市489个猪场1 206份临床腹泻样品进行猪流行性腹泻病毒（PEDV）、猪轮状病毒（PoRV）、猪传染性胃肠炎病毒（TGEV）、猪丁型冠状病毒（PDCoV）等病原检测,并分析其阳性检出率在不同年份、季节、地区、年龄段猪群之间的差异以及病原混合感染情况。结果显示,2017—2021年,PEDV、PDCoV、PoRV、TGEV样品阳性检出率分别为49.67%、7.63%、4.56%和0.33%,场阳性检出率分别为53.37%、8.18%、8.18%和0.61%;病毒性腹泻病原有一定的季节性流行特征,多表现为冬、春季流行加重;PEDV、PDCoV普遍流行,PoRV局部流行,TGEV散发流行;4种病原对不同年龄段腹泻猪群的感染率存在差异,其中对哺乳仔猪危害最为严重;猪群以单一感染为主,主要为PEDV单一感染,阳性检出率为47.93%,混合感染均为二重感染且感染率较低。结果表明,导致广西地区猪群腹泻的主要病毒性病原主要为PEDV、PDCoV和PoRV,其中PEDV为最主要病原,其他病原也呈流行加重趋势,需进一步加强病原监测和疫病综合防控。     

猪病毒性腹泻分子流行病学调查

为了解近年来中国猪病毒性腹泻的发生现状,于2011年4月至2012年4月利用多重RT-PCR方法对采集于13个省市的猪腹泻样品和临床健康的样品进行了检测,结果显示,腹泻猪群样品中TGEV阳性率为2.65%,PEDV阳性率为24.49%,ARV阳性率为3.20%;在肠道组织样品中,TGEV的阳性率为3.11%,PEDV为14.83%,ARV为1.67%;粪便样品中,TGEV的阳性率为2.80%,PEDV为28.42%,ARV为4.86%;母猪(所产仔猪腹泻)乳汁中,TGEV阳性率为1.08%,PEDV为31.89%,ARV为0.54%。健康猪群样品中,保育与育肥阶段猪中PEDV阳性率为2.13%,ARV阳性率为1.42%;哺乳仔猪中ARV阳性率为12.86%。由此可知,目前中国猪病毒性腹泻以PED为主要病因,PEDV和TGEV在幼龄猪群中存在隐性感染现象,且3种病毒性腹泻均可通过母乳传播病毒。     

猪流行性腹泻病毒、猪传染性胃肠炎病毒、猪A型轮状病毒多重RT-PCR方法的建立及其应用

为了建立一种能够同时检测猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪A群轮状病毒(RVA)的敏感、特异的多重RT-PCR(mRT-PCR)方法,本试验分别针对PEDV和TGEV的N基因、RVA的VP7基因设计了4对引物(其中针对PEDV N基因的引物为内、外2对),结合mRT-PCR和PEDV的套式RT-PCR(nRTPCR),建立了检测PEDV、TGEV和RVA的mRT-PCR方法。mRT-PCR能够同时扩增出针对3种病毒的预期大小的目的核苷酸片段,与猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪瘟病毒、伪狂犬病毒及猪圆环病毒2型等病毒无交叉反应;可以检测到PEDV、TGEV和RVA的最低核酸浓度分别为16.07、803.9和321.5μg/L。应用mRT-PCR检测了31份腹泻仔猪的血清、肛拭子或小肠组织,其中PEDV、TGEV与RVA的阳性率分别为61.29%、6.45%和25.81%,并检测到了PEDV与RVA或TGEV双重感染及PEDV、TGEV和RVA三重感染的样品。在检测临床样品时,mRT-PCR和单项RT-PCR检出PEDV、TGEV和RVA的符合率分别为96.77%、93.54%和93.54%。上述结果表明,mRTPCR能够快速鉴别检测PEDV、TGEV和RVA 3种病毒,PEDV是引起当前仔猪腹泻的主要病原。     

猪传染性胃肠炎病毒、猪流行性腹泻病毒和猪轮状病毒A多重荧光定量RT-PCR检测方法的建立

为对引起腹泻症状的猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)和猪轮状病毒A(PRoVA) 3种病毒同时快速地鉴别检测,本研究对GenBank中登录的TGEV的S基因、PEDV的S基因、PRo VA的NSP基因进行序列分析,分别设计了针对3种病毒的特异性引物和用3种荧光基团标记的核酸探针,通过条件优化建立了针对这3种病毒的多重荧光定量RT-PCR方法。结果显示,该方法能够特异性检测PEDV、TGEV和PRo VA,而与其它病原无交叉反应;对TGEV、PEDV和PRo VA的最低检测量分别为1.12拷贝/μL、39拷贝/μL和25拷贝/μL;组内和组间变异系数均小于5%;该方法与商品化的试剂盒检测结果符合率达100%。该方法快速、敏感,检测结果准确可靠,为猪病毒性腹泻疾病的流行病学调查和分子生物学快速诊断奠定了基础。     

四川部分猪场PEDV、TGEV、GARV和PKV感染状况调查

为了解四川省部分猪场4种猪腹泻病毒的感染情况,为本地区猪腹泻的诊断和治疗提供依据,采用RT-PCR方法,分别对来自四川省成都、绵阳、德阳、眉山、资阳、雅安、内江、宜宾、达州等地9个规模化猪场的90份临床健康猪和130份腹泻猪的粪便样品,进行猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪嵴病毒(PKV)和猪A群轮状病毒(GARV)的检测。结果表明,在所有9个猪群中PEDV和PKV检出率达100%(9/9),且在部分猪群腹泻样本中的检出率可达到60%以上,表明此2种病原在检测猪场感染比较普遍。此外腹泻样本中TGEV和GARV阳性率分别为11.54%(15/130)、7.69%(10/130),表明该2种病原在本地区猪场仍有感染情况存在。对PKV的检测结果表明腹泻猪粪便中PKV的阳性率为43.85%(57/130),显著高于外表健康猪粪便样本23.33%(21/90),且PEDV和PKV的混合感染在4种病原混合感染类型中所占比例最大,推断PKV与猪只腹泻具相关性,PEDV和PKV具有协同致病的可能。     

山西省猪流行性腹泻流行病学调查

为了查清山西省猪流行性腹泻的流行情况,对山西11个地市的30个规模化猪场的仔猪腹泻发病情况进行了流行病学调查,并对采集的253份病料进行猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)检测。结果:共有5 158窝、52 533头仔猪发生腹泻,死亡40 059头,死亡率为76.25%;病料检测PEDV阳性率为73.26%,TGEV阳性率为7.36%。表明山西省猪群发生的腹泻,主要是由猪流行性腹泻病毒引起。     

一例猪流行性腹泻的诊治

<正>猪流行性腹泻(Porcine epidemic diarrhea,PED)是由猪流行性病毒(PEDV)引起的接触性肠道传染病,其特征为初生仔猪呕吐、腹泻、脱水。近几年来,国内PED呈高发趋势,特别是哺乳仔猪病死率高达100%,给我国养猪业造成了重大经济损失。贵阳市某猪场有母猪600余头,母猪于产前60 d、25 d先后对PEDV和TGEV进行了2次免疫,2015年1月初母猪首发腹泻,而后3~7日龄仔猪相继发病死亡,1月份死亡300余头哺乳仔猪;经过再次     

2018年～2019年新疆部分地区猪病毒性腹泻病原检测与分析

为了解新疆部分地区的猪病毒性腹泻发病现状和流行情况,本研究于2018年11月～2019年12月对新疆6个不同地区25个疑似病毒性腹泻猪场进行发病时间、发病日龄、发病率与病死率等基本状况调查,并利用RT-PCR方法对采集的疑似病毒性腹泻仔猪的粪便及肠道内容物共1 388份病料样品进行了病毒性腹泻的病原检测。调查结果显示,本研究中的25个猪场的仔猪腹泻主要在冬春季节发生,发病日龄主要为1日龄～6日龄,发病率为80.00%,病死率为87.46%。病原检测结果显示:猪流行性腹泻病毒(PEDV)的阳性率为46.69%,猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)的阳性率为6.77%,猪轮状病毒(PoRV)的阳性率为14.55%,猪德尔塔冠状病毒(PDCoV)的阳性率为0.79%。PEDV/TGEV混合感染率为0.43%,PEDV/PoRV混合感染率为2.95%,PEDV/PDCoV混合感染率为0.29%,PEDV/TGEV/PoRV 3种混合感染率为0.43%。结果表明,引起新疆部分地区仔猪病毒性腹泻的主要病原为PEDV,并出现以PEDV/PoRV为主的多种病原混合感染。本研究为新疆地区生猪养殖场科学防控猪流行性腹泻疾病提供了参考。     

猪源冠状病毒监测简报

目前,已知感染猪群的冠状病毒有6种,分别是猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)、猪呼吸道冠状病毒(PRCV)、猪急性腹泻综合征冠状病毒(SADS-CoV)、猪血凝性脑脊髓炎病毒(PHEV)和猪δ冠状病毒(PDCoV)。在冠状病毒科α、β、γ、δ等4个属中,PEDV、TGEV、PRCV、SADS-CoV均为α冠状病毒,PHEV为β冠状病毒,PDCoV为δ冠状病毒。PRCV在临床上引发仔猪呼吸道症状,PHEV感染会造成仔猪呕吐和神经症状,其他4种病毒均可引起猪群腹泻。中国动物卫生与流行病学中心对2011年以来收集自全国16个省份的2 915份临床腹泻猪群样品(肠道、粪便等)进行了PEDV、TGEV检测,检出PEDV阳性1 223份、TGEV阳性109份,PEDV、TGEV检出率分别为41.96%、3.74%;对2014年以来收集自14个省份的12 430份临床健康猪组织样品(淋巴结、扁桃体等)进行了PEDV检测,检出阳性325份,检出率为2.61%。针对引发新型冠状病毒肺炎的病原2019新型冠状病毒(2019-nCoV),对2018—2019年收集自15个省份的2 658份生猪组织样品开展了追溯性检测,结果均为阴性。对2019-nCoV与猪源冠状病毒的亲缘关系进行了分析。基于全基因组的遗传进化分析表明:2019-nCoV与同为β冠状病毒属的PHEV核苷酸同源性仅为54%,与α、δ属猪源冠状病毒亲缘关系更远。基于以上数据与分析,可初步排除2019-nCoV来源于已知猪源冠状病毒的可能性。     

粤北地区新生仔猪腹泻病原学调查及PEDV ORF3基因分子特征和遗传变异分析

为了解粤北地区新生仔猪腹泻病的主要病原,本试验采用实时荧光定量RT-PCR方法对2015年粤北地区6个规模化猪场31份新生仔猪腹泻样品进行了猪流行腹泻病毒(PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪轮状病毒(PoRV)检测,并对5株PEDV流行毒株ORF3基因进行测序分析。病原检测结果显示,83.87%(26/31)样品为PEDV阳性,没有检测到TGEV和PoRV阳性样品。对PEDV ORF3基因序列分析结果显示,5个流行毒株ORF3基因全长均为675bp,相互之间核苷酸同源性为98.7%~100.0%,与参考序列同源性为94.5%~100.0%,多个核苷酸位点发生了共同突变。系统进化树分析结果表明,PEDV可分为两个基因群,粤北地区流行的PEDV与2013-2015年间在中国部分地区、东南亚、北美洲和欧洲流行的PEDV遗传关系较近,位于基因1群中的同一个亚群,而2011-2012年中国流行的PEDV主要毒株及疫苗毒株则归类于另外两个基因亚群。结果表明,粤北地区新生仔猪腹泻主要是由PEDV感染引起的,PEDV基因随着时间推移呈现不断进化和变异趋势。     

2020年～2021年河北省4种猪腹泻病毒流行情况调查及PEDV分离株S1和ORF3基因序列的遗传变异分析

为初步调查河北省近年4种猪腹泻相关病毒的流行情况，本研究于2020年～2021年从河北省部分地区猪场采集244份腹泻猪粪便或肠组织样品，采用荧光定量PCR (qPCR)检测4种猪腹泻相关病毒[(猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪轮状病毒(PoRV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)和猪德尔塔冠状病毒(PDCoV)]；采用RT-PCR扩增部分PEDV阳性样品S1和ORF3基因并测序，利用DNAStar软件分析这两个基因及其编码氨基酸序列与PEDV相应序列的同源性；采用MEGA 7.0软件构建这两个基因的进化树，分析PEDV的基因型及其遗传进化关系。采用DNAStar比对这两个基因编码的氨基酸序列，分析其氨基酸序列的变异情况。结果显示：病料样品中PEDV、PoRV、PDCoV和TGEV检出率分别为34.02%(83/244)、18.44%(45/244)、10.66%(26/244)和2.87%(7/244)。样品中两种病原混合感染较多，其中PEDV+PoRV和PEDV+PDCoV检出率最高，分别为8.61%(21/244)和2.46%(6/244)；仅2份样品为PEDV+PDCoV+PoRV...