不同日龄家兔肠道微生物群落结构

采用Miseq2×300测序平台对29,45,60日龄3个阶段的断奶幼兔,共30个粪便样品中的菌群16S rDNA V3和V4可变区进行了高通量测序和分析。结果显示:在不同的日龄间ACE指数和Chao1指数差异显著(P<0.05),Shannon指数和Simpson指数差异不显著(P>0.05),说明随着日龄的增大断奶兔肠道中的微生物群落丰度大量增加,但是菌群多样性并没有显著增加,表明在幼兔断奶时肠道微生物已经完成了定植。在门水平上,肠道微生物群落主要由厚壁菌门、变形菌门、拟杆菌门、疣微菌门和放线菌门组成,其中变形菌门、拟杆菌门和疣微菌门在幼兔的生长过程中丰度有显著性变化。聚类热图的结果显示断奶幼兔肠道微生物群落结构的变化是随着日龄的变化而逐渐变化。     

猪肠道微生物群落组成变化及其影响因素

肠道微生物群不仅为宿主提供营养,也有利于维持其肠道微生态的平衡,保证肠道的健康和发育,因此,维持动物肠道微生态平衡在动物生产中具有重要的意义。动物肠道微生物容易受各种因素的影响,但通过日粮调控以及微生物调控均能得到一定的改善。本文综述了猪肠道微生物组成变化及其影响因素,旨在使人们在养猪生产中能够了解和控制这些因素,从而为肠道微生物与猪的消化代谢、肠道健康维持以及疾病预防等的研究提供帮助。     

奶牛乳汁中微生物群落结构变化及其影响因素的研究进展

乳腺为微生物的生长繁殖提供了良好的生长环境,微生物也为机体发挥一些重要的生理功能.随着16S rRNA基因测序等其他分子生物学技术的成熟,人们对乳汁中微生物区系结构的理解也愈加深入.健康奶牛的乳汁及初乳中具有丰富的微生物多样性和特殊的微生物区系,若菌群结构紊乱则会发生乳腺炎,伴随着微生物多样性的显著降低.据报道,影响乳...     

Functional analysis and induction of four novel goose (Anser cygnoides) avian β-defensins in response to salmonella enteritidis infection

In the current study, four novel avian β-defensins (AvBDs) (AvBD2, 5, 9, and 10) were identified in tissues from the Chinese goose (Anser cygnoides). The antibacterial activity of the AvBDs showed that all of these AvBDs exhibited antibacterial activity against most of the bacteria investigated (P<0.01). In addition, antibacterial activity of all of the AvBDs against Staphylococcus aureus and Pasteurella multocida decreased significantly or was completely abolished at 150mM NaCl (P<0.01). None of the AvBDs showed hemolytic activity. AvBD2 and AvBD10 were expressed widely, whereas AvBD5 and AvBD9 mRNAs were expressed in a limited number of geese tissues. AvBD9 was significantly induced in some immune tissues from geese after Salmonella enteritidis infection. The others were significantly upregulated in small intestine and some immune tissues of the geese (P<0.01). The present results suggest that the AvBDs are part of the host defense mechanism of the goose.     

诱导冬眠期间野生达乌尔黄鼠肠道菌群结构和功能适应变化

本试验对野生达乌尔黄鼠诱导冬眠期间肠道菌群的结构和功能变化进行了研究,旨在探究诱导冬眠期间野生达乌尔黄鼠肠道菌群如何发挥其功能以帮助机体维持正常的生理功能,为今后进一步研究其作用机制提供依据.适应性喂养14 d后,将8只野生达乌尔黄鼠随机分为2组,对照组饲养于室温,诱导冬眠组饲养于4℃无光照环境,2组均饲喂标准鼠饲粮,...     

抗生素及其替代物在畜禽肠道内的作用及其对肠道微生物和形态结构的影响(续完)

肠道健康是保证畜禽正常生长的关键,而肠道健康在很大程度上受肠道微生物菌群及其形态结构的影响,因此改善畜禽肠道内微生物菌群平衡及其形态结构在养殖生产过程中就显得尤为重要。本文主要阐述了畜禽肠道微生物菌群平衡的重要性以及畜禽在不同生理状态下肠道内微生物组成的变化情况;另结合当前国际无抗养殖的趋势,抗生素作为生长促进剂的使用已受到越来越严格的限制,各种抗生素替代物不断涌现,成了当前的研究热点,重点阐述和比较了抗生素及其替代物在畜禽肠道内的作用机理以及其对肠道菌群和形态结构的影响。     

水稻秸秆发酵饲料中微生物群落结构与功能分析

文章旨在研究发酵对水稻秸秆饲料微生物群落结构的影响。试验以水稻秸秆为试验材料,设置2个组别,分别为对照组和发酵处理组,发酵处理组发酵试剂由枯草芽孢杆菌、粪肠球菌、纤维素酶和木聚糖酶构成;对照组添加等体积无菌水,发酵时间为14?d。试验结果表明,发酵处理的水稻秸秆发酵饲料中粗蛋白质含量及活菌数显著提高（P <0.05）;粗纤维、中性洗涤纤维和酸性洗涤纤维含量显著降低（P <0.05）。与对照组相比,发酵处理组中Observed?species、Shannon、Chao?1和Ace指数显著升高（P <0.05）,发酵处理对Simpson指数无显著影响（P> 0.05）。在门水平上,发酵处理显著提高后壁菌门相对丰度（P <0.05）,同时显著降低变形菌门和其他杂菌的相对丰度（P <0.05）。属水平上的结果表明,发酵显著提高植物乳杆菌属和柠檬乳杆菌属的相对丰度（P <0.05）,显著降低布式乳杆菌属和其他杂菌的相对丰度（P <0.05）。     

家蚕K_(100) E_(23)肠道微生物初探

家蚕肠道微生物对宿主有着十分重要的作用和意义,为了人为调控和改良蚕肠道微生态环境,要求对不同品种间,同一品种的不同龄期间蚕肠道微生物种群构成情况及其变动情况进行系统的研究。 本实验对桑叶育体试材料K100、E23的各龄期肠道好氧和兼性厌氧微生物进行了分离调查。发现不仅在不同品种之间的肠道好氧和兼性厌氧微生物构成存在着一定的差别,并且,同一蚕品种的不同龄期间也存在着差异。肠肝菌科细菌在1,2龄所占比例较高,在4,5龄则迅速下降;而微球菌属,芽孢杆菌属等细菌在4,5龄比例大幅提高。     

乳酸菌对青贮饲料微生物群落结构和功能的影响

<正>1引言青贮饲料可成为反刍动物一年四季的绿色饲料。在青贮饲料的传统发酵过程中,水溶性碳水化合物主要是被乳酸菌(Lactic Acid Bacteria,LAB)转化为有机酸混合物,使发酵物pH值下降,并能够厌氧保存。     

研究发现蜜蜂肠道微生物群落构建的生态机制

正近日,中国农业科学院蜜蜂研究所蜜蜂病虫害生物学团队与中国科学院生态环境研究中心城市与区域生态国家重点实验室合作,研究揭示了宿主和地理改变在群落构建过程中的相对作用,为理解蜜蜂肠道菌群的形成、发展和进化提供了理论依据。相关成果发表在《mBio》上。该研究对我国1 000公里范围内两种蜜蜂(中蜂、意蜂)的肠道菌群进行了16S rRNA基因测序分析,探究了蜜蜂肠道菌群的宿主格局和地理格局,区分了不同生态过程在塑造这种格局上的相对作用。     

犬肠道微生物菌群结构与肠道免疫的研究进展

近年来随着生物技术的发展,尤其是基因测序技术的飞速发展,对犬肠道内微生物的组成和结构、肠道黏膜免疫的功能进行了大量的研究。本文对近年来小型动物犬的肠道菌群的组成和结构、及其对肠黏膜免疫细胞和免疫功能进行综述。     

泌乳奶牛在低乳脂综合症下瘤胃微生物群落结构的变化

本试验利用18头安装瘤胃瘘管的奶牛饲喂一系列能导致低乳脂综合症(MFD)的日粮(每批日粮饲喂时间为28d)来检测因MFD引起的瘤胃微生物菌群的变化。奶牛首先饲喂含25%淀粉(DM基础)的TMR日粮,日粮中通过添加玉米青贮和慢速发酵的玉米(SFS处理,第1期)使日粮中淀粉含量达25%。第1期饲喂完后日粮更换为含27%淀粉的TMR日粮,日粮中添加一种快速发酵的高水分脱粒玉米使日粮中淀粉含量达27%(RFS处理,第2期)。第3期,RFS处理日粮中添加13.6mg莫能菌素/kg日粮(RFS/Mon处理组),第4期,奶牛饲喂日粮转换为无莫能菌素的RFS日粮(RFS/Post处理组)。两种来源的淀粉日粮和莫能菌素对奶牛乳脂含量的影响不同,聚簇分析证实4组奶牛的乳脂结构差异较大。采集4组奶牛的瘤胃固相和液相食糜,提取DNA进行全自动核糖体基因间隔区序列分析,并与已知细菌组分(BCC)对比。饲喂RFS日粮的1组奶牛(S-responsive)出现MFD,但饲喂莫能菌素未加重MFD症状,回撤莫能菌素后乳脂出现反弹。第2组奶牛(M-responsive)日粮由SFS更换为RFS日粮后,未出现MFD症状,但添加莫能菌素后出现MFD...     

三江源区不同退化演替阶段高寒草甸土壤酶活性和微生物群落结构的变化

 对三江源区不同退化演替阶段的高寒草甸土壤酶活性和微生物群落结构进行分析,结果表明：１）土壤微生物种类和数量并不随着高寒草甸的退化而降低,而是在中度退化阶段达到最高;２）不同退化演替过程,中度退化阶段土壤微生物的结构更加复杂;３）不同土层中,０～１０ｃｍ 土壤微生物的多样性更加丰富,其群落结构能更好地适应外界环境的变化;４）５种土壤酶的酶活性均随土层深度的增加而显著降低（P＜０．０５）。在不同退化演替阶段,碱性磷酸酶的活性随演替的进行而显著降低（P＜０．０５）;蛋白酶和多酚氧化酶的酶活性最大值出现在中度退化演替阶段,最小值则在未退化阶段（原生植被）出现;蔗糖酶和脲酶活性在４个演替阶段中均无显著变化（P＞０．０５）。不同酶活性对外界环境变化敏感性不同,蛋白酶、碱性磷酸酶和多酚氧化酶具有较高的敏感性,而脲酶和蔗糖酶活性的敏感性较低;５）土壤酶活性与土壤微生物在高寒草甸不同退化演替阶段具有显著相关性（P＜０．０５）。土壤酶活性、土壤微生物群落结构可以作为一个综合指标,来指示三江源区高寒草甸的演替阶段和退化程度。     

复合酸化剂对罗斯肉鸡生长性能和肠道微生物群落的影响研究

本试验研究复合酸化剂对肉仔鸡生长性能、屠宰性状、免疫器官指数和肠道菌群的影响。将600只1日龄罗斯肉鸡随机分成5个处理（对照组,0.5 kg/t金霉素组,0.5、1.0和3.0 kg/t复合酸化剂组）,每个处理3个重复,每个重复40只鸡,在试验第45天进行屠宰试验。结果表明,与对照组相比,复合酸化剂不影响肉仔鸡的生长性能（P〉0.05）;0.5 kg/t的复合酸化剂极显著增加了（P〈0.05）肉仔鸡的皮脂率,但也显著降低了（P〈0.05）鸡的腿肌率;0.5和3.0 kg/t的复合酸化剂显著增加了（P〈0.05）鸡盲肠的乳酸杆菌数。由此可知,该复合酸化剂不能显著改善肉仔鸡的生长性能和屠宰性状,但部分改善了及的肠道微生态环境,且以3.0kg/t的添加量较佳。     

3～6月龄伊犁马肠道微生物群落多样性的研究

本试验旨在研究3~6月龄伊犁马肠道微生物群落的多样性,揭示断奶前马驹肠道菌群演替的规律,从微生物学角度为此阶段马驹生长发育及肠道健康研究提供理论依据。试验选取平均体重为(89.75±8.81)kg、出生日期相同的3月龄伊犁马5匹,进行为期90 d的饲养试验。分别在试验的第0天(即试验开始的前1天)、第30天、第60天、第90天采集马驹粪便样品,从每份样品中提取微生物基因组总DNA,采用Illumina HiSeq测序技术检测样品微生物群落多样性。结果显示:1)对5匹马驹的20份粪样进行测序,共获得有效序列数157 665条,获得平均操作分类单元(OTUs)1 117个。2)马驹粪便中微生物群落α多样性指数(ACE、Chao1、Shannon和Simpson指数)随着马驹月龄的增加呈波动性变化,但各时间点之间均无显著性变化(P0.05)。3)在门水平上,马驹粪便中10大优势菌分别为厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)、疣微菌门(Verrucomicrobia)、螺旋体菌门(Spirochaetes)、梭杆菌门(Fusobacteria)、无壁菌门(Tenericutes)、放线菌门(Actinobacteria)、TM7、广古菌门(Euryarchaeota),其中以厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门及疣微菌门的丰度较高;在科水平上,马驹粪便中10大优势菌分别为芽孢杆菌科(Bacillaceae)、莫拉氏菌科(Moraxellaceae)、动球菌科(Planococcaceae)、肉杆菌科(Carnobacteriaceae)、BS11、RFP12、乳杆菌科(Lactobacillaceae)、瘤胃球菌科(Ruminococcaceae)、毛螺旋菌科(Lachnospiraceae)、紫单胞菌科(Porphyromonadaceae);在属水平上,马驹粪便中10大优势菌分别为不动杆菌属(Acinetobacter)、德库菌属(Desemzia)、乳杆菌属(Lactobacillus)、Ureibacillus、Paludibacter、芽孢杆菌属(Bacillus)、埃希式杆菌属(Escherichia)、肉食杆菌属(Carnobacterium)、密螺旋体属(Treponema)、艰难杆菌属(Mogibacterium)。由此得出,采用Illumina HiSeq测序技术能够准确地对3~6月龄伊犁马肠道微生物群落进行分类研究;厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门、疣微菌门是3~6月龄伊犁马肠道内的优势菌门。     

鸡肠道中的微生物群随日龄和性别变化

鸡胃肠道中定植的细菌对于其营养吸收，以及保护其在育成后不受病原体的侵害非常重要。乔治亚大学的科学家们对不同性别的鸡只肠道中的菌群差异进行了研究。试验期内饲喂的日粮为不含抗生素的玉米一豆粕育雏日粮。分别在3、7、14、21日龄时从回肠取样采用PCR鉴定细菌的16SDNA来区分细菌类型。结果发现，这些细菌群根据性别分为2个类群，     

中草药六神曲中微生物群落结构与发酵条件优化

研究旨在提高中草药六神曲饲料添加剂的应用效果。采用3因素（发酵温度、发酵湿度、料液比）3水平正交试验对发酵条件进行优化,以淀粉酶和蛋白酶活性为指标,结合极差分析法确定最优发酵条件和该条件下微生物群落结构与功能变化。结果表明,六神曲饲料添加剂发酵的最优条件为：温度37℃、湿度80%、料液比1.50 g/mL,该条件淀粉酶活性为31.70 mg/(min·g),蛋白酶活性为302.75μg/(min·g)。发酵过程中细菌类始终是主导菌群,变形菌门（Proteobacteria）为优势菌门,在发酵前期较为丰富;发酵中期和后期,厚壁菌门（Firmicutes）相对丰度逐渐升高为优势菌门。欧文氏菌属（Erwinia）、克罗诺杆菌属（Cronobacter）始终为各发酵阶段优势菌属。真菌群落结构上,子囊菌门（Ascomycota）为优势菌门,曲霉属（Aspergillus）为优势菌属,均在发酵后期含量最高。新陈代谢功能在发酵前期相对丰度最高,腐生型真菌在全部发酵样品中占比均最高。研究表明,中药六神曲饲料添加剂的规范化生产可推广应用。     

VFA和黏蛋白对肠道微生物和肠道疾病的影响

日粮组成和消化道健康直接影响动物的健康．胃肠道是病原菌侵入机体的直接人口。一旦消化器官的保护性机制出了问题，胃肠道内正常菌群以外的病原微生物便会定植．随后侵入到宿主体细胞和组织。保护胃肠道不受病原微生物侵害的因素有：IgA的分泌、胃肠道菌群的平衡、保护性生理内环境的维系、黏蛋白保护层、消化道蠕动。现就VFA及黏蛋白对肠道微生物和肠道疾病的影响作一介绍。     

西部旱区紫花苜蓿地土壤微生物群落结构和多样性分析

为探究紫花苜蓿种植地土壤微生物与区域环境因素及土壤特征关系,本研究以西部旱区苜蓿种植地为研究对象,基于高通量测序技术,结合试验区环境因素,分析了土壤细菌和古菌的群落结构和多样性。结果表明:3个试验区苜蓿种植地土壤微生物优势菌门主要是变形菌门、放线菌门和酸杆菌门,微生物群落结构差异较大;位于乌兰县试验区土壤的微生物多样性显著低于其他两个试验区; 3个试验区海拔、土壤全氮含量与微生物多样性显著相关;冗余分析发现,本文选取的环境因素能解释70%以上的土壤微生物群落变化,其中水分(降水量)和海拔解释度最高。综上所述,苜蓿地土壤微生物群落结构和多样性与环境因素(气候、海拔)、土壤质地密切相关。     

末端限制性片段长度多态性分析技术在鸭肠道微生物群落结构研究中的应用

本研究采用T-RFLP技术,基于末端限制性片段长度多态性分析,对鸭肠道微生物群落结构进行研究。结果表明,鸭肠道微生物群落具有较高的多样性和复杂性,其中包括了多种细菌和古菌。同时,不同饲养模式和饲料类型对鸭肠道微生物群落结构有一定影响,但这种影响并不明显。此外,本研究还发现鸭肠道微生物群落中存在着一些特定的菌群,这些菌群可能对鸭的生长和健康状态有一定的影响。本研究为深入了解鸭肠道微生物群落结构及其功能提供了重要参考。